MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 14202

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017269	GTG	2	6	407825	407830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422896
6002	NC_017269	ATT	2	6	407842	407847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422896
6003	NC_017269	TGG	3	9	407853	407861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422896
6004	NC_017269	ATT	2	6	407886	407891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422896
6005	NC_017269	CA	3	6	407969	407974	50 %	0 %	0 %	50 %	384422896
6006	NC_017269	ATC	2	6	408005	408010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422896
6007	NC_017269	TTG	2	6	408037	408042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422896
6008	NC_017269	CTGGT	2	10	408177	408186	0 %	40 %	40 %	20 %	384422896
6009	NC_017269	CGA	2	6	408292	408297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422896
6010	NC_017269	TCA	2	6	408420	408425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422896
6011	NC_017269	AACTC	2	10	408645	408654	40 %	20 %	0 %	40 %	384422896
6012	NC_017269	TTA	2	6	408682	408687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422896
6013	NC_017269	CTGG	2	8	408706	408713	0 %	25 %	50 %	25 %	384422896
6014	NC_017269	GAA	2	6	408718	408723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422896
6015	NC_017269	TTA	2	6	408769	408774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422896
6016	NC_017269	TGCCGC	2	12	408810	408821	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384422896
6017	NC_017269	C	6	6	408825	408830	0 %	0 %	0 %	100 %	384422896
6018	NC_017269	GC	3	6	408847	408852	0 %	0 %	50 %	50 %	384422896
6019	NC_017269	TATTGA	2	12	408912	408923	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384422896
6020	NC_017269	GTT	2	6	408961	408966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422896
6021	NC_017269	ATCC	2	8	408994	409001	25 %	25 %	0 %	50 %	384422896
6022	NC_017269	GCC	2	6	409079	409084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422896
6023	NC_017269	AGA	2	6	409113	409118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422896
6024	NC_017269	GCC	2	6	409189	409194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422896
6025	NC_017269	GA	3	6	409301	409306	50 %	0 %	50 %	0 %	384422896
6026	NC_017269	GTG	2	6	409325	409330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422896
6027	NC_017269	ATT	2	6	409348	409353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422896
6028	NC_017269	TTAA	2	8	409369	409376	50 %	50 %	0 %	0 %	384422896
6029	NC_017269	ATT	2	6	409462	409467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422896
6030	NC_017269	ATT	2	6	409469	409474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422896
6031	NC_017269	GCA	2	6	409491	409496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422896
6032	NC_017269	GCC	2	6	409515	409520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422896
6033	NC_017269	TTC	2	6	409596	409601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422897
6034	NC_017269	GCTG	2	8	409842	409849	0 %	25 %	50 %	25 %	384422897
6035	NC_017269	GGCAAT	2	12	409865	409876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384422897
6036	NC_017269	ACG	2	6	409919	409924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422897
6037	NC_017269	GT	3	6	409934	409939	0 %	50 %	50 %	0 %	384422897
6038	NC_017269	CAA	2	6	410024	410029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422897
6039	NC_017269	TGC	2	6	410141	410146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422897
6040	NC_017269	CAT	2	6	410209	410214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422897
6041	NC_017269	ATC	2	6	410313	410318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422897
6042	NC_017269	AAATCC	2	12	410319	410330	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384422897
6043	NC_017269	CT	3	6	410713	410718	0 %	50 %	0 %	50 %	384422898
6044	NC_017269	GAT	2	6	410758	410763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422898
6045	NC_017269	AGT	3	9	410781	410789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422898
6046	NC_017269	GCA	2	6	410827	410832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422898
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6049	NC_017269	CAACC	2	10	411010	411019	40 %	0 %	0 %	60 %	384422898
6050	NC_017269	CAT	2	6	411110	411115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422898
6051	NC_017269	TTG	2	6	411146	411151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422898
6052	NC_017269	ATT	2	6	411218	411223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422898
6053	NC_017269	TCA	2	6	411226	411231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422898
6054	NC_017269	TGA	2	6	411408	411413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422898
