MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_021822	TAGG	2	8	1177083	1177090	25 %	25 %	50 %	0 %	525853698
19502	NC_021822	CGA	2	6	1177154	1177159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
19503	NC_021822	GTCGT	2	10	1177165	1177174	0 %	40 %	40 %	20 %	525853698
19504	NC_021822	CTT	2	6	1177335	1177340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
19505	NC_021822	GAA	2	6	1177400	1177405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853698
19506	NC_021822	CTT	2	6	1177466	1177471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853698
19507	NC_021822	GCA	2	6	1177489	1177494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
19508	NC_021822	CAG	2	6	1177505	1177510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
19509	NC_021822	AGC	2	6	1177536	1177541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853698
19510	NC_021822	T	6	6	1177577	1177582	0 %	100 %	0 %	0 %	525853698
19511	NC_021822	CAC	3	9	1177613	1177621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853698
19512	NC_021822	TTAA	2	8	1177690	1177697	50 %	50 %	0 %	0 %	525853698
19513	NC_021822	ATCGG	2	10	1177963	1177972	20 %	20 %	40 %	20 %	525853698
19514	NC_021822	GTA	2	6	1178010	1178015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853698
19515	NC_021822	GAT	2	6	1178103	1178108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853698
19516	NC_021822	CCT	2	6	1178164	1178169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853699
19517	NC_021822	TG	3	6	1178235	1178240	0 %	50 %	50 %	0 %	525853699
19518	NC_021822	ATG	3	9	1178274	1178282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853699
19519	NC_021822	ACG	2	6	1178315	1178320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853699
19520	NC_021822	ACG	2	6	1178384	1178389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853699
19521	NC_021822	ACG	2	6	1178394	1178399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853699
19522	NC_021822	ACGC	2	8	1178482	1178489	25 %	0 %	25 %	50 %	525853699
19523	NC_021822	TCTAGT	2	12	1178571	1178582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525853699
19524	NC_021822	CGT	2	6	1178702	1178707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853699
19525	NC_021822	CG	3	6	1178853	1178858	0 %	0 %	50 %	50 %	525853699
19526	NC_021822	TGC	2	6	1178902	1178907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853699
19527	NC_021822	TGG	2	6	1178934	1178939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853699
19528	NC_021822	GCT	2	6	1178982	1178987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853699
19529	NC_021822	AGA	2	6	1179014	1179019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853699
19530	NC_021822	AAG	2	6	1179035	1179040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853699
19531	NC_021822	CTT	2	6	1179064	1179069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853699
19532	NC_021822	CTGTG	2	10	1179101	1179110	0 %	40 %	40 %	20 %	525853699
19533	NC_021822	TCT	2	6	1179120	1179125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853699
19534	NC_021822	AT	3	6	1179144	1179149	50 %	50 %	0 %	0 %	525853699
19535	NC_021822	CT	4	8	1179210	1179217	0 %	50 %	0 %	50 %	525853699
19536	NC_021822	ATT	2	6	1179224	1179229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853699
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19538	NC_021822	T	7	7	1179638	1179644	0 %	100 %	0 %	0 %	525853700
19539	NC_021822	A	8	8	1179645	1179652	100 %	0 %	0 %	0 %	525853700
19540	NC_021822	TGG	2	6	1179743	1179748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853700
19541	NC_021822	AGGT	2	8	1179776	1179783	25 %	25 %	50 %	0 %	525853700
19542	NC_021822	CGA	2	6	1179864	1179869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853700
19543	NC_021822	TGCA	2	8	1179896	1179903	25 %	25 %	25 %	25 %	525853700
19544	NC_021822	CG	3	6	1180013	1180018	0 %	0 %	50 %	50 %	525853700
19545	NC_021822	GAC	2	6	1180129	1180134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853700
19546	NC_021822	CGTT	2	8	1180155	1180162	0 %	50 %	25 %	25 %	525853700
19547	NC_021822	T	6	6	1180277	1180282	0 %	100 %	0 %	0 %	525853701
19548	NC_021822	CAT	2	6	1180328	1180333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853701
19549	NC_021822	ACC	2	6	1180373	1180378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853701
19550	NC_021822	GGCAA	2	10	1180393	1180402	40 %	0 %	40 %	20 %	525853701
19551	NC_021822	CG	3	6	1180419	1180424	0 %	0 %	50 %	50 %	525853701
19552	NC_021822	ACC	2	6	1180433	1180438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853701
