MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome II

Total Repeats: 17009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_016945	GAA	2	6	304068	304073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743713
5002	NC_016945	ATG	2	6	304677	304682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743714
5003	NC_016945	CAA	2	6	304692	304697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743714
5004	NC_016945	GGT	2	6	304862	304867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743714
5005	NC_016945	TGG	2	6	304879	304884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743714
5006	NC_016945	TCA	2	6	304901	304906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743714
5007	NC_016945	TGA	2	6	305035	305040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743714
5008	NC_016945	TGA	2	6	305055	305060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743714
5009	NC_016945	A	6	6	305111	305116	100 %	0 %	0 %	0 %	379743714
5010	NC_016945	CAAA	2	8	305130	305137	75 %	0 %	0 %	25 %	379743714
5011	NC_016945	A	6	6	305140	305145	100 %	0 %	0 %	0 %	379743714
5012	NC_016945	TGAC	2	8	305168	305175	25 %	25 %	25 %	25 %	379743715
5013	NC_016945	ATC	2	6	305181	305186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743715
5014	NC_016945	TTTC	2	8	305221	305228	0 %	75 %	0 %	25 %	379743715
5015	NC_016945	T	6	6	305241	305246	0 %	100 %	0 %	0 %	379743715
5016	NC_016945	GTA	2	6	305254	305259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743715
5017	NC_016945	TAAAAA	2	12	305315	305326	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379743715
5018	NC_016945	TAT	2	6	305401	305406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743715
5019	NC_016945	AAG	2	6	305528	305533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743715
5020	NC_016945	AGG	2	6	305552	305557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379743715
5021	NC_016945	TAA	2	6	305634	305639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743715
5022	NC_016945	CCT	2	6	305737	305742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379743715
5023	NC_016945	GTT	2	6	305743	305748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743715
5024	NC_016945	CAA	2	6	305814	305819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743715
5025	NC_016945	A	7	7	305843	305849	100 %	0 %	0 %	0 %	379743716
5026	NC_016945	ATT	2	6	305951	305956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743716
5027	NC_016945	CTAT	2	8	306021	306028	25 %	50 %	0 %	25 %	379743716
5028	NC_016945	ATA	2	6	306057	306062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743716
5029	NC_016945	AC	3	6	306096	306101	50 %	0 %	0 %	50 %	379743716
5030	NC_016945	GCTA	2	8	306128	306135	25 %	25 %	25 %	25 %	379743716
5031	NC_016945	GAA	2	6	306143	306148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743716
5032	NC_016945	TAT	2	6	306464	306469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379743717
5033	NC_016945	ATC	2	6	306633	306638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743717
5034	NC_016945	CTTG	2	8	306692	306699	0 %	50 %	25 %	25 %	379743717
5035	NC_016945	AGC	2	6	306712	306717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743717
5036	NC_016945	TAC	2	6	306768	306773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743717
5037	NC_016945	TC	5	10	306792	306801	0 %	50 %	0 %	50 %	379743717
5038	NC_016945	AAG	2	6	306802	306807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743717
5039	NC_016945	AAAG	2	8	306869	306876	75 %	0 %	25 %	0 %	379743717
5040	NC_016945	GC	3	6	306891	306896	0 %	0 %	50 %	50 %	379743717
5041	NC_016945	TGA	2	6	306941	306946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743717
5042	NC_016945	TGA	2	6	306959	306964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743717
5043	NC_016945	GAA	2	6	306987	306992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743717
5044	NC_016945	TGC	2	6	307102	307107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743717
5045	NC_016945	GAA	2	6	307170	307175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743717
5046	NC_016945	GCA	2	6	307229	307234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743717
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5048	NC_016945	TGGT	2	8	307268	307275	0 %	50 %	50 %	0 %	379743717
5049	NC_016945	AAG	2	6	307333	307338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743717
5050	NC_016945	TGA	2	6	307351	307356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743717
5051	NC_016945	CAC	2	6	307415	307420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379743717
5052	NC_016945	TCA	2	6	307422	307427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743717
5053	NC_016945	TGCGTG	2	12	307582	307593	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	379743717
