MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_021822	TCA	2	6	1631430	1631435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854049
27002	NC_021822	TTGG	2	8	1631477	1631484	0 %	50 %	50 %	0 %	525854049
27003	NC_021822	TTG	2	6	1631519	1631524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854049
27004	NC_021822	ATG	2	6	1631535	1631540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854049
27005	NC_021822	GAA	2	6	1631543	1631548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854049
27006	NC_021822	GCA	2	6	1631550	1631555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854049
27007	NC_021822	CAACC	2	10	1631677	1631686	40 %	0 %	0 %	60 %	525854049
27008	NC_021822	CGA	2	6	1631712	1631717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854049
27009	NC_021822	TGG	2	6	1631815	1631820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854049
27010	NC_021822	TCAGCG	2	12	1631821	1631832	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525854049
27011	NC_021822	GT	3	6	1631847	1631852	0 %	50 %	50 %	0 %	525854049
27012	NC_021822	CGC	2	6	1631865	1631870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854049
27013	NC_021822	CGT	2	6	1632034	1632039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854049
27014	NC_021822	GCAC	2	8	1632048	1632055	25 %	0 %	25 %	50 %	525854049
27015	NC_021822	GAA	2	6	1632125	1632130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854049
27016	NC_021822	CAA	2	6	1632140	1632145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854049
27017	NC_021822	CTT	2	6	1632147	1632152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854049
27018	NC_021822	GAA	2	6	1632943	1632948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854050
27019	NC_021822	TGA	2	6	1632971	1632976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854050
27020	NC_021822	GGCG	2	8	1633029	1633036	0 %	0 %	75 %	25 %	525854050
27021	NC_021822	GGC	2	6	1633129	1633134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854050
27022	NC_021822	TGG	2	6	1633149	1633154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854050
27023	NC_021822	TCG	2	6	1633187	1633192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854050
27024	NC_021822	CAT	2	6	1633209	1633214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854050
27025	NC_021822	AAG	2	6	1633241	1633246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854050
27026	NC_021822	ATG	2	6	1633276	1633281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854050
27027	NC_021822	CAT	2	6	1633308	1633313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854050
27028	NC_021822	A	6	6	1633364	1633369	100 %	0 %	0 %	0 %	525854050
27029	NC_021822	GGCT	2	8	1633387	1633394	0 %	25 %	50 %	25 %	525854050
27030	NC_021822	AGT	2	6	1633395	1633400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854050
27031	NC_021822	GGT	2	6	1633417	1633422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854050
27032	NC_021822	TTA	2	6	1633433	1633438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854050
27033	NC_021822	CAC	2	6	1633590	1633595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854051
27034	NC_021822	TTC	2	6	1633669	1633674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854051
27035	NC_021822	AG	3	6	1633707	1633712	50 %	0 %	50 %	0 %	525854051
27036	NC_021822	ATGA	2	8	1633800	1633807	50 %	25 %	25 %	0 %	525854051
27037	NC_021822	CTT	2	6	1633871	1633876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854051
27038	NC_021822	GTTAA	2	10	1633915	1633924	40 %	40 %	20 %	0 %	525854051
27039	NC_021822	CGA	2	6	1633940	1633945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854051
27040	NC_021822	TGAA	2	8	1633962	1633969	50 %	25 %	25 %	0 %	525854051
27041	NC_021822	TCA	2	6	1634012	1634017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854051
27042	NC_021822	TGGC	2	8	1634445	1634452	0 %	25 %	50 %	25 %	525854052
27043	NC_021822	TGA	2	6	1634456	1634461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854052
27044	NC_021822	GAA	2	6	1634485	1634490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854052
27045	NC_021822	AGC	2	6	1634496	1634501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854052
27046	NC_021822	GGT	2	6	1634569	1634574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854053
27047	NC_021822	GCA	2	6	1634576	1634581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854053
27048	NC_021822	CAC	2	6	1634657	1634662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854053
27049	NC_021822	AT	4	8	1634747	1634754	50 %	50 %	0 %	0 %	525854053
27050	NC_021822	TC	3	6	1634761	1634766	0 %	50 %	0 %	50 %	525854053
