MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome II

Total Repeats: 30458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27004	NC_021821	CCCA	2	8	1646561	1646568	25 %	0 %	0 %	75 %	525848394
27005	NC_021821	GA	3	6	1646624	1646629	50 %	0 %	50 %	0 %	525848394
27006	NC_021821	T	6	6	1646661	1646666	0 %	100 %	0 %	0 %	525848394
27007	NC_021821	CT	4	8	1646693	1646700	0 %	50 %	0 %	50 %	525848394
27008	NC_021821	TCG	2	6	1646806	1646811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848394
27009	NC_021821	CGT	2	6	1646858	1646863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848394
27010	NC_021821	TCAAA	2	10	1646882	1646891	60 %	20 %	0 %	20 %	525848394
27011	NC_021821	GCA	2	6	1647026	1647031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848394
27012	NC_021821	GAT	2	6	1647032	1647037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848394
27013	NC_021821	ATC	2	6	1647054	1647059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848394
27014	NC_021821	CAAG	2	8	1647164	1647171	50 %	0 %	25 %	25 %	525848394
27015	NC_021821	ACC	3	9	1647193	1647201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848394
27016	NC_021821	TC	3	6	1647278	1647283	0 %	50 %	0 %	50 %	525848395
27017	NC_021821	CGTC	2	8	1647290	1647297	0 %	25 %	25 %	50 %	525848395
27018	NC_021821	AAT	2	6	1647307	1647312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848395
27019	NC_021821	TGA	2	6	1647327	1647332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848395
27020	NC_021821	AAAT	2	8	1647354	1647361	75 %	25 %	0 %	0 %	525848395
27021	NC_021821	ATG	2	6	1647392	1647397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848395
27022	NC_021821	CGGT	2	8	1647435	1647442	0 %	25 %	50 %	25 %	525848395
27023	NC_021821	AGCGAC	2	12	1647484	1647495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848395
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27025	NC_021821	CTG	2	6	1647541	1647546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848395
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27033	NC_021821	TGC	2	6	1648252	1648257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848396
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27035	NC_021821	ACC	2	6	1648354	1648359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848396
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27039	NC_021821	CGT	2	6	1648502	1648507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848396
27040	NC_021821	CAT	2	6	1648508	1648513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848396
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27043	NC_021821	GAT	2	6	1648785	1648790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848396
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27052	NC_021821	ATG	2	6	1649125	1649130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848396
27053	NC_021821	GCCAA	2	10	1649162	1649171	40 %	0 %	20 %	40 %	525848396
27054	NC_021821	GAA	2	6	1649220	1649225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848397
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27059	NC_021821	AAT	2	6	1649437	1649442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848397
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27070	NC_021821	T	6	6	1650360	1650365	0 %	100 %	0 %	0 %	525848397
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27100	NC_021821	TTTC	2	8	1652522	1652529	0 %	75 %	0 %	25 %	525848399
27101	NC_021821	CAAT	2	8	1652622	1652629	50 %	25 %	0 %	25 %	525848399
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27103	NC_021821	TTG	2	6	1652736	1652741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848399
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27116	NC_021821	CTT	2	6	1653718	1653723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848400
27117	NC_021821	CGC	2	6	1653826	1653831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525848400
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27119	NC_021821	GTC	2	6	1653941	1653946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848400
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27182	NC_021821	CTG	2	6	1658402	1658407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848407
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27218	NC_021821	GA	3	6	1660499	1660504	50 %	0 %	50 %	0 %	525848410
27219	NC_021821	AC	3	6	1660535	1660540	50 %	0 %	0 %	50 %	525848410
27220	NC_021821	TCCAA	2	10	1660589	1660598	40 %	20 %	0 %	40 %	525848410
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27224	NC_021821	AGG	2	6	1660739	1660744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525848410
27225	NC_021821	TC	3	6	1660762	1660767	0 %	50 %	0 %	50 %	525848410
27226	NC_021821	CCA	2	6	1660816	1660821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848410
27227	NC_021821	ATGACA	2	12	1660834	1660845	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525848410
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27229	NC_021821	ATC	2	6	1661008	1661013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848410
