MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 53173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_019955	TCTG	2	8	210858	210865	0 %	50 %	25 %	25 %	433656509
3502	NC_019955	AGA	2	6	210924	210929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656509
3503	NC_019955	TGG	2	6	210965	210970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656509
3504	NC_019955	CAA	2	6	210987	210992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656509
3505	NC_019955	TGA	2	6	211087	211092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656509
3506	NC_019955	GAT	2	6	211202	211207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656510
3507	NC_019955	GA	3	6	211240	211245	50 %	0 %	50 %	0 %	433656510
3508	NC_019955	TC	3	6	211538	211543	0 %	50 %	0 %	50 %	433656510
3509	NC_019955	AG	3	6	211566	211571	50 %	0 %	50 %	0 %	433656510
3510	NC_019955	TAA	2	6	211609	211614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656510
3511	NC_019955	AGT	2	6	211670	211675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656510
3512	NC_019955	CAC	2	6	211689	211694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656510
3513	NC_019955	GCT	2	6	211701	211706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656510
3514	NC_019955	ACC	2	6	211723	211728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656510
3515	NC_019955	AGCCA	2	10	211744	211753	40 %	0 %	20 %	40 %	433656510
3516	NC_019955	TGG	2	6	211798	211803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656510
3517	NC_019955	GGAT	2	8	211866	211873	25 %	25 %	50 %	0 %	433656510
3518	NC_019955	AAC	2	6	212226	212231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656511
3519	NC_019955	CACG	2	8	212238	212245	25 %	0 %	25 %	50 %	433656511
3520	NC_019955	CTA	2	6	212251	212256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656511
3521	NC_019955	CGT	2	6	212259	212264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656511
3522	NC_019955	AG	3	6	212300	212305	50 %	0 %	50 %	0 %	433656511
3523	NC_019955	CAT	2	6	212351	212356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656511
3524	NC_019955	AAAG	2	8	212436	212443	75 %	0 %	25 %	0 %	433656512
3525	NC_019955	CAG	2	6	212474	212479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656512
3526	NC_019955	AAG	2	6	212582	212587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656512
3527	NC_019955	AAT	2	6	212597	212602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656512
3528	NC_019955	ATTA	2	8	212724	212731	50 %	50 %	0 %	0 %	433656513
3529	NC_019955	TCTTA	2	10	212784	212793	20 %	60 %	0 %	20 %	433656513
3530	NC_019955	ATT	2	6	212917	212922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656513
3531	NC_019955	TCTG	2	8	213074	213081	0 %	50 %	25 %	25 %	433656513
3532	NC_019955	TAA	2	6	213141	213146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656513
3533	NC_019955	GCAT	2	8	213156	213163	25 %	25 %	25 %	25 %	433656513
3534	NC_019955	CT	3	6	213166	213171	0 %	50 %	0 %	50 %	433656513
3535	NC_019955	ACA	2	6	213221	213226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656513
3536	NC_019955	AATG	2	8	213477	213484	50 %	25 %	25 %	0 %	433656513
3537	NC_019955	TAA	2	6	213504	213509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656513
3538	NC_019955	TGC	2	6	213680	213685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656513
3539	NC_019955	GTG	2	6	213944	213949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656513
3540	NC_019955	TTTG	2	8	213996	214003	0 %	75 %	25 %	0 %	433656513
3541	NC_019955	AGT	2	6	214032	214037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656513
3542	NC_019955	TCT	2	6	214127	214132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656513
3543	NC_019955	AAT	2	6	214159	214164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656513
3544	NC_019955	GAT	2	6	214201	214206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656513
3545	NC_019955	CCGTCG	2	12	214308	214319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	433656514
3546	NC_019955	CAT	2	6	214344	214349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656514
3547	NC_019955	ACCT	2	8	214390	214397	25 %	25 %	0 %	50 %	433656514
3548	NC_019955	GAACT	2	10	214573	214582	40 %	20 %	20 %	20 %	433656514
3549	NC_019955	CAG	2	6	214585	214590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656514
3550	NC_019955	AGCCT	2	10	214604	214613	20 %	20 %	20 %	40 %	433656514
3551	NC_019955	CAT	2	6	214752	214757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656514
3552	NC_019955	AGTG	2	8	214763	214770	25 %	25 %	50 %	0 %	433656514
3553	NC_019955	AAAT	2	8	214864	214871	75 %	25 %	0 %	0 %	433656515
3554	NC_019955	TCG	2	6	215028	215033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656515
3555	NC_019955	GT	3	6	215105	215110	0 %	50 %	50 %	0 %	433656515
3556	NC_019955	TGC	2	6	215174	215179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656515
3557	NC_019955	GTG	2	6	215356	215361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656515
3558	NC_019955	CAG	2	6	215426	215431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656515
3559	NC_019955	ACTA	2	8	215436	215443	50 %	25 %	0 %	25 %	433656515
3560	NC_019955	TGG	2	6	215462	215467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656515
3561	NC_019955	TTA	2	6	215569	215574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656515
3562	NC_019955	AG	3	6	215590	215595	50 %	0 %	50 %	0 %	433656515
3563	NC_019955	CTT	2	6	215652	215657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656515
3564	NC_019955	TG	3	6	215664	215669	0 %	50 %	50 %	0 %	433656515
3565	NC_019955	CAG	2	6	215671	215676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656515
3566	NC_019955	TGA	2	6	215856	215861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656516
