MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021822	GGTT	2	8	340868	340875	0 %	50 %	50 %	0 %	525853126
5502	NC_021822	TGG	2	6	340883	340888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853126
5503	NC_021822	TCG	2	6	340953	340958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853126
5504	NC_021822	AAT	2	6	340964	340969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853126
5505	NC_021822	GAA	2	6	340988	340993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853126
5506	NC_021822	GGT	2	6	341039	341044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853126
5507	NC_021822	CCA	2	6	341068	341073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853126
5508	NC_021822	TGA	2	6	341104	341109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853126
5509	NC_021822	TTG	2	6	341217	341222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853126
5510	NC_021822	CTCG	2	8	341260	341267	0 %	25 %	25 %	50 %	525853127
5511	NC_021822	CCTT	2	8	341330	341337	0 %	50 %	0 %	50 %	525853127
5512	NC_021822	TCA	2	6	341357	341362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853127
5513	NC_021822	TGG	2	6	341654	341659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853127
5514	NC_021822	TCA	2	6	341685	341690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853127
5515	NC_021822	TCGG	2	8	341735	341742	0 %	25 %	50 %	25 %	525853127
5516	NC_021822	TGA	2	6	341743	341748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853127
5517	NC_021822	GTA	2	6	341838	341843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853127
5518	NC_021822	GTC	2	6	341854	341859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853127
5519	NC_021822	CGAC	2	8	341867	341874	25 %	0 %	25 %	50 %	525853127
5520	NC_021822	ACG	2	6	341918	341923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853127
5521	NC_021822	C	6	6	341933	341938	0 %	0 %	0 %	100 %	525853127
5522	NC_021822	GAC	2	6	341951	341956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853127
5523	NC_021822	CTGC	2	8	342161	342168	0 %	25 %	25 %	50 %	525853127
5524	NC_021822	ACC	2	6	342265	342270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853127
5525	NC_021822	TTTGA	2	10	342358	342367	20 %	60 %	20 %	0 %	525853127
5526	NC_021822	CAG	2	6	342445	342450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853127
5527	NC_021822	CTT	2	6	342453	342458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853127
5528	NC_021822	TTG	2	6	342506	342511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853127
5529	NC_021822	AT	3	6	342602	342607	50 %	50 %	0 %	0 %	525853127
5530	NC_021822	GTT	2	6	342633	342638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853127
5531	NC_021822	GTT	2	6	342670	342675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853127
5532	NC_021822	GCT	2	6	342838	342843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853127
5533	NC_021822	CAA	2	6	342924	342929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853127
5534	NC_021822	TTGA	2	8	342950	342957	25 %	50 %	25 %	0 %	525853127
5535	NC_021822	TGTTTT	2	12	343062	343073	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525854240
5536	NC_021822	ACC	2	6	343126	343131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854240
5537	NC_021822	GCT	2	6	343139	343144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854240
5538	NC_021822	TAA	2	6	343173	343178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854240
5539	NC_021822	GAGC	2	8	343406	343413	25 %	0 %	50 %	25 %	525854240
5540	NC_021822	GCG	2	6	343433	343438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854240
5541	NC_021822	TTG	2	6	343532	343537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854240
5542	NC_021822	CTCA	2	8	343657	343664	25 %	25 %	0 %	50 %	525854240
5543	NC_021822	GT	3	6	343731	343736	0 %	50 %	50 %	0 %	525854240
5544	NC_021822	TGAA	2	8	343931	343938	50 %	25 %	25 %	0 %	525854240
5545	NC_021822	CTG	2	6	343993	343998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854240
5546	NC_021822	CCAA	2	8	344010	344017	50 %	0 %	0 %	50 %	525854240
5547	NC_021822	CGTG	2	8	344051	344058	0 %	25 %	50 %	25 %	525854240
5548	NC_021822	TTG	2	6	344083	344088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854240
5549	NC_021822	CTTT	2	8	344094	344101	0 %	75 %	0 %	25 %	525854240
5550	NC_021822	ACC	2	6	344203	344208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854240
5551	NC_021822	GATT	2	8	344362	344369	25 %	50 %	25 %	0 %	525854240
5552	NC_021822	CTT	2	6	344379	344384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854240
5553	NC_021822	TGGC	2	8	344400	344407	0 %	25 %	50 %	25 %	525854240
5554	NC_021822	CCA	2	6	344415	344420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854240
5555	NC_021822	GCA	2	6	344859	344864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853128
5556	NC_021822	CATGCT	2	12	344943	344954	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525853128
5557	NC_021822	CAT	2	6	345006	345011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853128
5558	NC_021822	CAT	2	6	345024	345029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853128
5559	NC_021822	GC	3	6	345047	345052	0 %	0 %	50 %	50 %	525853128
5560	NC_021822	CAG	2	6	345072	345077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853128
5561	NC_021822	AGA	2	6	345412	345417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853129
5562	NC_021822	AGC	2	6	345436	345441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5563	NC_021822	GT	3	6	345446	345451	0 %	50 %	50 %	0 %	525853129
5564	NC_021822	TG	3	6	345513	345518	0 %	50 %	50 %	0 %	525853129
5565	NC_021822	GTC	2	6	345584	345589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
