MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_021822	TCG	2	6	1722933	1722938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854128
28502	NC_021822	TGC	2	6	1722945	1722950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854128
28503	NC_021822	GAAT	2	8	1722992	1722999	50 %	25 %	25 %	0 %	525854128
28504	NC_021822	TGA	2	6	1723097	1723102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854128
28505	NC_021822	CGT	2	6	1723125	1723130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854128
28506	NC_021822	GAT	2	6	1723139	1723144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854128
28507	NC_021822	A	6	6	1723276	1723281	100 %	0 %	0 %	0 %	525854128
28508	NC_021822	CCA	2	6	1723283	1723288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854128
28509	NC_021822	AACG	2	8	1723305	1723312	50 %	0 %	25 %	25 %	525854128
28510	NC_021822	TTTCCT	2	12	1723374	1723385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854128
28511	NC_021822	AAT	2	6	1723724	1723729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854129
28512	NC_021822	GTG	2	6	1723884	1723889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854129
28513	NC_021822	CAG	2	6	1723922	1723927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854129
28514	NC_021822	CTC	2	6	1724214	1724219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854130
28515	NC_021822	AGCG	2	8	1724227	1724234	25 %	0 %	50 %	25 %	525854130
28516	NC_021822	A	6	6	1724319	1724324	100 %	0 %	0 %	0 %	525854130
28517	NC_021822	GAGC	2	8	1724345	1724352	25 %	0 %	50 %	25 %	525854130
28518	NC_021822	CAC	2	6	1724370	1724375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854130
28519	NC_021822	T	6	6	1724453	1724458	0 %	100 %	0 %	0 %	525854130
28520	NC_021822	TTG	2	6	1724517	1724522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854131
28521	NC_021822	GT	3	6	1724581	1724586	0 %	50 %	50 %	0 %	525854131
28522	NC_021822	GC	3	6	1724808	1724813	0 %	0 %	50 %	50 %	525854131
28523	NC_021822	AGT	2	6	1724819	1724824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854131
28524	NC_021822	TTC	2	6	1724863	1724868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854131
28525	NC_021822	CAT	2	6	1724906	1724911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854131
28526	NC_021822	TAGG	2	8	1725063	1725070	25 %	25 %	50 %	0 %	525854131
28527	NC_021822	CTC	2	6	1725075	1725080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854131
28528	NC_021822	GAC	2	6	1725114	1725119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854131
28529	NC_021822	GTA	3	9	1725126	1725134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854131
28530	NC_021822	GTAG	2	8	1725255	1725262	25 %	25 %	50 %	0 %	525854131
28531	NC_021822	ATG	2	6	1725301	1725306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854131
28532	NC_021822	CGA	2	6	1725311	1725316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854131
28533	NC_021822	AAT	2	6	1725331	1725336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854131
28534	NC_021822	CAT	2	6	1725350	1725355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854131
28535	NC_021822	AGT	2	6	1725364	1725369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854131
28536	NC_021822	ATG	2	6	1725385	1725390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854131
28537	NC_021822	GGC	2	6	1725546	1725551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854131
28538	NC_021822	TCT	2	6	1725578	1725583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854131
28539	NC_021822	TCG	2	6	1725587	1725592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854131
28540	NC_021822	TCT	2	6	1725610	1725615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854131
28541	NC_021822	TCT	2	6	1725641	1725646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854131
28542	NC_021822	CAAC	2	8	1726237	1726244	50 %	0 %	0 %	50 %	525854132
28543	NC_021822	TTGGC	2	10	1726262	1726271	0 %	40 %	40 %	20 %	525854132
28544	NC_021822	ACGG	2	8	1726294	1726301	25 %	0 %	50 %	25 %	525854132
28545	NC_021822	T	6	6	1726384	1726389	0 %	100 %	0 %	0 %	525854132
28546	NC_021822	ATC	2	6	1726394	1726399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854132
28547	NC_021822	CAG	2	6	1726414	1726419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854132
28548	NC_021822	CTGT	2	8	1726502	1726509	0 %	50 %	25 %	25 %	525854132
28549	NC_021822	CAT	2	6	1726510	1726515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854132
28550	NC_021822	TGG	2	6	1726704	1726709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854132
28551	NC_021822	GT	3	6	1726725	1726730	0 %	50 %	50 %	0 %	525854132
28552	NC_021822	CAT	2	6	1726735	1726740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854132
28553	NC_021822	TAGCAA	2	12	1726800	1726811	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525854132
28554	NC_021822	CGT	2	6	1726813	1726818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854132
28555	NC_021822	TCGC	2	8	1726857	1726864	0 %	25 %	25 %	50 %	525854132
28556	NC_021822	AGC	2	6	1726865	1726870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854132
28557	NC_021822	CGG	2	6	1726936	1726941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854132
28558	NC_021822	TAC	2	6	1727114	1727119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854132
28559	NC_021822	AGC	2	6	1727138	1727143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854132
28560	NC_021822	CTT	2	6	1727167	1727172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854132
