MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 14202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017269	TTCAA	2	10	672250	672259	40 %	40 %	0 %	20 %	384423133
10002	NC_017269	GCACG	2	10	672446	672455	20 %	0 %	40 %	40 %	384423134
10003	NC_017269	GC	3	6	672457	672462	0 %	0 %	50 %	50 %	384423134
10004	NC_017269	TGA	2	6	672539	672544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423134
10005	NC_017269	A	6	6	672606	672611	100 %	0 %	0 %	0 %	384423134
10006	NC_017269	GGC	2	6	672753	672758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423134
10007	NC_017269	ACG	2	6	672805	672810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423134
10008	NC_017269	TAA	2	6	672827	672832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423134
10009	NC_017269	AGC	2	6	672867	672872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423134
10010	NC_017269	CCA	2	6	672914	672919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423134
10011	NC_017269	ATGGA	2	10	673134	673143	40 %	20 %	40 %	0 %	384423135
10012	NC_017269	ACG	2	6	673235	673240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423135
10013	NC_017269	GCT	3	9	673315	673323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423135
10014	NC_017269	TTG	2	6	673326	673331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423135
10015	NC_017269	G	6	6	673387	673392	0 %	0 %	100 %	0 %	384423135
10016	NC_017269	GTT	2	6	673450	673455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423135
10017	NC_017269	CGC	2	6	673498	673503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423135
10018	NC_017269	CTG	2	6	673547	673552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423135
10019	NC_017269	TCA	2	6	673607	673612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423135
10020	NC_017269	TGG	2	6	673667	673672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423135
10021	NC_017269	GTG	2	6	673674	673679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423135
10022	NC_017269	AGGA	2	8	673719	673726	50 %	0 %	50 %	0 %	384423135
10023	NC_017269	CGT	3	9	673888	673896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423135
10024	NC_017269	CTC	2	6	673920	673925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423135
10025	NC_017269	GC	3	6	674051	674056	0 %	0 %	50 %	50 %	384423135
10026	NC_017269	TCGC	2	8	674100	674107	0 %	25 %	25 %	50 %	384423135
10027	NC_017269	G	6	6	674118	674123	0 %	0 %	100 %	0 %	384423135
10028	NC_017269	TCG	2	6	674145	674150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423135
10029	NC_017269	CTT	2	6	674166	674171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423135
10030	NC_017269	TTC	2	6	674207	674212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423135
10031	NC_017269	TG	3	6	674322	674327	0 %	50 %	50 %	0 %	384423135
10032	NC_017269	TCA	2	6	674484	674489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423136
10033	NC_017269	GC	3	6	674503	674508	0 %	0 %	50 %	50 %	384423136
10034	NC_017269	CA	3	6	674527	674532	50 %	0 %	0 %	50 %	384423136
10035	NC_017269	GGTA	2	8	674609	674616	25 %	25 %	50 %	0 %	384423136
10036	NC_017269	TGAG	2	8	674632	674639	25 %	25 %	50 %	0 %	384423136
10037	NC_017269	A	6	6	674749	674754	100 %	0 %	0 %	0 %	384423136
10038	NC_017269	CAC	2	6	674770	674775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423136
10039	NC_017269	TGC	2	6	674811	674816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423136
10040	NC_017269	CTG	2	6	674819	674824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423136
10041	NC_017269	TCA	2	6	674844	674849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423136
10042	NC_017269	TCT	2	6	674928	674933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423136
10043	NC_017269	TCT	2	6	674970	674975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423136
10044	NC_017269	CGA	2	6	674982	674987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423136
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10047	NC_017269	GCA	2	6	675267	675272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423136
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10050	NC_017269	CAA	2	6	675591	675596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423137
10051	NC_017269	TTG	2	6	675684	675689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423137
10052	NC_017269	CAT	2	6	675722	675727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
10053	NC_017269	CCA	2	6	675731	675736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423137
10054	NC_017269	GTT	2	6	675768	675773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423137
10055	NC_017269	GTT	2	6	675779	675784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423137
10056	NC_017269	CAC	2	6	675813	675818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423137
10057	NC_017269	ATCA	2	8	675819	675826	50 %	25 %	0 %	25 %	384423137
10058	NC_017269	TCG	2	6	675880	675885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423137
10059	NC_017269	ACC	2	6	675951	675956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423137
10060	NC_017269	TCA	2	6	675994	675999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
10061	NC_017269	AGC	2	6	676012	676017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423137
10062	NC_017269	CCA	2	6	676024	676029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423137
10063	NC_017269	CCA	2	6	676037	676042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423137