27051	NC_021822	CAAC	2	8	1635131	1635138	50 %	0 %	0 %	50 %	525854054
27052	NC_021822	TCC	2	6	1635159	1635164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854054
27053	NC_021822	CAA	2	6	1635188	1635193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854054
27054	NC_021822	GATA	2	8	1635280	1635287	50 %	25 %	25 %	0 %	525854054
27055	NC_021822	CAG	2	6	1635305	1635310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854054
27056	NC_021822	GGCGT	2	10	1635317	1635326	0 %	20 %	60 %	20 %	525854054
27057	NC_021822	AGA	2	6	1635385	1635390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854054
27058	NC_021822	TGG	2	6	1635522	1635527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854054
27059	NC_021822	TCG	2	6	1635639	1635644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854054
27060	NC_021822	GAT	2	6	1635673	1635678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854055
27061	NC_021822	AAC	2	6	1635710	1635715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854055
27062	NC_021822	CCTA	2	8	1635759	1635766	25 %	25 %	0 %	50 %	525854055
27063	NC_021822	TCG	2	6	1635777	1635782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854055
27064	NC_021822	CGCGC	2	10	1635840	1635849	0 %	0 %	40 %	60 %	525854055
27065	NC_021822	TA	3	6	1635867	1635872	50 %	50 %	0 %	0 %	525854055
27066	NC_021822	TGA	2	6	1635937	1635942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854055
27067	NC_021822	TGA	2	6	1635990	1635995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854055
27068	NC_021822	AAC	2	6	1636071	1636076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854055
27069	NC_021822	TGA	2	6	1636090	1636095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854055
27070	NC_021822	CGT	2	6	1636100	1636105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854055
27071	NC_021822	T	6	6	1636231	1636236	0 %	100 %	0 %	0 %	525854056
27072	NC_021822	TGCTTC	2	12	1636274	1636285	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525854056
27073	NC_021822	ATG	2	6	1636293	1636298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854056
27074	NC_021822	AAT	2	6	1636377	1636382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854056
27075	NC_021822	GAAAC	2	10	1636590	1636599	60 %	0 %	20 %	20 %	525854057
27076	NC_021822	GAT	2	6	1636721	1636726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854057
27077	NC_021822	TAC	2	6	1636782	1636787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854057
27078	NC_021822	CGGT	2	8	1636822	1636829	0 %	25 %	50 %	25 %	525854057
27079	NC_021822	TGA	2	6	1636831	1636836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854057
27080	NC_021822	GAT	2	6	1636881	1636886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854057
27081	NC_021822	TGA	2	6	1636946	1636951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854057
27082	NC_021822	ACCA	2	8	1636989	1636996	50 %	0 %	0 %	50 %	525854057
27083	NC_021822	AACG	2	8	1637052	1637059	50 %	0 %	25 %	25 %	525854057
27084	NC_021822	CAAC	2	8	1637204	1637211	50 %	0 %	0 %	50 %	525854058
27085	NC_021822	GAT	2	6	1637301	1637306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854058
27086	NC_021822	AACC	2	8	1637332	1637339	50 %	0 %	0 %	50 %	525854058
27087	NC_021822	GCT	2	6	1637348	1637353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854058
27088	NC_021822	CCAC	2	8	1637374	1637381	25 %	0 %	0 %	75 %	525854058
27089	NC_021822	TAC	2	6	1637436	1637441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854058
27090	NC_021822	GCCC	2	8	1637466	1637473	0 %	0 %	25 %	75 %	525854058
27091	NC_021822	ATC	2	6	1637566	1637571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854058
27092	NC_021822	CTT	2	6	1637576	1637581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854058
27093	NC_021822	GAA	2	6	1637584	1637589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854058
27094	NC_021822	CTTG	2	8	1637606	1637613	0 %	50 %	25 %	25 %	525854058
27095	NC_021822	TCT	2	6	1637620	1637625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854058
27096	NC_021822	TGC	2	6	1637688	1637693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854058
27097	NC_021822	TAG	2	6	1637694	1637699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854058
27098	NC_021822	TCT	2	6	1637761	1637766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854058
27099	NC_021822	ACG	2	6	1637862	1637867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854058
27100	NC_021822	TG	3	6	1637918	1637923	0 %	50 %	50 %	0 %	525854058
27101	NC_021822	CAT	2	6	1637996	1638001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854058
