MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 29140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019971	TGA	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
2	NC_019971	A	6	6	1164	1169	100 %	0 %	0 %	0 %	433659171
3	NC_019971	AAG	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
4	NC_019971	CTG	2	6	1230	1235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
5	NC_019971	CAG	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659171
6	NC_019971	CAA	2	6	1341	1346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659171
7	NC_019971	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
8	NC_019971	TGC	2	6	1384	1389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
9	NC_019971	TGC	2	6	1479	1484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
10	NC_019971	CAA	2	6	1527	1532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659171
11	NC_019971	TTG	2	6	1613	1618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
12	NC_019971	CCA	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
13	NC_019971	ATG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
14	NC_019971	CAC	2	6	1719	1724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
15	NC_019971	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
16	NC_019971	TGA	2	6	1827	1832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659171
17	NC_019971	GTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659171
18	NC_019971	ATC	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
19	NC_019971	CGC	2	6	1923	1928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659171
20	NC_019971	A	6	6	1961	1966	100 %	0 %	0 %	0 %	433659171
21	NC_019971	ATCG	2	8	2003	2010	25 %	25 %	25 %	25 %	433659171
22	NC_019971	CCGCTT	2	12	2092	2103	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	433659171
23	NC_019971	AGA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
24	NC_019971	CGT	2	6	2202	2207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
25	NC_019971	GAA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
26	NC_019971	CTA	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
27	NC_019971	ATT	2	6	2232	2237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659171
28	NC_019971	TCT	2	6	2238	2243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659171
29	NC_019971	CCA	2	6	2249	2254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659171
30	NC_019971	AC	3	6	2323	2328	50 %	0 %	0 %	50 %	433659171
31	NC_019971	TGC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659171
32	NC_019971	CAAC	2	8	2580	2587	50 %	0 %	0 %	50 %	433659171
33	NC_019971	CAG	2	6	2651	2656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659171
34	NC_019971	CAT	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659171
35	NC_019971	AAAG	2	8	2751	2758	75 %	0 %	25 %	0 %	433659171
36	NC_019971	TCAA	2	8	2876	2883	50 %	25 %	0 %	25 %	433659171
37	NC_019971	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659171
38	NC_019971	TTG	3	9	3500	3508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659172
39	NC_019971	TGC	2	6	3620	3625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659172
40	NC_019971	CATC	2	8	3711	3718	25 %	25 %	0 %	50 %	433659172
41	NC_019971	CAG	2	6	3723	3728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659172
42	NC_019971	TTG	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659172
43	NC_019971	AGG	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659172
44	NC_019971	CAT	2	6	3875	3880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659172
45	NC_019971	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659173
46	NC_019971	CTG	2	6	3947	3952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659173
47	NC_019971	AGT	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659173
48	NC_019971	CAA	2	6	4045	4050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659173
49	NC_019971	TTC	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
50	NC_019971	ATT	2	6	4280	4285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659173
51	NC_019971	CGCTGA	2	12	4322	4333	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	433659173
52	NC_019971	CCG	2	6	4334	4339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659173
53	NC_019971	TCT	2	6	4370	4375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
54	NC_019971	CCA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659173
55	NC_019971	TGC	2	6	4430	4435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659173
56	NC_019971	GAT	2	6	4467	4472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659173
57	NC_019971	TG	3	6	4480	4485	0 %	50 %	50 %	0 %	433659173
58	NC_019971	TCGTG	2	10	4553	4562	0 %	40 %	40 %	20 %	433659173
59	NC_019971	TCT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659173
60	NC_019971	GAA	4	12	6086	6097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659174
61	NC_019971	CAG	2	6	6129	6134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659174
62	NC_019971	GAA	2	6	6191	6196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659174
63	NC_019971	CCA	2	6	6565	6570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659175
64	NC_019971	ACT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659175
65	NC_019971	TTG	2	6	6598	6603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659175
66	NC_019971	ACA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
67	NC_019971	TCC	2	6	6745	6750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659175
68	NC_019971	ACC	2	6	6859	6864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659175
69	NC_019971	TGA	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
70	NC_019971	AAGCT	2	10	6940	6949	40 %	20 %	20 %	20 %	433659175
71	NC_019971	ATG	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
72	NC_019971	TCG	2	6	7150	7155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
73	NC_019971	GCG	2	6	7165	7170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659175
74	NC_019971	TGC	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
