MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021822	TGT	2	6	369960	369965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853148
6002	NC_021822	GTG	2	6	369967	369972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853148
6003	NC_021822	GTT	3	9	370033	370041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853148
6004	NC_021822	TGA	2	6	370073	370078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853148
6005	NC_021822	TGG	2	6	370095	370100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853148
6006	NC_021822	ATA	2	6	370137	370142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853148
6007	NC_021822	GTAATA	2	12	370215	370226	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525853148
6008	NC_021822	TTA	2	6	370298	370303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853148
6009	NC_021822	GTA	2	6	370320	370325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853148
6010	NC_021822	GCG	2	6	370361	370366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853148
6011	NC_021822	TGT	3	9	370470	370478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853148
6012	NC_021822	AC	3	6	370496	370501	50 %	0 %	0 %	50 %	525853148
6013	NC_021822	GTT	2	6	370627	370632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853149
6014	NC_021822	AGC	2	6	370683	370688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853149
6015	NC_021822	TCT	2	6	370707	370712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853149
6016	NC_021822	GTCA	2	8	370757	370764	25 %	25 %	25 %	25 %	525853149
6017	NC_021822	AG	3	6	370770	370775	50 %	0 %	50 %	0 %	525853149
6018	NC_021822	CTCG	2	8	370819	370826	0 %	25 %	25 %	50 %	525853149
6019	NC_021822	ATT	2	6	371058	371063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853150
6020	NC_021822	TCAG	2	8	371064	371071	25 %	25 %	25 %	25 %	525853150
6021	NC_021822	GCT	2	6	371157	371162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853150
6022	NC_021822	TGA	2	6	371172	371177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853150
6023	NC_021822	TGT	2	6	371202	371207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853150
6024	NC_021822	TGA	2	6	371237	371242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853150
6025	NC_021822	GCT	2	6	371289	371294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853150
6026	NC_021822	AACT	2	8	371354	371361	50 %	25 %	0 %	25 %	525853150
6027	NC_021822	TAGA	2	8	371378	371385	50 %	25 %	25 %	0 %	525853150
6028	NC_021822	TGCT	2	8	372185	372192	0 %	50 %	25 %	25 %	525853151
6029	NC_021822	CCT	2	6	372201	372206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853151
6030	NC_021822	CTT	2	6	372217	372222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853151
6031	NC_021822	TGT	2	6	372224	372229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853151
6032	NC_021822	GGT	2	6	372289	372294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853151
6033	NC_021822	TTGT	2	8	372377	372384	0 %	75 %	25 %	0 %	525853151
6034	NC_021822	CAT	2	6	372399	372404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853151
6035	NC_021822	A	6	6	372425	372430	100 %	0 %	0 %	0 %	525853151
6036	NC_021822	CT	3	6	372448	372453	0 %	50 %	0 %	50 %	525853151
6037	NC_021822	CTG	2	6	372509	372514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853151
6038	NC_021822	TTG	2	6	372563	372568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853151
6039	NC_021822	TTGCTC	2	12	372587	372598	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525853151
6040	NC_021822	GTC	2	6	372697	372702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853151
6041	NC_021822	ACA	2	6	372722	372727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853151
6042	NC_021822	AAG	2	6	372728	372733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853151
6043	NC_021822	GTT	2	6	372804	372809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853151
6044	NC_021822	GCC	2	6	372828	372833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853151
6045	NC_021822	CAC	2	6	373023	373028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853151
6046	NC_021822	ATT	2	6	373099	373104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853151
6047	NC_021822	ACA	2	6	373172	373177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853151
6048	NC_021822	TGG	2	6	373191	373196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853151
6049	NC_021822	CTA	2	6	373240	373245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853151
6050	NC_021822	GT	3	6	373528	373533	0 %	50 %	50 %	0 %	525854244
6051	NC_021822	CAT	3	9	373587	373595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854244
6052	NC_021822	CAC	2	6	373602	373607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854244
