MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 53173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019955	TCCC	2	8	94245	94252	0 %	25 %	0 %	75 %	433656400
1502	NC_019955	CAA	2	6	94256	94261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656400
1503	NC_019955	TTG	2	6	94341	94346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656400
1504	NC_019955	CGG	2	6	94353	94358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656400
1505	NC_019955	TGAC	2	8	94383	94390	25 %	25 %	25 %	25 %	433656400
1506	NC_019955	TGG	2	6	94545	94550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656400
1507	NC_019955	AAT	2	6	94637	94642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656400
1508	NC_019955	GC	3	6	94660	94665	0 %	0 %	50 %	50 %	433656400
1509	NC_019955	TGG	2	6	94710	94715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656400
1510	NC_019955	AAC	2	6	94755	94760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656400
1511	NC_019955	A	6	6	94781	94786	100 %	0 %	0 %	0 %	433656400
1512	NC_019955	ACC	2	6	94817	94822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656400
1513	NC_019955	GTG	2	6	94857	94862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656400
1514	NC_019955	TGG	2	6	94882	94887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656400
1515	NC_019955	CAT	2	6	94945	94950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656400
1516	NC_019955	AGA	2	6	95121	95126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656400
1517	NC_019955	T	6	6	95189	95194	0 %	100 %	0 %	0 %	433656400
1518	NC_019955	GGC	2	6	95248	95253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656400
1519	NC_019955	TCG	2	6	95298	95303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656400
1520	NC_019955	GGC	2	6	95345	95350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656400
1521	NC_019955	GC	3	6	95349	95354	0 %	0 %	50 %	50 %	433656400
1522	NC_019955	GAT	2	6	95363	95368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656400
1523	NC_019955	TACC	2	8	95383	95390	25 %	25 %	0 %	50 %	433656400
1524	NC_019955	CGT	2	6	95564	95569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656400
1525	NC_019955	TGTT	2	8	95604	95611	0 %	75 %	25 %	0 %	433656400
1526	NC_019955	TCG	2	6	95879	95884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656401
1527	NC_019955	CGC	2	6	95899	95904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656401
1528	NC_019955	CAT	2	6	95937	95942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656401
1529	NC_019955	GGA	2	6	95952	95957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433656401
1530	NC_019955	GTT	2	6	95958	95963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656401
1531	NC_019955	TTG	2	6	96035	96040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656401
1532	NC_019955	GTC	2	6	96058	96063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656401
1533	NC_019955	A	6	6	96076	96081	100 %	0 %	0 %	0 %	433656401
1534	NC_019955	T	7	7	96093	96099	0 %	100 %	0 %	0 %	433656401
1535	NC_019955	ATC	2	6	96101	96106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656401
1536	NC_019955	TGCT	2	8	96444	96451	0 %	50 %	25 %	25 %	433656402
1537	NC_019955	TGA	2	6	96464	96469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656402
1538	NC_019955	GTT	2	6	96512	96517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656402
1539	NC_019955	GAC	2	6	96541	96546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656402
1540	NC_019955	CTT	2	6	96548	96553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656402
1541	NC_019955	GTC	2	6	96606	96611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656402
1542	NC_019955	GCG	2	6	96655	96660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656402
1543	NC_019955	TGT	2	6	96707	96712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656402
1544	NC_019955	AAAG	2	8	97252	97259	75 %	0 %	25 %	0 %	433656403
1545	NC_019955	ACC	2	6	97295	97300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656403
1546	NC_019955	TCA	2	6	97478	97483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656403
1547	NC_019955	ATGA	2	8	97532	97539	50 %	25 %	25 %	0 %	433656404
1548	NC_019955	GGC	2	6	97744	97749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656404
1549	NC_019955	GC	3	6	97751	97756	0 %	0 %	50 %	50 %	433656404
1550	NC_019955	CTG	2	6	97787	97792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656404
1551	NC_019955	GT	4	8	97812	97819	0 %	50 %	50 %	0 %	433656404
1552	NC_019955	ACT	2	6	97858	97863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656404
1553	NC_019955	GTTGG	2	10	97907	97916	0 %	40 %	60 %	0 %	433656404
1554	NC_019955	GTG	2	6	97918	97923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656404
1555	NC_019955	AGG	2	6	97977	97982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433656404
1556	NC_019955	TGCT	2	8	98061	98068	0 %	50 %	25 %	25 %	433656406
1557	NC_019955	CGTCA	2	10	98186	98195	20 %	20 %	20 %	40 %	433656405
1558	NC_019955	TC	4	8	98196	98203	0 %	50 %	0 %	50 %	433656405
1559	NC_019955	TGC	2	6	98215	98220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656405
1560	NC_019955	TCG	3	9	98262	98270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656405
1561	NC_019955	CTG	2	6	98272	98277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656405
1562	NC_019955	AAG	2	6	98287	98292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656405
1563	NC_019955	GAA	2	6	98298	98303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656405
1564	NC_019955	ACC	2	6	98324	98329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656405
1565	NC_019955	TCA	2	6	98330	98335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656405
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1567	NC_019955	CTG	2	6	98397	98402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656407
1568	NC_019955	CTG	2	6	98478	98483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656407
1569	NC_019955	ATT	2	6	98500	98505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656407
1570	NC_019955	CACG	2	8	98524	98531	25 %	0 %	25 %	50 %	433656407
1571	NC_019955	TGG	2	6	98539	98544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656407
