MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_021822	ACG	2	6	1572818	1572823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854003
26002	NC_021822	GTTG	2	8	1572847	1572854	0 %	50 %	50 %	0 %	525854003
26003	NC_021822	CAC	2	6	1572855	1572860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854003
26004	NC_021822	GTG	2	6	1572902	1572907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854003
26005	NC_021822	ATC	2	6	1572908	1572913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854003
26006	NC_021822	TG	3	6	1572914	1572919	0 %	50 %	50 %	0 %	525854003
26007	NC_021822	GCG	2	6	1573002	1573007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854003
26008	NC_021822	CAG	2	6	1573091	1573096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854003
26009	NC_021822	GAA	2	6	1573124	1573129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854003
26010	NC_021822	CG	3	6	1573160	1573165	0 %	0 %	50 %	50 %	525854003
26011	NC_021822	TCTGA	2	10	1573178	1573187	20 %	40 %	20 %	20 %	525854003
26012	NC_021822	CAA	2	6	1573196	1573201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854003
26013	NC_021822	TGG	2	6	1573212	1573217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854003
26014	NC_021822	GCAGA	2	10	1573268	1573277	40 %	0 %	40 %	20 %	525854003
26015	NC_021822	CA	3	6	1573309	1573314	50 %	0 %	0 %	50 %	525854003
26016	NC_021822	CAA	2	6	1573354	1573359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854003
26017	NC_021822	TCT	2	6	1573364	1573369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854003
26018	NC_021822	AGCG	2	8	1573381	1573388	25 %	0 %	50 %	25 %	525854003
26019	NC_021822	GCG	2	6	1573499	1573504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854003
26020	NC_021822	CA	4	8	1573570	1573577	50 %	0 %	0 %	50 %	525854003
26021	NC_021822	CGA	2	6	1573599	1573604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854003
26022	NC_021822	GCA	2	6	1573615	1573620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854003
26023	NC_021822	CA	3	6	1573624	1573629	50 %	0 %	0 %	50 %	525854003
26024	NC_021822	CAT	2	6	1573642	1573647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854003
26025	NC_021822	GCA	2	6	1573697	1573702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854003
26026	NC_021822	CA	3	6	1573804	1573809	50 %	0 %	0 %	50 %	525854003
26027	NC_021822	ACGTC	2	10	1573812	1573821	20 %	20 %	20 %	40 %	525854003
26028	NC_021822	GAA	2	6	1573859	1573864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854003
26029	NC_021822	AATC	2	8	1573871	1573878	50 %	25 %	0 %	25 %	525854003
26030	NC_021822	GCTGA	2	10	1573880	1573889	20 %	20 %	40 %	20 %	525854003
26031	NC_021822	CA	4	8	1574070	1574077	50 %	0 %	0 %	50 %	525854004
26032	NC_021822	ACC	2	6	1574200	1574205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854004
26033	NC_021822	TCA	2	6	1574294	1574299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854004
26034	NC_021822	GA	4	8	1574312	1574319	50 %	0 %	50 %	0 %	525854004
26035	NC_021822	AAGT	2	8	1574323	1574330	50 %	25 %	25 %	0 %	525854004
26036	NC_021822	TCA	2	6	1574338	1574343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854004
26037	NC_021822	CCTTTG	2	12	1574391	1574402	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525854004
26038	NC_021822	TTGC	2	8	1574462	1574469	0 %	50 %	25 %	25 %	525854004
26039	NC_021822	GA	4	8	1574510	1574517	50 %	0 %	50 %	0 %	525854004
26040	NC_021822	AACG	2	8	1574596	1574603	50 %	0 %	25 %	25 %	525854004
26041	NC_021822	GCT	2	6	1574625	1574630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854004
26042	NC_021822	ACA	2	6	1574648	1574653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854004
26043	NC_021822	CAA	2	6	1574726	1574731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854004
26044	NC_021822	AG	3	6	1574763	1574768	50 %	0 %	50 %	0 %	525854004
26045	NC_021822	ATG	2	6	1574776	1574781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854004
26046	NC_021822	TGG	2	6	1574912	1574917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854005
26047	NC_021822	GC	3	6	1574959	1574964	0 %	0 %	50 %	50 %	525854005
26048	NC_021822	TTGTGA	2	12	1574994	1575005	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525854005
26049	NC_021822	GCG	2	6	1575028	1575033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854005
