MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_016944	TGC	2	6	2626252	2626257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742198
43502	NC_016944	CTGG	2	8	2626279	2626286	0 %	25 %	50 %	25 %	379742198
43503	NC_016944	GC	3	6	2626348	2626353	0 %	0 %	50 %	50 %	379742198
43504	NC_016944	TAAAAC	2	12	2626479	2626490	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379742198
43505	NC_016944	CAT	2	6	2626500	2626505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742198
43506	NC_016944	GAA	2	6	2626517	2626522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742198
43507	NC_016944	AAC	2	6	2626535	2626540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742198
43508	NC_016944	AC	3	6	2626539	2626544	50 %	0 %	0 %	50 %	379742198
43509	NC_016944	CCA	2	6	2626557	2626562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742198
43510	NC_016944	ATC	2	6	2626627	2626632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742198
43511	NC_016944	TCT	2	6	2626635	2626640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742198
43512	NC_016944	GAC	2	6	2626683	2626688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742198
43513	NC_016944	ACC	2	6	2626726	2626731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742198
43514	NC_016944	AAT	2	6	2626799	2626804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742198
43515	NC_016944	AAG	2	6	2626821	2626826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742198
43516	NC_016944	CTTTTT	2	12	2627594	2627605	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379742199
43517	NC_016944	GCC	2	6	2627652	2627657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742199
43518	NC_016944	TCT	2	6	2627709	2627714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742199
43519	NC_016944	CAC	2	6	2627761	2627766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742199
43520	NC_016944	CAC	2	6	2627785	2627790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742199
43521	NC_016944	CTT	2	6	2627920	2627925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742199
43522	NC_016944	AGT	2	6	2627995	2628000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742199
43523	NC_016944	CTT	2	6	2628002	2628007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742199
43524	NC_016944	TG	3	6	2628052	2628057	0 %	50 %	50 %	0 %	379742199
43525	NC_016944	CAG	2	6	2628179	2628184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742199
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43527	NC_016944	CGG	2	6	2628298	2628303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742199
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43533	NC_016944	GAAT	2	8	2628553	2628560	50 %	25 %	25 %	0 %	379742199
43534	NC_016944	CCAG	2	8	2628711	2628718	25 %	0 %	25 %	50 %	379742199
43535	NC_016944	ACC	2	6	2628719	2628724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742199
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43537	NC_016944	TTTC	2	8	2628745	2628752	0 %	75 %	0 %	25 %	379742199
43538	NC_016944	TCAG	2	8	2628807	2628814	25 %	25 %	25 %	25 %	379742199
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43542	NC_016944	AC	4	8	2628884	2628891	50 %	0 %	0 %	50 %	379742199
43543	NC_016944	GAT	2	6	2628914	2628919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742199
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43548	NC_016944	GTAA	2	8	2629328	2629335	50 %	25 %	25 %	0 %	379742200
43549	NC_016944	GACAGT	2	12	2629380	2629391	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379742200
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43553	NC_016944	ACC	2	6	2629656	2629661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742200
43554	NC_016944	TTC	2	6	2629704	2629709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742200
43555	NC_016944	CGT	2	6	2629726	2629731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742200
43556	NC_016944	CAGA	2	8	2629732	2629739	50 %	0 %	25 %	25 %	379742200
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43558	NC_016944	CGCTT	2	10	2629827	2629836	0 %	40 %	20 %	40 %	379742200
43559	NC_016944	ATC	2	6	2629911	2629916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742200
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43562	NC_016944	CTT	2	6	2630092	2630097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742200
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43604	NC_016944	ACCTG	2	10	2632161	2632170	20 %	20 %	20 %	40 %	379742201
43605	NC_016944	CTT	2	6	2632177	2632182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742201
43606	NC_016944	GTA	2	6	2632184	2632189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742201
43607	NC_016944	ACGT	2	8	2632276	2632283	25 %	25 %	25 %	25 %	379742201
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43612	NC_016944	GT	3	6	2632465	2632470	0 %	50 %	50 %	0 %	379742201
43613	NC_016944	ACG	2	6	2632487	2632492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742201
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43615	NC_016944	TTC	2	6	2632548	2632553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742201
43616	NC_016944	CTT	2	6	2632555	2632560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742201
43617	NC_016944	AGATC	2	10	2632567	2632576	40 %	20 %	20 %	20 %	379742201
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43723	NC_016944	TGA	2	6	2638430	2638435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742204
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43728	NC_016944	GA	3	6	2638809	2638814	50 %	0 %	50 %	0 %	379742204
43729	NC_016944	TG	3	6	2638909	2638914	0 %	50 %	50 %	0 %	379742205
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43839	NC_016944	A	6	6	2645834	2645839	100 %	0 %	0 %	0 %	379742212
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43843	NC_016944	CTTA	2	8	2646243	2646250	25 %	50 %	0 %	25 %	379742212
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43848	NC_016944	TGC	2	6	2646696	2646701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742212
43849	NC_016944	TGA	2	6	2646708	2646713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742212
43850	NC_016944	GAC	2	6	2646737	2646742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742212
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43879	NC_016944	CGCGC	2	10	2648041	2648050	0 %	0 %	40 %	60 %	379742214
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43950	NC_016944	GA	3	6	2651715	2651720	50 %	0 %	50 %	0 %	379742218
43951	NC_016944	GAT	2	6	2651741	2651746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742218
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43964	NC_016944	TCCGCA	2	12	2652303	2652314	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379742219
43965	NC_016944	CTT	2	6	2652397	2652402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742219
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