MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 53173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019955	GTT	2	6	238694	238699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656542
4002	NC_019955	TCA	2	6	238744	238749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656542
4003	NC_019955	TCAA	2	8	238756	238763	50 %	25 %	0 %	25 %	433656542
4004	NC_019955	CG	3	6	238824	238829	0 %	0 %	50 %	50 %	433656542
4005	NC_019955	GTT	2	6	238830	238835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656542
4006	NC_019955	CAG	2	6	238913	238918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656542
4007	NC_019955	TGAT	2	8	238928	238935	25 %	50 %	25 %	0 %	433656542
4008	NC_019955	ATC	2	6	239032	239037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656542
4009	NC_019955	GTA	2	6	239064	239069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656542
4010	NC_019955	GA	3	6	239186	239191	50 %	0 %	50 %	0 %	433656542
4011	NC_019955	TCGG	2	8	239231	239238	0 %	25 %	50 %	25 %	433656542
4012	NC_019955	GTAC	2	8	239389	239396	25 %	25 %	25 %	25 %	433656542
4013	NC_019955	GTT	2	6	239448	239453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656542
4014	NC_019955	CCA	2	6	239476	239481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656542
4015	NC_019955	TGT	2	6	239780	239785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656542
4016	NC_019955	GCT	2	6	239812	239817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656542
4017	NC_019955	CTC	2	6	239928	239933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433656542
4018	NC_019955	TGGTGT	2	12	239991	240002	0 %	50 %	50 %	0 %	433656542
4019	NC_019955	CGC	2	6	240068	240073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656542
4020	NC_019955	ACC	2	6	240159	240164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656542
4021	NC_019955	GTG	2	6	240224	240229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656542
4022	NC_019955	TGC	2	6	240264	240269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656542
4023	NC_019955	TGT	2	6	240374	240379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656542
4024	NC_019955	CG	3	6	240380	240385	0 %	0 %	50 %	50 %	433656542
4025	NC_019955	GCA	2	6	240460	240465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656542
4026	NC_019955	TCA	2	6	240610	240615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656542
4027	NC_019955	A	6	6	240620	240625	100 %	0 %	0 %	0 %	433656542
4028	NC_019955	A	6	6	240692	240697	100 %	0 %	0 %	0 %	433656542
4029	NC_019955	ACC	2	6	240780	240785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656542
4030	NC_019955	TGG	2	6	240810	240815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656542
4031	NC_019955	TTC	2	6	240903	240908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656543
4032	NC_019955	GGTT	2	8	240914	240921	0 %	50 %	50 %	0 %	433656543
4033	NC_019955	TCA	2	6	240975	240980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656543
4034	NC_019955	GTG	2	6	241003	241008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656543
4035	NC_019955	TGG	2	6	241082	241087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656543
4036	NC_019955	TTG	2	6	241322	241327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656543
4037	NC_019955	T	6	6	241389	241394	0 %	100 %	0 %	0 %	433656543
4038	NC_019955	CTG	2	6	241414	241419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656543
4039	NC_019955	TTG	2	6	241469	241474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656543
4040	NC_019955	CT	3	6	241497	241502	0 %	50 %	0 %	50 %	433656543
4041	NC_019955	TTG	2	6	241514	241519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656543
4042	NC_019955	GGT	2	6	241563	241568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656543
4043	NC_019955	TAG	2	6	241594	241599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656543
4044	NC_019955	TAA	2	6	241634	241639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656543
4045	NC_019955	ACT	2	6	241733	241738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656544
4046	NC_019955	T	6	6	241776	241781	0 %	100 %	0 %	0 %	433656544
4047	NC_019955	TGA	2	6	241842	241847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656544
4048	NC_019955	TGA	2	6	241862	241867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656544
4049	NC_019955	AAGA	2	8	241920	241927	75 %	0 %	25 %	0 %	433656544
4050	NC_019955	TGG	2	6	241986	241991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656544
4051	NC_019955	ACC	2	6	242033	242038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656544
4052	NC_019955	TCT	2	6	242177	242182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656544
4053	NC_019955	CTT	2	6	242217	242222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656544
4054	NC_019955	TAAG	2	8	242292	242299	50 %	25 %	25 %	0 %	433656544
4055	NC_019955	TCA	2	6	242328	242333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656544
4056	NC_019955	ATT	2	6	242402	242407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656545
4057	NC_019955	CGC	2	6	242460	242465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656545
4058	NC_019955	CTA	2	6	242471	242476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656545
4059	NC_019955	CTG	4	12	242483	242494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656545
4060	NC_019955	CTACTG	2	12	242498	242509	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	433656545
4061	NC_019955	TGC	2	6	242529	242534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656545
4062	NC_019955	CTG	2	6	242543	242548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656545
4063	NC_019955	TTC	2	6	242614	242619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656545
4064	NC_019955	ATT	2	6	242620	242625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656545
