MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_016945	ATG	2	6	1014302	1014307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744443
16002	NC_016945	CG	3	6	1014334	1014339	0 %	0 %	50 %	50 %	379744443
16003	NC_016945	GTG	2	6	1014478	1014483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744443
16004	NC_016945	GTT	2	6	1014496	1014501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744443
16005	NC_016945	CAG	2	6	1014532	1014537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744443
16006	NC_016945	AC	3	6	1014544	1014549	50 %	0 %	0 %	50 %	379744443
16007	NC_016945	TTG	2	6	1014554	1014559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744443
16008	NC_016945	CAT	2	6	1014630	1014635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744443
16009	NC_016945	ACGT	2	8	1014670	1014677	25 %	25 %	25 %	25 %	379744443
16010	NC_016945	A	6	6	1014724	1014729	100 %	0 %	0 %	0 %	379744443
16011	NC_016945	GAA	2	6	1014754	1014759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744443
16012	NC_016945	ACC	2	6	1014763	1014768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744443
16013	NC_016945	GCAA	2	8	1014781	1014788	50 %	0 %	25 %	25 %	379744443
16014	NC_016945	T	6	6	1014814	1014819	0 %	100 %	0 %	0 %	379744443
16015	NC_016945	AAAG	2	8	1014829	1014836	75 %	0 %	25 %	0 %	379744443
16016	NC_016945	CAA	2	6	1014841	1014846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744443
16017	NC_016945	ACG	2	6	1014859	1014864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744443
16018	NC_016945	CA	3	6	1014909	1014914	50 %	0 %	0 %	50 %	379744443
16019	NC_016945	ATC	2	6	1014946	1014951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744443
16020	NC_016945	GCA	2	6	1014967	1014972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744443
16021	NC_016945	CA	3	6	1014971	1014976	50 %	0 %	0 %	50 %	379744443
16022	NC_016945	CAA	2	6	1014978	1014983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744443
16023	NC_016945	CATT	2	8	1015008	1015015	25 %	50 %	0 %	25 %	379744443
16024	NC_016945	ATG	2	6	1015022	1015027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744443
16025	NC_016945	ACC	2	6	1015052	1015057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744443
16026	NC_016945	CCA	2	6	1015095	1015100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744443
16027	NC_016945	AGATG	2	10	1015508	1015517	40 %	20 %	40 %	0 %	379744444
16028	NC_016945	AAAG	2	8	1015528	1015535	75 %	0 %	25 %	0 %	379744444
16029	NC_016945	AGT	2	6	1015536	1015541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744444
16030	NC_016945	AGT	2	6	1015545	1015550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744444
16031	NC_016945	CAT	2	6	1015564	1015569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744444
16032	NC_016945	TG	3	6	1015590	1015595	0 %	50 %	50 %	0 %	379744444
16033	NC_016945	A	7	7	1016156	1016162	100 %	0 %	0 %	0 %	379744445
16034	NC_016945	CAG	2	6	1016198	1016203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744445
16035	NC_016945	GCA	2	6	1016236	1016241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744445
16036	NC_016945	CCCTG	2	10	1016292	1016301	0 %	20 %	20 %	60 %	379744445
16037	NC_016945	GCC	2	6	1016312	1016317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744445
16038	NC_016945	CAT	2	6	1016326	1016331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744445
16039	NC_016945	CCG	2	6	1016332	1016337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744445
16040	NC_016945	CA	3	6	1016360	1016365	50 %	0 %	0 %	50 %	379744445
16041	NC_016945	CAC	3	9	1016368	1016376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744445
16042	NC_016945	CT	3	6	1016412	1016417	0 %	50 %	0 %	50 %	379744445
16043	NC_016945	TCA	2	6	1016422	1016427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744445
16044	NC_016945	TTGA	2	8	1016453	1016460	25 %	50 %	25 %	0 %	379744445
16045	NC_016945	CTT	2	6	1016473	1016478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744445
16046	NC_016945	TTG	2	6	1016525	1016530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744445
16047	NC_016945	TCA	2	6	1016544	1016549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744445
16048	NC_016945	GCA	2	6	1016572	1016577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744445
16049	NC_016945	CAT	2	6	1016644	1016649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744445
16050	NC_016945	GC	3	6	1016729	1016734	0 %	0 %	50 %	50 %	379744445
16051	NC_016945	GCA	2	6	1016782	1016787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744445
16052	NC_016945	TGG	2	6	1016824	1016829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744445
