MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28001	NC_021822	CGC	2	6	1691948	1691953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854098
28002	NC_021822	GAC	2	6	1692055	1692060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854098
28003	NC_021822	CAC	2	6	1692180	1692185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854099
28004	NC_021822	GTT	2	6	1692186	1692191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854099
28005	NC_021822	TTGT	2	8	1692192	1692199	0 %	75 %	25 %	0 %	525854099
28006	NC_021822	TAC	2	6	1692238	1692243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854099
28007	NC_021822	TTC	2	6	1692286	1692291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854099
28008	NC_021822	GTT	2	6	1692309	1692314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854099
28009	NC_021822	TGT	2	6	1692365	1692370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854099
28010	NC_021822	TAAT	2	8	1692377	1692384	50 %	50 %	0 %	0 %	525854099
28011	NC_021822	CTG	2	6	1692448	1692453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854099
28012	NC_021822	TTATTT	2	12	1692468	1692479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525854099
28013	NC_021822	AAG	2	6	1692494	1692499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854099
28014	NC_021822	AG	3	6	1692519	1692524	50 %	0 %	50 %	0 %	525854099
28015	NC_021822	CAGC	2	8	1692567	1692574	25 %	0 %	25 %	50 %	525854099
28016	NC_021822	CAAA	2	8	1692666	1692673	75 %	0 %	0 %	25 %	525854099
28017	NC_021822	CAC	2	6	1692732	1692737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854099
28018	NC_021822	TTGA	2	8	1692757	1692764	25 %	50 %	25 %	0 %	525854099
28019	NC_021822	A	6	6	1692782	1692787	100 %	0 %	0 %	0 %	525854099
28020	NC_021822	AAG	2	6	1692827	1692832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854099
28021	NC_021822	GAT	2	6	1692858	1692863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854099
28022	NC_021822	ATT	2	6	1692889	1692894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854099
28023	NC_021822	AGC	2	6	1693046	1693051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854099
28024	NC_021822	GGT	2	6	1693108	1693113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854099
28025	NC_021822	TAAG	2	8	1693142	1693149	50 %	25 %	25 %	0 %	525854099
28026	NC_021822	GAT	2	6	1693190	1693195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854100
28027	NC_021822	CAT	2	6	1693211	1693216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854100
28028	NC_021822	ATG	2	6	1693422	1693427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854100
28029	NC_021822	ACA	2	6	1693548	1693553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854100
28030	NC_021822	AAC	2	6	1693581	1693586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854100
28031	NC_021822	TCATC	2	10	1693657	1693666	20 %	40 %	0 %	40 %	525854100
28032	NC_021822	GAA	2	6	1693697	1693702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854100
28033	NC_021822	AAGGG	2	10	1693728	1693737	40 %	0 %	60 %	0 %	525854100
28034	NC_021822	GTG	2	6	1693829	1693834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854100
28035	NC_021822	AGTAA	2	10	1693850	1693859	60 %	20 %	20 %	0 %	525854100
28036	NC_021822	GAA	2	6	1693875	1693880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854100
28037	NC_021822	TGTT	2	8	1693881	1693888	0 %	75 %	25 %	0 %	525854100
28038	NC_021822	GTTT	2	8	1693932	1693939	0 %	75 %	25 %	0 %	525854100
28039	NC_021822	TCT	2	6	1694071	1694076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854101
28040	NC_021822	ATT	2	6	1694084	1694089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854101
28041	NC_021822	TGG	2	6	1694202	1694207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854101
28042	NC_021822	CAT	2	6	1694314	1694319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854101
28043	NC_021822	ACTC	2	8	1694349	1694356	25 %	25 %	0 %	50 %	525854101
28044	NC_021822	GGCTT	2	10	1694380	1694389	0 %	40 %	40 %	20 %	525854101
28045	NC_021822	CGG	2	6	1694412	1694417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854101
28046	NC_021822	CAT	2	6	1694418	1694423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854101
28047	NC_021822	GTTT	2	8	1694429	1694436	0 %	75 %	25 %	0 %	525854101
28048	NC_021822	GGC	2	6	1694459	1694464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854101
28049	NC_021822	T	6	6	1694523	1694528	0 %	100 %	0 %	0 %	525854101
28050	NC_021822	TGGG	2	8	1694569	1694576	0 %	25 %	75 %	0 %	525854101
28051	NC_021822	AAT	2	6	1694660	1694665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854101
28052	NC_021822	AAT	2	6	1694791	1694796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854102
28053	NC_021822	CAT	2	6	1694814	1694819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854102
28054	NC_021822	TGG	3	9	1694919	1694927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854102
28055	NC_021822	GAA	2	6	1694965	1694970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854102
28056	NC_021822	GCG	2	6	1694988	1694993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854102
28057	NC_021822	T	6	6	1695029	1695034	0 %	100 %	0 %	0 %	525854102
28058	NC_021822	GGTT	2	8	1695070	1695077	0 %	50 %	50 %	0 %	525854102
28059	NC_021822	T	6	6	1695175	1695180	0 %	100 %	0 %	0 %	525854102
28060	NC_021822	T	6	6	1695185	1695190	0 %	100 %	0 %	0 %	525854102
28061	NC_021822	AGTTC	2	10	1695213	1695222	20 %	40 %	20 %	20 %	525854102
28062	NC_021822	TGG	2	6	1695243	1695248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854102
28063	NC_021822	ATA	2	6	1695251	1695256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854102
