MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021822	TGT	2	6	96961	96966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852918
1502	NC_021822	GCA	2	6	97010	97015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852918
1503	NC_021822	AAC	2	6	97154	97159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852918
1504	NC_021822	TGT	2	6	97164	97169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852918
1505	NC_021822	GTA	2	6	97183	97188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852918
1506	NC_021822	TGA	2	6	97203	97208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852918
1507	NC_021822	TCT	2	6	97250	97255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852918
1508	NC_021822	TCG	2	6	97284	97289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852918
1509	NC_021822	TCA	2	6	97302	97307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852918
1510	NC_021822	TTC	2	6	97316	97321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852918
1511	NC_021822	CGTC	2	8	97329	97336	0 %	25 %	25 %	50 %	525852918
1512	NC_021822	CAAAC	2	10	97408	97417	60 %	0 %	0 %	40 %	525852918
1513	NC_021822	TTC	2	6	97451	97456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852918
1514	NC_021822	GAA	2	6	97481	97486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852918
1515	NC_021822	GCCGC	2	10	97532	97541	0 %	0 %	40 %	60 %	525852918
1516	NC_021822	TTC	2	6	97568	97573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852918
1517	NC_021822	CA	3	6	97595	97600	50 %	0 %	0 %	50 %	525852918
1518	NC_021822	TTGAT	2	10	97715	97724	20 %	60 %	20 %	0 %	525852918
1519	NC_021822	TGC	2	6	97735	97740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852918
1520	NC_021822	GCG	2	6	97784	97789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852918
1521	NC_021822	TCGT	2	8	97811	97818	0 %	50 %	25 %	25 %	525852918
1522	NC_021822	CCA	2	6	97903	97908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852918
1523	NC_021822	T	6	6	97943	97948	0 %	100 %	0 %	0 %	525852918
1524	NC_021822	ATC	2	6	97972	97977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852918
1525	NC_021822	ATAGGT	2	12	98011	98022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852918
1526	NC_021822	AAGC	2	8	98100	98107	50 %	0 %	25 %	25 %	525852918
1527	NC_021822	T	7	7	98136	98142	0 %	100 %	0 %	0 %	525852918
1528	NC_021822	CAT	2	6	98143	98148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852918
1529	NC_021822	ACA	2	6	98627	98632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852919
1530	NC_021822	A	6	6	98636	98641	100 %	0 %	0 %	0 %	525852919
1531	NC_021822	CTG	2	6	98661	98666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852919
1532	NC_021822	CGA	2	6	98722	98727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852919
1533	NC_021822	CGA	2	6	98739	98744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852919
1534	NC_021822	AGA	2	6	98764	98769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852919
1535	NC_021822	GAT	2	6	98909	98914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852919
1536	NC_021822	GTG	2	6	98934	98939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852919
1537	NC_021822	TCC	2	6	98962	98967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525852919
1538	NC_021822	CAG	2	6	99020	99025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852919
1539	NC_021822	ATC	2	6	99062	99067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852919
1540	NC_021822	CAA	3	9	99160	99168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852919
1541	NC_021822	CCAAA	2	10	99239	99248	60 %	0 %	0 %	40 %	525852919
1542	NC_021822	GTG	2	6	99350	99355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852919
1543	NC_021822	GGT	2	6	99368	99373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852919
1544	NC_021822	GCG	2	6	99443	99448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852919
1545	NC_021822	ACG	2	6	99453	99458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852919
1546	NC_021822	TGTCA	2	10	99496	99505	20 %	40 %	20 %	20 %	525852919
1547	NC_021822	TGG	2	6	99766	99771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852919
1548	NC_021822	CAAT	2	8	99826	99833	50 %	25 %	0 %	25 %	525852919
1549	NC_021822	GCG	2	6	99893	99898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852919
1550	NC_021822	AAT	2	6	99956	99961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852919
1551	NC_021822	TAC	2	6	100070	100075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852919
1552	NC_021822	ACC	2	6	100134	100139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852919
1553	NC_021822	GACA	2	8	100186	100193	50 %	0 %	25 %	25 %	525852919
1554	NC_021822	GCG	2	6	100247	100252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852919
1555	NC_021822	ACA	2	6	100347	100352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852919
1556	NC_021822	GGC	2	6	100508	100513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852919
1557	NC_021822	AGA	2	6	100604	100609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852919
1558	NC_021822	GAA	2	6	100663	100668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852920
1559	NC_021822	CGG	2	6	100689	100694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852920
1560	NC_021822	CCA	2	6	100731	100736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852920
1561	NC_021822	CAA	2	6	100744	100749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852920
1562	NC_021822	CAA	2	6	100779	100784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852920
1563	NC_021822	CAA	2	6	100793	100798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852920
1564	NC_021822	GAAA	2	8	100831	100838	75 %	0 %	25 %	0 %	525852920
1565	NC_021822	CTT	2	6	100853	100858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852920
1566	NC_021822	CAA	2	6	100864	100869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852920
1567	NC_021822	GTA	2	6	100910	100915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852920
1568	NC_021822	AAG	2	6	100926	100931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852920
