MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_021822	GCT	2	6	1029495	1029500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853586
17002	NC_021822	ACC	2	6	1029505	1029510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853586
17003	NC_021822	TGC	2	6	1029542	1029547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853586
17004	NC_021822	AAT	2	6	1029662	1029667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853586
17005	NC_021822	ACC	2	6	1029683	1029688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853586
17006	NC_021822	CGC	2	6	1029735	1029740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853586
17007	NC_021822	TAA	2	6	1029913	1029918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853586
17008	NC_021822	TTG	2	6	1029954	1029959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853587
17009	NC_021822	GCA	2	6	1029989	1029994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853587
17010	NC_021822	TGA	2	6	1030031	1030036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853587
17011	NC_021822	CCA	2	6	1030040	1030045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853587
17012	NC_021822	ATG	2	6	1030058	1030063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853587
17013	NC_021822	GAGC	2	8	1030118	1030125	25 %	0 %	50 %	25 %	525853587
17014	NC_021822	AAAG	2	8	1030162	1030169	75 %	0 %	25 %	0 %	525853587
17015	NC_021822	TGC	2	6	1030225	1030230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853587
17016	NC_021822	CAC	2	6	1030231	1030236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853587
17017	NC_021822	CAG	2	6	1030295	1030300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853587
17018	NC_021822	AG	3	6	1030345	1030350	50 %	0 %	50 %	0 %	525853587
17019	NC_021822	TCA	2	6	1030378	1030383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853587
17020	NC_021822	CAC	2	6	1030401	1030406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853587
17021	NC_021822	CAGTCA	2	12	1030550	1030561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525853587
17022	NC_021822	GAA	2	6	1030584	1030589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853587
17023	NC_021822	GCA	2	6	1030651	1030656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853587
17024	NC_021822	CTG	2	6	1030734	1030739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853587
17025	NC_021822	TC	3	6	1030786	1030791	0 %	50 %	0 %	50 %	525853587
17026	NC_021822	A	7	7	1030813	1030819	100 %	0 %	0 %	0 %	525853587
17027	NC_021822	ATTT	2	8	1031035	1031042	25 %	75 %	0 %	0 %	525853588
17028	NC_021822	TGT	2	6	1031065	1031070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853588
17029	NC_021822	GT	3	6	1031078	1031083	0 %	50 %	50 %	0 %	525853588
17030	NC_021822	T	6	6	1031129	1031134	0 %	100 %	0 %	0 %	525853588
17031	NC_021822	AC	3	6	1031140	1031145	50 %	0 %	0 %	50 %	525853588
17032	NC_021822	GCT	2	6	1031166	1031171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853588
17033	NC_021822	ATC	2	6	1031222	1031227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853588
17034	NC_021822	GCG	2	6	1031255	1031260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853588
17035	NC_021822	GTA	2	6	1031291	1031296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853588
17036	NC_021822	GAA	2	6	1031318	1031323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853588
17037	NC_021822	CTT	2	6	1031446	1031451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853588
17038	NC_021822	GTT	2	6	1031576	1031581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853588
17039	NC_021822	CAC	2	6	1031603	1031608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853588
17040	NC_021822	TCG	2	6	1031689	1031694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853588
17041	NC_021822	GGC	3	9	1031706	1031714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853588
17042	NC_021822	TGT	2	6	1031752	1031757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853588
17043	NC_021822	CCA	2	6	1031793	1031798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853588
17044	NC_021822	ACG	2	6	1031892	1031897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853588
17045	NC_021822	GCT	2	6	1031944	1031949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853588
17046	NC_021822	TCG	2	6	1032061	1032066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853588
17047	NC_021822	CTGCC	2	10	1032077	1032086	0 %	20 %	20 %	60 %	525853588
17048	NC_021822	GC	3	6	1032094	1032099	0 %	0 %	50 %	50 %	525853588
17049	NC_021822	TTGC	2	8	1032145	1032152	0 %	50 %	25 %	25 %	525853588
17050	NC_021822	A	6	6	1032185	1032190	100 %	0 %	0 %	0 %	525853588
17051	NC_021822	GCG	2	6	1032214	1032219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853588
17052	NC_021822	TAA	2	6	1032235	1032240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853588
17053	NC_021822	GTG	2	6	1032297	1032302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853588
17054	NC_021822	TTC	2	6	1032649	1032654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854376
17055	NC_021822	ATTGC	2	10	1032680	1032689	20 %	40 %	20 %	20 %	525854376
17056	NC_021822	TCA	2	6	1032740	1032745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854376
17057	NC_021822	CCA	2	6	1032764	1032769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854376
17058	NC_021822	ATTC	2	8	1032813	1032820	25 %	50 %	0 %	25 %	525854376
17059	NC_021822	TC	3	6	1032819	1032824	0 %	50 %	0 %	50 %	525854376
17060	NC_021822	GAT	2	6	1032937	1032942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854376
17061	NC_021822	AAG	2	6	1032960	1032965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854376
17062	NC_021822	CGA	2	6	1032992	1032997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854376