1572	NC_019955	TGACGT	2	12	98545	98556	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656407
1573	NC_019955	GCG	2	6	98586	98591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656407
1574	NC_019955	TGG	2	6	98613	98618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656407
1575	NC_019955	TGAA	2	8	98659	98666	50 %	25 %	25 %	0 %	433656407
1576	NC_019955	CGT	2	6	98677	98682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656407
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1578	NC_019955	CAA	2	6	98741	98746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656407
1579	NC_019955	CTG	2	6	98760	98765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656407
1580	NC_019955	ACC	2	6	98778	98783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656407
1581	NC_019955	GAT	2	6	98807	98812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656407
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1583	NC_019955	TG	3	6	98989	98994	0 %	50 %	50 %	0 %	433656407
1584	NC_019955	T	6	6	99006	99011	0 %	100 %	0 %	0 %	433656407
1585	NC_019955	AT	3	6	99165	99170	50 %	50 %	0 %	0 %	433656407
1586	NC_019955	GTTG	2	8	99274	99281	0 %	50 %	50 %	0 %	433656407
1587	NC_019955	CGA	2	6	99364	99369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656407
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1589	NC_019955	AATA	2	8	99447	99454	75 %	25 %	0 %	0 %	433656408
1590	NC_019955	ATG	2	6	99558	99563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656408
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1592	NC_019955	TTG	2	6	99633	99638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656408
1593	NC_019955	GAA	2	6	99666	99671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656408
1594	NC_019955	CA	3	6	99715	99720	50 %	0 %	0 %	50 %	433656408
1595	NC_019955	GCGAT	2	10	99730	99739	20 %	20 %	40 %	20 %	433656408
1596	NC_019955	TTG	2	6	99834	99839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656408
1597	NC_019955	GCCA	2	8	99909	99916	25 %	0 %	25 %	50 %	433656408
1598	NC_019955	TCT	2	6	99979	99984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656408
1599	NC_019955	AAT	2	6	100061	100066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656408
1600	NC_019955	TTC	2	6	100218	100223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656408
1601	NC_019955	T	6	6	100248	100253	0 %	100 %	0 %	0 %	433656408
1602	NC_019955	AGC	2	6	100254	100259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656408
1603	NC_019955	CGT	2	6	100276	100281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656408
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1605	NC_019955	ACGG	2	8	100345	100352	25 %	0 %	50 %	25 %	433656408
1606	NC_019955	AC	3	6	100357	100362	50 %	0 %	0 %	50 %	433656408
1607	NC_019955	ACA	2	6	100501	100506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656408
1608	NC_019955	CAC	2	6	100513	100518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656408
1609	NC_019955	AAC	2	6	100569	100574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656408
1610	NC_019955	GTT	2	6	100585	100590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656408
1611	NC_019955	AC	3	6	100717	100722	50 %	0 %	0 %	50 %	433656408
1612	NC_019955	GGT	2	6	100738	100743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656408
1613	NC_019955	TGC	2	6	100789	100794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656408
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1615	NC_019955	GTT	2	6	100858	100863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656408
1616	NC_019955	CAT	3	9	100873	100881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656408
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1618	NC_019955	CTT	2	6	100921	100926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656408
1619	NC_019955	GTT	2	6	100958	100963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656408
1620	NC_019955	CTT	2	6	101005	101010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656408
1621	NC_019955	GTT	2	6	101015	101020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656408
1622	NC_019955	CCA	2	6	101053	101058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656408
1623	NC_019955	GTT	3	9	101156	101164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656408
1624	NC_019955	TCA	2	6	101166	101171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656408
1625	NC_019955	TG	3	6	101199	101204	0 %	50 %	50 %	0 %	433656408
1626	NC_019955	TCGG	2	8	101222	101229	0 %	25 %	50 %	25 %	433656408
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1632	NC_019955	TGA	2	6	101451	101456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656408
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1644	NC_019955	TGA	2	6	102124	102129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656409
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1986	NC_019955	AGC	2	6	121679	121684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656426
1987	NC_019955	A	6	6	121708	121713	100 %	0 %	0 %	0 %	433656426
1988	NC_019955	AGA	2	6	121758	121763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656426
1989	NC_019955	TGC	2	6	121772	121777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656426
1990	NC_019955	TCA	2	6	121784	121789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656426
1991	NC_019955	ATG	2	6	121790	121795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656426
1992	NC_019955	TGG	2	6	121799	121804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656426
1993	NC_019955	CAG	2	6	121903	121908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656426
1994	NC_019955	TC	3	6	121913	121918	0 %	50 %	0 %	50 %	433656426
1995	NC_019955	ATC	2	6	121929	121934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656426
1996	NC_019955	TTTC	2	8	122019	122026	0 %	75 %	0 %	25 %	433656427
1997	NC_019955	AAGC	2	8	122055	122062	50 %	0 %	25 %	25 %	433656427
1998	NC_019955	GCT	2	6	122111	122116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656427
1999	NC_019955	GCC	2	6	122120	122125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656427
2000	NC_019955	TTCGTA	2	12	122128	122139	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	433656427

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