MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021822	CGT	2	6	278499	278504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853078
4502	NC_021822	AAT	2	6	278715	278720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853079
4503	NC_021822	GAA	2	6	278767	278772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853079
4504	NC_021822	CAG	2	6	278777	278782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853079
4505	NC_021822	GAT	2	6	278803	278808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853079
4506	NC_021822	A	6	6	278950	278955	100 %	0 %	0 %	0 %	525853079
4507	NC_021822	CCT	2	6	279029	279034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853079
4508	NC_021822	A	6	6	279148	279153	100 %	0 %	0 %	0 %	525853079
4509	NC_021822	GA	3	6	279221	279226	50 %	0 %	50 %	0 %	525853079
4510	NC_021822	TGA	2	6	279227	279232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853079
4511	NC_021822	GC	3	6	279312	279317	0 %	0 %	50 %	50 %	525853079
4512	NC_021822	GCAA	2	8	279377	279384	50 %	0 %	25 %	25 %	525853079
4513	NC_021822	CAT	2	6	279540	279545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853079
4514	NC_021822	TTG	2	6	279554	279559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853079
4515	NC_021822	TTG	2	6	279788	279793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853079
4516	NC_021822	GC	3	6	279943	279948	0 %	0 %	50 %	50 %	525853080
4517	NC_021822	ACC	2	6	280057	280062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853080
4518	NC_021822	ACC	2	6	280082	280087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853080
4519	NC_021822	TAC	2	6	280233	280238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853080
4520	NC_021822	AAGT	2	8	280240	280247	50 %	25 %	25 %	0 %	525853080
4521	NC_021822	ACC	2	6	280315	280320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853080
4522	NC_021822	TGG	2	6	280851	280856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853081
4523	NC_021822	TAC	2	6	280889	280894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853081
4524	NC_021822	GAT	2	6	280934	280939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853081
4525	NC_021822	TGA	2	6	280957	280962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853081
4526	NC_021822	AAG	2	6	281012	281017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853081
4527	NC_021822	AG	3	6	281075	281080	50 %	0 %	50 %	0 %	525854230
4528	NC_021822	ACTT	2	8	281113	281120	25 %	50 %	0 %	25 %	525854230
4529	NC_021822	TTC	2	6	281152	281157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854230
4530	NC_021822	TCG	2	6	281279	281284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854230
4531	NC_021822	CTT	2	6	281286	281291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854230
4532	NC_021822	TGA	3	9	281292	281300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854230
4533	NC_021822	TCT	2	6	281345	281350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854230
4534	NC_021822	GTA	2	6	281900	281905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853082
4535	NC_021822	AAG	2	6	281906	281911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853082
4536	NC_021822	AGA	2	6	281930	281935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853082
4537	NC_021822	GTT	2	6	281947	281952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853082
4538	NC_021822	ACG	2	6	281992	281997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853082
4539	NC_021822	CAG	2	6	282004	282009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853082
4540	NC_021822	CCA	2	6	282036	282041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853082
4541	NC_021822	GCA	2	6	282067	282072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853082
4542	NC_021822	AGA	2	6	282162	282167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853082
4543	NC_021822	ACT	2	6	282192	282197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853082
4544	NC_021822	GCA	2	6	282238	282243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853082
4545	NC_021822	CGCT	2	8	282325	282332	0 %	25 %	25 %	50 %	525853082
4546	NC_021822	AAT	2	6	282347	282352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853082
4547	NC_021822	ACC	2	6	282679	282684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854231
4548	NC_021822	GCC	2	6	282703	282708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854231
4549	NC_021822	TGG	2	6	282736	282741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854231
4550	NC_021822	TC	3	6	282842	282847	0 %	50 %	0 %	50 %	525854231
4551	NC_021822	T	6	6	282896	282901	0 %	100 %	0 %	0 %	525854231
4552	NC_021822	TGTAG	2	10	282905	282914	20 %	40 %	40 %	0 %	525854231
4553	NC_021822	TTTG	2	8	282933	282940	0 %	75 %	25 %	0 %	525854231
4554	NC_021822	ACC	2	6	282970	282975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854231
4555	NC_021822	GTGCT	2	10	283003	283012	0 %	40 %	40 %	20 %	525854231
4556	NC_021822	GCA	2	6	283016	283021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854231
4557	NC_021822	CTT	2	6	283058	283063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854231
4558	NC_021822	TG	3	6	283091	283096	0 %	50 %	50 %	0 %	525854231
4559	NC_021822	CAC	2	6	283106	283111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854231
4560	NC_021822	AGT	2	6	283123	283128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854231
4561	NC_021822	TAC	2	6	283206	283211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854231
4562	NC_021822	AGTA	2	8	283293	283300	50 %	25 %	25 %	0 %	525853083
4563	NC_021822	TAA	2	6	283361	283366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853083
4564	NC_021822	CG	3	6	283371	283376	0 %	0 %	50 %	50 %	525853083