6053	NC_021822	CAT	2	6	373638	373643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854244
6054	NC_021822	GCC	2	6	373667	373672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854244
6055	NC_021822	TAC	2	6	373683	373688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854244
6056	NC_021822	ATT	2	6	373762	373767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854244
6057	NC_021822	TCG	2	6	373769	373774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854244
6058	NC_021822	AT	3	6	373787	373792	50 %	50 %	0 %	0 %	525854244
6059	NC_021822	GTT	3	9	373981	373989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853152
6060	NC_021822	CAA	2	6	374001	374006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853152
6061	NC_021822	CAT	2	6	374088	374093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853152
6062	NC_021822	CTTTG	2	10	374133	374142	0 %	60 %	20 %	20 %	525853152
6063	NC_021822	TGC	2	6	374193	374198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853152
6064	NC_021822	TGT	2	6	374206	374211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853152
6065	NC_021822	GCA	2	6	374303	374308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853152
6066	NC_021822	GGTT	2	8	374322	374329	0 %	50 %	50 %	0 %	525853152
6067	NC_021822	TTGCTG	2	12	374373	374384	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525853152
6068	NC_021822	CTT	2	6	374400	374405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853152
6069	NC_021822	CAC	2	6	374461	374466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853152
6070	NC_021822	TGA	2	6	374467	374472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853152
6071	NC_021822	CTT	2	6	374496	374501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853152
6072	NC_021822	GCG	2	6	374513	374518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853152
6073	NC_021822	GTT	2	6	374527	374532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853152
6074	NC_021822	GACA	2	8	374551	374558	50 %	0 %	25 %	25 %	525853152
6075	NC_021822	TCGATT	2	12	374676	374687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525853152
6076	NC_021822	CTG	3	9	374695	374703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853152
6077	NC_021822	GCGTT	2	10	374773	374782	0 %	40 %	40 %	20 %	525853152
6078	NC_021822	GAT	2	6	374893	374898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853152
6079	NC_021822	TCA	2	6	374954	374959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853152
6080	NC_021822	GGTA	2	8	375068	375075	25 %	25 %	50 %	0 %	525853152
6081	NC_021822	TACT	2	8	375098	375105	25 %	50 %	0 %	25 %	525853152
6082	NC_021822	TCG	2	6	375120	375125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853152
6083	NC_021822	GTTTT	2	10	375241	375250	0 %	80 %	20 %	0 %	525853152
6084	NC_021822	GAT	2	6	375268	375273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853152
6085	NC_021822	ACC	2	6	375311	375316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853152
6086	NC_021822	CGT	3	9	375390	375398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853152
6087	NC_021822	AACCAA	2	12	375426	375437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853152
6088	NC_021822	TCTT	2	8	375542	375549	0 %	75 %	0 %	25 %	525853152
6089	NC_021822	TTG	2	6	375649	375654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853152
6090	NC_021822	TAG	2	6	375661	375666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853152
6091	NC_021822	AGC	2	6	375680	375685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853152
6092	NC_021822	AACA	2	8	376239	376246	75 %	0 %	0 %	25 %	525853153
6093	NC_021822	TAG	3	9	376278	376286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853153
6094	NC_021822	TGC	2	6	376329	376334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853153
6095	NC_021822	TAAG	2	8	376458	376465	50 %	25 %	25 %	0 %	525853153
6096	NC_021822	GAAT	2	8	376466	376473	50 %	25 %	25 %	0 %	525853153
6097	NC_021822	CTT	2	6	376589	376594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853153
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6099	NC_021822	TGC	2	6	376706	376711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853153
6100	NC_021822	T	8	8	376726	376733	0 %	100 %	0 %	0 %	525853153
6101	NC_021822	GGC	2	6	376744	376749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853153
6102	NC_021822	AAC	2	6	376842	376847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853153
6103	NC_021822	CAA	2	6	376886	376891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853153
6104	NC_021822	TGCT	2	8	376930	376937	0 %	50 %	25 %	25 %	525853153
6105	NC_021822	ATG	2	6	376973	376978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853153
6106	NC_021822	AGGT	2	8	377004	377011	25 %	25 %	50 %	0 %	525853153
