MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021822	TCT	2	6	1119728	1119733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853654
18502	NC_021822	TCA	2	6	1119815	1119820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853654
18503	NC_021822	TCA	2	6	1119833	1119838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853654
18504	NC_021822	AAC	2	6	1119856	1119861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853654
18505	NC_021822	ATC	2	6	1119862	1119867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853654
18506	NC_021822	AAC	3	9	1119880	1119888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853654
18507	NC_021822	GGCTT	2	10	1119959	1119968	0 %	40 %	40 %	20 %	525853654
18508	NC_021822	TCCA	2	8	1119997	1120004	25 %	25 %	0 %	50 %	525853654
18509	NC_021822	GAA	2	6	1120038	1120043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853654
18510	NC_021822	GAT	2	6	1120056	1120061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853654
18511	NC_021822	ATG	2	6	1120173	1120178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853654
18512	NC_021822	TGA	2	6	1120196	1120201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853654
18513	NC_021822	TCA	2	6	1120277	1120282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853654
18514	NC_021822	CAT	2	6	1120290	1120295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853654
18515	NC_021822	AT	3	6	1120294	1120299	50 %	50 %	0 %	0 %	525853654
18516	NC_021822	ATC	2	6	1120310	1120315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853654
18517	NC_021822	CTT	2	6	1120432	1120437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853655
18518	NC_021822	CTT	2	6	1120501	1120506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853655
18519	NC_021822	TCT	2	6	1120512	1120517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853655
18520	NC_021822	CAAC	2	8	1120524	1120531	50 %	0 %	0 %	50 %	525853655
18521	NC_021822	TC	3	6	1120609	1120614	0 %	50 %	0 %	50 %	525853655
18522	NC_021822	ATTT	2	8	1120872	1120879	25 %	75 %	0 %	0 %	525853656
18523	NC_021822	T	6	6	1120877	1120882	0 %	100 %	0 %	0 %	525853656
18524	NC_021822	TGT	2	6	1120909	1120914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853656
18525	NC_021822	TGTC	2	8	1120960	1120967	0 %	50 %	25 %	25 %	525853656
18526	NC_021822	TCT	2	6	1121017	1121022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853656
18527	NC_021822	TGA	2	6	1121051	1121056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853656
18528	NC_021822	CAAT	2	8	1121065	1121072	50 %	25 %	0 %	25 %	525853656
18529	NC_021822	T	6	6	1121135	1121140	0 %	100 %	0 %	0 %	525853656
18530	NC_021822	GAC	2	6	1121161	1121166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853656
18531	NC_021822	CAT	2	6	1121432	1121437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853657
18532	NC_021822	AAAC	2	8	1121453	1121460	75 %	0 %	0 %	25 %	525853657
18533	NC_021822	GCC	2	6	1121580	1121585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853657
18534	NC_021822	TGG	2	6	1121591	1121596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853657
18535	NC_021822	CAT	2	6	1121630	1121635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853657
18536	NC_021822	TGA	2	6	1121660	1121665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853657
18537	NC_021822	ACCCC	2	10	1121727	1121736	20 %	0 %	0 %	80 %	525853657
18538	NC_021822	TTG	2	6	1121739	1121744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853657
18539	NC_021822	GAC	2	6	1121748	1121753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853657
18540	NC_021822	CAA	2	6	1121783	1121788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853657
18541	NC_021822	CCA	2	6	1121796	1121801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853657
18542	NC_021822	AAC	3	9	1121905	1121913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853657
18543	NC_021822	AAG	2	6	1122106	1122111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853657
18544	NC_021822	GC	3	6	1122214	1122219	0 %	0 %	50 %	50 %	525853657
18545	NC_021822	TCA	2	6	1122418	1122423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853657
18546	NC_021822	GATT	2	8	1122521	1122528	25 %	50 %	25 %	0 %	525853657
18547	NC_021822	ATGG	2	8	1122539	1122546	25 %	25 %	50 %	0 %	525853657
18548	NC_021822	ACG	2	6	1122571	1122576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853657
18549	NC_021822	TAC	2	6	1122624	1122629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853657
18550	NC_021822	CAGC	2	8	1122665	1122672	25 %	0 %	25 %	50 %	525853657
18551	NC_021822	CAA	2	6	1122707	1122712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853657
18552	NC_021822	GCATT	2	10	1122724	1122733	20 %	40 %	20 %	20 %	525853657
18553	NC_021822	AACAA	2	10	1122798	1122807	80 %	0 %	0 %	20 %	525853658
18554	NC_021822	CGCT	2	8	1122827	1122834	0 %	25 %	25 %	50 %	525853658
18555	NC_021822	TTG	2	6	1122850	1122855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853658
18556	NC_021822	ACG	2	6	1122878	1122883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853658
18557	NC_021822	GCA	2	6	1122892	1122897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853658
18558	NC_021822	AAGC	2	8	1122904	1122911	50 %	0 %	25 %	25 %	525853658
18559	NC_021822	GGT	2	6	1122957	1122962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853658
