MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016945	TCC	2	6	639184	639189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379744114
10002	NC_016945	TTG	2	6	639209	639214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744114
10003	NC_016945	GATT	2	8	639231	639238	25 %	50 %	25 %	0 %	379744114
10004	NC_016945	CAG	2	6	639297	639302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744114
10005	NC_016945	TCT	2	6	639582	639587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744114
10006	NC_016945	GTG	2	6	639656	639661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744114
10007	NC_016945	TTC	2	6	639716	639721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744114
10008	NC_016945	TGT	2	6	639786	639791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744114
10009	NC_016945	GTT	2	6	639817	639822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744114
10010	NC_016945	CAC	2	6	639897	639902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744114
10011	NC_016945	AGT	2	6	639978	639983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744114
10012	NC_016945	ACC	2	6	640015	640020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744114
10013	NC_016945	GCG	2	6	640085	640090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744114
10014	NC_016945	TAA	2	6	640189	640194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744114
10015	NC_016945	AGA	2	6	640201	640206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744114
10016	NC_016945	AAG	2	6	640296	640301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744114
10017	NC_016945	ACG	2	6	640315	640320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744114
10018	NC_016945	ATC	2	6	640339	640344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744114
10019	NC_016945	ATC	2	6	640418	640423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744114
10020	NC_016945	TGG	2	6	640482	640487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744114
10021	NC_016945	CCA	2	6	640502	640507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744114
10022	NC_016945	CCG	2	6	640541	640546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744114
10023	NC_016945	CCG	2	6	640559	640564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744114
10024	NC_016945	TTTG	2	8	640593	640600	0 %	75 %	25 %	0 %	379744114
10025	NC_016945	TG	3	6	640755	640760	0 %	50 %	50 %	0 %	379744114
10026	NC_016945	ATC	2	6	640807	640812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744114
10027	NC_016945	GAT	2	6	640854	640859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744114
10028	NC_016945	CAC	2	6	640975	640980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744114
10029	NC_016945	CG	3	6	641030	641035	0 %	0 %	50 %	50 %	379744114
10030	NC_016945	CAC	2	6	641112	641117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744114
10031	NC_016945	CCG	2	6	641157	641162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744114
10032	NC_016945	AG	4	8	641209	641216	50 %	0 %	50 %	0 %	379744114
10033	NC_016945	TCAC	2	8	641255	641262	25 %	25 %	0 %	50 %	379744114
10034	NC_016945	ATC	2	6	641302	641307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744114
10035	NC_016945	ACCA	2	8	641383	641390	50 %	0 %	0 %	50 %	379744114
10036	NC_016945	CG	3	6	641417	641422	0 %	0 %	50 %	50 %	379744114
10037	NC_016945	TGC	2	6	641449	641454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744114
10038	NC_016945	GCGGT	2	10	641496	641505	0 %	20 %	60 %	20 %	379744114
10039	NC_016945	C	7	7	641533	641539	0 %	0 %	0 %	100 %	379744114
10040	NC_016945	TGC	2	6	641544	641549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744114
10041	NC_016945	GTT	2	6	641602	641607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744114
10042	NC_016945	AGT	2	6	641616	641621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744114
10043	NC_016945	TGC	2	6	641645	641650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744114
10044	NC_016945	CAC	2	6	641658	641663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744114
10045	NC_016945	GCA	2	6	641714	641719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744114
10046	NC_016945	GCT	2	6	641722	641727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744114
10047	NC_016945	TTG	2	6	641805	641810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744114
10048	NC_016945	CAACC	2	10	642494	642503	40 %	0 %	0 %	60 %	379744115
10049	NC_016945	TGG	3	9	642581	642589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744115
10050	NC_016945	CCAA	2	8	642678	642685	50 %	0 %	0 %	50 %	379744115
10051	NC_016945	CGG	2	6	642749	642754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744115
10052	NC_016945	GCC	2	6	642786	642791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744115
10053	NC_016945	GCA	2	6	642792	642797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744115
10054	NC_016945	AC	3	6	642836	642841	50 %	0 %	0 %	50 %	379744115
10055	NC_016945	TCA	2	6	642916	642921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744115
10056	NC_016945	TC	4	8	642953	642960	0 %	50 %	0 %	50 %	379744115
10057	NC_016945	CCG	2	6	642961	642966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744115
10058	NC_016945	TGATG	2	10	642995	643004	20 %	40 %	40 %	0 %	379744115
10059	NC_016945	TG	4	8	643058	643065	0 %	50 %	50 %	0 %	379744115
10060	NC_016945	AAG	2	6	643102	643107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744115
10061	NC_016945	TGC	2	6	643120	643125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744115
10062	NC_016945	CCAA	2	8	643204	643211	50 %	0 %	0 %	50 %	379744115
10063	NC_016945	GCT	2	6	643334	643339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744115
10064	NC_016945	A	6	6	643359	643364	100 %	0 %	0 %	0 %	379744115
10065	NC_016945	GAT	2	6	643413	643418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744115
10066	NC_016945	A	6	6	643426	643431	100 %	0 %	0 %	0 %	379744115