5054	NC_016945	TCT	2	6	307618	307623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743717
5055	NC_016945	CAA	2	6	307641	307646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743717
5056	NC_016945	GTG	2	6	307710	307715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743717
5057	NC_016945	CGTG	2	8	307887	307894	0 %	25 %	50 %	25 %	379743717
5058	NC_016945	TGA	2	6	307984	307989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743717
5059	NC_016945	GAA	2	6	308040	308045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743717
5060	NC_016945	TTC	2	6	308055	308060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743717
5061	NC_016945	TTGG	2	8	308066	308073	0 %	50 %	50 %	0 %	379743717
5062	NC_016945	TGT	3	9	308087	308095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379743717
5063	NC_016945	AC	3	6	308213	308218	50 %	0 %	0 %	50 %	379743717
5064	NC_016945	GTAC	2	8	308283	308290	25 %	25 %	25 %	25 %	379743717
5065	NC_016945	GTAAAG	2	12	308293	308304	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379743717
5066	NC_016945	TAAATT	2	12	308312	308323	50 %	50 %	0 %	0 %	379743717
5067	NC_016945	GAT	2	6	308325	308330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743717
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5072	NC_016945	CAA	2	6	308765	308770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379743718
5073	NC_016945	GA	3	6	308800	308805	50 %	0 %	50 %	0 %	379743718
5074	NC_016945	GAT	2	6	308909	308914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743718
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5078	NC_016945	TGC	2	6	309072	309077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743719
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5080	NC_016945	CTA	2	6	309122	309127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743719
5081	NC_016945	TAC	2	6	309150	309155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743719
5082	NC_016945	GCT	2	6	309208	309213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379743719
5083	NC_016945	GTG	2	6	309298	309303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379743720
5084	NC_016945	TAC	2	6	309351	309356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743720
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5086	NC_016945	TCA	2	6	309517	309522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379743720
5087	NC_016945	GAA	2	6	309530	309535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743720
5088	NC_016945	GATC	2	8	309548	309555	25 %	25 %	25 %	25 %	379743720
5089	NC_016945	AGC	2	6	309590	309595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743720
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5091	NC_016945	AATG	2	8	309862	309869	50 %	25 %	25 %	0 %	379743721
5092	NC_016945	CTT	2	6	309908	309913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743721
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5094	NC_016945	GTA	2	6	309938	309943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743721
5095	NC_016945	ATG	2	6	309957	309962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743721
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5097	NC_016945	CTTTT	2	10	310053	310062	0 %	80 %	0 %	20 %	379743721
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5100	NC_016945	C	6	6	310195	310200	0 %	0 %	0 %	100 %	379743721
5101	NC_016945	ATCTC	2	10	310348	310357	20 %	40 %	0 %	40 %	379743721
5102	NC_016945	TGAG	2	8	310454	310461	25 %	25 %	50 %	0 %	379743721
5103	NC_016945	TTC	2	6	310524	310529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379743721
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5105	NC_016945	T	8	8	310616	310623	0 %	100 %	0 %	0 %	379743721
5106	NC_016945	AGA	2	6	311015	311020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743722
5107	NC_016945	CAG	2	6	311079	311084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379743722
5108	NC_016945	TAA	2	6	311093	311098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743722
5109	NC_016945	CTGC	2	8	311125	311132	0 %	25 %	25 %	50 %	379743722
5110	NC_016945	GAA	2	6	311154	311159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743722
5111	NC_016945	AAT	2	6	311168	311173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379743722
5112	NC_016945	TGTC	2	8	311221	311228	0 %	50 %	25 %	25 %	379743722
5113	NC_016945	ATG	2	6	311438	311443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379743723
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5117	NC_016945	TG	3	6	311612	311617	0 %	50 %	50 %	0 %	379743723
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5120	NC_016945	AAG	2	6	311739	311744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379743723
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