MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 30458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_021821	TGC	3	9	1735910	1735918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848471
28503	NC_021821	TTCG	2	8	1735958	1735965	0 %	50 %	25 %	25 %	525848471
28504	NC_021821	AGA	2	6	1735973	1735978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848471
28505	NC_021821	GC	3	6	1736017	1736022	0 %	0 %	50 %	50 %	525848471
28506	NC_021821	ACG	2	6	1736048	1736053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848471
28507	NC_021821	AAG	2	6	1736058	1736063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848471
28508	NC_021821	ACGC	2	8	1736113	1736120	25 %	0 %	25 %	50 %	525848471
28509	NC_021821	GAGT	2	8	1736139	1736146	25 %	25 %	50 %	0 %	525848471
28510	NC_021821	CAA	2	6	1736294	1736299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848471
28511	NC_021821	GTT	2	6	1736307	1736312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848471
28512	NC_021821	CTT	2	6	1736332	1736337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848471
28513	NC_021821	GAT	2	6	1736411	1736416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848471
28514	NC_021821	CCA	2	6	1736425	1736430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848471
28515	NC_021821	AAC	2	6	1736457	1736462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848471
28516	NC_021821	ATG	2	6	1736514	1736519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848471
28517	NC_021821	ATG	2	6	1736544	1736549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848471
28518	NC_021821	TCGC	2	8	1736551	1736558	0 %	25 %	25 %	50 %	525848471
28519	NC_021821	AAG	2	6	1736594	1736599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848471
28520	NC_021821	TCA	2	6	1736628	1736633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848471
28521	NC_021821	ATC	2	6	1736684	1736689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848471
28522	NC_021821	CGG	2	6	1736782	1736787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525848471
28523	NC_021821	CG	3	6	1736885	1736890	0 %	0 %	50 %	50 %	525848471
28524	NC_021821	GAT	3	9	1736891	1736899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848471
28525	NC_021821	ATATTG	2	12	1736948	1736959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525848471
28526	NC_021821	ACC	2	6	1736981	1736986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848471
28527	NC_021821	CGC	2	6	1736996	1737001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525848471
28528	NC_021821	AGT	2	6	1737097	1737102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848471
28529	NC_021821	CAG	2	6	1737113	1737118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848471
28530	NC_021821	TCT	2	6	1737253	1737258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848471
28531	NC_021821	CTT	2	6	1737283	1737288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848471
28532	NC_021821	GAC	2	6	1737297	1737302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848471
28533	NC_021821	CCA	2	6	1737313	1737318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848471
28534	NC_021821	GTT	2	6	1737320	1737325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848471
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28536	NC_021821	GA	3	6	1737529	1737534	50 %	0 %	50 %	0 %	525848471
28537	NC_021821	TGAA	2	8	1737627	1737634	50 %	25 %	25 %	0 %	525848471
28538	NC_021821	ACTC	2	8	1737654	1737661	25 %	25 %	0 %	50 %	525848472
28539	NC_021821	GCC	2	6	1737748	1737753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525848472
28540	NC_021821	CAGCA	2	10	1737762	1737771	40 %	0 %	20 %	40 %	525848472
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28543	NC_021821	ACCA	2	8	1737831	1737838	50 %	0 %	0 %	50 %	525848472
28544	NC_021821	GCC	2	6	1737874	1737879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525848472
28545	NC_021821	TTG	2	6	1737907	1737912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848472
28546	NC_021821	TTG	2	6	1738015	1738020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848472
28547	NC_021821	CTT	2	6	1738129	1738134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848472
28548	NC_021821	CGG	2	6	1738138	1738143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525848472
28549	NC_021821	CAAAGC	2	12	1738163	1738174	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525848472
28550	NC_021821	GCAC	2	8	1738279	1738286	25 %	0 %	25 %	50 %	525848472
28551	NC_021821	GCG	2	6	1738357	1738362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525848472
28552	NC_021821	GCA	2	6	1738366	1738371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848472
28553	NC_021821	TGC	2	6	1738387	1738392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848472
28554	NC_021821	TGA	2	6	1738412	1738417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848472
28555	NC_021821	TTC	2	6	1738420	1738425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848472
28556	NC_021821	TGCTTT	2	12	1738461	1738472	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525848472
28557	NC_021821	ACG	2	6	1738478	1738483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848472
28558	NC_021821	GTC	2	6	1738518	1738523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848472
28559	NC_021821	ATA	2	6	1738606	1738611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848472
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28562	NC_021821	TAA	2	6	1739041	1739046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848473
28563	NC_021821	TCA	2	6	1739182	1739187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848473
28564	NC_021821	TAGG	2	8	1739255	1739262	25 %	25 %	50 %	0 %	525848473
28565	NC_021821	ATC	2	6	1739388	1739393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848473
28566	NC_021821	CAC	2	6	1739441	1739446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848473
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28568	NC_021821	GGCT	2	8	1739488	1739495	0 %	25 %	50 %	25 %	525848473
28569	NC_021821	TTC	2	6	1739595	1739600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848473
28570	NC_021821	ATT	2	6	1739604	1739609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525848473
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28581	NC_021821	CCGTA	2	10	1740523	1740532	20 %	20 %	20 %	40 %	525848474
28582	NC_021821	GCA	2	6	1740574	1740579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848474
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28588	NC_021821	AAT	2	6	1740734	1740739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848474
28589	NC_021821	TCA	2	6	1740741	1740746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848474
28590	NC_021821	TTTTGC	2	12	1740753	1740764	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525848474
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28593	NC_021821	ACC	2	6	1740899	1740904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848474
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28595	NC_021821	T	6	6	1740950	1740955	0 %	100 %	0 %	0 %	525848474
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28598	NC_021821	TAG	2	6	1741128	1741133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848474
28599	NC_021821	TCT	2	6	1741143	1741148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848474
28600	NC_021821	T	6	6	1741148	1741153	0 %	100 %	0 %	0 %	525848474
28601	NC_021821	CAA	2	6	1741249	1741254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848474
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28603	NC_021821	GCTG	2	8	1741529	1741536	0 %	25 %	50 %	25 %	525848474
28604	NC_021821	TCA	2	6	1741554	1741559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848474
28605	NC_021821	GCC	2	6	1741571	1741576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525848474
28606	NC_021821	CCG	2	6	1741605	1741610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525848474
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28609	NC_021821	TCAC	2	8	1742196	1742203	25 %	25 %	0 %	50 %	525848474
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28613	NC_021821	CGA	2	6	1742285	1742290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848474
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28615	NC_021821	ATT	2	6	1742687	1742692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525848475
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28617	NC_021821	TCA	2	6	1742723	1742728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848475
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28964	NC_021821	CAATAC	2	12	1764428	1764439	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525848491
28965	NC_021821	TCTG	2	8	1764445	1764452	0 %	50 %	25 %	25 %	525848491
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28983	NC_021821	CGA	2	6	1766124	1766129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848801
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29000	NC_021821	AG	3	6	1766961	1766966	50 %	0 %	50 %	0 %	525848801

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