18560	NC_021822	GCCC	2	8	1122965	1122972	0 %	0 %	25 %	75 %	525853658
18561	NC_021822	ACA	2	6	1123038	1123043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853658
18562	NC_021822	GC	4	8	1123147	1123154	0 %	0 %	50 %	50 %	525853658
18563	NC_021822	ACC	2	6	1123191	1123196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853658
18564	NC_021822	TCA	2	6	1123213	1123218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853658
18565	NC_021822	GA	3	6	1123262	1123267	50 %	0 %	50 %	0 %	525853658
18566	NC_021822	TCG	2	6	1123277	1123282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853658
18567	NC_021822	CA	3	6	1123320	1123325	50 %	0 %	0 %	50 %	525853658
18568	NC_021822	GCC	2	6	1123337	1123342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853658
18569	NC_021822	GAT	2	6	1123368	1123373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853658
18570	NC_021822	GAG	2	6	1123375	1123380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525853658
18571	NC_021822	CGA	2	6	1123404	1123409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853658
18572	NC_021822	TAT	2	6	1123441	1123446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853658
18573	NC_021822	G	6	6	1123447	1123452	0 %	0 %	100 %	0 %	525853658
18574	NC_021822	AAG	2	6	1123705	1123710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853659
18575	NC_021822	GTT	2	6	1123740	1123745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853659
18576	NC_021822	TGC	2	6	1123757	1123762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853659
18577	NC_021822	TCTT	2	8	1123874	1123881	0 %	75 %	0 %	25 %	525853659
18578	NC_021822	TCA	2	6	1123886	1123891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853659
18579	NC_021822	TCA	2	6	1123931	1123936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853659
18580	NC_021822	CCA	2	6	1123971	1123976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853659
18581	NC_021822	ACATT	2	10	1124036	1124045	40 %	40 %	0 %	20 %	525853659
18582	NC_021822	ATT	2	6	1124051	1124056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853659
18583	NC_021822	TCT	2	6	1124257	1124262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853660
18584	NC_021822	TC	3	6	1124362	1124367	0 %	50 %	0 %	50 %	525853660
18585	NC_021822	CAAA	2	8	1124375	1124382	75 %	0 %	0 %	25 %	525853660
18586	NC_021822	AGG	2	6	1124384	1124389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525853660
18587	NC_021822	GTC	2	6	1124405	1124410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853660
18588	NC_021822	CCA	2	6	1124428	1124433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853660
18589	NC_021822	ATC	2	6	1124463	1124468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853660
18590	NC_021822	TC	3	6	1124490	1124495	0 %	50 %	0 %	50 %	525853660
18591	NC_021822	GCCGC	2	10	1124688	1124697	0 %	0 %	40 %	60 %	525853660
18592	NC_021822	GAGT	2	8	1124715	1124722	25 %	25 %	50 %	0 %	525853660
18593	NC_021822	AGT	2	6	1124743	1124748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853660
18594	NC_021822	A	6	6	1124798	1124803	100 %	0 %	0 %	0 %	525853660
18595	NC_021822	TGA	2	6	1124827	1124832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853660
18596	NC_021822	CAT	2	6	1125140	1125145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853661
18597	NC_021822	ACA	2	6	1125147	1125152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853661
18598	NC_021822	GAC	3	9	1125212	1125220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853661
18599	NC_021822	AC	3	6	1125219	1125224	50 %	0 %	0 %	50 %	525853661
18600	NC_021822	AAAC	2	8	1125245	1125252	75 %	0 %	0 %	25 %	525853661
18601	NC_021822	CCG	2	6	1125269	1125274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853661
18602	NC_021822	GAGTCT	2	12	1125328	1125339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525853661
18603	NC_021822	TCA	2	6	1125388	1125393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853661
18604	NC_021822	ACC	2	6	1125406	1125411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853661
18605	NC_021822	CAA	2	6	1125461	1125466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853661
18606	NC_021822	CAA	2	6	1125675	1125680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853661
18607	NC_021822	TACC	2	8	1125749	1125756	25 %	25 %	0 %	50 %	525853661
18608	NC_021822	CCAT	2	8	1125796	1125803	25 %	25 %	0 %	50 %	525853661
18609	NC_021822	GA	3	6	1125818	1125823	50 %	0 %	50 %	0 %	525853661
18610	NC_021822	AG	3	6	1125831	1125836	50 %	0 %	50 %	0 %	525853661
18611	NC_021822	CAC	2	6	1125854	1125859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853661
18612	NC_021822	CG	3	6	1125882	1125887	0 %	0 %	50 %	50 %	525853661
18613	NC_021822	AC	3	6	1125950	1125955	50 %	0 %	0 %	50 %	525853661
18614	NC_021822	ACC	2	6	1125987	1125992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853661
18615	NC_021822	CGG	2	6	1125996	1126001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853661
18616	NC_021822	TGC	2	6	1126009	1126014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853661
18617	NC_021822	TCAA	2	8	1126138	1126145	50 %	25 %	0 %	25 %	525853661
18618	NC_021822	TTC	2	6	1126170	1126175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853661
18619	NC_021822	TC	4	8	1126174	1126181	0 %	50 %	0 %	50 %	525853661
