MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 2

Total Repeats: 29140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_019971	ATC	2	6	285868	285873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659432
4502	NC_019971	CAG	2	6	285929	285934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659432
4503	NC_019971	AAC	2	6	285947	285952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659432
4504	NC_019971	CAG	2	6	285996	286001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659432
4505	NC_019971	GAC	2	6	286041	286046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659433
4506	NC_019971	GGC	2	6	286078	286083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659433
4507	NC_019971	GGT	2	6	286090	286095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659433
4508	NC_019971	A	6	6	286199	286204	100 %	0 %	0 %	0 %	433659433
4509	NC_019971	GCG	2	6	286264	286269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659433
4510	NC_019971	ACC	2	6	286273	286278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659433
4511	NC_019971	CCGAC	2	10	286298	286307	20 %	0 %	20 %	60 %	433659433
4512	NC_019971	ACG	2	6	286318	286323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659433
4513	NC_019971	AAC	2	6	286456	286461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659433
4514	NC_019971	ATT	2	6	286634	286639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659434
4515	NC_019971	GCC	2	6	286662	286667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433659434
4516	NC_019971	CAAT	2	8	286751	286758	50 %	25 %	0 %	25 %	433659434
4517	NC_019971	T	6	6	286764	286769	0 %	100 %	0 %	0 %	433659434
4518	NC_019971	CGA	2	6	286862	286867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659434
4519	NC_019971	CG	3	6	286905	286910	0 %	0 %	50 %	50 %	433659434
4520	NC_019971	GAGC	2	8	286931	286938	25 %	0 %	50 %	25 %	433659434
4521	NC_019971	TTG	2	6	287276	287281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659435
4522	NC_019971	AAAT	2	8	287298	287305	75 %	25 %	0 %	0 %	433659435
4523	NC_019971	A	6	6	287341	287346	100 %	0 %	0 %	0 %	433659435
4524	NC_019971	ATT	2	6	287535	287540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659435
4525	NC_019971	TAT	2	6	287585	287590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433659436
4526	NC_019971	A	6	6	287609	287614	100 %	0 %	0 %	0 %	433659436
4527	NC_019971	GC	3	6	287702	287707	0 %	0 %	50 %	50 %	433659436
4528	NC_019971	GAAA	2	8	287739	287746	75 %	0 %	25 %	0 %	433659436
4529	NC_019971	ATG	2	6	287813	287818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659436
4530	NC_019971	ACG	2	6	287836	287841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659436
4531	NC_019971	TACTG	2	10	287844	287853	20 %	40 %	20 %	20 %	433659436
4532	NC_019971	TCA	2	6	287864	287869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659436
4533	NC_019971	GCG	2	6	287944	287949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659436
4534	NC_019971	CG	3	6	288034	288039	0 %	0 %	50 %	50 %	433659436
4535	NC_019971	GAA	2	6	288100	288105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659436
4536	NC_019971	TCA	2	6	288179	288184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659436
4537	NC_019971	TGG	2	6	288233	288238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659436
4538	NC_019971	A	6	6	288241	288246	100 %	0 %	0 %	0 %	433659436
4539	NC_019971	CAG	2	6	288249	288254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659436
4540	NC_019971	AGA	2	6	288279	288284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659436
4541	NC_019971	TCT	2	6	288295	288300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433659436
4542	NC_019971	CGCT	2	8	288301	288308	0 %	25 %	25 %	50 %	433659436
4543	NC_019971	AAC	2	6	288361	288366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659436
4544	NC_019971	CGTG	2	8	288378	288385	0 %	25 %	50 %	25 %	433659436
4545	NC_019971	CGG	2	6	288389	288394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659436
4546	NC_019971	GAT	2	6	288429	288434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659436
4547	NC_019971	GAA	2	6	288475	288480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659436
4548	NC_019971	GAA	2	6	288528	288533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659436
4549	NC_019971	ACA	2	6	288553	288558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659436
4550	NC_019971	GTGG	2	8	288565	288572	0 %	25 %	75 %	0 %	433659436
4551	NC_019971	GCA	2	6	288574	288579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659436
4552	NC_019971	AAGC	2	8	288581	288588	50 %	0 %	25 %	25 %	433659436
4553	NC_019971	ACC	2	6	288634	288639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659436
4554	NC_019971	CAA	2	6	288664	288669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659436
4555	NC_019971	GGC	2	6	288688	288693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659436
