MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 14202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017269	GTC	2	6	33890	33895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422560
502	NC_017269	A	6	6	34139	34144	100 %	0 %	0 %	0 %	384422560
503	NC_017269	CGT	2	6	34147	34152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422560
504	NC_017269	TGA	2	6	34214	34219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422560
505	NC_017269	CAA	2	6	34278	34283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422560
506	NC_017269	CCA	2	6	34327	34332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422560
507	NC_017269	GCTTA	2	10	34350	34359	20 %	40 %	20 %	20 %	384422561
508	NC_017269	GT	3	6	34423	34428	0 %	50 %	50 %	0 %	384422561
509	NC_017269	AGTTTG	2	12	34457	34468	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384422561
510	NC_017269	GCA	2	6	34470	34475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422561
511	NC_017269	CAG	2	6	34507	34512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422561
512	NC_017269	CAA	2	6	34579	34584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422561
513	NC_017269	AATC	2	8	34591	34598	50 %	25 %	0 %	25 %	384422561
514	NC_017269	AAGCT	2	10	34787	34796	40 %	20 %	20 %	20 %	384422561
515	NC_017269	GTCA	2	8	34873	34880	25 %	25 %	25 %	25 %	384422561
516	NC_017269	T	6	6	34893	34898	0 %	100 %	0 %	0 %	384422561
517	NC_017269	ACTCA	2	10	34906	34915	40 %	20 %	0 %	40 %	384422561
518	NC_017269	CTT	2	6	34976	34981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422561
519	NC_017269	GTTG	2	8	35085	35092	0 %	50 %	50 %	0 %	384422561
520	NC_017269	TGA	2	6	35147	35152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422561
521	NC_017269	TGCA	2	8	35171	35178	25 %	25 %	25 %	25 %	384422561
522	NC_017269	GCGGA	2	10	35345	35354	20 %	0 %	60 %	20 %	384422562
523	NC_017269	CAA	2	6	35419	35424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422562
524	NC_017269	GTT	2	6	35442	35447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422562
525	NC_017269	CTG	2	6	35461	35466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422562
526	NC_017269	TGCAC	2	10	35477	35486	20 %	20 %	20 %	40 %	384422562
527	NC_017269	TGGT	2	8	35489	35496	0 %	50 %	50 %	0 %	384422562
528	NC_017269	CGC	2	6	35557	35562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422562
529	NC_017269	CGC	2	6	35575	35580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422562
530	NC_017269	CT	3	6	35588	35593	0 %	50 %	0 %	50 %	384422562
531	NC_017269	GAGTT	2	10	35629	35638	20 %	40 %	40 %	0 %	384422562
532	NC_017269	T	6	6	35673	35678	0 %	100 %	0 %	0 %	384422562
533	NC_017269	ACG	2	6	35705	35710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422562
534	NC_017269	GGC	2	6	35740	35745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422562
535	NC_017269	GGC	2	6	35752	35757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422562
536	NC_017269	GGTT	2	8	35772	35779	0 %	50 %	50 %	0 %	384422562
537	NC_017269	GTT	2	6	35883	35888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422562
538	NC_017269	GAGCT	2	10	35911	35920	20 %	20 %	40 %	20 %	384422562
539	NC_017269	CTG	2	6	35933	35938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422562
540	NC_017269	GGC	2	6	35965	35970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422562
541	NC_017269	CT	3	6	35978	35983	0 %	50 %	0 %	50 %	384422562
542	NC_017269	TGA	2	6	36011	36016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422562
543	NC_017269	TATG	2	8	36054	36061	25 %	50 %	25 %	0 %	384422562
544	NC_017269	TTG	2	6	36082	36087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422562
545	NC_017269	TCA	2	6	36170	36175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422562
546	NC_017269	TTG	2	6	36391	36396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422562
547	NC_017269	GGT	2	6	36524	36529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422562
548	NC_017269	TGG	2	6	36552	36557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422562
549	NC_017269	TTA	2	6	36683	36688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422562
550	NC_017269	AACG	2	8	36690	36697	50 %	0 %	25 %	25 %	384422562
551	NC_017269	ACA	2	6	36804	36809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422562
552	NC_017269	TG	3	6	37065	37070	0 %	50 %	50 %	0 %	384422563
553	NC_017269	TCA	2	6	37143	37148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422563
554	NC_017269	TAT	2	6	37198	37203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422563
555	NC_017269	TG	3	6	37359	37364	0 %	50 %	50 %	0 %	384422563
556	NC_017269	TGAG	2	8	37452	37459	25 %	25 %	50 %	0 %	384422563
557	NC_017269	TGA	2	6	37946	37951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422564
558	NC_017269	AGA	2	6	38126	38131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422564
559	NC_017269	CCACT	2	10	38161	38170	20 %	20 %	0 %	60 %	384422564
560	NC_017269	GCAA	2	8	38224	38231	50 %	0 %	25 %	25 %	384422564
561	NC_017269	ATA	2	6	38263	38268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422564
562	NC_017269	CAA	2	6	38321	38326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422564
563	NC_017269	ATC	2	6	38356	38361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422564
564	NC_017269	CGG	2	6	38377	38382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422564
565	NC_017269	ACGT	2	8	38386	38393	25 %	25 %	25 %	25 %	384422564
