MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27501	NC_021822	GAT	2	6	1662732	1662737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854076
27502	NC_021822	GAA	2	6	1662775	1662780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854076
27503	NC_021822	CAA	2	6	1662793	1662798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854076
27504	NC_021822	A	7	7	1662824	1662830	100 %	0 %	0 %	0 %	525854076
27505	NC_021822	CAAA	2	8	1662843	1662850	75 %	0 %	0 %	25 %	525854076
27506	NC_021822	T	6	6	1662867	1662872	0 %	100 %	0 %	0 %	525854076
27507	NC_021822	TTG	2	6	1662928	1662933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854076
27508	NC_021822	TGTT	2	8	1662962	1662969	0 %	75 %	25 %	0 %	525854076
27509	NC_021822	GCA	2	6	1663074	1663079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854076
27510	NC_021822	GGC	2	6	1663087	1663092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854076
27511	NC_021822	TTTG	2	8	1663122	1663129	0 %	75 %	25 %	0 %	525854076
27512	NC_021822	CG	3	6	1663205	1663210	0 %	0 %	50 %	50 %	525854076
27513	NC_021822	GGC	2	6	1663233	1663238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854076
27514	NC_021822	ATC	2	6	1663240	1663245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854076
27515	NC_021822	GAT	2	6	1663285	1663290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854076
27516	NC_021822	CTT	2	6	1663344	1663349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854076
27517	NC_021822	ATC	2	6	1663351	1663356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854076
27518	NC_021822	CGG	2	6	1663365	1663370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854076
27519	NC_021822	GTT	2	6	1663395	1663400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854076
27520	NC_021822	TGC	2	6	1663428	1663433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854076
27521	NC_021822	CCA	2	6	1663476	1663481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854076
27522	NC_021822	TGG	2	6	1663557	1663562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854076
27523	NC_021822	A	6	6	1663603	1663608	100 %	0 %	0 %	0 %	525854076
27524	NC_021822	TAT	2	6	1663641	1663646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854076
27525	NC_021822	TGG	2	6	1663728	1663733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854076
27526	NC_021822	TGC	2	6	1663734	1663739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854076
27527	NC_021822	CTT	2	6	1663746	1663751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854076
27528	NC_021822	ATG	2	6	1663864	1663869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854076
27529	NC_021822	TTG	2	6	1663874	1663879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854076
27530	NC_021822	ACTT	2	8	1663918	1663925	25 %	50 %	0 %	25 %	525854076
27531	NC_021822	GCAGC	2	10	1664162	1664171	20 %	0 %	40 %	40 %	525854077
27532	NC_021822	ATG	2	6	1664241	1664246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854077
27533	NC_021822	ATC	2	6	1664324	1664329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854077
27534	NC_021822	TATG	2	8	1664405	1664412	25 %	50 %	25 %	0 %	525854077
27535	NC_021822	TGG	2	6	1664449	1664454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854077
27536	NC_021822	GC	3	6	1664525	1664530	0 %	0 %	50 %	50 %	525854077
27537	NC_021822	ACA	2	6	1664643	1664648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854077
27538	NC_021822	GTG	2	6	1664726	1664731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854077
27539	NC_021822	TAC	2	6	1664807	1664812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854077
27540	NC_021822	CGG	2	6	1664904	1664909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854077
27541	NC_021822	TTC	2	6	1665031	1665036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854077
27542	NC_021822	GTT	2	6	1665053	1665058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854077
27543	NC_021822	AAG	2	6	1665090	1665095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854077
27544	NC_021822	CTA	2	6	1665127	1665132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854077
27545	NC_021822	TTC	2	6	1665268	1665273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854078
27546	NC_021822	CTGT	2	8	1665509	1665516	0 %	50 %	25 %	25 %	525854078
27547	NC_021822	CAA	2	6	1665533	1665538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854078
27548	NC_021822	ATG	3	9	1665563	1665571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854078
27549	NC_021822	ATG	2	6	1665662	1665667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854078
27550	NC_021822	TTTC	2	8	1665684	1665691	0 %	75 %	0 %	25 %	525854078
27551	NC_021822	AGACAA	2	12	1665826	1665837	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525854078
27552	NC_021822	TC	3	6	1665864	1665869	0 %	50 %	0 %	50 %	525854078
27553	NC_021822	CAT	2	6	1665871	1665876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854078
27554	NC_021822	CCA	4	12	1665881	1665892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854078
27555	NC_021822	AT	3	6	1665968	1665973	50 %	50 %	0 %	0 %	525854079
27556	NC_021822	TTC	2	6	1666003	1666008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854079
27557	NC_021822	GCA	2	6	1666075	1666080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854079
27558	NC_021822	GTT	2	6	1666090	1666095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854079
27559	NC_021822	TGGAC	2	10	1666177	1666186	20 %	20 %	40 %	20 %	525854079
27560	NC_021822	TGC	2	6	1666219	1666224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854079
27561	NC_021822	CTG	2	6	1666226	1666231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854079
27562	NC_021822	CTC	2	6	1666313	1666318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854079