28561	NC_021822	CGG	2	6	1727193	1727198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854132
28562	NC_021822	AGAGA	2	10	1727222	1727231	60 %	0 %	40 %	0 %	525854132
28563	NC_021822	GT	3	6	1727316	1727321	0 %	50 %	50 %	0 %	525854132
28564	NC_021822	ATC	2	6	1727501	1727506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854132
28565	NC_021822	GAT	2	6	1727702	1727707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854133
28566	NC_021822	ACCA	2	8	1727769	1727776	50 %	0 %	0 %	50 %	525854133
28567	NC_021822	TGA	2	6	1727797	1727802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854133
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28569	NC_021822	AC	3	6	1727922	1727927	50 %	0 %	0 %	50 %	525854133
28570	NC_021822	GTC	2	6	1727943	1727948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854133
28571	NC_021822	CAC	2	6	1727954	1727959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854133
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28573	NC_021822	CGC	2	6	1728032	1728037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854133
28574	NC_021822	CG	3	6	1728069	1728074	0 %	0 %	50 %	50 %	525854133
28575	NC_021822	TTG	2	6	1728226	1728231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854133
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28577	NC_021822	CGT	2	6	1728245	1728250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854133
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28581	NC_021822	CCA	2	6	1728417	1728422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854133
28582	NC_021822	GCA	2	6	1728484	1728489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854133
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28584	NC_021822	CCA	2	6	1728542	1728547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854133
28585	NC_021822	GCT	2	6	1728629	1728634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854133
28586	NC_021822	TGC	2	6	1728652	1728657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854133
28587	NC_021822	CTT	2	6	1728677	1728682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854133
28588	NC_021822	GCTT	2	8	1728706	1728713	0 %	50 %	25 %	25 %	525854133
28589	NC_021822	CAA	2	6	1728765	1728770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854133
28590	NC_021822	ATC	2	6	1728780	1728785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854133
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28600	NC_021822	AACCA	2	10	1729155	1729164	60 %	0 %	0 %	40 %	525854133
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28602	NC_021822	GCG	2	6	1729238	1729243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854133
28603	NC_021822	GTA	2	6	1729245	1729250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854133
28604	NC_021822	CAG	2	6	1729295	1729300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854133
28605	NC_021822	TGG	2	6	1729334	1729339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854133
28606	NC_021822	GTA	2	6	1729497	1729502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854134
28607	NC_021822	ACC	2	6	1729560	1729565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854134
28608	NC_021822	TC	3	6	1729605	1729610	0 %	50 %	0 %	50 %	525854134
28609	NC_021822	TTCA	2	8	1729701	1729708	25 %	50 %	0 %	25 %	525854134
28610	NC_021822	T	6	6	1729775	1729780	0 %	100 %	0 %	0 %	525854134
28611	NC_021822	TGA	2	6	1729907	1729912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854134
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28613	NC_021822	CCG	2	6	1729957	1729962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854134
28614	NC_021822	GTG	2	6	1730012	1730017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854134
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28616	NC_021822	CA	3	6	1730036	1730041	50 %	0 %	0 %	50 %	525854134
28617	NC_021822	GAA	2	6	1730049	1730054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854134
28618	NC_021822	T	6	6	1730183	1730188	0 %	100 %	0 %	0 %	525854135
28619	NC_021822	TTG	2	6	1730213	1730218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854135
28620	NC_021822	GCT	3	9	1730311	1730319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854135
28621	NC_021822	ATG	2	6	1730491	1730496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854135
28622	NC_021822	TAA	2	6	1730590	1730595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854135
28623	NC_021822	T	6	6	1730596	1730601	0 %	100 %	0 %	0 %	525854135
28624	NC_021822	GAT	2	6	1730618	1730623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854135
28625	NC_021822	AGT	3	9	1730665	1730673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854135
28626	NC_021822	GCA	2	6	1730907	1730912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854135
28627	NC_021822	T	6	6	1730924	1730929	0 %	100 %	0 %	0 %	525854135
28628	NC_021822	ATA	2	6	1730931	1730936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854135
28629	NC_021822	GCA	2	6	1731074	1731079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854136
28630	NC_021822	CCG	2	6	1731123	1731128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854136
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28632	NC_021822	CAC	2	6	1731232	1731237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854136
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28635	NC_021822	CTT	2	6	1731507	1731512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854136
28636	NC_021822	GT	3	6	1731533	1731538	0 %	50 %	50 %	0 %	525854136