6107	NC_021822	TTACT	2	10	377027	377036	20 %	60 %	0 %	20 %	525853153
6108	NC_021822	GC	3	6	377042	377047	0 %	0 %	50 %	50 %	525853153
6109	NC_021822	AGA	2	6	377059	377064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853153
6110	NC_021822	AGT	2	6	377074	377079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853153
6111	NC_021822	AGA	2	6	377128	377133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853153
6112	NC_021822	GCC	2	6	377148	377153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853153
6113	NC_021822	TTC	2	6	377160	377165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853153
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6115	NC_021822	TCA	2	6	377198	377203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853153
6116	NC_021822	GCA	2	6	377209	377214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853153
6117	NC_021822	AAC	2	6	377229	377234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853153
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6119	NC_021822	ATA	2	6	377341	377346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853153
6120	NC_021822	CAG	2	6	377454	377459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853153
6121	NC_021822	GAA	2	6	377481	377486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853153
6122	NC_021822	GTT	2	6	377526	377531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853153
6123	NC_021822	ATAA	2	8	378112	378119	75 %	25 %	0 %	0 %	525853154
6124	NC_021822	A	6	6	378145	378150	100 %	0 %	0 %	0 %	525853154
6125	NC_021822	AGA	2	6	378155	378160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853154
6126	NC_021822	AAC	2	6	378169	378174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853154
6127	NC_021822	CGG	2	6	378184	378189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853154
6128	NC_021822	TG	3	6	378254	378259	0 %	50 %	50 %	0 %	525853154
6129	NC_021822	GTG	2	6	378286	378291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853154
6130	NC_021822	ATC	2	6	378292	378297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853154
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6134	NC_021822	AAC	3	9	378942	378950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854245
6135	NC_021822	TGC	2	6	378960	378965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854245
6136	NC_021822	AAC	2	6	378970	378975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854245
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6140	NC_021822	GT	3	6	379472	379477	0 %	50 %	50 %	0 %	525853155
6141	NC_021822	TGA	3	9	379494	379502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853155
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6144	NC_021822	AGA	2	6	379626	379631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853155
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6151	NC_021822	GTT	2	6	379803	379808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853155
6152	NC_021822	GATCC	2	10	379816	379825	20 %	20 %	20 %	40 %	525853155
6153	NC_021822	GTG	2	6	379834	379839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853155
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6155	NC_021822	ATCA	2	8	379964	379971	50 %	25 %	0 %	25 %	525853155
6156	NC_021822	TAA	2	6	379998	380003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853155
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6159	NC_021822	GTT	2	6	380306	380311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853156
6160	NC_021822	CGA	2	6	380328	380333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853156
6161	NC_021822	GTC	2	6	380342	380347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853156
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6170	NC_021822	GTT	3	9	381134	381142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853156
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6177	NC_021822	TG	3	6	381536	381541	0 %	50 %	50 %	0 %	525853157
6178	NC_021822	GTC	2	6	381606	381611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853157
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6186	NC_021822	GT	4	8	382326	382333	0 %	50 %	50 %	0 %	525853157
6187	NC_021822	GT	3	6	382349	382354	0 %	50 %	50 %	0 %	525853157
6188	NC_021822	T	6	6	382362	382367	0 %	100 %	0 %	0 %	525853157
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6192	NC_021822	TCG	2	6	382561	382566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853157
6193	NC_021822	CTG	2	6	382605	382610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853157
6194	NC_021822	TGA	2	6	382631	382636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853157
6195	NC_021822	TGC	2	6	382726	382731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853157