4556	NC_019971	AGA	2	6	288740	288745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659436
4557	NC_019971	GAA	2	6	288790	288795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659436
4558	NC_019971	TTG	2	6	288800	288805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659436
4559	NC_019971	TGG	3	9	288807	288815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659436
4560	NC_019971	CTAA	2	8	288823	288830	50 %	25 %	0 %	25 %	433659436
4561	NC_019971	CAAC	2	8	288932	288939	50 %	0 %	0 %	50 %	433659436
4562	NC_019971	TGA	2	6	289106	289111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659436
4563	NC_019971	CAC	2	6	289113	289118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659436
4564	NC_019971	GAT	2	6	289125	289130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659436
4565	NC_019971	ACCA	2	8	289132	289139	50 %	0 %	0 %	50 %	433659436
4566	NC_019971	AAT	2	6	289633	289638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659437
4567	NC_019971	CTG	3	9	289683	289691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659437
4568	NC_019971	TTGA	2	8	289721	289728	25 %	50 %	25 %	0 %	433659437
4569	NC_019971	A	6	6	289871	289876	100 %	0 %	0 %	0 %	433659437
4570	NC_019971	AC	3	6	289933	289938	50 %	0 %	0 %	50 %	433659437
4571	NC_019971	TTG	2	6	289953	289958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659437
4572	NC_019971	TGG	2	6	290011	290016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433659437
4573	NC_019971	ATG	2	6	290061	290066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659437
4574	NC_019971	GAC	2	6	290155	290160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659437
4575	NC_019971	AGCCA	2	10	290215	290224	40 %	0 %	20 %	40 %	433659437
4576	NC_019971	ACC	2	6	290261	290266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433659437
4577	NC_019971	TAC	2	6	290300	290305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659437
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4580	NC_019971	AAG	2	6	290481	290486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659437
4581	NC_019971	TC	3	6	290499	290504	0 %	50 %	0 %	50 %	433659437
4582	NC_019971	GATT	2	8	290572	290579	25 %	50 %	25 %	0 %	433659437
4583	NC_019971	TTGA	2	8	290752	290759	25 %	50 %	25 %	0 %	433659438
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4586	NC_019971	GAG	2	6	291038	291043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433659438
4587	NC_019971	AGATA	2	10	291066	291075	60 %	20 %	20 %	0 %	433659438
4588	NC_019971	AGC	2	6	291076	291081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659438
4589	NC_019971	CATT	2	8	291110	291117	25 %	50 %	0 %	25 %	433659438
4590	NC_019971	TAA	2	6	291264	291269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433659438
4591	NC_019971	GCG	2	6	291455	291460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659439
4592	NC_019971	AGCATC	2	12	291678	291689	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433659439
4593	NC_019971	GTTG	2	8	291723	291730	0 %	50 %	50 %	0 %	433659439
4594	NC_019971	TGC	2	6	291742	291747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659439
4595	NC_019971	ATG	2	6	291753	291758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659439
4596	NC_019971	CGG	2	6	291786	291791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659439
4597	NC_019971	TCG	2	6	291835	291840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433659439
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4601	NC_019971	TTG	2	6	291959	291964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659439
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4604	NC_019971	GCG	2	6	292097	292102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433659439
4605	NC_019971	TCA	2	6	292236	292241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433659439
4606	NC_019971	GT	3	6	292267	292272	0 %	50 %	50 %	0 %	433659439
4607	NC_019971	GCA	2	6	292285	292290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433659439
4608	NC_019971	TGGAAA	2	12	292364	292375	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	433659440
4609	NC_019971	TTG	2	6	292385	292390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433659440
4610	NC_019971	AAATC	2	10	292391	292400	60 %	20 %	0 %	20 %	433659440
4611	NC_019971	TC	3	6	292493	292498	0 %	50 %	0 %	50 %	433659440
4612	NC_019971	CAA	2	6	292548	292553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433659440
4613	NC_019971	ATG	2	6	292558	292563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433659440
4614	NC_019971	AGA	2	6	292575	292580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433659440
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4618	NC_019971	GT	3	6	292860	292865	0 %	50 %	50 %	0 %	433659441
4619	NC_019971	CTC	2	6	292886	292891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433659441
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