28064	NC_021822	ACCA	2	8	1695395	1695402	50 %	0 %	0 %	50 %	525854103
28065	NC_021822	TTGG	2	8	1695455	1695462	0 %	50 %	50 %	0 %	525854103
28066	NC_021822	ACT	2	6	1695479	1695484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854103
28067	NC_021822	TGC	2	6	1695486	1695491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854103
28068	NC_021822	GA	3	6	1695511	1695516	50 %	0 %	50 %	0 %	525854103
28069	NC_021822	TTC	2	6	1695539	1695544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854103
28070	NC_021822	GCT	2	6	1695591	1695596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854103
28071	NC_021822	GCAAC	2	10	1695607	1695616	40 %	0 %	20 %	40 %	525854103
28072	NC_021822	GGC	2	6	1695620	1695625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854103
28073	NC_021822	GC	4	8	1695624	1695631	0 %	0 %	50 %	50 %	525854103
28074	NC_021822	CG	3	6	1695652	1695657	0 %	0 %	50 %	50 %	525854103
28075	NC_021822	CTA	2	6	1695778	1695783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854103
28076	NC_021822	GCAA	2	8	1695840	1695847	50 %	0 %	25 %	25 %	525854103
28077	NC_021822	CGA	2	6	1695985	1695990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854103
28078	NC_021822	TTG	2	6	1696001	1696006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854103
28079	NC_021822	CTG	2	6	1696036	1696041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854103
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28081	NC_021822	TTC	2	6	1696115	1696120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854103
28082	NC_021822	TCG	2	6	1696140	1696145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854103
28083	NC_021822	TGT	2	6	1696168	1696173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854103
28084	NC_021822	CGA	2	6	1696183	1696188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854103
28085	NC_021822	CTT	2	6	1696189	1696194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854103
28086	NC_021822	TGA	2	6	1696216	1696221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854103
28087	NC_021822	CAA	2	6	1696237	1696242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854103
28088	NC_021822	ATG	2	6	1696368	1696373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854103
28089	NC_021822	TCTTG	2	10	1696672	1696681	0 %	60 %	20 %	20 %	525854103
28090	NC_021822	CTT	2	6	1696807	1696812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854103
28091	NC_021822	GAGC	2	8	1696851	1696858	25 %	0 %	50 %	25 %	525854103
28092	NC_021822	T	6	6	1696886	1696891	0 %	100 %	0 %	0 %	525854103
28093	NC_021822	CAT	2	6	1696898	1696903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854103
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28095	NC_021822	CAT	2	6	1696967	1696972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854103
28096	NC_021822	ATG	2	6	1696998	1697003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854103
28097	NC_021822	AGC	2	6	1697229	1697234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854104
28098	NC_021822	TGA	2	6	1697328	1697333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854104
28099	NC_021822	GTG	2	6	1697346	1697351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854104
28100	NC_021822	CAAC	2	8	1697356	1697363	50 %	0 %	0 %	50 %	525854104
28101	NC_021822	CAA	2	6	1697370	1697375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854104
28102	NC_021822	GAG	2	6	1697407	1697412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525854104
28103	NC_021822	CGT	2	6	1697580	1697585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854104
28104	NC_021822	CATTG	2	10	1697618	1697627	20 %	40 %	20 %	20 %	525854105
28105	NC_021822	GCT	2	6	1697630	1697635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854105
28106	NC_021822	GCT	2	6	1697648	1697653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854105
28107	NC_021822	CTT	2	6	1697668	1697673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854105
28108	NC_021822	TGC	2	6	1697685	1697690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854105
28109	NC_021822	TGC	2	6	1697697	1697702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854105
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28111	NC_021822	GCA	2	6	1697928	1697933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854105
28112	NC_021822	TCT	3	9	1698003	1698011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854105
28113	NC_021822	GCA	2	6	1698064	1698069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854105
28114	NC_021822	GT	3	6	1698072	1698077	0 %	50 %	50 %	0 %	525854105
28115	NC_021822	GTT	2	6	1698134	1698139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854105
28116	NC_021822	ATGG	2	8	1698182	1698189	25 %	25 %	50 %	0 %	525854105
28117	NC_021822	CGC	2	6	1698223	1698228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854105
28118	NC_021822	GCT	2	6	1698302	1698307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854105
28119	NC_021822	GTT	2	6	1698339	1698344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854105
28120	NC_021822	CTG	2	6	1698376	1698381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854105
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28122	NC_021822	GTG	2	6	1698725	1698730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854106
28123	NC_021822	TTA	2	6	1698766	1698771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854106
28124	NC_021822	CGT	2	6	1698805	1698810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854106
28125	NC_021822	CTG	2	6	1698818	1698823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854106
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28200	NC_021822	CCA	2	6	1703069	1703074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854445
