MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016944	TTG	2	6	247495	247500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740130
4002	NC_016944	TGG	2	6	247501	247506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740130
4003	NC_016944	AAG	2	6	247549	247554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740130
4004	NC_016944	AAG	2	6	247557	247562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740130
4005	NC_016944	ACC	2	6	247723	247728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379740130
4006	NC_016944	GAGCA	2	10	247729	247738	40 %	0 %	40 %	20 %	379740130
4007	NC_016944	GAT	2	6	247908	247913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740130
4008	NC_016944	GTA	2	6	247914	247919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740130
4009	NC_016944	ATAA	2	8	247930	247937	75 %	25 %	0 %	0 %	379740130
4010	NC_016944	GGT	2	6	248084	248089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740131
4011	NC_016944	TGG	2	6	248224	248229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740131
4012	NC_016944	GTG	2	6	248307	248312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740131
4013	NC_016944	GAAT	2	8	248350	248357	50 %	25 %	25 %	0 %	379740131
4014	NC_016944	TCA	2	6	248469	248474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740131
4015	NC_016944	TGAT	2	8	248502	248509	25 %	50 %	25 %	0 %	379740131
4016	NC_016944	ATTGA	2	10	248528	248537	40 %	40 %	20 %	0 %	379740131
4017	NC_016944	CAT	2	6	248564	248569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740131
4018	NC_016944	GAA	2	6	248570	248575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740131
4019	NC_016944	GCT	2	6	248697	248702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740131
4020	NC_016944	TGA	2	6	248710	248715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740131
4021	NC_016944	TAC	2	6	248738	248743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740131
4022	NC_016944	ATT	2	6	248795	248800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740131
4023	NC_016944	GCAT	2	8	248878	248885	25 %	25 %	25 %	25 %	379740131
4024	NC_016944	AGA	2	6	248908	248913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740131
4025	NC_016944	GGT	2	6	248924	248929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740131
4026	NC_016944	ACT	2	6	248946	248951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740131
4027	NC_016944	GAT	2	6	248980	248985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740131
4028	NC_016944	AATT	2	8	249085	249092	50 %	50 %	0 %	0 %	379740131
4029	NC_016944	TAA	2	6	249114	249119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740131
4030	NC_016944	TTTA	2	8	249129	249136	25 %	75 %	0 %	0 %	379740131
4031	NC_016944	ATT	2	6	249138	249143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740131
4032	NC_016944	TC	3	6	249180	249185	0 %	50 %	0 %	50 %	379740131
4033	NC_016944	TTA	2	6	249236	249241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740131
4034	NC_016944	TGA	2	6	249276	249281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740131
4035	NC_016944	ATTA	2	8	249307	249314	50 %	50 %	0 %	0 %	379740131
4036	NC_016944	A	6	6	249340	249345	100 %	0 %	0 %	0 %	379740132
4037	NC_016944	ATC	2	6	249470	249475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740132
4038	NC_016944	GC	3	6	249596	249601	0 %	0 %	50 %	50 %	379740132
4039	NC_016944	CTA	2	6	249673	249678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740132
4040	NC_016944	A	7	7	249706	249712	100 %	0 %	0 %	0 %	379740132
4041	NC_016944	AGAA	2	8	249770	249777	75 %	0 %	25 %	0 %	379740132
4042	NC_016944	AATT	2	8	249840	249847	50 %	50 %	0 %	0 %	379740132
4043	NC_016944	GAG	2	6	249911	249916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379740132
4044	NC_016944	GAT	2	6	250050	250055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740132
4045	NC_016944	AG	3	6	250114	250119	50 %	0 %	50 %	0 %	379740132
4046	NC_016944	ATT	2	6	250243	250248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740132
4047	NC_016944	CCTAG	2	10	250306	250315	20 %	20 %	20 %	40 %	379740132
4048	NC_016944	AAG	2	6	250318	250323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740132
4049	NC_016944	ACA	2	6	250353	250358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740132
4050	NC_016944	A	6	6	250417	250422	100 %	0 %	0 %	0 %	379740132
4051	NC_016944	TGGA	2	8	250491	250498	25 %	25 %	50 %	0 %	379740133
4052	NC_016944	AT	3	6	250558	250563	50 %	50 %	0 %	0 %	379740133
4053	NC_016944	GTG	2	6	250737	250742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740133
4054	NC_016944	ATAA	2	8	250811	250818	75 %	25 %	0 %	0 %	379740133
4055	NC_016944	AT	3	6	250847	250852	50 %	50 %	0 %	0 %	379740133
4056	NC_016944	TG	3	6	250887	250892	0 %	50 %	50 %	0 %	379740133
4057	NC_016944	CTG	2	6	250941	250946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740133
4058	NC_016944	A	6	6	250955	250960	100 %	0 %	0 %	0 %	379740133
4059	NC_016944	GGT	2	6	251027	251032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740133
4060	NC_016944	A	6	6	251080	251085	100 %	0 %	0 %	0 %	379740133
4061	NC_016944	TGC	2	6	251158	251163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379740133
4062	NC_016944	TAT	2	6	251311	251316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740133
4063	NC_016944	TGA	2	6	251352	251357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740133
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4065	NC_016944	AAT	2	6	251369	251374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740133