19553	NC_021822	TGT	2	6	1180534	1180539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853701
19554	NC_021822	TTCAT	2	10	1180590	1180599	20 %	60 %	0 %	20 %	525853701
19555	NC_021822	TTC	2	6	1180628	1180633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853701
19556	NC_021822	GAT	2	6	1180658	1180663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853701
19557	NC_021822	GAA	2	6	1180712	1180717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853701
19558	NC_021822	GGT	2	6	1180733	1180738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853701
19559	NC_021822	CCA	2	6	1180902	1180907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853701
19560	NC_021822	CAAA	2	8	1180948	1180955	75 %	0 %	0 %	25 %	525853701
19561	NC_021822	CAC	2	6	1180960	1180965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853701
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19563	NC_021822	TCAA	2	8	1181028	1181035	50 %	25 %	0 %	25 %	525853701
19564	NC_021822	TGT	2	6	1181074	1181079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853701
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19567	NC_021822	CCCAA	2	10	1181175	1181184	40 %	0 %	0 %	60 %	525853701
19568	NC_021822	CAA	2	6	1181212	1181217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853701
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19570	NC_021822	CAA	2	6	1181384	1181389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853701
19571	NC_021822	TTC	2	6	1181801	1181806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853702
19572	NC_021822	TTG	2	6	1181981	1181986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853702
19573	NC_021822	ACA	2	6	1181991	1181996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853702
19574	NC_021822	AT	3	6	1182035	1182040	50 %	50 %	0 %	0 %	525853702
19575	NC_021822	TTC	2	6	1182140	1182145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853702
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19577	NC_021822	TC	3	6	1182175	1182180	0 %	50 %	0 %	50 %	525853702
19578	NC_021822	TTTC	2	8	1182216	1182223	0 %	75 %	0 %	25 %	525853702
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19581	NC_021822	TGC	2	6	1182357	1182362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853702
19582	NC_021822	AT	3	6	1182420	1182425	50 %	50 %	0 %	0 %	525853702
19583	NC_021822	TTC	2	6	1182434	1182439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853702
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19585	NC_021822	TA	3	6	1182553	1182558	50 %	50 %	0 %	0 %	525853702
19586	NC_021822	CAA	2	6	1182593	1182598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853702
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19588	NC_021822	TCG	3	9	1182993	1183001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854395
19589	NC_021822	TAT	2	6	1183028	1183033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854395
19590	NC_021822	TATTC	2	10	1183064	1183073	20 %	60 %	0 %	20 %	525854395
19591	NC_021822	A	6	6	1183087	1183092	100 %	0 %	0 %	0 %	525854395
19592	NC_021822	ATT	2	6	1183183	1183188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854396
19593	NC_021822	AAGTA	2	10	1183209	1183218	60 %	20 %	20 %	0 %	525854396
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19597	NC_021822	TTA	2	6	1183320	1183325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854396
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19599	NC_021822	AGCTCA	2	12	1183668	1183679	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525854396
19600	NC_021822	TTGC	2	8	1183707	1183714	0 %	50 %	25 %	25 %	525854396
19601	NC_021822	GAT	2	6	1183780	1183785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854396
19602	NC_021822	CCA	2	6	1183789	1183794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854396
19603	NC_021822	AC	3	6	1183805	1183810	50 %	0 %	0 %	50 %	525853703
19604	NC_021822	GCT	2	6	1183906	1183911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853703
19605	NC_021822	T	6	6	1183946	1183951	0 %	100 %	0 %	0 %	525853703
19606	NC_021822	GCC	2	6	1184068	1184073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853703
19607	NC_021822	GTA	2	6	1184087	1184092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853703
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19609	NC_021822	TGA	2	6	1184124	1184129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853703
19610	NC_021822	GTT	2	6	1184158	1184163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853703
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19613	NC_021822	TAA	2	6	1184355	1184360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853703