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28219	NC_021822	AAAG	2	8	1704355	1704362	75 %	0 %	25 %	0 %	525854110
28220	NC_021822	ATT	2	6	1704380	1704385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854110
28221	NC_021822	TTG	2	6	1704386	1704391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854110
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28223	NC_021822	AGC	2	6	1704428	1704433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854110
28224	NC_021822	TGA	2	6	1704450	1704455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854110
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28226	NC_021822	TGGTG	2	10	1704484	1704493	0 %	40 %	60 %	0 %	525854110
28227	NC_021822	CAT	2	6	1704502	1704507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854110
28228	NC_021822	ATC	2	6	1704644	1704649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854110
28229	NC_021822	TAC	2	6	1704686	1704691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854110
28230	NC_021822	GCA	2	6	1704711	1704716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854110
28231	NC_021822	ACG	2	6	1704720	1704725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854110
28232	NC_021822	CGG	2	6	1704726	1704731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854110
28233	NC_021822	TGGTTT	2	12	1704751	1704762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854110
28234	NC_021822	TGA	2	6	1704783	1704788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854110
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28239	NC_021822	A	6	6	1705104	1705109	100 %	0 %	0 %	0 %	525854111
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28243	NC_021822	ACT	2	6	1705342	1705347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854111
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28318	NC_021822	ATCC	2	8	1711103	1711110	25 %	25 %	0 %	50 %	525854118
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28323	NC_021822	TTGA	2	8	1711388	1711395	25 %	50 %	25 %	0 %	525854118
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28330	NC_021822	CGT	2	6	1711607	1711612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854118
28331	NC_021822	TCG	2	6	1711660	1711665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854118
28332	NC_021822	CGAAT	2	10	1711689	1711698	40 %	20 %	20 %	20 %	525854118
28333	NC_021822	GCG	2	6	1711785	1711790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854118
28334	NC_021822	CAACG	2	10	1711799	1711808	40 %	0 %	20 %	40 %	525854118
28335	NC_021822	GAA	2	6	1711883	1711888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854118
28336	NC_021822	CGT	2	6	1711922	1711927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854118
28337	NC_021822	AGC	2	6	1711962	1711967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854118
28338	NC_021822	CAA	2	6	1712066	1712071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854118
28339	NC_021822	GTG	2	6	1712124	1712129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854118
28340	NC_021822	T	6	6	1712185	1712190	0 %	100 %	0 %	0 %	525854118
28341	NC_021822	AAC	2	6	1712246	1712251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854118
28342	NC_021822	CAA	2	6	1712267	1712272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854118
28343	NC_021822	GTG	2	6	1712366	1712371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854118
28344	NC_021822	A	6	6	1712372	1712377	100 %	0 %	0 %	0 %	525854118
28345	NC_021822	AATC	2	8	1712453	1712460	50 %	25 %	0 %	25 %	525854118
28346	NC_021822	CCAAG	2	10	1712561	1712570	40 %	0 %	20 %	40 %	525854119
28347	NC_021822	GAT	2	6	1712587	1712592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854119
28348	NC_021822	ATTTG	2	10	1712658	1712667	20 %	60 %	20 %	0 %	525854119
28349	NC_021822	ACTG	2	8	1712871	1712878	25 %	25 %	25 %	25 %	525854119
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28452	NC_021822	GGT	2	6	1719608	1719613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854126
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28465	NC_021822	GCA	2	6	1720267	1720272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854127
28466	NC_021822	CAA	2	6	1720415	1720420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854127
28467	NC_021822	GTT	2	6	1720437	1720442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854127
28468	NC_021822	CTG	2	6	1720460	1720465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854127
28469	NC_021822	GTCA	2	8	1720512	1720519	25 %	25 %	25 %	25 %	525854127
28470	NC_021822	CTG	2	6	1720559	1720564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854127
28471	NC_021822	GCTT	2	8	1720572	1720579	0 %	50 %	25 %	25 %	525854127
28472	NC_021822	TCA	2	6	1720888	1720893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854127
28473	NC_021822	GTT	2	6	1720983	1720988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854127
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28477	NC_021822	CTG	2	6	1721219	1721224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854127
28478	NC_021822	CGC	2	6	1721264	1721269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854127
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28483	NC_021822	CTG	2	6	1721558	1721563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854127
28484	NC_021822	CCG	2	6	1721569	1721574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854127
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28492	NC_021822	GTAC	2	8	1722039	1722046	25 %	25 %	25 %	25 %	525854127
28493	NC_021822	ACG	2	6	1722052	1722057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854127
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