27102	NC_021822	AGT	2	6	1638013	1638018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854058
27103	NC_021822	TGT	2	6	1638029	1638034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854058
27104	NC_021822	ACC	2	6	1638060	1638065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854058
27105	NC_021822	ATC	2	6	1638088	1638093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854058
27106	NC_021822	TGC	3	9	1638096	1638104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854058
27107	NC_021822	AGTC	2	8	1638125	1638132	25 %	25 %	25 %	25 %	525854058
27108	NC_021822	ACC	2	6	1638150	1638155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854058
27109	NC_021822	CA	3	6	1638174	1638179	50 %	0 %	0 %	50 %	525854058
27110	NC_021822	ACT	2	6	1638193	1638198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854058
27111	NC_021822	GAA	2	6	1638276	1638281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854058
27112	NC_021822	AGA	2	6	1638283	1638288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854058
27113	NC_021822	ACG	2	6	1638336	1638341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854058
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27115	NC_021822	CTG	2	6	1638470	1638475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854058
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27230	NC_021822	GAACT	2	10	1646859	1646868	40 %	20 %	20 %	20 %	525854064
27231	NC_021822	CGT	2	6	1647018	1647023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854064
27232	NC_021822	AGCC	2	8	1647028	1647035	25 %	0 %	25 %	50 %	525854064
27233	NC_021822	CTT	2	6	1647077	1647082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854064
27234	NC_021822	TCA	2	6	1647121	1647126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854064
27235	NC_021822	ACTG	2	8	1647281	1647288	25 %	25 %	25 %	25 %	525854064
27236	NC_021822	TTG	2	6	1647375	1647380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854064
27237	NC_021822	TTG	2	6	1647414	1647419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854064
27238	NC_021822	AATC	2	8	1647446	1647453	50 %	25 %	0 %	25 %	525854064
27239	NC_021822	GCA	2	6	1647644	1647649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854064
27240	NC_021822	GCC	2	6	1647714	1647719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854064
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27243	NC_021822	TTG	2	6	1647816	1647821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854064
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27246	NC_021822	CGA	2	6	1648036	1648041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854064
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27249	NC_021822	TATTG	2	10	1648134	1648143	20 %	60 %	20 %	0 %	525854064
27250	NC_021822	T	6	6	1648254	1648259	0 %	100 %	0 %	0 %	525854064
27251	NC_021822	ACC	2	6	1648260	1648265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854064
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27257	NC_021822	ACT	2	6	1648509	1648514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854065
27258	NC_021822	CAT	3	9	1648590	1648598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854065
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27327	NC_021822	TA	3	6	1652045	1652050	50 %	50 %	0 %	0 %	525854068
27328	NC_021822	TAC	2	6	1652121	1652126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854068
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27334	NC_021822	GCG	2	6	1652455	1652460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854068
27335	NC_021822	GATT	2	8	1652525	1652532	25 %	50 %	25 %	0 %	525854068
27336	NC_021822	CGT	2	6	1652551	1652556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854068
27337	NC_021822	GCT	2	6	1652572	1652577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854068
27338	NC_021822	GAA	2	6	1652583	1652588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854068
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27340	NC_021822	CACT	2	8	1652624	1652631	25 %	25 %	0 %	50 %	525854068
27341	NC_021822	ATG	2	6	1652677	1652682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854068
27342	NC_021822	AAG	2	6	1652720	1652725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854068
27343	NC_021822	AT	3	6	1652856	1652861	50 %	50 %	0 %	0 %	525854068
27344	NC_021822	CCA	2	6	1652957	1652962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854068
27345	NC_021822	TGA	2	6	1652979	1652984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854068
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27347	NC_021822	TGG	2	6	1653158	1653163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854068
