MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_021822	CTTT	2	8	937704	937711	0 %	75 %	0 %	25 %	525853522
15502	NC_021822	GCA	2	6	937722	937727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853522
15503	NC_021822	CAA	2	6	937782	937787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853522
15504	NC_021822	GGT	2	6	937803	937808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853522
15505	NC_021822	CAT	2	6	937833	937838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853522
15506	NC_021822	GGT	2	6	937870	937875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853522
15507	NC_021822	AAG	2	6	937969	937974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853523
15508	NC_021822	ATCA	2	8	937978	937985	50 %	25 %	0 %	25 %	525853523
15509	NC_021822	AGA	2	6	938003	938008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853523
15510	NC_021822	CAA	2	6	938034	938039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853523
15511	NC_021822	GC	3	6	938064	938069	0 %	0 %	50 %	50 %	525853523
15512	NC_021822	GAA	2	6	938083	938088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853523
15513	NC_021822	TCT	2	6	938098	938103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853523
15514	NC_021822	CTG	2	6	938126	938131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853523
15515	NC_021822	AAAAG	2	10	938142	938151	80 %	0 %	20 %	0 %	525853523
15516	NC_021822	CGC	3	9	938252	938260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853524
15517	NC_021822	GTG	2	6	938307	938312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853524
15518	NC_021822	TCA	2	6	938319	938324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853524
15519	NC_021822	CAG	2	6	938378	938383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853524
15520	NC_021822	GTG	2	6	938391	938396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853524
15521	NC_021822	TTG	2	6	938409	938414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853524
15522	NC_021822	CAT	2	6	938419	938424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853524
15523	NC_021822	AAT	2	6	938464	938469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853524
15524	NC_021822	GCC	2	6	938484	938489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853524
15525	NC_021822	TGCT	2	8	938509	938516	0 %	50 %	25 %	25 %	525853524
15526	NC_021822	GCT	2	6	938600	938605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853524
15527	NC_021822	AAT	2	6	938611	938616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853524
15528	NC_021822	GCT	2	6	938644	938649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853524
15529	NC_021822	AGT	2	6	938713	938718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853524
15530	NC_021822	CGC	2	6	938723	938728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853524
15531	NC_021822	CGGTAT	2	12	938740	938751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525853524
15532	NC_021822	GTA	2	6	938876	938881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853524
15533	NC_021822	TCA	2	6	938937	938942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853524
15534	NC_021822	AAAC	2	8	938969	938976	75 %	0 %	0 %	25 %	525853524
15535	NC_021822	AC	3	6	939019	939024	50 %	0 %	0 %	50 %	525853524
15536	NC_021822	TTC	2	6	939042	939047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853524
15537	NC_021822	ATC	2	6	939068	939073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853524
15538	NC_021822	TTG	2	6	939078	939083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853524
15539	NC_021822	AT	3	6	939087	939092	50 %	50 %	0 %	0 %	525853524
15540	NC_021822	TTGA	2	8	939125	939132	25 %	50 %	25 %	0 %	525853524
15541	NC_021822	ATCGA	2	10	939269	939278	40 %	20 %	20 %	20 %	525853524
15542	NC_021822	TTG	2	6	939365	939370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853524
15543	NC_021822	CAAT	2	8	939430	939437	50 %	25 %	0 %	25 %	525853524
15544	NC_021822	TGA	2	6	939438	939443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853524
15545	NC_021822	CAA	2	6	939532	939537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853524
15546	NC_021822	GCTG	2	8	939577	939584	0 %	25 %	50 %	25 %	525853524
15547	NC_021822	CCA	2	6	939780	939785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853524
15548	NC_021822	ATC	2	6	939815	939820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853524
15549	NC_021822	GCT	2	6	939821	939826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853524
15550	NC_021822	CCG	2	6	939843	939848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853524
15551	NC_021822	T	6	6	939884	939889	0 %	100 %	0 %	0 %	525853524
15552	NC_021822	TGA	2	6	939892	939897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853524
15553	NC_021822	ACC	2	6	939908	939913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853524
15554	NC_021822	GAC	2	6	939997	940002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853524
15555	NC_021822	ATCA	2	8	940034	940041	50 %	25 %	0 %	25 %	525853524
15556	NC_021822	GCC	2	6	940088	940093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853524
15557	NC_021822	AAG	2	6	940108	940113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853524
15558	NC_021822	AGAA	2	8	940124	940131	75 %	0 %	25 %	0 %	525853524
15559	NC_021822	TTG	2	6	940160	940165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853524
15560	NC_021822	TCT	2	6	940173	940178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853524
15561	NC_021822	CAAAC	2	10	940186	940195	60 %	0 %	0 %	40 %	525853524
15562	NC_021822	CTG	2	6	940258	940263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853524
15563	NC_021822	TGCG	2	8	940304	940311	0 %	25 %	50 %	25 %	525853524
15564	NC_021822	GTT	2	6	940459	940464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853525
15565	NC_021822	T	6	6	940497	940502	0 %	100 %	0 %	0 %	525853525
15566	NC_021822	GCT	2	6	940503	940508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853525