18620	NC_021822	AAT	2	6	1126210	1126215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853661
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18732	NC_021822	TTC	2	6	1131540	1131545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853665
18733	NC_021822	ACCA	2	8	1131582	1131589	50 %	0 %	0 %	50 %	525853665
18734	NC_021822	AGGCAG	2	12	1131612	1131623	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525853665
18735	NC_021822	CGCA	2	8	1131660	1131667	25 %	0 %	25 %	50 %	525853665
18736	NC_021822	CGT	2	6	1131729	1131734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853665
18737	NC_021822	T	6	6	1131831	1131836	0 %	100 %	0 %	0 %	525853665
18738	NC_021822	ATCA	2	8	1131852	1131859	50 %	25 %	0 %	25 %	525853665
18739	NC_021822	ATC	2	6	1131867	1131872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853665
18740	NC_021822	ATG	2	6	1131904	1131909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853665
18741	NC_021822	CTTTCG	2	12	1131983	1131994	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525853665
18742	NC_021822	CTT	2	6	1132016	1132021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853665
18743	NC_021822	CATG	2	8	1132022	1132029	25 %	25 %	25 %	25 %	525853665
18744	NC_021822	GATA	2	8	1132037	1132044	50 %	25 %	25 %	0 %	525853665
18745	NC_021822	TGC	2	6	1132270	1132275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853665
18746	NC_021822	CTC	2	6	1132346	1132351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854390
18747	NC_021822	TTC	2	6	1132364	1132369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854390
18748	NC_021822	CTT	2	6	1132408	1132413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854390
18749	NC_021822	CAC	2	6	1132478	1132483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854390
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18751	NC_021822	TTC	2	6	1132523	1132528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854390
18752	NC_021822	ATG	2	6	1132539	1132544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854390
18753	NC_021822	TTC	2	6	1132565	1132570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854390
18754	NC_021822	AAG	2	6	1132604	1132609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854390
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18756	NC_021822	TCT	2	6	1132749	1132754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854390
18757	NC_021822	GTT	2	6	1132796	1132801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854390
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18759	NC_021822	ACCA	2	8	1132820	1132827	50 %	0 %	0 %	50 %	525854390
18760	NC_021822	TGT	2	6	1132831	1132836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854390
18761	NC_021822	TG	3	6	1132849	1132854	0 %	50 %	50 %	0 %	525854390
18762	NC_021822	CGT	2	6	1132927	1132932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854390
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18769	NC_021822	GCTG	2	8	1133601	1133608	0 %	25 %	50 %	25 %	525853667
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18802	NC_021822	CGG	2	6	1135418	1135423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853668
18803	NC_021822	GTG	2	6	1135441	1135446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853668
18804	NC_021822	TTG	2	6	1135466	1135471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853668
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18833	NC_021822	GCCAA	2	10	1136917	1136926	40 %	0 %	20 %	40 %	525853670
18834	NC_021822	CTG	2	6	1136946	1136951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853670
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18837	NC_021822	CT	3	6	1137305	1137310	0 %	50 %	0 %	50 %	525853670
18838	NC_021822	CAA	2	6	1137314	1137319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853670
18839	NC_021822	TTGA	2	8	1137320	1137327	25 %	50 %	25 %	0 %	525853670
18840	NC_021822	CAT	2	6	1137337	1137342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853670
18841	NC_021822	CAA	2	6	1137344	1137349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853670
18842	NC_021822	GGC	2	6	1137388	1137393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853670
18843	NC_021822	ACC	2	6	1137437	1137442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853670
18844	NC_021822	TTGTT	2	10	1137530	1137539	0 %	80 %	20 %	0 %	525853670
18845	NC_021822	GGC	2	6	1137557	1137562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853670
18846	NC_021822	A	7	7	1137582	1137588	100 %	0 %	0 %	0 %	525853670
18847	NC_021822	TAG	2	6	1137598	1137603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853670
18848	NC_021822	AGC	2	6	1137653	1137658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853670
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18850	NC_021822	TCCGAC	2	12	1137683	1137694	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	525853670
18851	NC_021822	ACCA	2	8	1137747	1137754	50 %	0 %	0 %	50 %	525853670
18852	NC_021822	CTA	2	6	1137904	1137909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853670
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18855	NC_021822	ACG	2	6	1137981	1137986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853670
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18953	NC_021822	CATC	2	8	1144409	1144416	25 %	25 %	0 %	50 %	525853675
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