MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_021822	TTGAT	2	10	783940	783949	20 %	60 %	20 %	0 %	525853409
13002	NC_021822	GTG	2	6	783961	783966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853409
13003	NC_021822	CTT	3	9	783971	783979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853409
13004	NC_021822	TAA	2	6	784011	784016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853409
13005	NC_021822	TGC	2	6	784140	784145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853410
13006	NC_021822	TGT	2	6	784203	784208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853410
13007	NC_021822	TGC	2	6	784356	784361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853410
13008	NC_021822	CGG	2	6	784448	784453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853410
13009	NC_021822	CAA	2	6	784515	784520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853410
13010	NC_021822	GTG	2	6	784549	784554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853410
13011	NC_021822	GAA	2	6	784623	784628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853410
13012	NC_021822	CTG	2	6	784679	784684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853410
13013	NC_021822	CCA	2	6	784686	784691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853410
13014	NC_021822	CCATTG	2	12	784734	784745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525853410
13015	NC_021822	CA	3	6	784780	784785	50 %	0 %	0 %	50 %	525853410
13016	NC_021822	ATC	2	6	784849	784854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853410
13017	NC_021822	T	6	6	784979	784984	0 %	100 %	0 %	0 %	525853411
13018	NC_021822	CGTG	2	8	784999	785006	0 %	25 %	50 %	25 %	525853411
13019	NC_021822	ATC	2	6	785013	785018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853411
13020	NC_021822	CATA	2	8	785123	785130	50 %	25 %	0 %	25 %	525853411
13021	NC_021822	TGC	2	6	785154	785159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853411
13022	NC_021822	GGATA	2	10	785176	785185	40 %	20 %	40 %	0 %	525853411
13023	NC_021822	CTT	2	6	785245	785250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853411
13024	NC_021822	TAAGG	2	10	785282	785291	40 %	20 %	40 %	0 %	525853411
13025	NC_021822	GA	3	6	785360	785365	50 %	0 %	50 %	0 %	525853411
13026	NC_021822	CTT	2	6	785404	785409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853411
13027	NC_021822	CA	3	6	785470	785475	50 %	0 %	0 %	50 %	525853411
13028	NC_021822	ACG	2	6	785478	785483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853411
13029	NC_021822	CGA	2	6	785563	785568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853411
13030	NC_021822	TTC	2	6	785809	785814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853412
13031	NC_021822	AGAT	2	8	785833	785840	50 %	25 %	25 %	0 %	525853412
13032	NC_021822	TCA	2	6	785901	785906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853412
13033	NC_021822	GGA	2	6	785911	785916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525853412
13034	NC_021822	CTG	2	6	785985	785990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853412
13035	NC_021822	GCAA	2	8	786035	786042	50 %	0 %	25 %	25 %	525853412
13036	NC_021822	TGA	2	6	786146	786151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853412
13037	NC_021822	TGA	2	6	786172	786177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853412
13038	NC_021822	CAG	2	6	786227	786232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853412
13039	NC_021822	TGCGA	2	10	786268	786277	20 %	20 %	40 %	20 %	525853412
13040	NC_021822	CGC	2	6	786313	786318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853412
13041	NC_021822	CCG	2	6	786324	786329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853412
13042	NC_021822	AAT	2	6	786355	786360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853412
13043	NC_021822	ATC	2	6	786410	786415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853412
13044	NC_021822	CGC	2	6	786528	786533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853412
13045	NC_021822	ATG	2	6	786545	786550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853412
13046	NC_021822	CAT	2	6	786567	786572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853412
13047	NC_021822	CTT	2	6	786579	786584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853412
13048	NC_021822	ACT	2	6	786593	786598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853412
13049	NC_021822	GAAA	2	8	786691	786698	75 %	0 %	25 %	0 %	525853412
13050	NC_021822	CAT	2	6	786894	786899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853412
13051	NC_021822	AGC	2	6	786902	786907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853412
13052	NC_021822	TTGA	2	8	787018	787025	25 %	50 %	25 %	0 %	525853412
13053	NC_021822	AC	3	6	787086	787091	50 %	0 %	0 %	50 %	525853412
13054	NC_021822	CG	3	6	787135	787140	0 %	0 %	50 %	50 %	525853412
13055	NC_021822	TAGT	2	8	787212	787219	25 %	50 %	25 %	0 %	525853412
13056	NC_021822	TTC	2	6	787440	787445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853413
13057	NC_021822	TTC	2	6	787468	787473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853413
13058	NC_021822	AAG	2	6	787494	787499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853413
13059	NC_021822	CAG	2	6	787514	787519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853413
13060	NC_021822	CCAG	2	8	787520	787527	25 %	0 %	25 %	50 %	525853413
13061	NC_021822	GA	3	6	787541	787546	50 %	0 %	50 %	0 %	525853413
