MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_021822	TTCGA	2	10	997827	997836	20 %	40 %	20 %	20 %	525853566
16502	NC_021822	TCT	2	6	997872	997877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853566
16503	NC_021822	CTT	2	6	997903	997908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853566
16504	NC_021822	ATT	2	6	997988	997993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853566
16505	NC_021822	GTT	2	6	998038	998043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853566
16506	NC_021822	CTT	2	6	998053	998058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853566
16507	NC_021822	CTTTTT	2	12	998069	998080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	525853566
16508	NC_021822	GCA	2	6	998205	998210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853566
16509	NC_021822	GCTTG	2	10	998217	998226	0 %	40 %	40 %	20 %	525853566
16510	NC_021822	CAT	2	6	998236	998241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853566
16511	NC_021822	ATG	2	6	998253	998258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853566
16512	NC_021822	T	6	6	998360	998365	0 %	100 %	0 %	0 %	525853566
16513	NC_021822	AGT	2	6	998378	998383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853566
16514	NC_021822	CTC	2	6	998404	998409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853566
16515	NC_021822	AT	3	6	998428	998433	50 %	50 %	0 %	0 %	525853566
16516	NC_021822	AGC	2	6	998435	998440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853566
16517	NC_021822	ACC	3	9	998459	998467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853566
16518	NC_021822	AAGCA	2	10	998588	998597	60 %	0 %	20 %	20 %	525853566
16519	NC_021822	CAT	2	6	998620	998625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853566
16520	NC_021822	GGA	2	6	998634	998639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525853566
16521	NC_021822	T	6	6	998656	998661	0 %	100 %	0 %	0 %	525853566
16522	NC_021822	GGC	2	6	998728	998733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853566
16523	NC_021822	ATC	2	6	998751	998756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853566
16524	NC_021822	GCT	2	6	998855	998860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853566
16525	NC_021822	CCA	2	6	998883	998888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853566
16526	NC_021822	TCA	2	6	998959	998964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853566
16527	NC_021822	TCA	2	6	998979	998984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853566
16528	NC_021822	TTC	2	6	999023	999028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853566
16529	NC_021822	CA	3	6	999046	999051	50 %	0 %	0 %	50 %	525853566
16530	NC_021822	CAT	2	6	999065	999070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853566
16531	NC_021822	GTT	2	6	999142	999147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853566
16532	NC_021822	TCA	2	6	999162	999167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853566
16533	NC_021822	AATA	2	8	999193	999200	75 %	25 %	0 %	0 %	525853566
16534	NC_021822	GGAT	2	8	999203	999210	25 %	25 %	50 %	0 %	525853566
16535	NC_021822	CAA	2	6	999224	999229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853566
16536	NC_021822	ATG	2	6	999251	999256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853566
16537	NC_021822	GCC	2	6	999276	999281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853566
16538	NC_021822	T	6	6	999405	999410	0 %	100 %	0 %	0 %	525853567
16539	NC_021822	TTG	2	6	999438	999443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853567
16540	NC_021822	CTTT	2	8	999585	999592	0 %	75 %	0 %	25 %	525853567
16541	NC_021822	TTG	2	6	999611	999616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853567
16542	NC_021822	GCC	2	6	999837	999842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853567
16543	NC_021822	GAC	2	6	999880	999885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853567
16544	NC_021822	T	6	6	999913	999918	0 %	100 %	0 %	0 %	525853567
16545	NC_021822	ATA	2	6	999966	999971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853567
16546	NC_021822	CCA	2	6	1000010	1000015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853567
16547	NC_021822	CTT	2	6	1000028	1000033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853567
16548	NC_021822	TAG	2	6	1000142	1000147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853567
16549	NC_021822	TAAGT	2	10	1000191	1000200	40 %	40 %	20 %	0 %	525853567
16550	NC_021822	T	6	6	1000207	1000212	0 %	100 %	0 %	0 %	525853567
16551	NC_021822	CAAA	2	8	1000280	1000287	75 %	0 %	0 %	25 %	525853567
16552	NC_021822	AAC	2	6	1000329	1000334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853568
