MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_021822	ATT	2	6	640934	640939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854300
10503	NC_021822	GGC	2	6	640940	640945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854300
10504	NC_021822	CAG	2	6	641001	641006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854300
10505	NC_021822	TTG	2	6	641022	641027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854300
10506	NC_021822	ATT	2	6	641072	641077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854300
10507	NC_021822	TGA	2	6	641082	641087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854300
10508	NC_021822	TGTT	2	8	641211	641218	0 %	75 %	25 %	0 %	525854300
10509	NC_021822	GTTA	2	8	641239	641246	25 %	50 %	25 %	0 %	525854300
10510	NC_021822	CAA	2	6	641432	641437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854300
10511	NC_021822	CTG	2	6	641487	641492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854300
10512	NC_021822	AATC	2	8	641539	641546	50 %	25 %	0 %	25 %	525854300
10513	NC_021822	TTG	2	6	641574	641579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854300
10514	NC_021822	TCTA	2	8	641711	641718	25 %	50 %	0 %	25 %	525854300
10515	NC_021822	TGC	2	6	641748	641753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854300
10516	NC_021822	AGTA	2	8	641797	641804	50 %	25 %	25 %	0 %	525854300
10517	NC_021822	ATT	2	6	641900	641905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854300
10518	NC_021822	TCG	2	6	641932	641937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854300
10519	NC_021822	AGA	2	6	641965	641970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854300
10520	NC_021822	TTGG	2	8	642143	642150	0 %	50 %	50 %	0 %	525854301
10521	NC_021822	AGTG	2	8	642305	642312	25 %	25 %	50 %	0 %	525854301
10522	NC_021822	TCT	2	6	642471	642476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854301
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10525	NC_021822	TGGA	2	8	642533	642540	25 %	25 %	50 %	0 %	525854301
10526	NC_021822	TTGG	2	8	642572	642579	0 %	50 %	50 %	0 %	525854301
10527	NC_021822	TAG	2	6	642636	642641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854301
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10529	NC_021822	ATCC	2	8	642681	642688	25 %	25 %	0 %	50 %	525854301
10530	NC_021822	TCTG	2	8	642690	642697	0 %	50 %	25 %	25 %	525854301
10531	NC_021822	AAG	2	6	642747	642752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854301
10532	NC_021822	ACT	2	6	642783	642788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854301
10533	NC_021822	CAG	2	6	642865	642870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854301
10534	NC_021822	AGTTC	2	10	642882	642891	20 %	40 %	20 %	20 %	525854301
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10536	NC_021822	ATTA	2	8	642959	642966	50 %	50 %	0 %	0 %	525854301
10537	NC_021822	ATC	2	6	643314	643319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854302
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10539	NC_021822	A	7	7	643370	643376	100 %	0 %	0 %	0 %	525854302
10540	NC_021822	ATC	2	6	643411	643416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854302
10541	NC_021822	CTA	2	6	643420	643425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854302
10542	NC_021822	TAT	2	6	643460	643465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854302
10543	NC_021822	AGA	2	6	643529	643534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854302
10544	NC_021822	CAT	2	6	643547	643552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854302
10545	NC_021822	TTG	2	6	643561	643566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854302
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10547	NC_021822	TGA	2	6	643747	643752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854302
10548	NC_021822	ATGG	3	12	643769	643780	25 %	25 %	50 %	0 %	525854302
10549	NC_021822	TGG	2	6	643784	643789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854302
10550	NC_021822	TG	3	6	643800	643805	0 %	50 %	50 %	0 %	525854302
10551	NC_021822	TTC	2	6	643829	643834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854302
10552	NC_021822	CAA	2	6	643844	643849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854302
10553	NC_021822	TTGTGG	2	12	643922	643933	0 %	50 %	50 %	0 %	525854302
10554	NC_021822	TAA	2	6	643979	643984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854302
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10556	NC_021822	CAT	2	6	644013	644018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854302
10557	NC_021822	ACA	2	6	644032	644037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854302
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10561	NC_021822	TCG	2	6	644264	644269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854302
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10564	NC_021822	TTTA	2	8	644697	644704	25 %	75 %	0 %	0 %	525854303
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10571	NC_021822	TGAT	2	8	645023	645030	25 %	50 %	25 %	0 %	525854303
10572	NC_021822	ACG	2	6	645071	645076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854303
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10574	NC_021822	ATCG	2	8	645169	645176	25 %	25 %	25 %	25 %	525854303
10575	NC_021822	GGTGC	2	10	645196	645205	0 %	20 %	60 %	20 %	525854303
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10580	NC_021822	AAG	2	6	645461	645466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854303
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10586	NC_021822	CGACA	2	10	645774	645783	40 %	0 %	20 %	40 %	525854303
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10588	NC_021822	AGCGAC	2	12	645936	645947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854303
10589	NC_021822	ACTACA	2	12	645950	645961	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525854303
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10591	NC_021822	GCA	2	6	646044	646049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854303
10592	NC_021822	GCT	2	6	646057	646062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854303
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10597	NC_021822	AAGC	2	8	646353	646360	50 %	0 %	25 %	25 %	525854303
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10600	NC_021822	GA	3	6	646673	646678	50 %	0 %	50 %	0 %	525854303
10601	NC_021822	TAC	2	6	646680	646685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854303
10602	NC_021822	GAA	2	6	646725	646730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854303
10603	NC_021822	GATT	2	8	646749	646756	25 %	50 %	25 %	0 %	525854303
10604	NC_021822	TCG	2	6	646807	646812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854303
10605	NC_021822	TGA	2	6	646851	646856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854303
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10607	NC_021822	CAG	2	6	647093	647098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854304
10608	NC_021822	TTG	2	6	647106	647111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854304
10609	NC_021822	TGA	2	6	647172	647177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854304
10610	NC_021822	GCAA	2	8	647181	647188	50 %	0 %	25 %	25 %	525854304
10611	NC_021822	TGGAAG	2	12	647229	647240	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525854304
10612	NC_021822	GTC	2	6	647256	647261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854304
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10614	NC_021822	AAGA	2	8	647414	647421	75 %	0 %	25 %	0 %	525854304
10615	NC_021822	CTG	2	6	647525	647530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854304
10616	NC_021822	ATG	2	6	647531	647536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854304
10617	NC_021822	ATC	2	6	647540	647545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854304
10618	NC_021822	TG	3	6	647589	647594	0 %	50 %	50 %	0 %	525854304
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10620	NC_021822	AGC	2	6	647623	647628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854304
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10737	NC_021822	CAAAA	2	10	654175	654184	80 %	0 %	0 %	20 %	525854308
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10981	NC_021822	CGA	2	6	667732	667737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854317
10982	NC_021822	TGA	2	6	667892	667897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854317
10983	NC_021822	TATC	2	8	667904	667911	25 %	50 %	0 %	25 %	525854317
10984	NC_021822	GGTTAT	2	12	667944	667955	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525854317
10985	NC_021822	GCT	2	6	667974	667979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854317
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10991	NC_021822	A	8	8	668262	668269	100 %	0 %	0 %	0 %	525854317
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11000	NC_021822	TTGA	2	8	668733	668740	25 %	50 %	25 %	0 %	525854317

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