15567	NC_021822	CTTC	2	8	940533	940540	0 %	50 %	0 %	50 %	525853525
15568	NC_021822	AGC	3	9	940555	940563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853525
15569	NC_021822	ATG	2	6	940671	940676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853525
15570	NC_021822	TGA	2	6	940746	940751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853525
15571	NC_021822	CTGC	2	8	940828	940835	0 %	25 %	25 %	50 %	525853525
15572	NC_021822	CAAT	2	8	940837	940844	50 %	25 %	0 %	25 %	525853525
15573	NC_021822	TG	3	6	940847	940852	0 %	50 %	50 %	0 %	525853525
15574	NC_021822	TAGA	2	8	940956	940963	50 %	25 %	25 %	0 %	525853525
15575	NC_021822	CAG	2	6	940989	940994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853525
15576	NC_021822	GAA	2	6	941183	941188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853525
15577	NC_021822	AAT	2	6	941481	941486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854365
15578	NC_021822	AAC	2	6	941520	941525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854365
15579	NC_021822	TA	3	6	941577	941582	50 %	50 %	0 %	0 %	525854365
15580	NC_021822	TGT	2	6	941612	941617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854365
15581	NC_021822	TGG	2	6	941667	941672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853526
15582	NC_021822	TTGGT	2	10	941699	941708	0 %	60 %	40 %	0 %	525853526
15583	NC_021822	TCTTTA	2	12	941717	941728	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525853526
15584	NC_021822	GCC	2	6	941733	941738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853526
15585	NC_021822	CCTCC	2	10	941741	941750	0 %	20 %	0 %	80 %	525853526
15586	NC_021822	ATC	2	6	941767	941772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853526
15587	NC_021822	GGT	2	6	941812	941817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853526
15588	NC_021822	ACTT	2	8	941896	941903	25 %	50 %	0 %	25 %	525853526
15589	NC_021822	GGC	3	9	942003	942011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853526
15590	NC_021822	TAC	2	6	942067	942072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853526
15591	NC_021822	CT	3	6	942082	942087	0 %	50 %	0 %	50 %	525853526
15592	NC_021822	CTT	2	6	942109	942114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853526
15593	NC_021822	GAA	2	6	942208	942213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853526
15594	NC_021822	TG	3	6	942237	942242	0 %	50 %	50 %	0 %	525853526
15595	NC_021822	CAA	2	6	942293	942298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853526
15596	NC_021822	TCG	2	6	942344	942349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853526
15597	NC_021822	ATG	3	9	942424	942432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853526
15598	NC_021822	CGG	2	6	942441	942446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853526
15599	NC_021822	TTC	2	6	942452	942457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853526
15600	NC_021822	TGG	2	6	942515	942520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853526
15601	NC_021822	TACT	2	8	942558	942565	25 %	50 %	0 %	25 %	525853526
15602	NC_021822	GTT	2	6	942642	942647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853526
15603	NC_021822	TGT	2	6	942657	942662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853526
15604	NC_021822	AGC	2	6	942675	942680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853526
15605	NC_021822	ATG	2	6	942691	942696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853526
15606	NC_021822	CTTGG	2	10	942709	942718	0 %	40 %	40 %	20 %	525853526
15607	NC_021822	CTT	2	6	942768	942773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853526
15608	NC_021822	ATC	2	6	942925	942930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853526
15609	NC_021822	ATC	3	9	943043	943051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853527
15610	NC_021822	CGA	2	6	943057	943062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853527
15611	NC_021822	CAAT	2	8	943074	943081	50 %	25 %	0 %	25 %	525853527
15612	NC_021822	CTT	2	6	943124	943129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853527
15613	NC_021822	GCT	2	6	943138	943143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853527
15614	NC_021822	CCA	2	6	943153	943158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853527
15615	NC_021822	TGA	2	6	943326	943331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853527
15616	NC_021822	TAC	2	6	943382	943387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853527
15617	NC_021822	TAA	2	6	943461	943466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853527
15618	NC_021822	T	6	6	943495	943500	0 %	100 %	0 %	0 %	525853527
15619	NC_021822	ATGG	2	8	943637	943644	25 %	25 %	50 %	0 %	525853528
15620	NC_021822	ATG	2	6	943755	943760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853528
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15623	NC_021822	GTC	2	6	943823	943828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853528
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15628	NC_021822	TTGA	2	8	944012	944019	25 %	50 %	25 %	0 %	525853528
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15739	NC_021822	CTG	2	6	951375	951380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853534
15740	NC_021822	TCA	2	6	951432	951437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853534
15741	NC_021822	TGG	2	6	951481	951486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853534
15742	NC_021822	TCC	2	6	951523	951528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853534
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15744	NC_021822	TGG	2	6	951784	951789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853534
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15755	NC_021822	AC	3	6	952643	952648	50 %	0 %	0 %	50 %	525853535
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15771	NC_021822	GACA	2	8	953508	953515	50 %	0 %	25 %	25 %	525853535