28637	NC_021822	GTTG	2	8	1731547	1731554	0 %	50 %	50 %	0 %	525854136
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28644	NC_021822	TG	3	6	1732364	1732369	0 %	50 %	50 %	0 %	525854137
28645	NC_021822	TAC	2	6	1732429	1732434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854137
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28650	NC_021822	TGC	2	6	1732990	1732995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854448
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28653	NC_021822	TGCT	2	8	1733241	1733248	0 %	50 %	25 %	25 %	525854448
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28693	NC_021822	GATT	2	8	1735773	1735780	25 %	50 %	25 %	0 %	525854140
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28701	NC_021822	TTTGG	2	10	1736175	1736184	0 %	60 %	40 %	0 %	525854140
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28718	NC_021822	CAA	2	6	1737177	1737182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854141
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28731	NC_021822	GC	3	6	1737969	1737974	0 %	0 %	50 %	50 %	525854142
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28733	NC_021822	GC	4	8	1738094	1738101	0 %	0 %	50 %	50 %	525854142
28734	NC_021822	CTTC	2	8	1738181	1738188	0 %	50 %	0 %	50 %	525854142
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28845	NC_021822	CAAC	2	8	1743742	1743749	50 %	0 %	0 %	50 %	525854147
28846	NC_021822	CGG	2	6	1743754	1743759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854147
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28850	NC_021822	GC	3	6	1743921	1743926	0 %	0 %	50 %	50 %	525854147
28851	NC_021822	TGG	2	6	1743949	1743954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854148
28852	NC_021822	TTA	2	6	1743985	1743990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854148
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28861	NC_021822	TGG	2	6	1744367	1744372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854148
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28952	NC_021822	GCG	2	6	1749146	1749151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854154
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28964	NC_021822	A	6	6	1749781	1749786	100 %	0 %	0 %	0 %	525854154
28965	NC_021822	TGC	2	6	1749787	1749792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854154
28966	NC_021822	CGA	2	6	1749795	1749800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854154
28967	NC_021822	GCCA	2	8	1749916	1749923	25 %	0 %	25 %	50 %	525854154
28968	NC_021822	CCA	2	6	1749925	1749930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854154
28969	NC_021822	CAT	2	6	1749931	1749936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854154
28970	NC_021822	TCC	2	6	1749940	1749945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854154
28971	NC_021822	GAAG	2	8	1749951	1749958	50 %	0 %	50 %	0 %	525854154
28972	NC_021822	CGA	2	6	1749964	1749969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854154
28973	NC_021822	GCG	2	6	1749979	1749984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854154
28974	NC_021822	AGAT	2	8	1750016	1750023	50 %	25 %	25 %	0 %	525854154
28975	NC_021822	ATC	2	6	1750031	1750036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854154
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28978	NC_021822	GAC	2	6	1750579	1750584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854155
28979	NC_021822	TTC	2	6	1750762	1750767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854155
28980	NC_021822	A	6	6	1750879	1750884	100 %	0 %	0 %	0 %	525854156
28981	NC_021822	GGC	2	6	1750905	1750910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854156
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28983	NC_021822	CGAC	2	8	1750988	1750995	25 %	0 %	25 %	50 %	525854156
28984	NC_021822	CGG	2	6	1751109	1751114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854156
28985	NC_021822	TAC	2	6	1751149	1751154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854156
28986	NC_021822	AAG	2	6	1751246	1751251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854156
28987	NC_021822	TGA	2	6	1751345	1751350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854156
28988	NC_021822	ACGA	2	8	1751374	1751381	50 %	0 %	25 %	25 %	525854156
28989	NC_021822	ACGGC	2	10	1751486	1751495	20 %	0 %	40 %	40 %	525854156
28990	NC_021822	ATG	2	6	1751528	1751533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854156
28991	NC_021822	CTT	2	6	1751640	1751645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854156
28992	NC_021822	TGC	2	6	1751694	1751699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854156
28993	NC_021822	CTT	2	6	1751762	1751767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854156
28994	NC_021822	ACT	2	6	1751813	1751818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854156
28995	NC_021822	CGG	2	6	1751873	1751878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854156
28996	NC_021822	GTT	2	6	1751883	1751888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854156
28997	NC_021822	GCG	2	6	1751912	1751917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854156
28998	NC_021822	CAAA	2	8	1751957	1751964	75 %	0 %	0 %	25 %	525854156
28999	NC_021822	GTT	2	6	1751995	1752000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854156
29000	NC_021822	CAT	2	6	1752120	1752125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854156

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