MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_016945	CAGT	2	8	548682	548689	25 %	25 %	25 %	25 %	379744036
8502	NC_016945	AAG	2	6	548694	548699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744036
8503	NC_016945	CTC	2	6	548785	548790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379744036
8504	NC_016945	CAAAGC	2	12	548887	548898	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379744036
8505	NC_016945	TGCC	2	8	549087	549094	0 %	25 %	25 %	50 %	379744036
8506	NC_016945	GAA	2	6	549131	549136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744036
8507	NC_016945	AAC	2	6	549141	549146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379744036
8508	NC_016945	GCT	2	6	549229	549234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744036
8509	NC_016945	GC	3	6	549477	549482	0 %	0 %	50 %	50 %	379744036
8510	NC_016945	TG	3	6	549549	549554	0 %	50 %	50 %	0 %	379744036
8511	NC_016945	TGA	2	6	549561	549566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744036
8512	NC_016945	CCTT	2	8	549590	549597	0 %	50 %	0 %	50 %	379744036
8513	NC_016945	TCG	2	6	549630	549635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744036
8514	NC_016945	ACCAA	2	10	549900	549909	60 %	0 %	0 %	40 %	379744037
8515	NC_016945	TGG	2	6	549956	549961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744037
8516	NC_016945	CTT	2	6	550151	550156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744037
8517	NC_016945	ATG	2	6	550269	550274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744037
8518	NC_016945	TTGA	2	8	550320	550327	25 %	50 %	25 %	0 %	379744037
8519	NC_016945	CAG	2	6	550345	550350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744037
8520	NC_016945	ACT	2	6	550366	550371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744037
8521	NC_016945	AAG	2	6	550374	550379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744037
8522	NC_016945	ACT	2	6	550396	550401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744037
8523	NC_016945	TGA	2	6	550490	550495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744037
8524	NC_016945	AGA	2	6	550637	550642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379744037
8525	NC_016945	CTCTT	2	10	550677	550686	0 %	60 %	0 %	40 %	379744037
8526	NC_016945	CCG	2	6	550882	550887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744037
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8528	NC_016945	C	7	7	551105	551111	0 %	0 %	0 %	100 %	379744038
8529	NC_016945	CATC	2	8	551140	551147	25 %	25 %	0 %	50 %	379744038
8530	NC_016945	CGC	2	6	551149	551154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379744038
8531	NC_016945	CAT	2	6	551197	551202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744038
8532	NC_016945	CTG	2	6	551237	551242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744038
8533	NC_016945	A	6	6	551276	551281	100 %	0 %	0 %	0 %	379744038
8534	NC_016945	GAT	2	6	551312	551317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744038
8535	NC_016945	CG	3	6	551323	551328	0 %	0 %	50 %	50 %	379744038
8536	NC_016945	GTG	2	6	551369	551374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744038
8537	NC_016945	TCAC	2	8	551418	551425	25 %	25 %	0 %	50 %	379744038
8538	NC_016945	TTC	2	6	551525	551530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379744038
8539	NC_016945	AGTCC	2	10	551548	551557	20 %	20 %	20 %	40 %	379744038
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8541	NC_016945	CTG	2	6	551608	551613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744038
8542	NC_016945	GATG	2	8	552032	552039	25 %	25 %	50 %	0 %	379744039
8543	NC_016945	CCGT	2	8	552046	552053	0 %	25 %	25 %	50 %	379744039
8544	NC_016945	GCA	2	6	552068	552073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744039
8545	NC_016945	CAG	2	6	552121	552126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379744039
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8547	NC_016945	TGCG	2	8	552144	552151	0 %	25 %	50 %	25 %	379744039
8548	NC_016945	GTG	2	6	552231	552236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744039
8549	NC_016945	TGA	2	6	552284	552289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744039
8550	NC_016945	GC	3	6	552324	552329	0 %	0 %	50 %	50 %	379744039
8551	NC_016945	GAT	2	6	552350	552355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744039
8552	NC_016945	TGG	2	6	552601	552606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744039
8553	NC_016945	A	6	6	552882	552887	100 %	0 %	0 %	0 %	379744039
8554	NC_016945	GGAC	2	8	552894	552901	25 %	0 %	50 %	25 %	379744039
8555	NC_016945	GTG	2	6	552945	552950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744039
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8557	NC_016945	TGG	2	6	553098	553103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744040
8558	NC_016945	TGC	2	6	553125	553130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379744040
8559	NC_016945	GGT	2	6	553217	553222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744040
8560	NC_016945	CACAT	2	10	553268	553277	40 %	20 %	0 %	40 %	379744040
8561	NC_016945	TGA	3	9	553282	553290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744040
8562	NC_016945	CT	3	6	553301	553306	0 %	50 %	0 %	50 %	379744040
8563	NC_016945	ATG	2	6	553332	553337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379744040
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8565	NC_016945	CGG	2	6	553365	553370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744040
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8569	NC_016945	ATT	2	6	553697	553702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379744040
8570	NC_016945	ACTG	2	8	553735	553742	25 %	25 %	25 %	25 %	379744040
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8591	NC_016945	TG	4	8	555181	555188	0 %	50 %	50 %	0 %	379744042
8592	NC_016945	CT	3	6	555200	555205	0 %	50 %	0 %	50 %	379744042
8593	NC_016945	TCAT	2	8	555546	555553	25 %	50 %	0 %	25 %	379744043
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8612	NC_016945	ATA	2	6	556274	556279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379744043
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8990	NC_016945	CGG	3	9	578456	578464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379744065
8991	NC_016945	ATC	2	6	578497	578502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379744065
8992	NC_016945	GGT	2	6	578560	578565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379744065
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