26050	NC_021822	CAA	2	6	1575043	1575048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854005
26051	NC_021822	TGCC	2	8	1575058	1575065	0 %	25 %	25 %	50 %	525854005
26052	NC_021822	GCA	2	6	1575096	1575101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854005
26053	NC_021822	TCT	2	6	1575156	1575161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854005
26054	NC_021822	GCCA	2	8	1575189	1575196	25 %	0 %	25 %	50 %	525854005
26055	NC_021822	AGC	2	6	1575213	1575218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854005
26056	NC_021822	TTG	2	6	1575245	1575250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854005
26057	NC_021822	AGA	2	6	1575321	1575326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854005
26058	NC_021822	GCAA	2	8	1575432	1575439	50 %	0 %	25 %	25 %	525854005
26059	NC_021822	ACA	2	6	1575490	1575495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854005
26060	NC_021822	CAAG	2	8	1575497	1575504	50 %	0 %	25 %	25 %	525854005
26061	NC_021822	GCC	2	6	1575510	1575515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854005
26062	NC_021822	CCCTGC	2	12	1575518	1575529	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	525854005
26063	NC_021822	AGAA	2	8	1575676	1575683	75 %	0 %	25 %	0 %	525854005
26064	NC_021822	CGC	2	6	1575719	1575724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854005
26065	NC_021822	CAA	2	6	1575727	1575732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854005
26066	NC_021822	GA	3	6	1575740	1575745	50 %	0 %	50 %	0 %	525854005
26067	NC_021822	GTTTG	2	10	1575781	1575790	0 %	60 %	40 %	0 %	525854005
26068	NC_021822	TCA	2	6	1575793	1575798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854005
26069	NC_021822	TGA	2	6	1575799	1575804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854005
26070	NC_021822	CG	3	6	1575889	1575894	0 %	0 %	50 %	50 %	525854006
26071	NC_021822	CA	3	6	1575930	1575935	50 %	0 %	0 %	50 %	525854006
26072	NC_021822	CAA	2	6	1575972	1575977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854006
26073	NC_021822	AAC	2	6	1576001	1576006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854006
26074	NC_021822	ACC	2	6	1576099	1576104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854006
26075	NC_021822	TGC	2	6	1576202	1576207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854006
26076	NC_021822	CTG	2	6	1576210	1576215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854006
26077	NC_021822	AG	3	6	1576228	1576233	50 %	0 %	50 %	0 %	525854006
26078	NC_021822	TGCC	2	8	1576329	1576336	0 %	25 %	25 %	50 %	525854006
26079	NC_021822	CG	3	6	1576361	1576366	0 %	0 %	50 %	50 %	525854006
26080	NC_021822	A	8	8	1576368	1576375	100 %	0 %	0 %	0 %	525854006
26081	NC_021822	CAA	2	6	1576381	1576386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854006
26082	NC_021822	CAC	3	9	1576395	1576403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854006
26083	NC_021822	TAG	2	6	1576405	1576410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854006
26084	NC_021822	TGA	2	6	1576428	1576433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854006
26085	NC_021822	AGGCCA	2	12	1576470	1576481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854006
26086	NC_021822	CGC	2	6	1576489	1576494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854006
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26088	NC_021822	GAG	2	6	1576608	1576613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525854006
26089	NC_021822	TGA	2	6	1576634	1576639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854006
26090	NC_021822	TCA	2	6	1576652	1576657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854006
26091	NC_021822	ACAA	2	8	1576763	1576770	75 %	0 %	0 %	25 %	525854006
26092	NC_021822	CCG	2	6	1576874	1576879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854007
26093	NC_021822	GA	3	6	1576913	1576918	50 %	0 %	50 %	0 %	525854007
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26100	NC_021822	TAG	2	6	1577340	1577345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854007
26101	NC_021822	CG	3	6	1577382	1577387	0 %	0 %	50 %	50 %	525854007
26102	NC_021822	CCGA	2	8	1577464	1577471	25 %	0 %	25 %	50 %	525854007
26103	NC_021822	CAG	2	6	1577498	1577503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854007