1569	NC_021822	CCA	2	6	100947	100952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852920
1570	NC_021822	TACC	2	8	101160	101167	25 %	25 %	0 %	50 %	525852921
1571	NC_021822	TGT	2	6	101191	101196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852921
1572	NC_021822	CGA	2	6	101291	101296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852921
1573	NC_021822	GCA	2	6	101327	101332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852921
1574	NC_021822	AAG	2	6	101339	101344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852921
1575	NC_021822	CAG	2	6	101389	101394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852921
1576	NC_021822	CCA	2	6	101436	101441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852921
1577	NC_021822	AC	3	6	101580	101585	50 %	0 %	0 %	50 %	525852921
1578	NC_021822	CGC	2	6	101661	101666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852921
1579	NC_021822	AACA	2	8	101672	101679	75 %	0 %	0 %	25 %	525852921
1580	NC_021822	GAT	2	6	101692	101697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852921
1581	NC_021822	AAC	2	6	101738	101743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852921
1582	NC_021822	TCT	2	6	101765	101770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852921
1583	NC_021822	TGC	2	6	101796	101801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852921
1584	NC_021822	CGT	2	6	101853	101858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852921
1585	NC_021822	GAA	2	6	101902	101907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852921
1586	NC_021822	CGC	2	6	101983	101988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852921
1587	NC_021822	CAT	2	6	101992	101997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852921
1588	NC_021822	GT	3	6	102009	102014	0 %	50 %	50 %	0 %	525852921
1589	NC_021822	GAA	2	6	102082	102087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852921
1590	NC_021822	ATC	2	6	102092	102097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852921
1591	NC_021822	CTT	2	6	102117	102122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852921
1592	NC_021822	GTT	2	6	102145	102150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852921
1593	NC_021822	T	6	6	102295	102300	0 %	100 %	0 %	0 %	525852921
1594	NC_021822	GACC	2	8	102330	102337	25 %	0 %	25 %	50 %	525852921
1595	NC_021822	GAA	2	6	102379	102384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852921
1596	NC_021822	GTT	2	6	102486	102491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852922
1597	NC_021822	CAT	2	6	102637	102642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852922
1598	NC_021822	AAC	2	6	102670	102675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852922
1599	NC_021822	GAT	2	6	102767	102772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852923
1600	NC_021822	TCT	2	6	102783	102788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852923
1601	NC_021822	TTCA	2	8	102824	102831	25 %	50 %	0 %	25 %	525852923
1602	NC_021822	TTC	2	6	102920	102925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852923
1603	NC_021822	GTA	2	6	103031	103036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852923
1604	NC_021822	TCAA	2	8	103101	103108	50 %	25 %	0 %	25 %	525852923
1605	NC_021822	GAA	2	6	103467	103472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852924
1606	NC_021822	GA	3	6	103576	103581	50 %	0 %	50 %	0 %	525852924
1607	NC_021822	A	6	6	103581	103586	100 %	0 %	0 %	0 %	525852924
1608	NC_021822	CAA	2	6	103589	103594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852924
1609	NC_021822	TGA	2	6	103600	103605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852924
1610	NC_021822	GC	3	6	103701	103706	0 %	0 %	50 %	50 %	525852924
1611	NC_021822	ACT	2	6	103773	103778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852924
1612	NC_021822	AAG	2	6	103788	103793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852924
1613	NC_021822	T	6	6	103810	103815	0 %	100 %	0 %	0 %	525852924
1614	NC_021822	AG	3	6	103816	103821	50 %	0 %	50 %	0 %	525852924
1615	NC_021822	GC	3	6	104030	104035	0 %	0 %	50 %	50 %	525852924
1616	NC_021822	GAT	2	6	104083	104088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852924
1617	NC_021822	GAC	2	6	104119	104124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852924
1618	NC_021822	TGC	2	6	104175	104180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852924
1619	NC_021822	GT	3	6	104204	104209	0 %	50 %	50 %	0 %	525852924
1620	NC_021822	GAG	2	6	104216	104221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525852924
1621	NC_021822	CGC	2	6	104252	104257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852924
1622	NC_021822	CGAC	2	8	104271	104278	25 %	0 %	25 %	50 %	525852924
1623	NC_021822	ATT	2	6	104285	104290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525852924
1624	NC_021822	GGC	2	6	104374	104379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852924
1625	NC_021822	AGA	2	6	104413	104418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852924
1626	NC_021822	GTT	2	6	104579	104584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852925
1627	NC_021822	AGT	2	6	104630	104635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852925
1628	NC_021822	CG	3	6	104658	104663	0 %	0 %	50 %	50 %	525852925
1629	NC_021822	TTC	2	6	104712	104717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852925
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1634	NC_021822	AAATC	2	10	105253	105262	60 %	20 %	0 %	20 %	525852925
1635	NC_021822	CTTG	2	8	105263	105270	0 %	50 %	25 %	25 %	525852925
1636	NC_021822	TGGT	2	8	105290	105297	0 %	50 %	50 %	0 %	525852925
1637	NC_021822	CGA	2	6	105314	105319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852925
1638	NC_021822	AGT	2	6	105463	105468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852926
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1640	NC_021822	CTT	2	6	105496	105501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852926
1641	NC_021822	TGA	2	6	105538	105543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852926
1642	NC_021822	TTG	2	6	105600	105605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852926