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5568	NC_021822	CTG	2	6	345690	345695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5569	NC_021822	ATC	2	6	345738	345743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853129
5570	NC_021822	TTA	2	6	345759	345764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853129
5571	NC_021822	GT	3	6	345800	345805	0 %	50 %	50 %	0 %	525853129
5572	NC_021822	AGTG	2	8	345821	345828	25 %	25 %	50 %	0 %	525853129
5573	NC_021822	TGG	2	6	345840	345845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853129
5574	NC_021822	GCAGAT	2	12	345884	345895	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525853129
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5577	NC_021822	GTT	2	6	345956	345961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853129
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5581	NC_021822	CAA	2	6	346150	346155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853129
5582	NC_021822	CTGT	2	8	346206	346213	0 %	50 %	25 %	25 %	525853129
5583	NC_021822	ATT	2	6	346248	346253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853129
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5585	NC_021822	TGG	3	9	346351	346359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853129
5586	NC_021822	CGT	2	6	346391	346396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5587	NC_021822	TCG	2	6	346423	346428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5588	NC_021822	CGA	2	6	346435	346440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5589	NC_021822	TCG	2	6	346464	346469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5590	NC_021822	CGG	2	6	346512	346517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853129
5591	NC_021822	GTC	2	6	346596	346601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5592	NC_021822	CTT	2	6	346684	346689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853129
5593	NC_021822	GAT	2	6	346697	346702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853129
5594	NC_021822	TCG	2	6	346795	346800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5595	NC_021822	A	6	6	346922	346927	100 %	0 %	0 %	0 %	525853129
5596	NC_021822	CAGCG	2	10	347001	347010	20 %	0 %	40 %	40 %	525853129
5597	NC_021822	GCG	2	6	347069	347074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853129
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5601	NC_021822	GAT	2	6	347393	347398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853129
5602	NC_021822	GT	3	6	347485	347490	0 %	50 %	50 %	0 %	525853129
5603	NC_021822	TGG	2	6	347514	347519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853129
5604	NC_021822	TGTT	2	8	347610	347617	0 %	75 %	25 %	0 %	525853129
5605	NC_021822	TG	4	8	347682	347689	0 %	50 %	50 %	0 %	525853129
5606	NC_021822	GTTTTG	2	12	347697	347708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853129
5607	NC_021822	AGC	2	6	347717	347722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5608	NC_021822	ACCAC	2	10	347735	347744	40 %	0 %	0 %	60 %	525853129
5609	NC_021822	TGGT	2	8	347758	347765	0 %	50 %	50 %	0 %	525853129
5610	NC_021822	CAGC	2	8	347768	347775	25 %	0 %	25 %	50 %	525853129
5611	NC_021822	CAAG	2	8	347824	347831	50 %	0 %	25 %	25 %	525853129
5612	NC_021822	CGT	2	6	347912	347917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5613	NC_021822	AAC	2	6	347930	347935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853129
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5616	NC_021822	ATC	2	6	348086	348091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853129
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5618	NC_021822	GC	3	6	348128	348133	0 %	0 %	50 %	50 %	525853129
5619	NC_021822	ATGTT	2	10	348210	348219	20 %	60 %	20 %	0 %	525853129
5620	NC_021822	GCA	2	6	348235	348240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5621	NC_021822	ATC	2	6	348242	348247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853129
5622	NC_021822	TGGT	2	8	348253	348260	0 %	50 %	50 %	0 %	525853129
5623	NC_021822	CGG	2	6	348420	348425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853129
5624	NC_021822	ACA	2	6	348455	348460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853129
5625	NC_021822	CGTT	2	8	348472	348479	0 %	50 %	25 %	25 %	525853129
5626	NC_021822	TTG	2	6	348497	348502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853129
5627	NC_021822	TG	3	6	348501	348506	0 %	50 %	50 %	0 %	525853129
5628	NC_021822	GTG	2	6	348525	348530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853129
5629	NC_021822	TCAA	2	8	348550	348557	50 %	25 %	0 %	25 %	525853129
5630	NC_021822	ATC	2	6	348704	348709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853129
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5632	NC_021822	CAT	2	6	348745	348750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853129
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5634	NC_021822	CTT	2	6	348879	348884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853129
5635	NC_021822	AGA	2	6	348976	348981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853129
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5638	NC_021822	CGC	2	6	349074	349079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853129
5639	NC_021822	TAT	2	6	349162	349167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853129
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5641	NC_021822	CCGTT	2	10	349214	349223	0 %	40 %	20 %	40 %	525853129
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5646	NC_021822	CGT	2	6	349471	349476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853129