27230	NC_021821	GC	3	6	1661065	1661070	0 %	0 %	50 %	50 %	525848410
27231	NC_021821	ATG	2	6	1661173	1661178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848410
27232	NC_021821	TGC	2	6	1661378	1661383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848411
27233	NC_021821	GCC	2	6	1661390	1661395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525848411
27234	NC_021821	TCAT	2	8	1661402	1661409	25 %	50 %	0 %	25 %	525848411
27235	NC_021821	TGT	2	6	1661446	1661451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848411
27236	NC_021821	TTTG	2	8	1661508	1661515	0 %	75 %	25 %	0 %	525848411
27237	NC_021821	CAC	2	6	1661560	1661565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525848411
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27242	NC_021821	GCCA	2	8	1661847	1661854	25 %	0 %	25 %	50 %	525848412
27243	NC_021821	AGTGGA	2	12	1661899	1661910	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525848412
27244	NC_021821	CAA	2	6	1661982	1661987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848412
27245	NC_021821	CGT	2	6	1662117	1662122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848412
27246	NC_021821	TCG	2	6	1662147	1662152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848412
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27250	NC_021821	GA	3	6	1662360	1662365	50 %	0 %	50 %	0 %	525848412
27251	NC_021821	CGAG	2	8	1662385	1662392	25 %	0 %	50 %	25 %	525848412
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27253	NC_021821	TGC	2	6	1662596	1662601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848412
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27257	NC_021821	CTT	2	6	1662736	1662741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848789
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27260	NC_021821	CAA	2	6	1662845	1662850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848413
27261	NC_021821	CTGC	2	8	1662865	1662872	0 %	25 %	25 %	50 %	525848413
27262	NC_021821	TAG	2	6	1662890	1662895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848413
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27264	NC_021821	AGA	2	6	1663170	1663175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848413
27265	NC_021821	GA	3	6	1663174	1663179	50 %	0 %	50 %	0 %	525848413
27266	NC_021821	AAT	2	6	1663185	1663190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848413
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27269	NC_021821	GACA	2	8	1663335	1663342	50 %	0 %	25 %	25 %	525848413
27270	NC_021821	GC	3	6	1663442	1663447	0 %	0 %	50 %	50 %	525848413
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27295	NC_021821	GAACA	2	10	1664795	1664804	60 %	0 %	20 %	20 %	525848415
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27298	NC_021821	CGGT	2	8	1664890	1664897	0 %	25 %	50 %	25 %	525848415
27299	NC_021821	CA	3	6	1664976	1664981	50 %	0 %	0 %	50 %	525848415
27300	NC_021821	GAAA	2	8	1664984	1664991	75 %	0 %	25 %	0 %	525848415
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27302	NC_021821	GAT	2	6	1665074	1665079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848415
27303	NC_021821	ACG	2	6	1665085	1665090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848415
27304	NC_021821	ATG	2	6	1665099	1665104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848415
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27306	NC_021821	GCA	2	6	1665168	1665173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848415
27307	NC_021821	AAG	2	6	1665177	1665182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525848415
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27309	NC_021821	GC	3	6	1665318	1665323	0 %	0 %	50 %	50 %	525848415
27310	NC_021821	ATG	2	6	1665360	1665365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848415
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27313	NC_021821	ATC	3	9	1665573	1665581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848415
27314	NC_021821	ATC	2	6	1665585	1665590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848415
27315	NC_021821	A	6	6	1665668	1665673	100 %	0 %	0 %	0 %	525848415
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27318	NC_021821	CAAC	2	8	1665809	1665816	50 %	0 %	0 %	50 %	525848415
27319	NC_021821	CGT	2	6	1665835	1665840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848415
27320	NC_021821	GTC	2	6	1665851	1665856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848415
27321	NC_021821	TTG	2	6	1665865	1665870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848415
27322	NC_021821	TGC	2	6	1665875	1665880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848415
27323	NC_021821	CTG	2	6	1665919	1665924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848415
27324	NC_021821	TCC	2	6	1665938	1665943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525848416
27325	NC_021821	T	6	6	1665951	1665956	0 %	100 %	0 %	0 %	525848416
27326	NC_021821	GGTA	2	8	1666026	1666033	25 %	25 %	50 %	0 %	525848416
27327	NC_021821	GCA	2	6	1666040	1666045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848416