10067	NC_016945	ACC	2	6	643456	643461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744115
10068	NC_016945	GCA	2	6	643529	643534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744115
10069	NC_016945	TGC	2	6	643705	643710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744116
10070	NC_016945	T	6	6	643712	643717	0 %	100 %	0 %	0 %	379744116
10071	NC_016945	ATT	2	6	643788	643793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379744116
10072	NC_016945	TGT	2	6	643802	643807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744116
10073	NC_016945	TC	3	6	643850	643855	0 %	50 %	0 %	50 %	379744116
10074	NC_016945	CTG	2	6	643872	643877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744116
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10079	NC_016945	TGG	2	6	644076	644081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744116
10080	NC_016945	T	6	6	644117	644122	0 %	100 %	0 %	0 %	379744116
10081	NC_016945	AAC	2	6	644226	644231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744116
10082	NC_016945	GCG	2	6	644259	644264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744116
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10085	NC_016945	GTAG	2	8	644467	644474	25 %	25 %	50 %	0 %	379744117
10086	NC_016945	AAACAG	2	12	644501	644512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379744117
10087	NC_016945	CCA	2	6	644545	644550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744117
10088	NC_016945	TCT	2	6	644574	644579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744117
10089	NC_016945	TGG	2	6	644673	644678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744117
10090	NC_016945	GC	3	6	644679	644684	0 %	0 %	50 %	50 %	379744117
10091	NC_016945	AGC	2	6	644737	644742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744117
10092	NC_016945	AGT	2	6	644755	644760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744117
10093	NC_016945	CAA	2	6	644795	644800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744117
10094	NC_016945	TTGA	2	8	644819	644826	25 %	50 %	25 %	0 %	379744117
10095	NC_016945	ATCA	2	8	644885	644892	50 %	25 %	0 %	25 %	379744117
10096	NC_016945	TCAA	2	8	644991	644998	50 %	25 %	0 %	25 %	379744117
10097	NC_016945	CT	3	6	645015	645020	0 %	50 %	0 %	50 %	379744117
10098	NC_016945	TGG	2	6	645097	645102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744117
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10101	NC_016945	CAG	2	6	645176	645181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744117
10102	NC_016945	CAG	2	6	645263	645268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744117
10103	NC_016945	GGA	2	6	645330	645335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379744117
10104	NC_016945	GTC	2	6	645434	645439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744117
10105	NC_016945	CCATG	2	10	645466	645475	20 %	20 %	20 %	40 %	379744117
10106	NC_016945	CAG	2	6	645497	645502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744117
10107	NC_016945	ACG	2	6	645504	645509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744117
10108	NC_016945	GATC	2	8	645550	645557	25 %	25 %	25 %	25 %	379744117
10109	NC_016945	GTAG	2	8	645595	645602	25 %	25 %	50 %	0 %	379744117
10110	NC_016945	TCA	2	6	645624	645629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744117
10111	NC_016945	CAG	2	6	645632	645637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744117
10112	NC_016945	TGG	3	9	645776	645784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744118
10113	NC_016945	AAT	2	6	645796	645801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744118
10114	NC_016945	ATCA	2	8	645837	645844	50 %	25 %	0 %	25 %	379744118
10115	NC_016945	GTT	2	6	645910	645915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379744118
10116	NC_016945	GATT	2	8	645941	645948	25 %	50 %	25 %	0 %	379744118
10117	NC_016945	ATC	2	6	645990	645995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744118
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10120	NC_016945	GCT	2	6	646104	646109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744118
10121	NC_016945	CCT	2	6	646211	646216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379744118
10122	NC_016945	CGC	2	6	646320	646325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744118
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10125	NC_016945	GGTC	2	8	646472	646479	0 %	25 %	50 %	25 %	379744118
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10235	NC_016945	CAG	2	6	652797	652802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744122
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10238	NC_016945	TGC	2	6	653043	653048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744122
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10240	NC_016945	CAT	2	6	653085	653090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744122
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10352	NC_016945	GA	5	10	659863	659872	50 %	0 %	50 %	0 %	379744129
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10482	NC_016945	CAC	2	6	667864	667869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379744136
10483	NC_016945	T	7	7	667917	667923	0 %	100 %	0 %	0 %	379744136
10484	NC_016945	CGGT	2	8	667986	667993	0 %	25 %	50 %	25 %	379744136
10485	NC_016945	CAT	2	6	668013	668018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744136
10486	NC_016945	CG	3	6	668020	668025	0 %	0 %	50 %	50 %	379744136
10487	NC_016945	ACGC	2	8	668035	668042	25 %	0 %	25 %	50 %	379744136
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10489	NC_016945	TGC	2	6	668066	668071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744136
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10491	NC_016945	TCC	2	6	668087	668092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379744136
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