13062	NC_021822	GCG	2	6	787618	787623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853413
13063	NC_021822	ACC	2	6	787719	787724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853413
13064	NC_021822	GAA	2	6	787782	787787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853413
13065	NC_021822	GAT	2	6	787869	787874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853413
13066	NC_021822	CTT	2	6	787958	787963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853413
13067	NC_021822	AAG	2	6	787982	787987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853413
13068	NC_021822	GA	3	6	788000	788005	50 %	0 %	50 %	0 %	525853413
13069	NC_021822	GCT	2	6	788023	788028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853413
13070	NC_021822	GGTT	2	8	788043	788050	0 %	50 %	50 %	0 %	525853413
13071	NC_021822	CGA	2	6	788074	788079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853413
13072	NC_021822	TTGC	2	8	788081	788088	0 %	50 %	25 %	25 %	525853413
13073	NC_021822	TTC	2	6	788115	788120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853413
13074	NC_021822	GAA	2	6	788178	788183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853413
13075	NC_021822	GCT	2	6	788194	788199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853413
13076	NC_021822	GC	3	6	788233	788238	0 %	0 %	50 %	50 %	525853413
13077	NC_021822	GTT	2	6	788333	788338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853413
13078	NC_021822	AC	3	6	788363	788368	50 %	0 %	0 %	50 %	525853413
13079	NC_021822	AGA	2	6	788426	788431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853413
13080	NC_021822	GTG	2	6	788437	788442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853413
13081	NC_021822	AGT	2	6	788476	788481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853413
13082	NC_021822	AG	3	6	788482	788487	50 %	0 %	50 %	0 %	525853413
13083	NC_021822	GAA	3	9	788559	788567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853413
13084	NC_021822	TTC	2	6	788589	788594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853413
13085	NC_021822	T	7	7	788625	788631	0 %	100 %	0 %	0 %	525853413
13086	NC_021822	ACA	2	6	788632	788637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853413
13087	NC_021822	AGA	2	6	788660	788665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853413
13088	NC_021822	CGT	2	6	789101	789106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853414
13089	NC_021822	CTT	2	6	789110	789115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853414
13090	NC_021822	GGTGC	2	10	789116	789125	0 %	20 %	60 %	20 %	525853414
13091	NC_021822	CAC	2	6	789132	789137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853414
13092	NC_021822	GCA	2	6	789146	789151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853414
13093	NC_021822	TC	3	6	789180	789185	0 %	50 %	0 %	50 %	525853414
13094	NC_021822	TGG	2	6	789204	789209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853414
13095	NC_021822	GCA	2	6	789220	789225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853414
13096	NC_021822	TCAA	2	8	789265	789272	50 %	25 %	0 %	25 %	525853414
13097	NC_021822	TCG	2	6	789326	789331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853414
13098	NC_021822	GTC	2	6	789379	789384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853414
13099	NC_021822	TAA	2	6	789427	789432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853414
13100	NC_021822	ATT	2	6	789486	789491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853414
13101	NC_021822	GTCAC	2	10	789555	789564	20 %	20 %	20 %	40 %	525853414
13102	NC_021822	CGA	2	6	789678	789683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853414
13103	NC_021822	TCT	2	6	789686	789691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853414
13104	NC_021822	CGA	2	6	789744	789749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853414
13105	NC_021822	CCTA	2	8	789827	789834	25 %	25 %	0 %	50 %	525853414
13106	NC_021822	AATC	2	8	789844	789851	50 %	25 %	0 %	25 %	525853414
13107	NC_021822	AAG	2	6	789903	789908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853414
13108	NC_021822	AGC	2	6	789926	789931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853414
13109	NC_021822	AAC	2	6	790131	790136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853414
13110	NC_021822	AAC	2	6	790158	790163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853414
13111	NC_021822	AGT	2	6	790359	790364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853414
13112	NC_021822	GCA	2	6	790418	790423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854336
13113	NC_021822	GTG	2	6	790438	790443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854336
13114	NC_021822	TTG	2	6	790495	790500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854336
13115	NC_021822	CCG	2	6	790563	790568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854336
13116	NC_021822	ACA	2	6	790592	790597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854336
13117	NC_021822	CTGA	2	8	790606	790613	25 %	25 %	25 %	25 %	525854336
13118	NC_021822	CGC	2	6	790774	790779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854336
13119	NC_021822	AAG	2	6	790850	790855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854336
13120	NC_021822	GAAA	2	8	790887	790894	75 %	0 %	25 %	0 %	525854336
13121	NC_021822	CGG	2	6	790949	790954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854336