19614	NC_021822	CG	3	6	1184427	1184432	0 %	0 %	50 %	50 %	525853703
19615	NC_021822	CAA	2	6	1184442	1184447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853703
19616	NC_021822	GTA	2	6	1184478	1184483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853703
19617	NC_021822	GA	3	6	1184494	1184499	50 %	0 %	50 %	0 %	525853703
19618	NC_021822	TCA	3	9	1184608	1184616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853703
19619	NC_021822	GCA	2	6	1184625	1184630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853703
19620	NC_021822	ACA	2	6	1185028	1185033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853703
19621	NC_021822	TGA	2	6	1185089	1185094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853703
19622	NC_021822	GTC	2	6	1185132	1185137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853703
19623	NC_021822	CTG	2	6	1185141	1185146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853703
19624	NC_021822	TCC	2	6	1185184	1185189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853703
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19626	NC_021822	GAA	2	6	1185328	1185333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853703
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19629	NC_021822	CGAAA	2	10	1185921	1185930	60 %	0 %	20 %	20 %	525853704
19630	NC_021822	CGG	2	6	1185948	1185953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853704
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19632	NC_021822	GGCA	2	8	1186055	1186062	25 %	0 %	50 %	25 %	525853704
19633	NC_021822	AGCAA	2	10	1186089	1186098	60 %	0 %	20 %	20 %	525853704
19634	NC_021822	TGA	2	6	1186194	1186199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853704
19635	NC_021822	GCG	2	6	1186211	1186216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853704
19636	NC_021822	TG	3	6	1186227	1186232	0 %	50 %	50 %	0 %	525853704
19637	NC_021822	CATC	2	8	1186241	1186248	25 %	25 %	0 %	50 %	525853704
19638	NC_021822	TAG	2	6	1186343	1186348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853705
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19642	NC_021822	GAA	2	6	1186573	1186578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853705
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19644	NC_021822	GCT	3	9	1186665	1186673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853706
19645	NC_021822	CTGTT	2	10	1186778	1186787	0 %	60 %	20 %	20 %	525853706
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19649	NC_021822	CGG	2	6	1187095	1187100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853706
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19652	NC_021822	CG	3	6	1187147	1187152	0 %	0 %	50 %	50 %	525853706
19653	NC_021822	GTA	2	6	1187172	1187177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853706
19654	NC_021822	TAC	2	6	1187355	1187360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853706
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19686	NC_021822	AAG	2	6	1189071	1189076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853706
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19720	NC_021822	GTA	2	6	1191127	1191132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853708
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19725	NC_021822	GAA	2	6	1191295	1191300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853708
19726	NC_021822	CTT	2	6	1191319	1191324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853708
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19730	NC_021822	TGCGCT	2	12	1191479	1191490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853708
19731	NC_021822	AC	3	6	1191519	1191524	50 %	0 %	0 %	50 %	525853708
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19733	NC_021822	GTA	2	6	1191583	1191588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853708
19734	NC_021822	TGA	2	6	1191594	1191599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853708
19735	NC_021822	GTG	2	6	1191618	1191623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853708
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19953	NC_021822	TCAAA	2	10	1205149	1205158	60 %	20 %	0 %	20 %	525853723
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19960	NC_021822	C	6	6	1205520	1205525	0 %	0 %	0 %	100 %	525853723
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19999	NC_021822	TCA	2	6	1207910	1207915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853725
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