27348	NC_021822	GTTG	2	8	1653264	1653271	0 %	50 %	50 %	0 %	525854068
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27450	NC_021822	AAAT	2	8	1659396	1659403	75 %	25 %	0 %	0 %	525854072
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27452	NC_021822	AGGTA	2	10	1659516	1659525	40 %	20 %	40 %	0 %	525854072
27453	NC_021822	AGAA	2	8	1659543	1659550	75 %	0 %	25 %	0 %	525854072
27454	NC_021822	T	6	6	1659591	1659596	0 %	100 %	0 %	0 %	525854072
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27456	NC_021822	GGCA	2	8	1659878	1659885	25 %	0 %	50 %	25 %	525854073
27457	NC_021822	GC	3	6	1659925	1659930	0 %	0 %	50 %	50 %	525854073
27458	NC_021822	AAG	2	6	1659932	1659937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854073
27459	NC_021822	ATG	2	6	1659961	1659966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854073
27460	NC_021822	CG	3	6	1660038	1660043	0 %	0 %	50 %	50 %	525854073
27461	NC_021822	CA	3	6	1660095	1660100	50 %	0 %	0 %	50 %	525854073
27462	NC_021822	ATTA	2	8	1660163	1660170	50 %	50 %	0 %	0 %	525854073
27463	NC_021822	TTGA	2	8	1660173	1660180	25 %	50 %	25 %	0 %	525854073
27464	NC_021822	GAT	2	6	1660555	1660560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854074
27465	NC_021822	CGA	2	6	1660737	1660742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854074
27466	NC_021822	TCT	2	6	1660787	1660792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854074
27467	NC_021822	AG	3	6	1660795	1660800	50 %	0 %	50 %	0 %	525854074
27468	NC_021822	TGG	2	6	1660986	1660991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854074
27469	NC_021822	ATC	2	6	1661050	1661055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854074
27470	NC_021822	AGC	2	6	1661225	1661230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854074
27471	NC_021822	GCC	2	6	1661231	1661236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854074
27472	NC_021822	CAA	2	6	1661250	1661255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854074
27473	NC_021822	ACA	2	6	1661327	1661332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854074
27474	NC_021822	A	6	6	1661341	1661346	100 %	0 %	0 %	0 %	525854074
27475	NC_021822	TAAA	2	8	1661349	1661356	75 %	25 %	0 %	0 %	525854074
27476	NC_021822	CAAAA	2	10	1661363	1661372	80 %	0 %	0 %	20 %	525854074
27477	NC_021822	CCAG	2	8	1661613	1661620	25 %	0 %	25 %	50 %	525854075
27478	NC_021822	TGC	2	6	1661653	1661658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854075
27479	NC_021822	TGG	2	6	1661759	1661764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854075
27480	NC_021822	GCGA	2	8	1661817	1661824	25 %	0 %	50 %	25 %	525854075
27481	NC_021822	TCC	2	6	1661828	1661833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854075
27482	NC_021822	TGG	2	6	1661876	1661881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854075
27483	NC_021822	AGA	2	6	1661915	1661920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854075
27484	NC_021822	GAC	2	6	1661940	1661945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854075
27485	NC_021822	TCACC	2	10	1661957	1661966	20 %	20 %	0 %	60 %	525854075
27486	NC_021822	GGT	2	6	1662021	1662026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854075
27487	NC_021822	TTG	2	6	1662124	1662129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854075
27488	NC_021822	TGG	2	6	1662247	1662252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854075
27489	NC_021822	CCA	2	6	1662262	1662267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854075
27490	NC_021822	TTG	2	6	1662298	1662303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854075
27491	NC_021822	AGA	2	6	1662326	1662331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854075
27492	NC_021822	CGC	2	6	1662428	1662433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854075
27493	NC_021822	GCA	2	6	1662453	1662458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854075
27494	NC_021822	ATA	2	6	1662463	1662468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854075
27495	NC_021822	AAT	2	6	1662473	1662478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854075
27496	NC_021822	GTGG	2	8	1662547	1662554	0 %	25 %	75 %	0 %	525854076
27497	NC_021822	CAG	2	6	1662555	1662560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854076
27498	NC_021822	TC	3	6	1662604	1662609	0 %	50 %	0 %	50 %	525854076
27499	NC_021822	GTG	2	6	1662667	1662672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854076
27500	NC_021822	CAA	2	6	1662718	1662723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854076

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