10064	NC_017269	ATC	2	6	676050	676055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
10065	NC_017269	GAT	2	6	676067	676072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423137
10066	NC_017269	CAG	2	6	676074	676079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423137
10067	NC_017269	CAATCT	2	12	676094	676105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
10068	NC_017269	GC	3	6	676130	676135	0 %	0 %	50 %	50 %	384423137
10069	NC_017269	CTC	2	6	676188	676193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423137
10070	NC_017269	ACT	2	6	676201	676206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
10071	NC_017269	CT	3	6	676213	676218	0 %	50 %	0 %	50 %	384423137
10072	NC_017269	TGC	2	6	676277	676282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423137
10073	NC_017269	GAT	2	6	676304	676309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423137
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10077	NC_017269	GATT	2	8	676556	676563	25 %	50 %	25 %	0 %	384423137
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10080	NC_017269	TCA	2	6	676754	676759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
10081	NC_017269	CAT	2	6	676760	676765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
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10083	NC_017269	CAGT	2	8	676808	676815	25 %	25 %	25 %	25 %	384423137
10084	NC_017269	TCA	2	6	676831	676836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
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10086	NC_017269	GC	3	6	676907	676912	0 %	0 %	50 %	50 %	384423137
10087	NC_017269	GCA	2	6	677047	677052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423137
10088	NC_017269	GCT	2	6	677118	677123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423137
10089	NC_017269	GAT	2	6	677136	677141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423137
10090	NC_017269	CCG	2	6	677300	677305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423137
10091	NC_017269	GTTG	2	8	677414	677421	0 %	50 %	50 %	0 %	384423137
10092	NC_017269	GCT	2	6	677453	677458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423137
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10099	NC_017269	CGC	3	9	677894	677902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423137
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10101	NC_017269	CAT	2	6	677996	678001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
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10106	NC_017269	CTT	2	6	678425	678430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423137
10107	NC_017269	TCGG	2	8	678541	678548	0 %	25 %	50 %	25 %	384423137
10108	NC_017269	CTG	3	9	678634	678642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423137
10109	NC_017269	GA	3	6	678659	678664	50 %	0 %	50 %	0 %	384423137
10110	NC_017269	TCA	2	6	678697	678702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423137
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10116	NC_017269	TCG	2	6	678919	678924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423137
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10120	NC_017269	GCT	2	6	679131	679136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423137
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10122	NC_017269	TTA	2	6	679210	679215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423137
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10227	NC_017269	TCC	2	6	685918	685923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384423138
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10230	NC_017269	GCA	2	6	686103	686108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423138
10231	NC_017269	ACTG	2	8	686172	686179	25 %	25 %	25 %	25 %	384423138
10232	NC_017269	TCA	2	6	686185	686190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423138
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10235	NC_017269	A	7	7	686284	686290	100 %	0 %	0 %	0 %	384423138
10236	NC_017269	GAT	2	6	686396	686401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423138
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10240	NC_017269	CAGA	2	8	686762	686769	50 %	0 %	25 %	25 %	384423139
10241	NC_017269	TCT	2	6	686836	686841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423139
10242	NC_017269	TCA	2	6	686860	686865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423139
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10344	NC_017269	AACT	2	8	692148	692155	50 %	25 %	0 %	25 %	384423144
10345	NC_017269	TCA	2	6	692158	692163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423144
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10349	NC_017269	CTCG	2	8	692696	692703	0 %	25 %	25 %	50 %	384423146
10350	NC_017269	ACG	2	6	692745	692750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423146
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10352	NC_017269	GCA	2	6	693002	693007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423146
10353	NC_017269	TTTAC	2	10	693049	693058	20 %	60 %	0 %	20 %	384423146
10354	NC_017269	TCA	2	6	693094	693099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423146
10355	NC_017269	TCA	2	6	693104	693109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423146
10356	NC_017269	GATA	2	8	693185	693192	50 %	25 %	25 %	0 %	384423146
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10358	NC_017269	GCT	2	6	693413	693418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423146
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