MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 42053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_017270	CGC	2	6	1180138	1180143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384424347
17502	NC_017270	GTG	2	6	1180148	1180153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384424347
17503	NC_017270	CAC	2	6	1180171	1180176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384424347
17504	NC_017270	CTG	2	6	1180177	1180182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424347
17505	NC_017270	CTAAGC	2	12	1180348	1180359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384424347
17506	NC_017270	CCAG	2	8	1180435	1180442	25 %	0 %	25 %	50 %	384424347
17507	NC_017270	AG	3	6	1180517	1180522	50 %	0 %	50 %	0 %	384424347
17508	NC_017270	GCC	2	6	1180524	1180529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384424347
17509	NC_017270	CTT	2	6	1180615	1180620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384424347
17510	NC_017270	GC	3	6	1180692	1180697	0 %	0 %	50 %	50 %	384424347
17511	NC_017270	GGC	2	6	1180721	1180726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384424347
17512	NC_017270	GAC	2	6	1180730	1180735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384424347
17513	NC_017270	CAC	2	6	1180835	1180840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384424347
17514	NC_017270	ATC	2	6	1180932	1180937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424347
17515	NC_017270	TCA	2	6	1180947	1180952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424347
17516	NC_017270	T	6	6	1180964	1180969	0 %	100 %	0 %	0 %	384424347
17517	NC_017270	TCA	2	6	1181010	1181015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424347
17518	NC_017270	ATC	2	6	1181028	1181033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424347
17519	NC_017270	TCG	2	6	1181047	1181052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424347
17520	NC_017270	GC	3	6	1181065	1181070	0 %	0 %	50 %	50 %	384424347
17521	NC_017270	GCC	2	6	1181078	1181083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384424347
17522	NC_017270	CCG	2	6	1181206	1181211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384424347
17523	NC_017270	CAT	2	6	1181225	1181230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424347
17524	NC_017270	AGTTGG	2	12	1181287	1181298	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384424347
17525	NC_017270	TGGG	2	8	1181325	1181332	0 %	25 %	75 %	0 %	384424347
17526	NC_017270	CGA	2	6	1181401	1181406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384424347
17527	NC_017270	CGCGC	2	10	1181430	1181439	0 %	0 %	40 %	60 %	384424347
17528	NC_017270	CCA	2	6	1181448	1181453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384424347
17529	NC_017270	ACC	2	6	1181457	1181462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384424347
17530	NC_017270	TCA	2	6	1181503	1181508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424347
17531	NC_017270	GC	3	6	1181544	1181549	0 %	0 %	50 %	50 %	384424347
17532	NC_017270	TG	3	6	1181553	1181558	0 %	50 %	50 %	0 %	384424347
17533	NC_017270	GGAT	2	8	1181653	1181660	25 %	25 %	50 %	0 %	384424348
17534	NC_017270	GC	3	6	1181714	1181719	0 %	0 %	50 %	50 %	384424348
17535	NC_017270	ATC	2	6	1181769	1181774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424348
17536	NC_017270	GTTT	2	8	1181776	1181783	0 %	75 %	25 %	0 %	384424348
17537	NC_017270	GAA	2	6	1181791	1181796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384424348
17538	NC_017270	GCC	2	6	1181859	1181864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384424348
17539	NC_017270	ATC	2	6	1181906	1181911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424348
17540	NC_017270	TGC	2	6	1182072	1182077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424348
17541	NC_017270	TGG	2	6	1182087	1182092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384424348
17542	NC_017270	GAAC	2	8	1182130	1182137	50 %	0 %	25 %	25 %	384424348
17543	NC_017270	CG	3	6	1182161	1182166	0 %	0 %	50 %	50 %	384424348
17544	NC_017270	TGA	2	6	1182190	1182195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384424348
17545	NC_017270	GTT	2	6	1182208	1182213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384424348
17546	NC_017270	TGT	2	6	1182221	1182226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384424348
17547	NC_017270	TGT	2	6	1182234	1182239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384424348
17548	NC_017270	CCG	3	9	1182276	1182284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384424348
