MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 30458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021821	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525848541
2	NC_021821	GAA	2	6	2471	2476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848541
3	NC_021821	TCT	2	6	2481	2486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848541
4	NC_021821	CCA	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848541
5	NC_021821	CAA	2	6	2550	2555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848541
6	NC_021821	CT	3	6	2566	2571	0 %	50 %	0 %	50 %	525848541
7	NC_021821	TGA	2	6	2609	2614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848541
8	NC_021821	A	6	6	2628	2633	100 %	0 %	0 %	0 %	525848541
9	NC_021821	AAT	2	6	2646	2651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848541
10	NC_021821	ATC	2	6	2655	2660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848541
11	NC_021821	ATTT	2	8	2688	2695	25 %	75 %	0 %	0 %	525848541
12	NC_021821	GAA	2	6	2702	2707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848541
13	NC_021821	TTTA	2	8	2730	2737	25 %	75 %	0 %	0 %	525848541
14	NC_021821	ACA	2	6	2750	2755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848541
15	NC_021821	TCA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848541
16	NC_021821	CAAA	2	8	2802	2809	75 %	0 %	0 %	25 %	525848542
17	NC_021821	GAC	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848542
18	NC_021821	TTTC	2	8	2850	2857	0 %	75 %	0 %	25 %	525848542
19	NC_021821	AT	3	6	2864	2869	50 %	50 %	0 %	0 %	525848542
20	NC_021821	CAA	2	6	2898	2903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848542
21	NC_021821	T	6	6	2913	2918	0 %	100 %	0 %	0 %	525848542
22	NC_021821	GAAT	2	8	2939	2946	50 %	25 %	25 %	0 %	525848542
23	NC_021821	TG	3	6	3017	3022	0 %	50 %	50 %	0 %	525848542
24	NC_021821	CATA	2	8	3095	3102	50 %	25 %	0 %	25 %	525848542
25	NC_021821	TCA	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848542
26	NC_021821	CAA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848542
27	NC_021821	TTG	2	6	3239	3244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848542
28	NC_021821	GAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848543
29	NC_021821	AAC	2	6	3519	3524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848543
30	NC_021821	TCT	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848543
31	NC_021821	CTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
32	NC_021821	CT	4	8	3733	3740	0 %	50 %	0 %	50 %	525847174
33	NC_021821	CAT	2	6	3741	3746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847174
34	NC_021821	TCT	2	6	3892	3897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
35	NC_021821	CAT	2	6	3957	3962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847174
36	NC_021821	GCT	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847174
37	NC_021821	CTG	2	6	4054	4059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847174
38	NC_021821	T	7	7	4078	4084	0 %	100 %	0 %	0 %	525847174
39	NC_021821	TCT	3	9	4157	4165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847174
40	NC_021821	GCT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847175
41	NC_021821	TTCC	2	8	4424	4431	0 %	50 %	0 %	50 %	525847175
42	NC_021821	CTT	2	6	4445	4450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847175
43	NC_021821	TAA	2	6	4457	4462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847175
44	NC_021821	CCA	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847175
45	NC_021821	TTTG	2	8	4645	4652	0 %	75 %	25 %	0 %	525847175
46	NC_021821	TGA	2	6	4665	4670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847175
47	NC_021821	GCG	2	6	4740	4745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525847175
48	NC_021821	ATC	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847175
49	NC_021821	TCA	2	6	4789	4794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847175
50	NC_021821	CGA	2	6	4833	4838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847175
51	NC_021821	GCTC	2	8	4865	4872	0 %	25 %	25 %	50 %	525847175
52	NC_021821	CGC	2	6	4880	4885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525847175
53	NC_021821	ACG	2	6	4904	4909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847175
54	NC_021821	TTG	2	6	4917	4922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847175
55	NC_021821	TTG	2	6	4926	4931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847175
56	NC_021821	CTT	2	6	4967	4972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847175
57	NC_021821	TGA	2	6	5047	5052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847176
58	NC_021821	GGT	2	6	5073	5078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525847176
59	NC_021821	GTTT	2	8	5083	5090	0 %	75 %	25 %	0 %	525847176
60	NC_021821	TGCT	2	8	5128	5135	0 %	50 %	25 %	25 %	525847176
61	NC_021821	CAT	2	6	5140	5145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
62	NC_021821	TTGC	2	8	5184	5191	0 %	50 %	25 %	25 %	525847176
63	NC_021821	AGCT	2	8	5274	5281	25 %	25 %	25 %	25 %	525847176
64	NC_021821	TATTT	2	10	5329	5338	20 %	80 %	0 %	0 %	525847176
65	NC_021821	TTC	2	6	5357	5362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
66	NC_021821	TTG	2	6	5366	5371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847176
67	NC_021821	AGA	2	6	5389	5394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525847176
68	NC_021821	GC	3	6	5448	5453	0 %	0 %	50 %	50 %	525847176