27563	NC_021822	TCAA	2	8	1666455	1666462	50 %	25 %	0 %	25 %	525854079
27564	NC_021822	AAG	2	6	1666558	1666563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854079
27565	NC_021822	CGC	2	6	1666568	1666573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854079
27566	NC_021822	CTG	2	6	1666655	1666660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854079
27567	NC_021822	CTC	2	6	1666811	1666816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854079
27568	NC_021822	ATCAC	2	10	1666996	1667005	40 %	20 %	0 %	40 %	525854080
27569	NC_021822	ATC	2	6	1667016	1667021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854080
27570	NC_021822	ATC	2	6	1667053	1667058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854080
27571	NC_021822	A	6	6	1667059	1667064	100 %	0 %	0 %	0 %	525854080
27572	NC_021822	TTG	2	6	1667091	1667096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854080
27573	NC_021822	ATG	2	6	1667199	1667204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854080
27574	NC_021822	TC	3	6	1667251	1667256	0 %	50 %	0 %	50 %	525854080
27575	NC_021822	GAA	2	6	1667259	1667264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854080
27576	NC_021822	GGT	2	6	1667309	1667314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854080
27577	NC_021822	GAT	2	6	1667345	1667350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854080
27578	NC_021822	GGT	3	9	1667429	1667437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854080
27579	NC_021822	AAC	2	6	1667442	1667447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854080
27580	NC_021822	TGG	2	6	1667505	1667510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854080
27581	NC_021822	AAGC	2	8	1667532	1667539	50 %	0 %	25 %	25 %	525854080
27582	NC_021822	AGC	2	6	1667556	1667561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854080
27583	NC_021822	ACT	2	6	1667581	1667586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854080
27584	NC_021822	CTT	2	6	1667689	1667694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854081
27585	NC_021822	ATTG	2	8	1667722	1667729	25 %	50 %	25 %	0 %	525854081
27586	NC_021822	GAAC	2	8	1667735	1667742	50 %	0 %	25 %	25 %	525854081
27587	NC_021822	TCG	2	6	1667775	1667780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854081
27588	NC_021822	TCT	2	6	1667835	1667840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854081
27589	NC_021822	GCT	2	6	1667896	1667901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854081
27590	NC_021822	GTT	2	6	1667903	1667908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854081
27591	NC_021822	TCA	2	6	1667917	1667922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854081
27592	NC_021822	TTC	2	6	1667939	1667944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854081
27593	NC_021822	CATC	2	8	1667998	1668005	25 %	25 %	0 %	50 %	525854081
27594	NC_021822	CTT	2	6	1668010	1668015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854081
27595	NC_021822	GC	3	6	1668071	1668076	0 %	0 %	50 %	50 %	525854081
27596	NC_021822	CAC	2	6	1668128	1668133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854081
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27598	NC_021822	TGGC	2	8	1668332	1668339	0 %	25 %	50 %	25 %	525854081
27599	NC_021822	TCAC	2	8	1668342	1668349	25 %	25 %	0 %	50 %	525854081
27600	NC_021822	GTC	2	6	1668383	1668388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854081
27601	NC_021822	GCC	2	6	1668419	1668424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854081
27602	NC_021822	CAAT	2	8	1668598	1668605	50 %	25 %	0 %	25 %	525854081
27603	NC_021822	TGCT	2	8	1668618	1668625	0 %	50 %	25 %	25 %	525854081
27604	NC_021822	GGA	2	6	1668675	1668680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525854081
27605	NC_021822	GCG	2	6	1668731	1668736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854081
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27607	NC_021822	CAAC	2	8	1668949	1668956	50 %	0 %	0 %	50 %	525854081
27608	NC_021822	TTC	2	6	1668960	1668965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854081
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27611	NC_021822	GCGTT	2	10	1669113	1669122	0 %	40 %	40 %	20 %	525854081
27612	NC_021822	TAA	2	6	1669177	1669182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854081
27613	NC_021822	CAA	3	9	1669201	1669209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854081
27614	NC_021822	CGA	2	6	1669231	1669236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854081
27615	NC_021822	GCT	2	6	1669237	1669242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854081
27616	NC_021822	CAC	2	6	1669267	1669272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854081
27617	NC_021822	GCGTT	2	10	1669766	1669775	0 %	40 %	40 %	20 %	525854442
27618	NC_021822	CAA	2	6	1669793	1669798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854442
27619	NC_021822	CTT	2	6	1669812	1669817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854442
27620	NC_021822	TTC	2	6	1669837	1669842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854442
27621	NC_021822	ATC	2	6	1669902	1669907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854442
27622	NC_021822	TGT	2	6	1669947	1669952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854442
27623	NC_021822	CA	3	6	1669956	1669961	50 %	0 %	0 %	50 %	525854442
27624	NC_021822	CAC	2	6	1669981	1669986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854442
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27627	NC_021822	CAA	2	6	1670186	1670191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854442
27628	NC_021822	AAC	2	6	1670197	1670202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854442
27629	NC_021822	GGC	2	6	1670207	1670212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854442