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15776	NC_021822	ATCA	2	8	953796	953803	50 %	25 %	0 %	25 %	525853535
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15840	NC_021822	GTTA	2	8	959214	959221	25 %	50 %	25 %	0 %	525853536
15841	NC_021822	ACA	2	6	959278	959283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853536
15842	NC_021822	CA	4	8	959304	959311	50 %	0 %	0 %	50 %	525853536
15843	NC_021822	GCA	2	6	959419	959424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853536
15844	NC_021822	ACT	2	6	959475	959480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853536
15845	NC_021822	ATC	2	6	959484	959489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853536
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15851	NC_021822	GATA	2	8	959993	960000	50 %	25 %	25 %	0 %	525853536
15852	NC_021822	GTA	2	6	960108	960113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853536
15853	NC_021822	CAC	2	6	960125	960130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853536
15854	NC_021822	TCA	2	6	960202	960207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853536
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15856	NC_021822	GCA	2	6	960289	960294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853536
15857	NC_021822	TCG	2	6	960299	960304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853536
15858	NC_021822	ACAG	2	8	960346	960353	50 %	0 %	25 %	25 %	525853536
15859	NC_021822	CG	4	8	960421	960428	0 %	0 %	50 %	50 %	525853536
15860	NC_021822	GAA	2	6	960469	960474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853536
15861	NC_021822	AGA	2	6	960554	960559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853536
15862	NC_021822	CTGA	2	8	960671	960678	25 %	25 %	25 %	25 %	525853536
15863	NC_021822	GAC	2	6	960701	960706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853536
15864	NC_021822	TGTT	2	8	960742	960749	0 %	75 %	25 %	0 %	525853536
15865	NC_021822	GCTT	2	8	960781	960788	0 %	50 %	25 %	25 %	525853536
15866	NC_021822	TAT	2	6	960800	960805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853536
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15870	NC_021822	ACT	2	6	961847	961852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853537
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15872	NC_021822	GCT	2	6	962021	962026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853537
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15876	NC_021822	CTGT	2	8	962228	962235	0 %	50 %	25 %	25 %	525853537
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15895	NC_021822	CTG	2	6	963648	963653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853538
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15946	NC_021822	T	6	6	967937	967942	0 %	100 %	0 %	0 %	525853542
15947	NC_021822	TTA	2	6	967954	967959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853542
15948	NC_021822	AAATC	2	10	967999	968008	60 %	20 %	0 %	20 %	525853542
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15951	NC_021822	GAA	2	6	968220	968225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853542
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15953	NC_021822	CAA	2	6	968309	968314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853542
15954	NC_021822	TCTA	2	8	968333	968340	25 %	50 %	0 %	25 %	525853542
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15958	NC_021822	CATC	2	8	968461	968468	25 %	25 %	0 %	50 %	525853542
15959	NC_021822	TTG	2	6	968548	968553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853542
15960	NC_021822	ATCG	2	8	968598	968605	25 %	25 %	25 %	25 %	525853542
15961	NC_021822	GCAGT	2	10	968716	968725	20 %	20 %	40 %	20 %	525853542
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15963	NC_021822	CACG	2	8	968789	968796	25 %	0 %	25 %	50 %	525853542
15964	NC_021822	ACC	2	6	968884	968889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853542
15965	NC_021822	GCT	2	6	968961	968966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853542
15966	NC_021822	CAAA	2	8	969045	969052	75 %	0 %	0 %	25 %	525853542
15967	NC_021822	CTTG	2	8	969053	969060	0 %	50 %	25 %	25 %	525853542
15968	NC_021822	CGC	2	6	969068	969073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853542
15969	NC_021822	AGC	2	6	969080	969085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853542
15970	NC_021822	GC	4	8	969084	969091	0 %	0 %	50 %	50 %	525853542
15971	NC_021822	TGT	2	6	969116	969121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853542
15972	NC_021822	CAA	2	6	969163	969168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853542
15973	NC_021822	ATC	2	6	969183	969188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853542
15974	NC_021822	AGC	2	6	969190	969195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853542
15975	NC_021822	TGA	2	6	969289	969294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853542
15976	NC_021822	CTAAA	2	10	969516	969525	60 %	20 %	0 %	20 %	525853542
15977	NC_021822	CTT	2	6	969655	969660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853543
15978	NC_021822	TGC	2	6	969672	969677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853543
15979	NC_021822	CTCCA	2	10	969713	969722	20 %	20 %	0 %	60 %	525853543
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15982	NC_021822	ATC	2	6	969759	969764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853543
15983	NC_021822	CA	3	6	969824	969829	50 %	0 %	0 %	50 %	525853543
15984	NC_021822	TGA	2	6	969857	969862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853543
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15987	NC_021822	A	6	6	970102	970107	100 %	0 %	0 %	0 %	525853543
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15998	NC_021822	AAAG	2	8	970561	970568	75 %	0 %	25 %	0 %	525853543
15999	NC_021822	ACA	2	6	970687	970692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853543
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