4565	NC_021822	CAG	2	6	283394	283399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853083
4566	NC_021822	TAA	2	6	283409	283414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853083
4567	NC_021822	GAT	2	6	283438	283443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853083
4568	NC_021822	TACT	2	8	283510	283517	25 %	50 %	0 %	25 %	525853083
4569	NC_021822	CGG	2	6	283534	283539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853083
4570	NC_021822	TAA	2	6	283610	283615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853083
4571	NC_021822	T	6	6	283634	283639	0 %	100 %	0 %	0 %	525853083
4572	NC_021822	TGCC	2	8	283687	283694	0 %	25 %	25 %	50 %	525853083
4573	NC_021822	GCA	2	6	283741	283746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853083
4574	NC_021822	CGCCA	2	10	283805	283814	20 %	0 %	20 %	60 %	525853083
4575	NC_021822	AGC	2	6	283818	283823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853083
4576	NC_021822	GACG	2	8	283832	283839	25 %	0 %	50 %	25 %	525853083
4577	NC_021822	AAT	2	6	283905	283910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853083
4578	NC_021822	GCT	2	6	283917	283922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853083
4579	NC_021822	ACG	2	6	283965	283970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853083
4580	NC_021822	GCC	2	6	283982	283987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853083
4581	NC_021822	CGC	2	6	283991	283996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853083
4582	NC_021822	CAG	2	6	283999	284004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853083
4583	NC_021822	ACC	2	6	284058	284063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853083
4584	NC_021822	AGGC	2	8	284111	284118	25 %	0 %	50 %	25 %	525853083
4585	NC_021822	GC	3	6	284164	284169	0 %	0 %	50 %	50 %	525853083
4586	NC_021822	CTGT	2	8	284187	284194	0 %	50 %	25 %	25 %	525853083
4587	NC_021822	CGT	2	6	284289	284294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853083
4588	NC_021822	CCAA	2	8	284373	284380	50 %	0 %	0 %	50 %	525853084
4589	NC_021822	TGA	2	6	284398	284403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853084
4590	NC_021822	CTG	2	6	284419	284424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853084
4591	NC_021822	TGC	2	6	284429	284434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853084
4592	NC_021822	ACTA	2	8	284495	284502	50 %	25 %	0 %	25 %	525853084
4593	NC_021822	T	6	6	284564	284569	0 %	100 %	0 %	0 %	525853084
4594	NC_021822	CGC	2	6	284570	284575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853084
4595	NC_021822	GAT	2	6	284600	284605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853084
4596	NC_021822	CTTT	2	8	284674	284681	0 %	75 %	0 %	25 %	525853084
4597	NC_021822	TTG	2	6	284749	284754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853084
4598	NC_021822	GGT	2	6	284873	284878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853084
4599	NC_021822	TCA	2	6	284892	284897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853084
4600	NC_021822	TTGG	2	8	284910	284917	0 %	50 %	50 %	0 %	525853084
4601	NC_021822	CAA	2	6	284927	284932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853084
4602	NC_021822	CTG	2	6	284938	284943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853084
4603	NC_021822	GAT	2	6	284953	284958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853084
4604	NC_021822	GAC	2	6	285074	285079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853084
4605	NC_021822	GTT	2	6	285098	285103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853084
4606	NC_021822	GCA	2	6	285138	285143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525853084
4607	NC_021822	TTC	2	6	285174	285179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853084
4608	NC_021822	AAG	2	6	285269	285274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525853085
4609	NC_021822	T	6	6	285301	285306	0 %	100 %	0 %	0 %	525853085
4610	NC_021822	CT	3	6	285342	285347	0 %	50 %	0 %	50 %	525853085
4611	NC_021822	CAAT	2	8	285375	285382	50 %	25 %	0 %	25 %	525853085
4612	NC_021822	GCG	2	6	285516	285521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853085
4613	NC_021822	ATG	2	6	285552	285557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853085
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4615	NC_021822	T	6	6	285669	285674	0 %	100 %	0 %	0 %	525853086
4616	NC_021822	TGC	2	6	285686	285691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853086
4617	NC_021822	GAT	2	6	285772	285777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853086
4618	NC_021822	GAT	2	6	285805	285810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853086
4619	NC_021822	TCAA	2	8	285908	285915	50 %	25 %	0 %	25 %	525853086
4620	NC_021822	TGA	2	6	285995	286000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853086
4621	NC_021822	CGC	2	6	286024	286029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853086
4622	NC_021822	GTG	2	6	286057	286062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853086
4623	NC_021822	TGA	2	6	286203	286208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853086
4624	NC_021822	GTG	2	6	286385	286390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853087
4625	NC_021822	GAT	2	6	286447	286452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853087
4626	NC_021822	GTTG	2	8	286561	286568	0 %	50 %	50 %	0 %	525853087
4627	NC_021822	TCTT	2	8	286657	286664	0 %	75 %	0 %	25 %	525853087
4628	NC_021822	T	7	7	286676	286682	0 %	100 %	0 %	0 %	525853087
4629	NC_021822	TTCGG	2	10	286684	286693	0 %	40 %	40 %	20 %	525853087
4630	NC_021822	CTTG	2	8	286709	286716	0 %	50 %	25 %	25 %	525853087
4631	NC_021822	TTGG	2	8	286726	286733	0 %	50 %	50 %	0 %	525853087