26104	NC_021822	GC	3	6	1577652	1577657	0 %	0 %	50 %	50 %	525854007
26105	NC_021822	T	6	6	1577739	1577744	0 %	100 %	0 %	0 %	525854007
26106	NC_021822	GT	3	6	1577877	1577882	0 %	50 %	50 %	0 %	525854008
26107	NC_021822	CTC	2	6	1577944	1577949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854008
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26109	NC_021822	GTC	2	6	1577995	1578000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854008
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26113	NC_021822	CTT	3	9	1578222	1578230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854008
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26115	NC_021822	CG	3	6	1578437	1578442	0 %	0 %	50 %	50 %	525854008
26116	NC_021822	CTT	2	6	1578474	1578479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854008
26117	NC_021822	TTG	2	6	1578602	1578607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854008
26118	NC_021822	CCA	2	6	1578773	1578778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854008
26119	NC_021822	CGTC	2	8	1578933	1578940	0 %	25 %	25 %	50 %	525854008
26120	NC_021822	ATC	2	6	1579105	1579110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854008
26121	NC_021822	TGA	2	6	1579127	1579132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854008
26122	NC_021822	TTC	2	6	1579256	1579261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854008
26123	NC_021822	GCG	2	6	1579374	1579379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854008
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26125	NC_021822	GT	3	6	1579430	1579435	0 %	50 %	50 %	0 %	525854008
26126	NC_021822	CAC	2	6	1579464	1579469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854008
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26219	NC_021822	TAT	2	6	1584816	1584821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854011
26220	NC_021822	CACCT	2	10	1584830	1584839	20 %	20 %	0 %	60 %	525854011
26221	NC_021822	ACG	2	6	1584936	1584941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854011
26222	NC_021822	TGC	2	6	1584985	1584990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854011
26223	NC_021822	TGA	2	6	1585027	1585032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854011
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26225	NC_021822	TTG	2	6	1585286	1585291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854011
26226	NC_021822	AAG	2	6	1585314	1585319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854011
26227	NC_021822	GCGA	2	8	1585328	1585335	25 %	0 %	50 %	25 %	525854011
26228	NC_021822	CTT	2	6	1585369	1585374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854011
26229	NC_021822	GCT	2	6	1585375	1585380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854011
26230	NC_021822	GAA	2	6	1585388	1585393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854011
26231	NC_021822	A	7	7	1585421	1585427	100 %	0 %	0 %	0 %	525854011
26232	NC_021822	GT	3	6	1585464	1585469	0 %	50 %	50 %	0 %	525854012
26233	NC_021822	TGT	3	9	1585467	1585475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854012
26234	NC_021822	CGT	2	6	1585525	1585530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854012
26235	NC_021822	GGC	2	6	1585609	1585614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854012
26236	NC_021822	CGC	3	9	1585649	1585657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854012
26237	NC_021822	TGCG	2	8	1585665	1585672	0 %	25 %	50 %	25 %	525854012
26238	NC_021822	GCA	2	6	1585685	1585690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854012
26239	NC_021822	TGTTTG	2	12	1585728	1585739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854012
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26254	NC_021822	TGC	2	6	1586356	1586361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854012
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26258	NC_021822	TTCCT	2	10	1586544	1586553	0 %	60 %	0 %	40 %	525854012
26259	NC_021822	GC	3	6	1586659	1586664	0 %	0 %	50 %	50 %	525854013
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26268	NC_021822	ACGCA	2	10	1587297	1587306	40 %	0 %	20 %	40 %	525854013
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26278	NC_021822	GT	3	6	1587946	1587951	0 %	50 %	50 %	0 %	525854013
