MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42234	NC_016944	CATC	2	8	2552657	2552664	25 %	25 %	0 %	50 %	379742141
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42342	NC_016944	AGA	2	6	2559247	2559252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742146
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42344	NC_016944	CCGACC	2	12	2559453	2559464	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	379742146
42345	NC_016944	TAG	2	6	2559491	2559496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742146
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42347	NC_016944	ATTA	2	8	2559509	2559516	50 %	50 %	0 %	0 %	379742146
42348	NC_016944	TGA	2	6	2560236	2560241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742147
42349	NC_016944	TGGAAA	2	12	2560247	2560258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379742147
42350	NC_016944	GTT	2	6	2560350	2560355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742147
42351	NC_016944	GAC	2	6	2560381	2560386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742147
42352	NC_016944	ATC	3	9	2560623	2560631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742148
42353	NC_016944	GTT	2	6	2560632	2560637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742148
42354	NC_016944	TCT	2	6	2560666	2560671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742148
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42356	NC_016944	ATC	2	6	2560801	2560806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742148
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42364	NC_016944	ATG	2	6	2561321	2561326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742149
42365	NC_016944	CGAT	2	8	2561334	2561341	25 %	25 %	25 %	25 %	379742149
42366	NC_016944	CTG	2	6	2561513	2561518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742149
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42451	NC_016944	GC	3	6	2566566	2566571	0 %	0 %	50 %	50 %	379742154
42452	NC_016944	AG	3	6	2566584	2566589	50 %	0 %	50 %	0 %	379742154
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42455	NC_016944	GA	3	6	2566699	2566704	50 %	0 %	50 %	0 %	379742154
42456	NC_016944	CTG	2	6	2566733	2566738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742154
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42461	NC_016944	ATG	2	6	2566969	2566974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742154
42462	NC_016944	CCA	2	6	2566994	2566999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742154
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42464	NC_016944	CAT	2	6	2567115	2567120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742154
42465	NC_016944	GCTTG	2	10	2567138	2567147	0 %	40 %	40 %	20 %	379742154
42466	NC_016944	CCA	2	6	2567165	2567170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742154
42467	NC_016944	CCA	2	6	2567185	2567190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742154
42468	NC_016944	ATC	2	6	2567271	2567276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742154
42469	NC_016944	AGA	2	6	2567304	2567309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742154
42470	NC_016944	GCAATC	2	12	2567317	2567328	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379742154
42471	NC_016944	GCGAC	2	10	2567366	2567375	20 %	0 %	40 %	40 %	379742154
42472	NC_016944	ACCA	2	8	2567400	2567407	50 %	0 %	0 %	50 %	379742154
42473	NC_016944	TGA	2	6	2567411	2567416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742154
42474	NC_016944	TGT	2	6	2567512	2567517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742154
42475	NC_016944	GAA	2	6	2567548	2567553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742154
42476	NC_016944	CCA	2	6	2567621	2567626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742154
42477	NC_016944	CAT	2	6	2567882	2567887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742154
42478	NC_016944	TCCA	2	8	2567916	2567923	25 %	25 %	0 %	50 %	379742154
42479	NC_016944	CAA	2	6	2567941	2567946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742154
42480	NC_016944	TGT	2	6	2568064	2568069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742154
42481	NC_016944	GAT	2	6	2568128	2568133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742154
42482	NC_016944	TCA	2	6	2568206	2568211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742154
42483	NC_016944	CAAG	2	8	2568383	2568390	50 %	0 %	25 %	25 %	379742154
42484	NC_016944	CT	3	6	2568403	2568408	0 %	50 %	0 %	50 %	379742154
42485	NC_016944	CCA	2	6	2568464	2568469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742154
42486	NC_016944	TGG	2	6	2568476	2568481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742154
42487	NC_016944	AG	3	6	2568495	2568500	50 %	0 %	50 %	0 %	379742154
42488	NC_016944	CTG	2	6	2568519	2568524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742154
42489	NC_016944	GAT	2	6	2568537	2568542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742154
42490	NC_016944	GCT	2	6	2569236	2569241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742155
42491	NC_016944	AG	3	6	2569257	2569262	50 %	0 %	50 %	0 %	379742155
42492	NC_016944	CGC	2	6	2569271	2569276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742155
42493	NC_016944	ATT	2	6	2569281	2569286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379742155
42494	NC_016944	CAG	2	6	2569302	2569307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742155
42495	NC_016944	TGG	2	6	2569335	2569340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742155
42496	NC_016944	TC	3	6	2569458	2569463	0 %	50 %	0 %	50 %	379742155
42497	NC_016944	AAG	2	6	2569511	2569516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742155
42498	NC_016944	CCG	2	6	2569526	2569531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742155
42499	NC_016944	GCA	2	6	2569599	2569604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742155
42500	NC_016944	AAT	2	6	2569691	2569696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742156

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