17063	NC_021822	GGTT	2	8	1033014	1033021	0 %	50 %	50 %	0 %	525854376
17064	NC_021822	GAT	2	6	1033095	1033100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854376
17065	NC_021822	CAG	2	6	1033159	1033164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854376
17066	NC_021822	TTGA	2	8	1033187	1033194	25 %	50 %	25 %	0 %	525854376
17067	NC_021822	GAA	2	6	1033287	1033292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854377
17068	NC_021822	CAAG	2	8	1033309	1033316	50 %	0 %	25 %	25 %	525854377
17069	NC_021822	CTG	2	6	1033419	1033424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854377
17070	NC_021822	TCT	2	6	1033510	1033515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854377
17071	NC_021822	GCC	2	6	1033570	1033575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854377
17072	NC_021822	GAC	2	6	1033584	1033589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854377
17073	NC_021822	ACC	2	6	1033593	1033598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854377
17074	NC_021822	AACC	2	8	1033607	1033614	50 %	0 %	0 %	50 %	525854377
17075	NC_021822	TCA	3	9	1033723	1033731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854377
17076	NC_021822	AG	3	6	1033757	1033762	50 %	0 %	50 %	0 %	525854377
17077	NC_021822	CCA	2	6	1034053	1034058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854377
17078	NC_021822	TCG	2	6	1034104	1034109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854377
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17082	NC_021822	TCT	2	6	1034485	1034490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853589
17083	NC_021822	AGT	2	6	1034546	1034551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853589
17084	NC_021822	AGC	2	6	1034689	1034694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853589
17085	NC_021822	TTC	2	6	1034794	1034799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853589
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17087	NC_021822	AC	3	6	1034870	1034875	50 %	0 %	0 %	50 %	525853589
17088	NC_021822	TCT	2	6	1034884	1034889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853589
17089	NC_021822	TCT	2	6	1034929	1034934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853589
17090	NC_021822	GCC	2	6	1035037	1035042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853589
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17094	NC_021822	CGAC	2	8	1035268	1035275	25 %	0 %	25 %	50 %	525853589
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17098	NC_021822	CAATCA	2	12	1035373	1035384	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525853590
17099	NC_021822	TGA	2	6	1035478	1035483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853590
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17101	NC_021822	CTT	2	6	1035763	1035768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853590
17102	NC_021822	CCT	2	6	1035798	1035803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853590
17103	NC_021822	AAC	2	6	1035812	1035817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853590
17104	NC_021822	TTC	2	6	1035860	1035865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853590
17105	NC_021822	GCG	2	6	1035919	1035924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853590
17106	NC_021822	ACA	2	6	1035964	1035969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853590
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17108	NC_021822	TCT	2	6	1036089	1036094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853590
17109	NC_021822	TGCT	2	8	1036111	1036118	0 %	50 %	25 %	25 %	525853590
17110	NC_021822	ACTT	2	8	1036226	1036233	25 %	50 %	0 %	25 %	525853591
17111	NC_021822	CTG	2	6	1036264	1036269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853591
17112	NC_021822	TGA	2	6	1036286	1036291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853591
17113	NC_021822	TTTGA	2	10	1036306	1036315	20 %	60 %	20 %	0 %	525853591
17114	NC_021822	GTTT	2	8	1036350	1036357	0 %	75 %	25 %	0 %	525853591
17115	NC_021822	AAC	2	6	1036428	1036433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853591
17116	NC_021822	GCT	2	6	1036450	1036455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853591
17117	NC_021822	ACC	2	6	1036553	1036558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853591
17118	NC_021822	ACGA	2	8	1036563	1036570	50 %	0 %	25 %	25 %	525853591
17119	NC_021822	CAA	2	6	1036587	1036592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853591
17120	NC_021822	T	6	6	1036673	1036678	0 %	100 %	0 %	0 %	525853591
17121	NC_021822	AC	3	6	1036776	1036781	50 %	0 %	0 %	50 %	525853591
17122	NC_021822	GAC	2	6	1036820	1036825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853591
17123	NC_021822	TCA	2	6	1036949	1036954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853591
17124	NC_021822	AG	3	6	1037041	1037046	50 %	0 %	50 %	0 %	525853591
17125	NC_021822	GGTT	2	8	1037062	1037069	0 %	50 %	50 %	0 %	525853591
17126	NC_021822	GGC	2	6	1037080	1037085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853591
17127	NC_021822	CCA	2	6	1037152	1037157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853591
17128	NC_021822	TAC	2	6	1037197	1037202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853591
17129	NC_021822	TCAAAA	2	12	1037396	1037407	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525853591
17130	NC_021822	TCT	2	6	1037420	1037425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853591
17131	NC_021822	CCA	2	6	1037461	1037466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853591
17132	NC_021822	GCC	2	6	1037564	1037569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853591
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17136	NC_021822	CGCC	2	8	1037876	1037883	0 %	0 %	25 %	75 %	525853591