69	NC_021821	GCT	2	6	5462	5467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847176
70	NC_021821	TCA	2	6	5585	5590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
71	NC_021821	CAG	2	6	5595	5600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847176
72	NC_021821	TCA	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847176
73	NC_021821	ACC	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847176
74	NC_021821	CGA	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847176
75	NC_021821	CTT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
76	NC_021821	TTC	2	6	5770	5775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
77	NC_021821	TTTGGA	2	12	5820	5831	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525847176
78	NC_021821	T	6	6	5839	5844	0 %	100 %	0 %	0 %	525847176
79	NC_021821	AAC	2	6	5965	5970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847176
80	NC_021821	CAC	2	6	5973	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847176
81	NC_021821	TTC	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847176
82	NC_021821	GAT	2	6	6071	6076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847176
83	NC_021821	TAAG	2	8	7239	7246	50 %	25 %	25 %	0 %	525847177
84	NC_021821	ATA	2	6	7284	7289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525847177
85	NC_021821	TC	4	8	7301	7308	0 %	50 %	0 %	50 %	525847177
86	NC_021821	CTG	2	6	7328	7333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847177
87	NC_021821	TCA	2	6	7387	7392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847177
88	NC_021821	CTG	2	6	7397	7402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847177
89	NC_021821	TTA	2	6	7441	7446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847177
90	NC_021821	TAGA	2	8	7465	7472	50 %	25 %	25 %	0 %	525847177
91	NC_021821	GAT	2	6	7493	7498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847177
92	NC_021821	AT	3	6	7516	7521	50 %	50 %	0 %	0 %	525847177
93	NC_021821	CTG	2	6	7535	7540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847177
94	NC_021821	CTT	2	6	7541	7546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847177
95	NC_021821	TCA	2	6	7547	7552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847177
96	NC_021821	CTC	2	6	7569	7574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525847177
97	NC_021821	T	7	7	7620	7626	0 %	100 %	0 %	0 %	525847177
98	NC_021821	A	7	7	7674	7680	100 %	0 %	0 %	0 %	525847177
99	NC_021821	TCT	3	9	7681	7689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847177
100	NC_021821	T	6	6	8023	8028	0 %	100 %	0 %	0 %	525847178
101	NC_021821	CAA	2	6	8035	8040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847178
102	NC_021821	T	6	6	8063	8068	0 %	100 %	0 %	0 %	525847178
103	NC_021821	A	7	7	8089	8095	100 %	0 %	0 %	0 %	525847178
104	NC_021821	GTC	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525847178
105	NC_021821	CTT	2	6	8140	8145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847178
106	NC_021821	TGT	2	6	8197	8202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847178
107	NC_021821	T	6	6	8204	8209	0 %	100 %	0 %	0 %	525847178
108	NC_021821	T	8	8	8346	8353	0 %	100 %	0 %	0 %	525847179
109	NC_021821	ACG	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847179
110	NC_021821	AT	3	6	8384	8389	50 %	50 %	0 %	0 %	525847179
111	NC_021821	CTTA	2	8	8457	8464	25 %	50 %	0 %	25 %	525847179
112	NC_021821	CAA	2	6	8484	8489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847179
113	NC_021821	TCT	2	6	8500	8505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525847179
114	NC_021821	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	525847179
115	NC_021821	TTTCA	2	10	8547	8556	20 %	60 %	0 %	20 %	525847179
116	NC_021821	TCA	2	6	8563	8568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847179
117	NC_021821	TTA	2	6	8623	8628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847179
118	NC_021821	ACC	2	6	8635	8640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847179
119	NC_021821	TTTGC	2	10	8679	8688	0 %	60 %	20 %	20 %	525847179
120	NC_021821	TTG	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847180
121	NC_021821	CAG	2	6	8866	8871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525847180
122	NC_021821	TTG	2	6	8937	8942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525847180
123	NC_021821	GCA	2	6	9235	9240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848544
124	NC_021821	AAC	2	6	9279	9284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848544
125	NC_021821	TTG	2	6	9357	9362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848544
126	NC_021821	TGCC	2	8	9455	9462	0 %	25 %	25 %	50 %	525848544
127	NC_021821	TGC	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848544
128	NC_021821	TC	3	6	9525	9530	0 %	50 %	0 %	50 %	525848544
129	NC_021821	GCA	2	6	9571	9576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848544
130	NC_021821	AAT	2	6	9652	9657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848544
131	NC_021821	T	8	8	9735	9742	0 %	100 %	0 %	0 %	525848544
132	NC_021821	AG	3	6	9753	9758	50 %	0 %	50 %	0 %	525848544
133	NC_021821	ATT	2	6	9789	9794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525848544
134	NC_021821	CT	3	6	9795	9800	0 %	50 %	0 %	50 %	525848544
135	NC_021821	AAC	2	6	10157	10162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848545
136	NC_021821	TCA	2	6	10213	10218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848545