17549	NC_017270	CG	3	6	1182297	1182302	0 %	0 %	50 %	50 %	384424348
17550	NC_017270	GC	3	6	1182328	1182333	0 %	0 %	50 %	50 %	384424348
17551	NC_017270	TGCT	2	8	1182428	1182435	0 %	50 %	25 %	25 %	384424348
17552	NC_017270	TAA	2	6	1182436	1182441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384424348
17553	NC_017270	TTG	2	6	1182474	1182479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384424348
17554	NC_017270	ACG	2	6	1182578	1182583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384424348
17555	NC_017270	CAT	2	6	1182604	1182609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424348
17556	NC_017270	GGC	2	6	1182610	1182615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384424348
17557	NC_017270	GTG	2	6	1182633	1182638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384424348
17558	NC_017270	AGCTC	2	10	1182653	1182662	20 %	20 %	20 %	40 %	384424349
17559	NC_017270	AGCTC	2	10	1182707	1182716	20 %	20 %	20 %	40 %	384424349
17560	NC_017270	GCG	2	6	1182784	1182789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384424349
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17562	NC_017270	TCA	3	9	1182872	1182880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424349
17563	NC_017270	CGG	2	6	1182966	1182971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384424349
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17565	NC_017270	CCCA	2	8	1183089	1183096	25 %	0 %	0 %	75 %	384424349
17566	NC_017270	GCC	2	6	1183116	1183121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384424349
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17569	NC_017270	TGG	2	6	1183241	1183246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384424349
17570	NC_017270	TCA	2	6	1183303	1183308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424349
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17572	NC_017270	GTGC	2	8	1183334	1183341	0 %	25 %	50 %	25 %	384424349
17573	NC_017270	TGG	2	6	1183355	1183360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384424349
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17587	NC_017270	TTGG	2	8	1184173	1184180	0 %	50 %	50 %	0 %	384424350
17588	NC_017270	CCA	2	6	1184307	1184312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384424350
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17591	NC_017270	CAAA	2	8	1184462	1184469	75 %	0 %	0 %	25 %	384424350
17592	NC_017270	GCG	2	6	1184485	1184490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384424350
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17596	NC_017270	T	6	6	1185033	1185038	0 %	100 %	0 %	0 %	384424351
17597	NC_017270	TGA	2	6	1185067	1185072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384424351
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17599	NC_017270	TGCT	2	8	1185135	1185142	0 %	50 %	25 %	25 %	384424351
17600	NC_017270	TAA	2	6	1185159	1185164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384424351
17601	NC_017270	TGC	2	6	1185208	1185213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424351
17602	NC_017270	GCT	2	6	1185255	1185260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424351
17603	NC_017270	TAGCT	2	10	1185427	1185436	20 %	40 %	20 %	20 %	384424351
17604	NC_017270	GCA	2	6	1185535	1185540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384424351
17605	NC_017270	CCA	2	6	1185547	1185552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384424351
17606	NC_017270	TGGC	2	8	1185613	1185620	0 %	25 %	50 %	25 %	384424351
17607	NC_017270	TGA	2	6	1185641	1185646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384424351
17608	NC_017270	CAT	2	6	1185950	1185955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424352
17609	NC_017270	TTC	2	6	1185957	1185962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384424352
17610	NC_017270	GCCGC	2	10	1186057	1186066	0 %	0 %	40 %	60 %	384424352
17611	NC_017270	ATC	2	6	1186068	1186073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384424352
17612	NC_017270	CAG	2	6	1186100	1186105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384424352
17613	NC_017270	GTC	2	6	1186161	1186166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384424352
17614	NC_017270	CAG	2	6	1186218	1186223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384424353
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17616	NC_017270	TGAT	2	8	1186329	1186336	25 %	50 %	25 %	0 %	384424353
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