16553	NC_021822	GCT	2	6	1000373	1000378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853568
16554	NC_021822	TGTT	2	8	1000646	1000653	0 %	75 %	25 %	0 %	525853568
16555	NC_021822	CATC	2	8	1000729	1000736	25 %	25 %	0 %	50 %	525853568
16556	NC_021822	GA	4	8	1000755	1000762	50 %	0 %	50 %	0 %	525853568
16557	NC_021822	ATC	2	6	1000790	1000795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853568
16558	NC_021822	CCA	2	6	1000827	1000832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853568
16559	NC_021822	T	6	6	1000840	1000845	0 %	100 %	0 %	0 %	525853568
16560	NC_021822	AAC	2	6	1000914	1000919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853568
16561	NC_021822	CAA	2	6	1000933	1000938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853568
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16563	NC_021822	CT	3	6	1001130	1001135	0 %	50 %	0 %	50 %	525853568
16564	NC_021822	GAG	2	6	1001149	1001154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525853568
16565	NC_021822	TCAA	2	8	1001346	1001353	50 %	25 %	0 %	25 %	525853568
16566	NC_021822	CTC	2	6	1001444	1001449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853568
16567	NC_021822	AACC	2	8	1001458	1001465	50 %	0 %	0 %	50 %	525853568
16568	NC_021822	TTAG	2	8	1001481	1001488	25 %	50 %	25 %	0 %	525853568
16569	NC_021822	ATA	2	6	1001733	1001738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853568
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16571	NC_021822	A	6	6	1001982	1001987	100 %	0 %	0 %	0 %	525853568
16572	NC_021822	TTC	2	6	1002032	1002037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853568
16573	NC_021822	GTA	2	6	1002122	1002127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853568
16574	NC_021822	GAATT	2	10	1002194	1002203	40 %	40 %	20 %	0 %	525853569
16575	NC_021822	ATCA	2	8	1002223	1002230	50 %	25 %	0 %	25 %	525853569
16576	NC_021822	T	7	7	1002275	1002281	0 %	100 %	0 %	0 %	525853569
16577	NC_021822	CA	3	6	1002351	1002356	50 %	0 %	0 %	50 %	525853569
16578	NC_021822	GCT	2	6	1002376	1002381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853569
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16580	NC_021822	CCAA	2	8	1002463	1002470	50 %	0 %	0 %	50 %	525853569
16581	NC_021822	CTGA	2	8	1002526	1002533	25 %	25 %	25 %	25 %	525853569
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16584	NC_021822	TTA	2	6	1002632	1002637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853570
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16587	NC_021822	CCTTCA	2	12	1002805	1002816	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525853570
16588	NC_021822	GATTT	2	10	1002877	1002886	20 %	60 %	20 %	0 %	525853570
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16590	NC_021822	ACC	2	6	1002954	1002959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853570
16591	NC_021822	ATC	2	6	1002966	1002971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853570
16592	NC_021822	TTC	2	6	1003032	1003037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853570
16593	NC_021822	TTAG	2	8	1003111	1003118	25 %	50 %	25 %	0 %	525853570
16594	NC_021822	TTC	2	6	1003119	1003124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853570
16595	NC_021822	CA	3	6	1003130	1003135	50 %	0 %	0 %	50 %	525853570
16596	NC_021822	AGC	2	6	1003182	1003187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853570
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16598	NC_021822	GCTC	2	8	1003267	1003274	0 %	25 %	25 %	50 %	525853570
16599	NC_021822	TAG	2	6	1003356	1003361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853570
16600	NC_021822	TTG	2	6	1003371	1003376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853570
16601	NC_021822	TCTT	2	8	1003415	1003422	0 %	75 %	0 %	25 %	525853570
16602	NC_021822	TAAT	2	8	1003455	1003462	50 %	50 %	0 %	0 %	525853571
16603	NC_021822	TC	3	6	1003545	1003550	0 %	50 %	0 %	50 %	525853571
16604	NC_021822	CTTCG	2	10	1003561	1003570	0 %	40 %	20 %	40 %	525853571
16605	NC_021822	AC	3	6	1003730	1003735	50 %	0 %	0 %	50 %	525853571
16606	NC_021822	ATCT	2	8	1003929	1003936	25 %	50 %	0 %	25 %	525853571
16607	NC_021822	CAA	2	6	1003980	1003985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853571
16608	NC_021822	AACC	2	8	1004033	1004040	50 %	0 %	0 %	50 %	525853571
16609	NC_021822	CAG	2	6	1004067	1004072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853571
16610	NC_021822	ATC	2	6	1004221	1004226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853571
16611	NC_021822	CGA	2	6	1004293	1004298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853571
16612	NC_021822	GCA	3	9	1004366	1004374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853571