4066	NC_016944	GAT	2	6	251513	251518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740133
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4069	NC_016944	TAG	2	6	251594	251599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740134
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4073	NC_016944	AT	3	6	251759	251764	50 %	50 %	0 %	0 %	379740134
4074	NC_016944	CTA	2	6	251795	251800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740134
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4076	NC_016944	ATGT	2	8	251908	251915	25 %	50 %	25 %	0 %	379740134
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4079	NC_016944	AAG	2	6	251964	251969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740134
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4092	NC_016944	ATTTT	2	10	252521	252530	20 %	80 %	0 %	0 %	379740134
4093	NC_016944	GA	3	6	252580	252585	50 %	0 %	50 %	0 %	379740134
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4099	NC_016944	AT	3	6	252855	252860	50 %	50 %	0 %	0 %	379740134
4100	NC_016944	T	6	6	252934	252939	0 %	100 %	0 %	0 %	379740134
4101	NC_016944	T	6	6	252972	252977	0 %	100 %	0 %	0 %	379740135
4102	NC_016944	GAT	2	6	253130	253135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740135
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4104	NC_016944	TTC	3	9	253296	253304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379740135
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4106	NC_016944	ACCA	2	8	253312	253319	50 %	0 %	0 %	50 %	379740135
4107	NC_016944	GCTA	2	8	253415	253422	25 %	25 %	25 %	25 %	379740135
4108	NC_016944	CTTT	2	8	253491	253498	0 %	75 %	0 %	25 %	379740135
4109	NC_016944	AATT	2	8	253584	253591	50 %	50 %	0 %	0 %	379740135
4110	NC_016944	ATA	2	6	253601	253606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379740135
4111	NC_016944	TAG	2	6	253641	253646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740135
4112	NC_016944	A	6	6	253700	253705	100 %	0 %	0 %	0 %	379740135
4113	NC_016944	T	6	6	253710	253715	0 %	100 %	0 %	0 %	379740135
4114	NC_016944	GTA	2	6	253720	253725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740135
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4118	NC_016944	TGAC	2	8	254020	254027	25 %	25 %	25 %	25 %	379740136
4119	NC_016944	CAA	2	6	254115	254120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379740136
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4122	NC_016944	TGA	2	6	254276	254281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740136
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4124	NC_016944	GTT	2	6	254340	254345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740136
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4246	NC_016944	TGA	2	6	260140	260145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740141
4247	NC_016944	AGA	2	6	260182	260187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379740141
4248	NC_016944	TGT	2	6	260251	260256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740141
4249	NC_016944	GAT	2	6	260324	260329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740141
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4251	NC_016944	GGT	2	6	261854	261859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740142
4252	NC_016944	TAAG	2	8	261903	261910	50 %	25 %	25 %	0 %	379740142
4253	NC_016944	T	6	6	262073	262078	0 %	100 %	0 %	0 %	379740143
4254	NC_016944	ATT	2	6	262087	262092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379740143
4255	NC_016944	GTA	2	6	262103	262108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740143
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4258	NC_016944	ATTA	2	8	262141	262148	50 %	50 %	0 %	0 %	379740143
4259	NC_016944	TTAG	2	8	262327	262334	25 %	50 %	25 %	0 %	379740143
4260	NC_016944	ATC	2	6	262342	262347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740144
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4267	NC_016944	CT	3	6	262647	262652	0 %	50 %	0 %	50 %	379740144
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4275	NC_016944	GGT	2	6	263479	263484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379740145
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4336	NC_016944	GAAA	2	8	266935	266942	75 %	0 %	25 %	0 %	379740148
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4339	NC_016944	CAT	2	6	267011	267016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740148
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4349	NC_016944	AAGC	2	8	267712	267719	50 %	0 %	25 %	25 %	379740150
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4355	NC_016944	ATG	2	6	267961	267966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379740150
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4357	NC_016944	T	7	7	268094	268100	0 %	100 %	0 %	0 %	379740150
4358	NC_016944	ACG	2	6	268115	268120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379740150
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4363	NC_016944	ATC	2	6	268362	268367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379740150
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4365	NC_016944	TGT	2	6	268425	268430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379740151
4366	NC_016944	ATTG	2	8	268447	268454	25 %	50 %	25 %	0 %	379740151
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4368	NC_016944	A	6	6	268558	268563	100 %	0 %	0 %	0 %	379740151
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