4632	NC_021822	CTTT	2	8	286739	286746	0 %	75 %	0 %	25 %	525853087
4633	NC_021822	ACC	2	6	286777	286782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525853087
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4635	NC_021822	T	6	6	286800	286805	0 %	100 %	0 %	0 %	525853087
4636	NC_021822	CTT	2	6	286815	286820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853087
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4643	NC_021822	ATGA	2	8	287010	287017	50 %	25 %	25 %	0 %	525853087
4644	NC_021822	GA	3	6	287019	287024	50 %	0 %	50 %	0 %	525853087
4645	NC_021822	CCT	2	6	287029	287034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525853087
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4651	NC_021822	TGG	3	9	287585	287593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853088
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4653	NC_021822	ATT	2	6	287650	287655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525853088
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4662	NC_021822	GTGG	2	8	287985	287992	0 %	25 %	75 %	0 %	525853088
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4728	NC_021822	CTT	2	6	293721	293726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853094
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4732	NC_021822	ATC	2	6	294380	294385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853095
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4735	NC_021822	CTTG	2	8	294678	294685	0 %	50 %	25 %	25 %	525853095
4736	NC_021822	GAT	2	6	294693	294698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853095
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4741	NC_021822	GCG	2	6	295080	295085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525853095
4742	NC_021822	TCA	2	6	295103	295108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853095
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4744	NC_021822	CGC	2	6	295171	295176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853095
4745	NC_021822	TTC	2	6	295250	295255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525853095
4746	NC_021822	ATA	3	9	295285	295293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853096
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4748	NC_021822	CAT	2	6	295340	295345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853096
4749	NC_021822	AC	3	6	295354	295359	50 %	0 %	0 %	50 %	525853096
4750	NC_021822	GA	3	6	295444	295449	50 %	0 %	50 %	0 %	525853096
4751	NC_021822	GTTT	2	8	295617	295624	0 %	75 %	25 %	0 %	525853096
4752	NC_021822	TGT	2	6	295658	295663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853096
4753	NC_021822	TACC	2	8	295666	295673	25 %	25 %	0 %	50 %	525853096
4754	NC_021822	AG	3	6	295760	295765	50 %	0 %	50 %	0 %	525853096
4755	NC_021822	TGC	2	6	295769	295774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853096
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4757	NC_021822	A	6	6	295809	295814	100 %	0 %	0 %	0 %	525853096
4758	NC_021822	TTCG	2	8	295829	295836	0 %	50 %	25 %	25 %	525853096
4759	NC_021822	TCAC	2	8	295842	295849	25 %	25 %	0 %	50 %	525853096
4760	NC_021822	T	6	6	295871	295876	0 %	100 %	0 %	0 %	525853096
4761	NC_021822	AGCA	2	8	295900	295907	50 %	0 %	25 %	25 %	525853096
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4770	NC_021822	GATC	2	8	297277	297284	25 %	25 %	25 %	25 %	525854232
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4776	NC_021822	CG	3	6	297799	297804	0 %	0 %	50 %	50 %	525854233
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4788	NC_021822	ATTG	2	8	298392	298399	25 %	50 %	25 %	0 %	525854233
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4853	NC_021822	AGCA	2	8	302463	302470	50 %	0 %	25 %	25 %	525853098
4854	NC_021822	CAT	2	6	302501	302506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853098
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4857	NC_021822	GTT	2	6	302607	302612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853098
4858	NC_021822	T	6	6	302616	302621	0 %	100 %	0 %	0 %	525853098
4859	NC_021822	GTT	2	6	302627	302632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525853098
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4862	NC_021822	A	6	6	302697	302702	100 %	0 %	0 %	0 %	525853098
4863	NC_021822	TTTG	2	8	302717	302724	0 %	75 %	25 %	0 %	525853098
4864	NC_021822	CAT	2	6	302738	302743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853098
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4866	NC_021822	ATAAA	2	10	302884	302893	80 %	20 %	0 %	0 %	525853098
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4989	NC_021822	ATA	2	6	310177	310182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853105
4990	NC_021822	TAAATA	2	12	310211	310222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853105
4991	NC_021822	AAT	2	6	310258	310263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853105
4992	NC_021822	GAT	2	6	310277	310282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853105
4993	NC_021822	A	6	6	310326	310331	100 %	0 %	0 %	0 %	525853105
4994	NC_021822	GCC	2	6	310333	310338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525853105
4995	NC_021822	TAA	2	6	310360	310365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525853105
4996	NC_021822	AAGC	2	8	310368	310375	50 %	0 %	25 %	25 %	525853105
4997	NC_021822	T	6	6	310952	310957	0 %	100 %	0 %	0 %	525853106
4998	NC_021822	GCTT	2	8	310976	310983	0 %	50 %	25 %	25 %	525853106
4999	NC_021822	ACA	2	6	311045	311050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853106
5000	NC_021822	GTG	2	6	311203	311208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525853106

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