16613	NC_021822	AAT	2	6	1004415	1004420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853571
16614	NC_021822	TCC	2	6	1004476	1004481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853571
16615	NC_021822	TACT	2	8	1004559	1004566	25 %	50 %	0 %	25 %	525853571
16616	NC_021822	GAT	2	6	1004682	1004687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853571
16617	NC_021822	GCT	2	6	1004703	1004708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853571
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16619	NC_021822	CCAA	2	8	1004790	1004797	50 %	0 %	0 %	50 %	525853571
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16733	NC_021822	TTG	2	6	1010467	1010472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853577
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16736	NC_021822	TGC	2	6	1010694	1010699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853577
16737	NC_021822	ATA	2	6	1010886	1010891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853577
16738	NC_021822	ATC	2	6	1010946	1010951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853577
16739	NC_021822	TTC	2	6	1010967	1010972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853577
16740	NC_021822	GCTC	2	8	1011076	1011083	0 %	25 %	25 %	50 %	525853577
16741	NC_021822	TGC	2	6	1011213	1011218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853577
16742	NC_021822	TCG	2	6	1011253	1011258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853577
16743	NC_021822	CTT	2	6	1011365	1011370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853577
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16745	NC_021822	TGC	2	6	1011436	1011441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853577
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16748	NC_021822	TGC	2	6	1011525	1011530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853577
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16750	NC_021822	CT	3	6	1011673	1011678	0 %	50 %	0 %	50 %	525853577
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16755	NC_021822	CTT	2	6	1012001	1012006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853577
16756	NC_021822	GGCT	2	8	1012041	1012048	0 %	25 %	50 %	25 %	525853577
16757	NC_021822	GC	3	6	1012185	1012190	0 %	0 %	50 %	50 %	525853577
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16763	NC_021822	T	6	6	1012393	1012398	0 %	100 %	0 %	0 %	525853577
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16772	NC_021822	TGC	2	6	1012939	1012944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853577
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16840	NC_021822	T	6	6	1018803	1018808	0 %	100 %	0 %	0 %	525854372
16841	NC_021822	CGT	2	6	1018853	1018858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854372
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16844	NC_021822	CAAC	2	8	1018936	1018943	50 %	0 %	0 %	50 %	525854372
16845	NC_021822	CAA	2	6	1018982	1018987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854372
16846	NC_021822	CTA	2	6	1019221	1019226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854372
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16852	NC_021822	TTC	2	6	1019519	1019524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854372
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16973	NC_021822	CGC	2	6	1027860	1027865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853585
16974	NC_021822	TGT	2	6	1027922	1027927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853585
16975	NC_021822	ACC	2	6	1027972	1027977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853585
16976	NC_021822	AGT	2	6	1028077	1028082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853585
16977	NC_021822	CGG	2	6	1028144	1028149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853585
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16981	NC_021822	CTCG	2	8	1028276	1028283	0 %	25 %	25 %	50 %	525853585
16982	NC_021822	CAGC	2	8	1028297	1028304	25 %	0 %	25 %	50 %	525853585
16983	NC_021822	TCT	2	6	1028465	1028470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853585
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16987	NC_021822	CTT	2	6	1028634	1028639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853585
16988	NC_021822	TCA	2	6	1028653	1028658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853585
16989	NC_021822	CT	3	6	1028790	1028795	0 %	50 %	0 %	50 %	525853585
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16992	NC_021822	CGA	2	6	1028996	1029001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853585
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