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6199	NC_021822	CTT	2	6	382913	382918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853157
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6202	NC_021822	TC	3	6	383144	383149	0 %	50 %	0 %	50 %	525853157
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6211	NC_021822	TC	3	6	383863	383868	0 %	50 %	0 %	50 %	525853158
6212	NC_021822	GAC	2	6	384031	384036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853158
6213	NC_021822	TGA	2	6	384037	384042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853158
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6215	NC_021822	ATC	2	6	384125	384130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853158
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6219	NC_021822	AATCC	2	10	384452	384461	40 %	20 %	0 %	40 %	525853158
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6221	NC_021822	GAT	3	9	384597	384605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853159
6222	NC_021822	TATC	2	8	384633	384640	25 %	50 %	0 %	25 %	525853159
6223	NC_021822	TGGT	2	8	384716	384723	0 %	50 %	50 %	0 %	525853159
6224	NC_021822	GT	3	6	384728	384733	0 %	50 %	50 %	0 %	525853159
6225	NC_021822	GAC	3	9	384770	384778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853159
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6227	NC_021822	GGAT	2	8	385018	385025	25 %	25 %	50 %	0 %	525853159
6228	NC_021822	TGC	2	6	385064	385069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853159
6229	NC_021822	TTG	2	6	385075	385080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853159
6230	NC_021822	AACA	2	8	385182	385189	75 %	0 %	0 %	25 %	525853159
6231	NC_021822	GCA	2	6	385272	385277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853159
6232	NC_021822	TGA	2	6	385313	385318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853159
6233	NC_021822	TTG	2	6	385336	385341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853159
6234	NC_021822	CGT	2	6	385350	385355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853159
6235	NC_021822	TGA	2	6	385400	385405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853159
6236	NC_021822	TGT	3	9	385532	385540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853159
6237	NC_021822	GTTT	2	8	385607	385614	0 %	75 %	25 %	0 %	525853159
6238	NC_021822	ATCAGC	2	12	385646	385657	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525853159
6239	NC_021822	TATT	2	8	385669	385676	25 %	75 %	0 %	0 %	525853159
6240	NC_021822	TGG	2	6	385703	385708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853159
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6242	NC_021822	ACT	2	6	386045	386050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853160
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6281	NC_021822	GCCA	2	8	388008	388015	25 %	0 %	25 %	50 %	525853163
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6477	NC_021822	TGCT	2	8	399838	399845	0 %	50 %	25 %	25 %	525853173
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6482	NC_021822	T	6	6	400055	400060	0 %	100 %	0 %	0 %	525853173
6483	NC_021822	GAA	2	6	400081	400086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853173
6484	NC_021822	TATC	2	8	400129	400136	25 %	50 %	0 %	25 %	525853173
6485	NC_021822	GGC	2	6	400137	400142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853173
6486	NC_021822	GA	3	6	400204	400209	50 %	0 %	50 %	0 %	525853173
6487	NC_021822	TCA	2	6	400274	400279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853173
6488	NC_021822	CGC	2	6	400291	400296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853173
6489	NC_021822	ATC	2	6	400342	400347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853174
6490	NC_021822	GTTCGG	2	12	400393	400404	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525853174
6491	NC_021822	TG	3	6	400434	400439	0 %	50 %	50 %	0 %	525853174
6492	NC_021822	TGG	2	6	400656	400661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853174
6493	NC_021822	CAA	2	6	400708	400713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853174
6494	NC_021822	CAA	2	6	400736	400741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853174
6495	NC_021822	TGGA	2	8	400746	400753	25 %	25 %	50 %	0 %	525853174
6496	NC_021822	AGC	2	6	400755	400760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853174
6497	NC_021822	ATAC	2	8	400811	400818	50 %	25 %	0 %	25 %	525853174
6498	NC_021822	TCC	3	9	400849	400857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853174
6499	NC_021822	TGA	2	6	400920	400925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853175
6500	NC_021822	TAA	2	6	400927	400932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853175

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