137	NC_021821	AAATT	2	10	10295	10304	60 %	40 %	0 %	0 %	525848545
138	NC_021821	CAAA	2	8	10481	10488	75 %	0 %	0 %	25 %	525848545
139	NC_021821	AGCAG	2	10	10506	10515	40 %	0 %	40 %	20 %	525848545
140	NC_021821	GGA	2	6	10536	10541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525848545
141	NC_021821	AACC	2	8	10565	10572	50 %	0 %	0 %	50 %	525848545
142	NC_021821	TGA	2	6	10616	10621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848545
143	NC_021821	ATG	2	6	10673	10678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848545
144	NC_021821	AGC	2	6	10713	10718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848545
145	NC_021821	A	7	7	10792	10798	100 %	0 %	0 %	0 %	525848545
146	NC_021821	AGA	2	6	10809	10814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848545
147	NC_021821	ACA	2	6	10825	10830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848545
148	NC_021821	CAGC	2	8	11211	11218	25 %	0 %	25 %	50 %	525848545
149	NC_021821	TAAACT	2	12	11301	11312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525848545
150	NC_021821	CAA	2	6	11383	11388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848545
151	NC_021821	TTC	2	6	11430	11435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848545
152	NC_021821	AGTA	2	8	11439	11446	50 %	25 %	25 %	0 %	525848545
153	NC_021821	GCA	2	6	11563	11568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848545
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155	NC_021821	GATT	2	8	11711	11718	25 %	50 %	25 %	0 %	525848546
156	NC_021821	GCA	2	6	11753	11758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848546
157	NC_021821	TGA	2	6	11769	11774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848546
158	NC_021821	GAT	2	6	11779	11784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848546
159	NC_021821	TGT	2	6	11785	11790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848546
160	NC_021821	AGT	2	6	11791	11796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848546
161	NC_021821	CCAT	2	8	11797	11804	25 %	25 %	0 %	50 %	525848546
162	NC_021821	TTTC	2	8	11846	11853	0 %	75 %	0 %	25 %	525848546
163	NC_021821	GTCA	2	8	12020	12027	25 %	25 %	25 %	25 %	525848546
164	NC_021821	GCA	2	6	12034	12039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848546
165	NC_021821	GAA	2	6	12059	12064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848546
166	NC_021821	AACG	2	8	12155	12162	50 %	0 %	25 %	25 %	525848546
167	NC_021821	CTG	2	6	12164	12169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848546
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170	NC_021821	T	6	6	12359	12364	0 %	100 %	0 %	0 %	525848546
171	NC_021821	GAAC	2	8	12396	12403	50 %	0 %	25 %	25 %	525848546
172	NC_021821	GA	3	6	12412	12417	50 %	0 %	50 %	0 %	525848546
173	NC_021821	AC	3	6	12421	12426	50 %	0 %	0 %	50 %	525848546
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176	NC_021821	ACC	2	6	12572	12577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848546
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178	NC_021821	TTC	2	6	12659	12664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848546
179	NC_021821	TGA	2	6	12694	12699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848546
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243	NC_021821	T	6	6	15846	15851	0 %	100 %	0 %	0 %	525848547
244	NC_021821	TCA	2	6	15893	15898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848547
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246	NC_021821	CAACT	2	10	15928	15937	40 %	20 %	0 %	40 %	525848547
247	NC_021821	TC	3	6	15971	15976	0 %	50 %	0 %	50 %	525847184
248	NC_021821	CAT	2	6	15991	15996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847184
249	NC_021821	AGT	2	6	15997	16002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525847184
250	NC_021821	T	8	8	16015	16022	0 %	100 %	0 %	0 %	525847184
251	NC_021821	TAC	2	6	16051	16056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847184
252	NC_021821	AT	3	6	16158	16163	50 %	50 %	0 %	0 %	525847184
253	NC_021821	CAT	2	6	16175	16180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847184
254	NC_021821	CAA	2	6	16258	16263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525847184
255	NC_021821	ATC	2	6	16283	16288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847184
256	NC_021821	ATC	2	6	16290	16295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847184
257	NC_021821	ATT	2	6	16307	16312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847184
258	NC_021821	CCA	2	6	16332	16337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525847184
259	NC_021821	TA	4	8	16354	16361	50 %	50 %	0 %	0 %	525847184
260	NC_021821	AT	3	6	16449	16454	50 %	50 %	0 %	0 %	525847184
261	NC_021821	CAT	2	6	16549	16554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847184
262	NC_021821	TTA	2	6	16566	16571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525847184
263	NC_021821	CAT	2	6	16631	16636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847184
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267	NC_021821	TA	3	6	17049	17054	50 %	50 %	0 %	0 %	525847185
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393	NC_021821	TCA	2	6	26284	26289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525847188
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397	NC_021821	C	6	6	26441	26446	0 %	0 %	0 %	100 %	525847188
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