4065	NC_019955	TAA	2	6	243261	243266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656546
4066	NC_019955	CAG	2	6	243326	243331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656546
4067	NC_019955	TTC	2	6	243374	243379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656546
4068	NC_019955	CTT	2	6	243386	243391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656546
4069	NC_019955	CTT	2	6	243438	243443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656546
4070	NC_019955	CAA	2	6	243607	243612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656546
4071	NC_019955	TTG	2	6	243701	243706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656546
4072	NC_019955	ACTT	2	8	243741	243748	25 %	50 %	0 %	25 %	433656546
4073	NC_019955	TTAA	2	8	243768	243775	50 %	50 %	0 %	0 %	433656546
4074	NC_019955	CTG	2	6	243950	243955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656547
4075	NC_019955	CAA	2	6	243961	243966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656547
4076	NC_019955	AGTA	2	8	243976	243983	50 %	25 %	25 %	0 %	433656547
4077	NC_019955	CTT	2	6	244007	244012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656547
4078	NC_019955	AAGTAA	2	12	244079	244090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	433656547
4079	NC_019955	ACG	2	6	244156	244161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656547
4080	NC_019955	TGA	2	6	244215	244220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656547
4081	NC_019955	ACG	2	6	244252	244257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656547
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4083	NC_019955	GTG	2	6	244511	244516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656547
4084	NC_019955	TTA	2	6	244633	244638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656547
4085	NC_019955	AAGC	2	8	244741	244748	50 %	0 %	25 %	25 %	433656547
4086	NC_019955	GGT	2	6	244762	244767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656547
4087	NC_019955	CAA	2	6	244867	244872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656547
4088	NC_019955	GAA	2	6	244918	244923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656547
4089	NC_019955	GTT	2	6	245059	245064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656547
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4091	NC_019955	CAA	2	6	245135	245140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656547
4092	NC_019955	AAG	2	6	245300	245305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656547
4093	NC_019955	TCA	2	6	245314	245319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656547
4094	NC_019955	TCT	2	6	245329	245334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656547
4095	NC_019955	TTGC	2	8	245440	245447	0 %	50 %	25 %	25 %	433656547
4096	NC_019955	CAG	2	6	245470	245475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656547
4097	NC_019955	GTTTGG	2	12	245480	245491	0 %	50 %	50 %	0 %	433656547
4098	NC_019955	GCT	2	6	245581	245586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656547
4099	NC_019955	GC	3	6	245658	245663	0 %	0 %	50 %	50 %	433656547
4100	NC_019955	GTA	2	6	245708	245713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656547
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4102	NC_019955	GTAC	2	8	245822	245829	25 %	25 %	25 %	25 %	433656547
4103	NC_019955	CCGT	2	8	245831	245838	0 %	25 %	25 %	50 %	433656547
4104	NC_019955	TGG	2	6	245874	245879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656547
4105	NC_019955	TGC	2	6	245964	245969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656547
4106	NC_019955	GAA	2	6	245991	245996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656547
4107	NC_019955	GAA	2	6	246064	246069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656547
4108	NC_019955	AGA	2	6	246153	246158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656547
4109	NC_019955	AAGTTC	2	12	246212	246223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433656547
4110	NC_019955	A	6	6	246289	246294	100 %	0 %	0 %	0 %	433656547
4111	NC_019955	AAC	2	6	246373	246378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656547
4112	NC_019955	TTG	2	6	246407	246412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656547
4113	NC_019955	CAG	2	6	246455	246460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656547
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4115	NC_019955	CCA	2	6	246858	246863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656548
4116	NC_019955	GAT	2	6	246879	246884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656548
4117	NC_019955	AT	3	6	246997	247002	50 %	50 %	0 %	0 %	433656548
4118	NC_019955	CAG	2	6	247027	247032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656548
4119	NC_019955	AG	3	6	247031	247036	50 %	0 %	50 %	0 %	433656548
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4121	NC_019955	GGT	2	6	247077	247082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656548
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4235	NC_019955	TC	3	6	253151	253156	0 %	50 %	0 %	50 %	433656553
4236	NC_019955	AT	3	6	253180	253185	50 %	50 %	0 %	0 %	433656553
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4239	NC_019955	AGAT	2	8	253349	253356	50 %	25 %	25 %	0 %	433656553
4240	NC_019955	AT	3	6	253355	253360	50 %	50 %	0 %	0 %	433656553
4241	NC_019955	AACTTG	2	12	253368	253379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	433656553
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4491	NC_019955	GTG	2	6	267234	267239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656564
4492	NC_019955	TTAT	2	8	267303	267310	25 %	75 %	0 %	0 %	433656564
4493	NC_019955	GGT	2	6	267323	267328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656564
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