17137	NC_021822	TGA	2	6	1037961	1037966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853591
17138	NC_021822	TTGA	2	8	1037998	1038005	25 %	50 %	25 %	0 %	525853591
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17140	NC_021822	GCT	2	6	1038095	1038100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853591
17141	NC_021822	CTT	2	6	1038132	1038137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853591
17142	NC_021822	AGC	2	6	1038215	1038220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853591
17143	NC_021822	T	6	6	1038248	1038253	0 %	100 %	0 %	0 %	525853591
17144	NC_021822	TGC	2	6	1038275	1038280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853591
17145	NC_021822	GATC	2	8	1038300	1038307	25 %	25 %	25 %	25 %	525853591
17146	NC_021822	TC	5	10	1038331	1038340	0 %	50 %	0 %	50 %	525853591
17147	NC_021822	TTG	2	6	1038343	1038348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853591
17148	NC_021822	CGA	2	6	1038353	1038358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853591
17149	NC_021822	GTC	2	6	1038424	1038429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853591
17150	NC_021822	ACA	2	6	1038443	1038448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853591
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17152	NC_021822	TCA	2	6	1038540	1038545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853591
17153	NC_021822	TAA	2	6	1038574	1038579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853591
17154	NC_021822	CTGAC	2	10	1038580	1038589	20 %	20 %	20 %	40 %	525853591
17155	NC_021822	ACAT	2	8	1038590	1038597	50 %	25 %	0 %	25 %	525853591
17156	NC_021822	CTT	2	6	1038678	1038683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853591
17157	NC_021822	CA	3	6	1038769	1038774	50 %	0 %	0 %	50 %	525853591
17158	NC_021822	CAA	2	6	1038810	1038815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853591
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17209	NC_021822	TATT	2	8	1042129	1042136	25 %	75 %	0 %	0 %	525853594
17210	NC_021822	GAC	2	6	1042166	1042171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853594
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17215	NC_021822	TAC	2	6	1042658	1042663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853594
17216	NC_021822	CAT	2	6	1042715	1042720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853594
17217	NC_021822	ATGCC	2	10	1042835	1042844	20 %	20 %	20 %	40 %	525853594
17218	NC_021822	CTC	2	6	1042907	1042912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853594
17219	NC_021822	TGAGCT	2	12	1042939	1042950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525853594
17220	NC_021822	TGT	2	6	1042968	1042973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853594
17221	NC_021822	CCAA	2	8	1042989	1042996	50 %	0 %	0 %	50 %	525853594
17222	NC_021822	TGC	2	6	1042998	1043003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853594
17223	NC_021822	GCC	2	6	1043015	1043020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853594
17224	NC_021822	GAA	3	9	1043051	1043059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853594
17225	NC_021822	GAA	2	6	1043081	1043086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853594
17226	NC_021822	TGGTG	2	10	1043230	1043239	0 %	40 %	60 %	0 %	525853594
17227	NC_021822	TAC	2	6	1043296	1043301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853594
17228	NC_021822	CGC	2	6	1043327	1043332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853594
17229	NC_021822	AGA	2	6	1043352	1043357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853594
17230	NC_021822	CGC	2	6	1043363	1043368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853594
17231	NC_021822	CTG	2	6	1043510	1043515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853594
17232	NC_021822	GAA	2	6	1043531	1043536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853594
17233	NC_021822	TGT	2	6	1043541	1043546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853594
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17459	NC_021822	CG	3	6	1058124	1058129	0 %	0 %	50 %	50 %	525853607
17460	NC_021822	TCA	2	6	1058149	1058154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853607
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17462	NC_021822	CAC	2	6	1058297	1058302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853607
17463	NC_021822	ATG	2	6	1058374	1058379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853607
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17465	NC_021822	CGC	2	6	1058396	1058401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853607
17466	NC_021822	ACT	2	6	1058431	1058436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853607
17467	NC_021822	CAC	2	6	1058438	1058443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853607
17468	NC_021822	CAC	2	6	1058450	1058455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853607
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17472	NC_021822	GCA	2	6	1058761	1058766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853607
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17492	NC_021822	GAT	2	6	1059667	1059672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853608
17493	NC_021822	TGT	2	6	1059708	1059713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853608
17494	NC_021822	A	6	6	1059721	1059726	100 %	0 %	0 %	0 %	525853608
17495	NC_021822	A	6	6	1059737	1059742	100 %	0 %	0 %	0 %	525853608
17496	NC_021822	CAA	2	6	1059750	1059755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853608
17497	NC_021822	TCAA	2	8	1059788	1059795	50 %	25 %	0 %	25 %	525853608
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17499	NC_021822	TCGG	2	8	1059830	1059837	0 %	25 %	50 %	25 %	525853608
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