16053	NC_016945	ATG	2	6	1016841	1016846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744445
16054	NC_016945	CG	3	6	1016859	1016864	0 %	0 %	50 %	50 %	379744445
16055	NC_016945	C	6	6	1016901	1016906	0 %	0 %	0 %	100 %	379744445
16056	NC_016945	CGG	2	6	1016965	1016970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744445
16057	NC_016945	CAG	2	6	1016984	1016989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744445
16058	NC_016945	GCA	2	6	1017018	1017023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744445
16059	NC_016945	TGG	2	6	1017094	1017099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744445
16060	NC_016945	GT	3	6	1017103	1017108	0 %	50 %	50 %	0 %	379744445
16061	NC_016945	GCA	2	6	1017141	1017146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744445
16062	NC_016945	GTG	2	6	1017160	1017165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744445
16063	NC_016945	CAC	2	6	1017209	1017214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744445
16064	NC_016945	GCA	3	9	1017250	1017258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744445
16065	NC_016945	CGC	2	6	1017273	1017278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744445
16066	NC_016945	GAT	2	6	1017322	1017327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744445
16067	NC_016945	TTGA	2	8	1017386	1017393	25 %	50 %	25 %	0 %	379744445
16068	NC_016945	AG	3	6	1017575	1017580	50 %	0 %	50 %	0 %	379744445
16069	NC_016945	AG	3	6	1017942	1017947	50 %	0 %	50 %	0 %	379744446
16070	NC_016945	GCT	2	6	1018014	1018019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744446
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16076	NC_016945	CTG	2	6	1018643	1018648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744447
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16088	NC_016945	ACG	2	6	1019360	1019365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744447
16089	NC_016945	CAAG	2	8	1019470	1019477	50 %	0 %	25 %	25 %	379744447
16090	NC_016945	GCT	2	6	1019524	1019529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744447
16091	NC_016945	GGC	2	6	1019828	1019833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744447
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16095	NC_016945	GTA	2	6	1020035	1020040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744447
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16097	NC_016945	CTAACT	2	12	1020088	1020099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744447
16098	NC_016945	TTC	2	6	1020116	1020121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744447
16099	NC_016945	GCT	2	6	1020142	1020147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744447
16100	NC_016945	ACTTTC	2	12	1020200	1020211	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379744447
16101	NC_016945	CGCC	2	8	1020215	1020222	0 %	0 %	25 %	75 %	379744447
16102	NC_016945	GCG	2	6	1020252	1020257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744447
16103	NC_016945	CGC	3	9	1020263	1020271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744447
16104	NC_016945	CGCT	2	8	1020721	1020728	0 %	25 %	25 %	50 %	379744448
16105	NC_016945	CTG	2	6	1020733	1020738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744448
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16107	NC_016945	TTG	2	6	1020811	1020816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744448
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16109	NC_016945	TG	3	6	1020867	1020872	0 %	50 %	50 %	0 %	379744448
16110	NC_016945	GT	3	6	1020875	1020880	0 %	50 %	50 %	0 %	379744448
16111	NC_016945	TCAA	2	8	1021106	1021113	50 %	25 %	0 %	25 %	379744449
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16468	NC_016945	AG	3	6	1041879	1041884	50 %	0 %	50 %	0 %	379744462
16469	NC_016945	ATC	2	6	1041885	1041890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744462
16470	NC_016945	T	6	6	1041912	1041917	0 %	100 %	0 %	0 %	379744462
16471	NC_016945	CAT	2	6	1041923	1041928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744462
16472	NC_016945	GTTC	2	8	1042007	1042014	0 %	50 %	25 %	25 %	379744462
16473	NC_016945	TGC	2	6	1042075	1042080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744462
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16478	NC_016945	AG	3	6	1042279	1042284	50 %	0 %	50 %	0 %	379744462
16479	NC_016945	TC	3	6	1042304	1042309	0 %	50 %	0 %	50 %	379744462
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16500	NC_016945	CTT	2	6	1043617	1043622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744464

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