27328	NC_021821	CAA	2	6	1666104	1666109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848416
27329	NC_021821	GAAGG	2	10	1666163	1666172	40 %	0 %	60 %	0 %	525848416
27330	NC_021821	CATC	2	8	1666254	1666261	25 %	25 %	0 %	50 %	525848416
27331	NC_021821	TCT	2	6	1666313	1666318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848416
27332	NC_021821	GGCAT	2	10	1666355	1666364	20 %	20 %	40 %	20 %	525848416
27333	NC_021821	TCA	2	6	1666436	1666441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848416
27334	NC_021821	TGA	2	6	1666461	1666466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848416
27335	NC_021821	CACC	2	8	1666504	1666511	25 %	0 %	0 %	75 %	525848416
27336	NC_021821	CAAG	2	8	1666590	1666597	50 %	0 %	25 %	25 %	525848416
27337	NC_021821	GC	3	6	1666602	1666607	0 %	0 %	50 %	50 %	525848416
27338	NC_021821	ATG	2	6	1666796	1666801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848416
27339	NC_021821	AAT	2	6	1666819	1666824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848416
27340	NC_021821	GAT	2	6	1666885	1666890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848416
27341	NC_021821	AAC	2	6	1666912	1666917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848416
27342	NC_021821	CAA	2	6	1666931	1666936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848416
27343	NC_021821	AGG	2	6	1667031	1667036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525848416
27344	NC_021821	AGT	2	6	1667074	1667079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848416
27345	NC_021821	AAT	2	6	1667506	1667511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525848417
27346	NC_021821	GTT	2	6	1667683	1667688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848417
27347	NC_021821	ACCTA	2	10	1667771	1667780	40 %	20 %	0 %	40 %	525848417
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27349	NC_021821	AATG	2	8	1667823	1667830	50 %	25 %	25 %	0 %	525848417
27350	NC_021821	GTT	2	6	1667842	1667847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848417
27351	NC_021821	GC	3	6	1667906	1667911	0 %	0 %	50 %	50 %	525848417
27352	NC_021821	TGA	2	6	1667952	1667957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848417
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27465	NC_021821	TGAT	2	8	1675386	1675393	25 %	50 %	25 %	0 %	525848424
27466	NC_021821	TCT	3	9	1675394	1675402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848424
27467	NC_021821	GTG	2	6	1675431	1675436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525848424
27468	NC_021821	CT	3	6	1675519	1675524	0 %	50 %	0 %	50 %	525848424
27469	NC_021821	GGC	2	6	1675559	1675564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525848424
27470	NC_021821	AAC	2	6	1675577	1675582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848424
27471	NC_021821	GGT	2	6	1675601	1675606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525848424
27472	NC_021821	CT	3	6	1675615	1675620	0 %	50 %	0 %	50 %	525848424
27473	NC_021821	GTAC	2	8	1675641	1675648	25 %	25 %	25 %	25 %	525848424
27474	NC_021821	GTTG	2	8	1675693	1675700	0 %	50 %	50 %	0 %	525848424
27475	NC_021821	AGCA	2	8	1675714	1675721	50 %	0 %	25 %	25 %	525848424
27476	NC_021821	AGC	2	6	1675732	1675737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525848424
27477	NC_021821	AAC	2	6	1675766	1675771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525848424
27478	NC_021821	TAC	2	6	1675814	1675819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848424
27479	NC_021821	TAC	2	6	1675853	1675858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525848424
27480	NC_021821	CAAC	2	8	1675861	1675868	50 %	0 %	0 %	50 %	525848424
27481	NC_021821	TGA	2	6	1675870	1675875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525848424
27482	NC_021821	TACGC	2	10	1675918	1675927	20 %	20 %	20 %	40 %	525848424
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27485	NC_021821	GT	3	6	1676493	1676498	0 %	50 %	50 %	0 %	525848425
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27490	NC_021821	TC	3	6	1676626	1676631	0 %	50 %	0 %	50 %	525848425
27491	NC_021821	GCT	2	6	1676698	1676703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525848425
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27493	NC_021821	CTT	2	6	1676872	1676877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848425
27494	NC_021821	GCG	2	6	1676882	1676887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525848425
27495	NC_021821	TGG	2	6	1676937	1676942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525848425
27496	NC_021821	TTG	2	6	1676948	1676953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525848425
27497	NC_021821	CTT	2	6	1677032	1677037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525848425
27498	NC_021821	CTTC	2	8	1677102	1677109	0 %	50 %	0 %	50 %	525848425
27499	NC_021821	GCTG	2	8	1677148	1677155	0 %	25 %	50 %	25 %	525848425
27500	NC_021821	GATG	2	8	1677156	1677163	25 %	25 %	50 %	0 %	525848425

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