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26335	NC_021822	CCA	2	6	1590774	1590779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854015
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26339	NC_021822	TC	3	6	1590971	1590976	0 %	50 %	0 %	50 %	525854016
26340	NC_021822	GCC	2	6	1591000	1591005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854016
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26343	NC_021822	CTT	2	6	1591086	1591091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854016
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26346	NC_021822	TCGG	2	8	1591477	1591484	0 %	25 %	50 %	25 %	525854016
26347	NC_021822	CGT	2	6	1591485	1591490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854016
26348	NC_021822	AGGC	2	8	1591517	1591524	25 %	0 %	50 %	25 %	525854016
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26465	NC_021822	ACC	2	6	1597857	1597862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854020
26466	NC_021822	CGC	2	6	1597907	1597912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854020
26467	NC_021822	ATC	2	6	1597962	1597967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854020
26468	NC_021822	CTT	2	6	1598005	1598010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854020
26469	NC_021822	ATG	2	6	1598122	1598127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854020
26470	NC_021822	CT	3	6	1598148	1598153	0 %	50 %	0 %	50 %	525854020
26471	NC_021822	GAT	2	6	1598183	1598188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854020
26472	NC_021822	GTG	2	6	1598226	1598231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854020
26473	NC_021822	GCT	2	6	1598327	1598332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854020
26474	NC_021822	CGG	2	6	1598350	1598355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854020
26475	NC_021822	AGCA	2	8	1598368	1598375	50 %	0 %	25 %	25 %	525854020
26476	NC_021822	ATG	2	6	1598376	1598381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854020
26477	NC_021822	CGAC	2	8	1598386	1598393	25 %	0 %	25 %	50 %	525854020
26478	NC_021822	CAC	2	6	1598404	1598409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854020
26479	NC_021822	CCA	2	6	1598437	1598442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854020
26480	NC_021822	TGA	2	6	1598482	1598487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854020
26481	NC_021822	AAAG	2	8	1598507	1598514	75 %	0 %	25 %	0 %	525854020
26482	NC_021822	CA	3	6	1598515	1598520	50 %	0 %	0 %	50 %	525854020
26483	NC_021822	TGT	2	6	1598601	1598606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854020
26484	NC_021822	TAT	2	6	1598651	1598656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854021
26485	NC_021822	GCA	2	6	1598657	1598662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854021
26486	NC_021822	GTT	2	6	1598668	1598673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854021
26487	NC_021822	CTT	2	6	1598745	1598750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854021
26488	NC_021822	TCA	2	6	1598751	1598756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854021
26489	NC_021822	ACC	2	6	1598804	1598809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854021
26490	NC_021822	CAA	2	6	1598899	1598904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854021
26491	NC_021822	TTG	2	6	1598950	1598955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854021
26492	NC_021822	ACC	2	6	1598959	1598964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854021
26493	NC_021822	TGT	2	6	1598984	1598989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854021
26494	NC_021822	TGC	2	6	1599023	1599028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854021
26495	NC_021822	GA	3	6	1599119	1599124	50 %	0 %	50 %	0 %	525854021
26496	NC_021822	GA	3	6	1599400	1599405	50 %	0 %	50 %	0 %	525854021
26497	NC_021822	CGAC	2	8	1599440	1599447	25 %	0 %	25 %	50 %	525854021
26498	NC_021822	GTC	2	6	1599487	1599492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854021
26499	NC_021822	CTG	2	6	1599650	1599655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854021
26500	NC_021822	TCA	2	6	1599662	1599667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854021

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