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1644	NC_021822	ACGC	2	8	105640	105647	25 %	0 %	25 %	50 %	525852926
1645	NC_021822	GCTTT	2	10	105648	105657	0 %	60 %	20 %	20 %	525852926
1646	NC_021822	TGC	2	6	105824	105829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852926
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1654	NC_021822	ACC	2	6	106359	106364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852926
1655	NC_021822	GC	3	6	106385	106390	0 %	0 %	50 %	50 %	525852926
1656	NC_021822	GCC	2	6	106421	106426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852926
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1665	NC_021822	TGA	2	6	107067	107072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852927
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1668	NC_021822	GCC	2	6	107179	107184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525852927
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1733	NC_021822	CATG	2	8	111335	111342	25 %	25 %	25 %	25 %	525852931
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1742	NC_021822	CAA	2	6	111909	111914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852931
1743	NC_021822	CT	3	6	111996	112001	0 %	50 %	0 %	50 %	525852931
1744	NC_021822	CT	3	6	112092	112097	0 %	50 %	0 %	50 %	525852931
1745	NC_021822	GTG	2	6	112213	112218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852931
1746	NC_021822	TTTGGG	2	12	112242	112253	0 %	50 %	50 %	0 %	525852931
1747	NC_021822	ATG	2	6	112271	112276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852931
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1749	NC_021822	GCA	2	6	112411	112416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852931
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1751	NC_021822	CTG	2	6	112475	112480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852931
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1754	NC_021822	GTA	2	6	112534	112539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852931
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1759	NC_021822	AGAC	2	8	113121	113128	50 %	0 %	25 %	25 %	525852932
1760	NC_021822	GTG	2	6	113131	113136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852932
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1762	NC_021822	TGGTG	2	10	113229	113238	0 %	40 %	60 %	0 %	525852932
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1765	NC_021822	GTT	2	6	113329	113334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852932
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1767	NC_021822	TTGA	2	8	113365	113372	25 %	50 %	25 %	0 %	525852932
1768	NC_021822	T	6	6	113510	113515	0 %	100 %	0 %	0 %	525852933
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1774	NC_021822	TGG	2	6	114010	114015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852933
1775	NC_021822	ACT	2	6	114032	114037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852933
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1850	NC_021822	GC	3	6	118226	118231	0 %	0 %	50 %	50 %	525854215
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1852	NC_021822	GAT	2	6	118329	118334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854215
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1854	NC_021822	CTG	2	6	118396	118401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854215
1855	NC_021822	TGG	2	6	118476	118481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854215
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1859	NC_021822	GCG	2	6	118696	118701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854215
1860	NC_021822	AGGCA	2	10	118782	118791	40 %	0 %	40 %	20 %	525854215
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1865	NC_021822	A	7	7	119432	119438	100 %	0 %	0 %	0 %	525852937
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1867	NC_021822	CT	3	6	119530	119535	0 %	50 %	0 %	50 %	525852937
1868	NC_021822	GAC	3	9	119567	119575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852937
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1871	NC_021822	ATG	2	6	119789	119794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852937
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1874	NC_021822	GAC	2	6	119903	119908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852937
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1974	NC_021822	GA	3	6	125935	125940	50 %	0 %	50 %	0 %	525852943
1975	NC_021822	TGC	2	6	125982	125987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852943
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1984	NC_021822	CTG	2	6	126309	126314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852943
1985	NC_021822	T	6	6	126328	126333	0 %	100 %	0 %	0 %	525852943
1986	NC_021822	TGCA	2	8	126404	126411	25 %	25 %	25 %	25 %	525852943
1987	NC_021822	TCT	2	6	126455	126460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852943
1988	NC_021822	CCA	2	6	126497	126502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852943
1989	NC_021822	TTG	2	6	126580	126585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852943
1990	NC_021822	CCA	2	6	126623	126628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525852943
1991	NC_021822	AGT	2	6	126636	126641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852943
1992	NC_021822	TGA	2	6	126761	126766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852943
1993	NC_021822	GT	3	6	126800	126805	0 %	50 %	50 %	0 %	525852943
1994	NC_021822	TCGG	2	8	126877	126884	0 %	25 %	50 %	25 %	525852943
1995	NC_021822	CAGT	2	8	126900	126907	25 %	25 %	25 %	25 %	525852943
1996	NC_021822	AGT	2	6	126965	126970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852943
1997	NC_021822	TAA	2	6	127265	127270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525852944
1998	NC_021822	TGG	2	6	127361	127366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852944
1999	NC_021822	TATG	2	8	127403	127410	25 %	50 %	25 %	0 %	525852944
2000	NC_021822	TG	3	6	127525	127530	0 %	50 %	50 %	0 %	525852944

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