566	NC_017269	TTG	2	6	38422	38427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422564
567	NC_017269	TCG	2	6	38480	38485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422564
568	NC_017269	ATG	3	9	38505	38513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422564
569	NC_017269	CTG	2	6	38521	38526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422564
570	NC_017269	CTG	2	6	38538	38543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422564
571	NC_017269	GAA	2	6	38637	38642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422564
572	NC_017269	GAT	2	6	38649	38654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422564
573	NC_017269	AAG	2	6	38671	38676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422564
574	NC_017269	TGC	2	6	38711	38716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422564
575	NC_017269	GGTTG	2	10	38796	38805	0 %	40 %	60 %	0 %	384422564
576	NC_017269	TAA	2	6	38894	38899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422564
577	NC_017269	TGG	2	6	38911	38916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422564
578	NC_017269	TGA	3	9	38927	38935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422564
579	NC_017269	CTG	2	6	39009	39014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422564
580	NC_017269	TGGA	2	8	39081	39088	25 %	25 %	50 %	0 %	384422564
581	NC_017269	TCG	2	6	39161	39166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422564
582	NC_017269	GCG	2	6	39168	39173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422564
583	NC_017269	CAA	3	9	39257	39265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422564
584	NC_017269	AAG	2	6	39277	39282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422564
585	NC_017269	TGG	2	6	39293	39298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422564
586	NC_017269	GAA	2	6	39314	39319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422564
587	NC_017269	TCGT	2	8	39334	39341	0 %	50 %	25 %	25 %	384422564
588	NC_017269	ACT	2	6	39535	39540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422564
589	NC_017269	TG	3	6	39583	39588	0 %	50 %	50 %	0 %	384422564
590	NC_017269	AGGTG	2	10	39602	39611	20 %	20 %	60 %	0 %	384422564
591	NC_017269	CTT	2	6	39617	39622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422564
592	NC_017269	TGTT	2	8	39682	39689	0 %	75 %	25 %	0 %	384422564
593	NC_017269	GCT	2	6	39714	39719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422564
594	NC_017269	GGT	2	6	39738	39743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422564
595	NC_017269	CAT	2	6	39764	39769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422564
596	NC_017269	GAT	2	6	39770	39775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422564
597	NC_017269	CGG	2	6	39788	39793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422564
598	NC_017269	T	7	7	39864	39870	0 %	100 %	0 %	0 %	384422565
599	NC_017269	GCC	2	6	39873	39878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422565
600	NC_017269	ATC	2	6	39879	39884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422565
601	NC_017269	TG	3	6	39885	39890	0 %	50 %	50 %	0 %	384422565
602	NC_017269	TGG	2	6	39925	39930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422565
603	NC_017269	GCA	2	6	39939	39944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422565
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605	NC_017269	CTT	2	6	40189	40194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422565
606	NC_017269	GCA	2	6	40291	40296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422565
607	NC_017269	CAA	3	9	40441	40449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422565
608	NC_017269	GAT	2	6	40478	40483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422565
609	NC_017269	ACC	2	6	40514	40519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422565
610	NC_017269	T	7	7	40579	40585	0 %	100 %	0 %	0 %	384422565
611	NC_017269	GCTGA	2	10	40586	40595	20 %	20 %	40 %	20 %	384422565
612	NC_017269	CAT	2	6	40940	40945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422566
613	NC_017269	CTG	2	6	40971	40976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422566
614	NC_017269	TGT	2	6	41008	41013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422566
615	NC_017269	TGGGT	2	10	41130	41139	0 %	40 %	60 %	0 %	384422566
616	NC_017269	TCA	2	6	41159	41164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422566
617	NC_017269	CTTGG	2	10	41199	41208	0 %	40 %	40 %	20 %	384422566
618	NC_017269	ACTGA	2	10	41262	41271	40 %	20 %	20 %	20 %	384422566
619	NC_017269	CTG	2	6	41286	41291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422566
620	NC_017269	CAAG	2	8	41327	41334	50 %	0 %	25 %	25 %	384422566
621	NC_017269	TTTC	2	8	41407	41414	0 %	75 %	0 %	25 %	384422566
622	NC_017269	TTA	2	6	41466	41471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422566
623	NC_017269	A	7	7	41476	41482	100 %	0 %	0 %	0 %	384422566
624	NC_017269	GCT	2	6	41504	41509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422566
625	NC_017269	TTG	2	6	41586	41591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422566
626	NC_017269	GCA	2	6	41618	41623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422566
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628	NC_017269	A	6	6	41680	41685	100 %	0 %	0 %	0 %	384422566
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