75	NC_019971	AGG	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659175
76	NC_019971	CAA	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
77	NC_019971	GAT	2	6	7242	7247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
78	NC_019971	TGC	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659175
79	NC_019971	TGA	2	6	7357	7362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659175
80	NC_019971	CAA	2	6	7364	7369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659175
81	NC_019971	AAG	2	6	7432	7437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659175
82	NC_019971	CAAC	2	8	7451	7458	50 %	0 %	0 %	50 %	433659175
83	NC_019971	CAAA	2	8	7477	7484	75 %	0 %	0 %	25 %	433659175
84	NC_019971	TTG	2	6	7510	7515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659175
85	NC_019971	TC	3	6	7664	7669	0 %	50 %	0 %	50 %	433659176
86	NC_019971	TAA	2	6	7700	7705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659176
87	NC_019971	AGAT	2	8	7744	7751	50 %	25 %	25 %	0 %	433659176
88	NC_019971	GCG	2	6	7894	7899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659176
89	NC_019971	A	6	6	7941	7946	100 %	0 %	0 %	0 %	433659176
90	NC_019971	AGC	2	6	7975	7980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659176
91	NC_019971	CTG	2	6	8038	8043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659176
92	NC_019971	TTC	2	6	8139	8144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659176
93	NC_019971	GTT	2	6	8258	8263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659176
94	NC_019971	TTG	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659176
95	NC_019971	CTTG	2	8	8290	8297	0 %	50 %	25 %	25 %	433659176
96	NC_019971	TAA	2	6	8311	8316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659176
97	NC_019971	GCG	2	6	8329	8334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659176
98	NC_019971	GCA	2	6	8338	8343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659176
99	NC_019971	ATCCT	2	10	8389	8398	20 %	40 %	0 %	40 %	433659176
100	NC_019971	AAG	2	6	8583	8588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
101	NC_019971	ATC	2	6	8756	8761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
102	NC_019971	CAAG	2	8	8779	8786	50 %	0 %	25 %	25 %	433659177
103	NC_019971	A	6	6	8829	8834	100 %	0 %	0 %	0 %	433659177
104	NC_019971	T	6	6	8906	8911	0 %	100 %	0 %	0 %	433659177
105	NC_019971	CGGTG	2	10	9007	9016	0 %	20 %	60 %	20 %	433659177
106	NC_019971	GCG	2	6	9027	9032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659177
107	NC_019971	TGA	2	6	9076	9081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659177
108	NC_019971	TTG	2	6	9089	9094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659177
109	NC_019971	ATT	2	6	9242	9247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
110	NC_019971	GCT	2	6	9259	9264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659177
111	NC_019971	GCA	2	6	9286	9291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659177
112	NC_019971	ATC	2	6	9308	9313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
113	NC_019971	ATT	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
114	NC_019971	TTA	2	6	9422	9427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659177
115	NC_019971	GAT	2	6	9428	9433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659177
116	NC_019971	AC	3	6	9445	9450	50 %	0 %	0 %	50 %	433659177
117	NC_019971	ACTT	2	8	9555	9562	25 %	50 %	0 %	25 %	433659177
118	NC_019971	AAC	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659177
119	NC_019971	TGG	2	6	9748	9753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659177
120	NC_019971	CAT	2	6	9793	9798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
121	NC_019971	CTTGG	2	10	9827	9836	0 %	40 %	40 %	20 %	433659177
122	NC_019971	GGT	2	6	9868	9873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659177
123	NC_019971	GTT	2	6	10007	10012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659177
124	NC_019971	GAA	2	6	10064	10069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
125	NC_019971	GATG	2	8	10132	10139	25 %	25 %	50 %	0 %	433659177
126	NC_019971	ATGA	2	8	10169	10176	50 %	25 %	25 %	0 %	433659177
127	NC_019971	ATC	2	6	10196	10201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659177
128	NC_019971	AGA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659177
129	NC_019971	CAG	2	6	10232	10237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659177
130	NC_019971	TTG	2	6	10266	10271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659177
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132	NC_019971	TGA	2	6	10487	10492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659178
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163	NC_019971	TAA	2	6	11837	11842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659181
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259	NC_019971	AGC	2	6	17170	17175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659186
260	NC_019971	TGG	2	6	17203	17208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659186
261	NC_019971	GAT	2	6	17241	17246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659186
262	NC_019971	TTG	2	6	17259	17264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659186
263	NC_019971	GTT	2	6	17315	17320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659186
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291	NC_019971	AAG	2	6	18607	18612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659187
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372	NC_019971	CAAC	2	8	23136	23143	50 %	0 %	0 %	50 %	433659192
373	NC_019971	CAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659192
374	NC_019971	GAG	2	6	23187	23192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659192
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500	NC_019971	CGG	2	6	30507	30512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659199

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