MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 14202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017269	ATG	2	6	130437	130442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422640
2002	NC_017269	CGC	2	6	130454	130459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422640
2003	NC_017269	GCC	3	9	130500	130508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422640
2004	NC_017269	ACCGCC	2	12	130553	130564	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384422640
2005	NC_017269	TGC	2	6	130590	130595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422640
2006	NC_017269	CTTT	2	8	130689	130696	0 %	75 %	0 %	25 %	384422640
2007	NC_017269	TGC	2	6	130830	130835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422640
2008	NC_017269	GAA	2	6	130865	130870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422640
2009	NC_017269	GCGA	2	8	130949	130956	25 %	0 %	50 %	25 %	384422640
2010	NC_017269	GTG	2	6	130983	130988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422640
2011	NC_017269	CAA	2	6	131009	131014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422640
2012	NC_017269	TACC	2	8	131019	131026	25 %	25 %	0 %	50 %	384422640
2013	NC_017269	TGA	2	6	131035	131040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422640
2014	NC_017269	CGT	2	6	131051	131056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422640
2015	NC_017269	GTCT	2	8	131061	131068	0 %	50 %	25 %	25 %	384422640
2016	NC_017269	GC	3	6	131089	131094	0 %	0 %	50 %	50 %	384422640
2017	NC_017269	CAT	2	6	131137	131142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422640
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2019	NC_017269	CT	3	6	131210	131215	0 %	50 %	0 %	50 %	384422640
2020	NC_017269	AG	3	6	131363	131368	50 %	0 %	50 %	0 %	384422640
2021	NC_017269	TTC	2	6	131417	131422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422640
2022	NC_017269	AGA	2	6	131488	131493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422640
2023	NC_017269	CTT	2	6	131521	131526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422640
2024	NC_017269	TTG	2	6	131550	131555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422640
2025	NC_017269	TCAA	2	8	131559	131566	50 %	25 %	0 %	25 %	384422640
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2035	NC_017269	GC	3	6	132184	132189	0 %	0 %	50 %	50 %	384422640
2036	NC_017269	ATG	2	6	132231	132236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422640
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2041	NC_017269	GGC	2	6	132535	132540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422640
2042	NC_017269	CTAT	2	8	132585	132592	25 %	50 %	0 %	25 %	384422640
2043	NC_017269	ATG	2	6	132638	132643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422640
2044	NC_017269	CAAG	2	8	132676	132683	50 %	0 %	25 %	25 %	384422640
2045	NC_017269	GGA	2	6	132715	132720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422640
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2049	NC_017269	GCGTC	2	10	132885	132894	0 %	20 %	40 %	40 %	384422640
2050	NC_017269	AAG	2	6	132924	132929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422640
2051	NC_017269	GATCA	2	10	132935	132944	40 %	20 %	20 %	20 %	384422640
2052	NC_017269	TTC	2	6	132971	132976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422640
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2054	NC_017269	CGT	2	6	133040	133045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422640
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2056	NC_017269	TCG	2	6	133284	133289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422640
2057	NC_017269	GAT	2	6	133300	133305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422640
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2059	NC_017269	GAG	2	6	133534	133539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422641
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2062	NC_017269	GCCT	2	8	133660	133667	0 %	25 %	25 %	50 %	384422641
2063	NC_017269	TGA	2	6	133709	133714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422641
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2089	NC_017269	AGCCA	2	10	135531	135540	40 %	0 %	20 %	40 %	384422642
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2103	NC_017269	CAAC	2	8	136554	136561	50 %	0 %	0 %	50 %	384422642
2104	NC_017269	AGC	2	6	136606	136611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422642
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2110	NC_017269	TGG	2	6	136839	136844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422642
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2113	NC_017269	GGCGC	2	10	136933	136942	0 %	0 %	60 %	40 %	384422642
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2117	NC_017269	TTA	2	6	137143	137148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422642
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2119	NC_017269	TAAAAC	2	12	137214	137225	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384422642
2120	NC_017269	CCA	2	6	137262	137267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422642
2121	NC_017269	AC	3	6	137269	137274	50 %	0 %	0 %	50 %	384422642
2122	NC_017269	ACT	2	6	137322	137327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422642
2123	NC_017269	GATG	2	8	137346	137353	25 %	25 %	50 %	0 %	384422642
2124	NC_017269	GGTG	2	8	137354	137361	0 %	25 %	75 %	0 %	384422642
2125	NC_017269	ATG	2	6	137369	137374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422642
2126	NC_017269	ATG	2	6	137435	137440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422642
2127	NC_017269	TCA	2	6	137446	137451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422642
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2130	NC_017269	CTT	2	6	138796	138801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422643
2131	NC_017269	TGC	2	6	138853	138858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422643
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2244	NC_017269	ACC	2	6	144462	144467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422649
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2485	NC_017269	TGC	2	6	158850	158855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
2486	NC_017269	GTA	2	6	158906	158911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422661
2487	NC_017269	CGG	2	6	158931	158936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
2488	NC_017269	CGG	2	6	159048	159053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422661
2489	NC_017269	TGA	2	6	159123	159128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422661
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2493	NC_017269	CTG	2	6	159266	159271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422661
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