5647	NC_021822	GAC	2	6	349519	349524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853129
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5649	NC_021822	GAG	2	6	349619	349624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525853129
5650	NC_021822	GT	3	6	349719	349724	0 %	50 %	50 %	0 %	525853130
5651	NC_021822	ATA	2	6	349742	349747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853130
5652	NC_021822	TGGC	2	8	349769	349776	0 %	25 %	50 %	25 %	525853130
5653	NC_021822	TGG	2	6	349799	349804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853130
5654	NC_021822	GTT	2	6	349850	349855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853130
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5656	NC_021822	TTTG	2	8	349921	349928	0 %	75 %	25 %	0 %	525853130
5657	NC_021822	CCG	2	6	349943	349948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853130
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5659	NC_021822	ATCA	2	8	350024	350031	50 %	25 %	0 %	25 %	525853130
5660	NC_021822	TCA	2	6	350034	350039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853130
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5670	NC_021822	GTTG	2	8	350398	350405	0 %	50 %	50 %	0 %	525853130
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5678	NC_021822	ATG	2	6	350995	351000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853131
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5686	NC_021822	TGC	2	6	351491	351496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853132
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5693	NC_021822	ATG	2	6	351717	351722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853132
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5700	NC_021822	GC	3	6	352122	352127	0 %	0 %	50 %	50 %	525853132
5701	NC_021822	CCA	2	6	352189	352194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853132
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5705	NC_021822	ATC	2	6	352326	352331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853132
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5730	NC_021822	AACG	2	8	353497	353504	50 %	0 %	25 %	25 %	525853134
5731	NC_021822	GCC	2	6	353757	353762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853134
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5735	NC_021822	GCA	3	9	353991	353999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853134
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5739	NC_021822	AAT	2	6	354263	354268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853134
5740	NC_021822	GAA	2	6	354313	354318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854241
5741	NC_021822	TTGA	2	8	354356	354363	25 %	50 %	25 %	0 %	525854241
5742	NC_021822	CCAT	2	8	354387	354394	25 %	25 %	0 %	50 %	525854241
5743	NC_021822	CGA	2	6	354609	354614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853135
5744	NC_021822	TGCT	2	8	354841	354848	0 %	50 %	25 %	25 %	525853135
5745	NC_021822	GCT	2	6	354871	354876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853135
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5747	NC_021822	GAT	2	6	354925	354930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853135
5748	NC_021822	TGA	2	6	354933	354938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853135
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5751	NC_021822	GCAA	2	8	355052	355059	50 %	0 %	25 %	25 %	525853135
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5763	NC_021822	TG	3	6	355751	355756	0 %	50 %	50 %	0 %	525853135
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5775	NC_021822	GTT	2	6	357058	357063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853136
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5847	NC_021822	GGGTT	2	10	361459	361468	0 %	40 %	60 %	0 %	525853140
5848	NC_021822	AGC	2	6	361562	361567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853140
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5853	NC_021822	A	6	6	361824	361829	100 %	0 %	0 %	0 %	525854243
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5860	NC_021822	TGT	2	6	362308	362313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853141
5861	NC_021822	GC	3	6	362331	362336	0 %	0 %	50 %	50 %	525853141
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5863	NC_021822	GC	3	6	362434	362439	0 %	0 %	50 %	50 %	525853141
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5865	NC_021822	GATGAA	2	12	362505	362516	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525853141
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5982	NC_021822	GCACC	2	10	368792	368801	20 %	0 %	20 %	60 %	525853146
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5984	NC_021822	TCAA	2	8	368894	368901	50 %	25 %	0 %	25 %	525853146
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5987	NC_021822	CTT	2	6	369053	369058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853147
5988	NC_021822	ACC	2	6	369062	369067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853147
5989	NC_021822	ACT	2	6	369099	369104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853147
5990	NC_021822	CAA	2	6	369112	369117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853147
5991	NC_021822	GATC	2	8	369199	369206	25 %	25 %	25 %	25 %	525853147
5992	NC_021822	GTTGC	2	10	369385	369394	0 %	40 %	40 %	20 %	525853147
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5999	NC_021822	TTAC	2	8	369770	369777	25 %	50 %	0 %	25 %	525853148
6000	NC_021822	CAA	2	6	369899	369904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853148

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