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6056	NC_017269	AGA	2	6	411507	411512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422898
6057	NC_017269	CAAAT	2	10	411537	411546	60 %	20 %	0 %	20 %	384422898
6058	NC_017269	A	6	6	411559	411564	100 %	0 %	0 %	0 %	384422898
6059	NC_017269	ATT	2	6	411566	411571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422898
6060	NC_017269	ATA	2	6	411581	411586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422898
6061	NC_017269	AAC	2	6	411631	411636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422898
6062	NC_017269	T	6	6	411679	411684	0 %	100 %	0 %	0 %	384422898
6063	NC_017269	ATG	2	6	411788	411793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422898
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6065	NC_017269	GTAA	2	8	411949	411956	50 %	25 %	25 %	0 %	384422898
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6067	NC_017269	CAAT	2	8	412045	412052	50 %	25 %	0 %	25 %	384422898
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6070	NC_017269	AAT	2	6	412243	412248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422898
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6073	NC_017269	ACCA	2	8	412313	412320	50 %	0 %	0 %	50 %	384422898
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6081	NC_017269	GCATT	2	10	412897	412906	20 %	40 %	20 %	20 %	384422899
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6087	NC_017269	ACC	2	6	413117	413122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422899
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6094	NC_017269	GC	3	6	413469	413474	0 %	0 %	50 %	50 %	384422899
6095	NC_017269	CGA	2	6	413503	413508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422899
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6103	NC_017269	AGTG	2	8	413999	414006	25 %	25 %	50 %	0 %	384422899
6104	NC_017269	TGCC	2	8	414015	414022	0 %	25 %	25 %	50 %	384422899
6105	NC_017269	CTT	2	6	414053	414058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422899
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6109	NC_017269	TGC	2	6	414231	414236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422899
6110	NC_017269	CG	3	6	414315	414320	0 %	0 %	50 %	50 %	384422899
6111	NC_017269	CTT	3	9	414386	414394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422899
6112	NC_017269	A	6	6	414434	414439	100 %	0 %	0 %	0 %	384422899
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6117	NC_017269	GTC	2	6	414928	414933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422901
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6120	NC_017269	CCA	2	6	415134	415139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422901
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6245	NC_017269	GAT	2	6	422648	422653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422910
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6253	NC_017269	GAA	2	6	423148	423153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422911
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6368	NC_017269	CG	3	6	431530	431535	0 %	0 %	50 %	50 %	384422917
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6371	NC_017269	CA	3	6	431679	431684	50 %	0 %	0 %	50 %	384422917
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6481	NC_017269	TGA	2	6	438890	438895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422922
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6483	NC_017269	GCC	2	6	439008	439013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422922
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6485	NC_017269	A	6	6	439075	439080	100 %	0 %	0 %	0 %	384422922
6486	NC_017269	GCTGC	2	10	439090	439099	0 %	20 %	40 %	40 %	384422922
6487	NC_017269	AGC	2	6	439126	439131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422922
6488	NC_017269	TCAA	2	8	439183	439190	50 %	25 %	0 %	25 %	384422922
6489	NC_017269	GCA	3	9	439193	439201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422922
6490	NC_017269	ATG	2	6	439479	439484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422923
6491	NC_017269	TTG	2	6	439564	439569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422923
6492	NC_017269	CAAG	2	8	439577	439584	50 %	0 %	25 %	25 %	384422923
6493	NC_017269	CGC	2	6	439742	439747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422923
6494	NC_017269	GCA	2	6	439785	439790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422923
6495	NC_017269	CTCA	2	8	439798	439805	25 %	25 %	0 %	50 %	384422923
6496	NC_017269	CG	3	6	439831	439836	0 %	0 %	50 %	50 %	384422923
6497	NC_017269	GAT	2	6	439941	439946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422923
6498	NC_017269	TG	3	6	440025	440030	0 %	50 %	50 %	0 %	384422923
6499	NC_017269	GAT	2	6	440037	440042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422923
6500	NC_017269	CTG	2	6	440097	440102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422923

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