3567	NC_019955	GAA	2	6	215914	215919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656516
3568	NC_019955	GTTTG	2	10	216066	216075	0 %	60 %	40 %	0 %	433656516
3569	NC_019955	ACT	2	6	216093	216098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656516
3570	NC_019955	AGA	3	9	216129	216137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656516
3571	NC_019955	CGTG	2	8	216162	216169	0 %	25 %	50 %	25 %	433656516
3572	NC_019955	GGC	2	6	216184	216189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656516
3573	NC_019955	GTTC	2	8	216201	216208	0 %	50 %	25 %	25 %	433656516
3574	NC_019955	GAA	2	6	216234	216239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656516
3575	NC_019955	TTA	2	6	216265	216270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656517
3576	NC_019955	CTGA	2	8	216344	216351	25 %	25 %	25 %	25 %	433656517
3577	NC_019955	TAC	2	6	216386	216391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656517
3578	NC_019955	A	7	7	216458	216464	100 %	0 %	0 %	0 %	433656517
3579	NC_019955	T	6	6	216481	216486	0 %	100 %	0 %	0 %	433656517
3580	NC_019955	TTA	2	6	216579	216584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656517
3581	NC_019955	TGA	2	6	216661	216666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656517
3582	NC_019955	AAGA	2	8	216686	216693	75 %	0 %	25 %	0 %	433656517
3583	NC_019955	TGG	2	6	216696	216701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656517
3584	NC_019955	AAG	2	6	216795	216800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656517
3585	NC_019955	GAG	2	6	216833	216838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433656517
3586	NC_019955	ATG	2	6	216876	216881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656517
3587	NC_019955	CAAC	2	8	216885	216892	50 %	0 %	0 %	50 %	433656517
3588	NC_019955	TTA	2	6	216924	216929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656517
3589	NC_019955	GAT	2	6	217004	217009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656517
3590	NC_019955	AAG	2	6	217056	217061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656517
3591	NC_019955	CAA	3	9	217169	217177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656517
3592	NC_019955	A	6	6	217179	217184	100 %	0 %	0 %	0 %	433656517
3593	NC_019955	CG	3	6	217322	217327	0 %	0 %	50 %	50 %	433656518
3594	NC_019955	CAA	2	6	217441	217446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656518
3595	NC_019955	GTT	2	6	217523	217528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656518
3596	NC_019955	TTGCGG	2	12	217578	217589	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	433656518
3597	NC_019955	CGTC	2	8	217651	217658	0 %	25 %	25 %	50 %	433656518
3598	NC_019955	ACA	2	6	217729	217734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656518
3599	NC_019955	TCT	2	6	217890	217895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656518
3600	NC_019955	CAT	2	6	217903	217908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656518
3601	NC_019955	CTT	2	6	217975	217980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656518
3602	NC_019955	GTG	2	6	217992	217997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656518
3603	NC_019955	ATT	2	6	217998	218003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656518
3604	NC_019955	GTAA	2	8	218037	218044	50 %	25 %	25 %	0 %	433656519
3605	NC_019955	CT	3	6	218121	218126	0 %	50 %	0 %	50 %	433656519
3606	NC_019955	A	6	6	218144	218149	100 %	0 %	0 %	0 %	433656519
3607	NC_019955	ATG	2	6	218251	218256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656519
3608	NC_019955	CAATC	2	10	218382	218391	40 %	20 %	0 %	40 %	433656519
3609	NC_019955	CCAG	2	8	218398	218405	25 %	0 %	25 %	50 %	433656519
3610	NC_019955	CTG	2	6	218472	218477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656519
3611	NC_019955	TGCT	2	8	218493	218500	0 %	50 %	25 %	25 %	433656519
3612	NC_019955	TGC	2	6	218564	218569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656519
3613	NC_019955	GTT	2	6	218580	218585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656519
3614	NC_019955	TTC	2	6	218644	218649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656519
3615	NC_019955	CGGT	2	8	218654	218661	0 %	25 %	50 %	25 %	433656519
3616	NC_019955	TCA	2	6	218687	218692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656519
3617	NC_019955	TCT	2	6	218839	218844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656520
3618	NC_019955	TTGA	2	8	218850	218857	25 %	50 %	25 %	0 %	433656520
3619	NC_019955	CTTG	3	12	218870	218881	0 %	50 %	25 %	25 %	433656520
3620	NC_019955	GTT	2	6	218930	218935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656520
3621	NC_019955	TGG	2	6	219028	219033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656520
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3623	NC_019955	GCCA	2	8	219231	219238	25 %	0 %	25 %	50 %	433656520
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3992	NC_019955	GGAAT	2	10	238222	238231	40 %	20 %	40 %	0 %	433656541
3993	NC_019955	AGC	2	6	238254	238259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656541
3994	NC_019955	CAT	2	6	238286	238291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656541
3995	NC_019955	ATC	2	6	238361	238366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656541
3996	NC_019955	GTC	2	6	238391	238396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656541
3997	NC_019955	T	6	6	238452	238457	0 %	100 %	0 %	0 %	433656541
3998	NC_019955	TGC	2	6	238516	238521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656541
3999	NC_019955	CCA	2	6	238536	238541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656541
4000	NC_019955	GAT	2	6	238547	238552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656541

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