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13238	NC_021822	AAG	2	6	798463	798468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853418
13239	NC_021822	CGT	2	6	798498	798503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853418
13240	NC_021822	GC	3	6	798527	798532	0 %	0 %	50 %	50 %	525853418
13241	NC_021822	TGA	2	6	798536	798541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853418
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13243	NC_021822	TGG	2	6	798785	798790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853418
13244	NC_021822	TGG	2	6	798842	798847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853418
13245	NC_021822	GAC	2	6	798860	798865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853418
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13249	NC_021822	CTT	2	6	799048	799053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853418
13250	NC_021822	TGA	2	6	799063	799068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853418
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13254	NC_021822	ACTG	2	8	799350	799357	25 %	25 %	25 %	25 %	525853418
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13262	NC_021822	CGG	2	6	799847	799852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853418
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13333	NC_021822	CTT	2	6	804360	804365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853421
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13342	NC_021822	TCT	2	6	804683	804688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853421
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13344	NC_021822	GCA	2	6	804857	804862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853421
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13350	NC_021822	AATC	2	8	805026	805033	50 %	25 %	0 %	25 %	525853421
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13357	NC_021822	GGT	2	6	805245	805250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853421
13358	NC_021822	AAT	2	6	805362	805367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853421
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13360	NC_021822	CTA	2	6	805425	805430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853421
13361	NC_021822	CT	3	6	805457	805462	0 %	50 %	0 %	50 %	525853421
13362	NC_021822	CAT	2	6	805512	805517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853421
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13370	NC_021822	ATGA	2	8	806545	806552	50 %	25 %	25 %	0 %	525853423
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13462	NC_021822	GAC	2	6	812765	812770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853428
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13469	NC_021822	GCA	2	6	813221	813226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853429
13470	NC_021822	AC	3	6	813257	813262	50 %	0 %	0 %	50 %	525853429
13471	NC_021822	TTGT	2	8	813274	813281	0 %	75 %	25 %	0 %	525853429
13472	NC_021822	GT	3	6	813280	813285	0 %	50 %	50 %	0 %	525853429
13473	NC_021822	CGG	2	6	813287	813292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853429
13474	NC_021822	TGA	2	6	813422	813427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853429
13475	NC_021822	TTC	2	6	813475	813480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853429
13476	NC_021822	ACAA	2	8	813496	813503	75 %	0 %	0 %	25 %	525853429
13477	NC_021822	AAGCGT	2	12	813645	813656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525853429
13478	NC_021822	CAA	2	6	813693	813698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853429
13479	NC_021822	CAAG	2	8	813719	813726	50 %	0 %	25 %	25 %	525853429
13480	NC_021822	CGA	2	6	813731	813736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853429
13481	NC_021822	TGA	2	6	813821	813826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853429
13482	NC_021822	CAAG	2	8	813830	813837	50 %	0 %	25 %	25 %	525853429
13483	NC_021822	GGC	2	6	813869	813874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853429
13484	NC_021822	GTG	2	6	813906	813911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853429
13485	NC_021822	CG	3	6	813969	813974	0 %	0 %	50 %	50 %	525853429
13486	NC_021822	GAA	2	6	814014	814019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853429
13487	NC_021822	GTT	2	6	814043	814048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853429
13488	NC_021822	TGG	2	6	814124	814129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853429
13489	NC_021822	GTC	2	6	814132	814137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853429
13490	NC_021822	TCGT	2	8	814145	814152	0 %	50 %	25 %	25 %	525853429
13491	NC_021822	GCAA	2	8	814303	814310	50 %	0 %	25 %	25 %	525853430
13492	NC_021822	T	6	6	814338	814343	0 %	100 %	0 %	0 %	525853430
13493	NC_021822	TTAAG	2	10	814346	814355	40 %	40 %	20 %	0 %	525853430
13494	NC_021822	TGA	2	6	814481	814486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853430
13495	NC_021822	CTCG	2	8	814508	814515	0 %	25 %	25 %	50 %	525853430
13496	NC_021822	GTC	2	6	814539	814544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853430
13497	NC_021822	TCG	2	6	814580	814585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853430
13498	NC_021822	AACT	2	8	814623	814630	50 %	25 %	0 %	25 %	525853430
13499	NC_021822	TTTG	2	8	814640	814647	0 %	75 %	25 %	0 %	525853430
13500	NC_021822	AAGA	2	8	814740	814747	75 %	0 %	25 %	0 %	525853430

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