27630	NC_021822	TTG	2	6	1670252	1670257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854442
27631	NC_021822	GATA	2	8	1670298	1670305	50 %	25 %	25 %	0 %	525854442
27632	NC_021822	AGT	2	6	1670334	1670339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854442
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27634	NC_021822	GCCT	2	8	1670416	1670423	0 %	25 %	25 %	50 %	525854442
27635	NC_021822	ACCAA	2	10	1670430	1670439	60 %	0 %	0 %	40 %	525854442
27636	NC_021822	TTGA	2	8	1670441	1670448	25 %	50 %	25 %	0 %	525854442
27637	NC_021822	GAC	2	6	1670479	1670484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854442
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27639	NC_021822	CTC	2	6	1670531	1670536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854442
27640	NC_021822	GAT	2	6	1670555	1670560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854442
27641	NC_021822	TGT	2	6	1670593	1670598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854442
27642	NC_021822	AAAGC	2	10	1670658	1670667	60 %	0 %	20 %	20 %	525854442
27643	NC_021822	GTA	2	6	1670674	1670679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854442
27644	NC_021822	GTTGG	2	10	1670681	1670690	0 %	40 %	60 %	0 %	525854442
27645	NC_021822	TGCT	2	8	1670699	1670706	0 %	50 %	25 %	25 %	525854442
27646	NC_021822	GCG	2	6	1670752	1670757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854442
27647	NC_021822	ATC	2	6	1670807	1670812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854442
27648	NC_021822	GCT	2	6	1670830	1670835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854442
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27650	NC_021822	GAT	2	6	1670950	1670955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854442
27651	NC_021822	TTTG	2	8	1670968	1670975	0 %	75 %	25 %	0 %	525854442
27652	NC_021822	CAA	2	6	1671014	1671019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854442
27653	NC_021822	ACA	2	6	1671040	1671045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854442
27654	NC_021822	TCTT	2	8	1671096	1671103	0 %	75 %	0 %	25 %	525854442
27655	NC_021822	GTAA	2	8	1671120	1671127	50 %	25 %	25 %	0 %	525854442
27656	NC_021822	GTAA	2	8	1671177	1671184	50 %	25 %	25 %	0 %	525854442
27657	NC_021822	CAA	2	6	1671206	1671211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854442
27658	NC_021822	GCT	2	6	1671236	1671241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854442
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27667	NC_021822	TG	3	6	1671657	1671662	0 %	50 %	50 %	0 %	525854442
27668	NC_021822	GTTTGA	2	12	1671663	1671674	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525854442
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27670	NC_021822	TGAAG	2	10	1671762	1671771	40 %	20 %	40 %	0 %	525854442
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27675	NC_021822	CTT	2	6	1672115	1672120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854082
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27682	NC_021822	CGA	2	6	1672591	1672596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854082
27683	NC_021822	TGC	2	6	1672803	1672808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854082
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27714	NC_021822	T	6	6	1674105	1674110	0 %	100 %	0 %	0 %	525854083
27715	NC_021822	CAG	2	6	1674159	1674164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854083
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27718	NC_021822	CAA	2	6	1674900	1674905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854443
27719	NC_021822	AG	3	6	1674916	1674921	50 %	0 %	50 %	0 %	525854443
27720	NC_021822	TGA	2	6	1675381	1675386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854084
27721	NC_021822	A	6	6	1675386	1675391	100 %	0 %	0 %	0 %	525854084
27722	NC_021822	AAG	2	6	1675408	1675413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854084
27723	NC_021822	CTG	2	6	1675452	1675457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854084
27724	NC_021822	CAG	2	6	1675540	1675545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854084
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27726	NC_021822	TTG	2	6	1675575	1675580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854084
27727	NC_021822	TGC	2	6	1675606	1675611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854084
27728	NC_021822	TGC	2	6	1675701	1675706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854084
27729	NC_021822	CAA	2	6	1675749	1675754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854084
27730	NC_021822	TTG	2	6	1675835	1675840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854084
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27732	NC_021822	ATG	2	6	1675868	1675873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854084
27733	NC_021822	CAC	2	6	1675941	1675946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854084
27734	NC_021822	GAT	2	6	1676042	1676047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854084
27735	NC_021822	TGA	2	6	1676049	1676054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854084
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27848	NC_021822	ATT	2	6	1683561	1683566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854090
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27955	NC_021822	CAA	2	6	1689441	1689446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854096
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27959	NC_021822	TCTA	2	8	1689542	1689549	25 %	50 %	0 %	25 %	525854096
27960	NC_021822	GTT	2	6	1689621	1689626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854096
27961	NC_021822	ATC	2	6	1689706	1689711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854096
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