MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_016944	TTG	2	6	2509863	2509868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742112
41502	NC_016944	TGA	2	6	2509914	2509919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742112
41503	NC_016944	GCT	2	6	2509992	2509997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742112
41504	NC_016944	ACTC	2	8	2510113	2510120	25 %	25 %	0 %	50 %	379742112
41505	NC_016944	TG	3	6	2510185	2510190	0 %	50 %	50 %	0 %	379742112
41506	NC_016944	TGT	2	6	2510199	2510204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742112
41507	NC_016944	CAG	2	6	2510249	2510254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742112
41508	NC_016944	GA	3	6	2510267	2510272	50 %	0 %	50 %	0 %	379742112
41509	NC_016944	AAG	2	6	2510273	2510278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742112
41510	NC_016944	ATT	2	6	2510370	2510375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379742113
41511	NC_016944	T	6	6	2510374	2510379	0 %	100 %	0 %	0 %	379742113
41512	NC_016944	TCGAG	2	10	2510491	2510500	20 %	20 %	40 %	20 %	379742113
41513	NC_016944	GTG	2	6	2510521	2510526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742113
41514	NC_016944	T	6	6	2510570	2510575	0 %	100 %	0 %	0 %	379742113
41515	NC_016944	GAC	2	6	2510651	2510656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742113
41516	NC_016944	AGG	2	6	2510687	2510692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379742113
41517	NC_016944	GAG	2	6	2511128	2511133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379742114
41518	NC_016944	CAT	2	6	2511162	2511167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742114
41519	NC_016944	CTG	2	6	2511181	2511186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742114
41520	NC_016944	ATCA	2	8	2511235	2511242	50 %	25 %	0 %	25 %	379742114
41521	NC_016944	A	7	7	2511251	2511257	100 %	0 %	0 %	0 %	379742114
41522	NC_016944	TGA	2	6	2511297	2511302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742114
41523	NC_016944	GCC	2	6	2511328	2511333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742114
41524	NC_016944	ACA	2	6	2511342	2511347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742114
41525	NC_016944	CAA	2	6	2511378	2511383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742114
41526	NC_016944	ACTCA	2	10	2511400	2511409	40 %	20 %	0 %	40 %	379742114
41527	NC_016944	TCA	2	6	2511428	2511433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742114
41528	NC_016944	TC	3	6	2511434	2511439	0 %	50 %	0 %	50 %	379742114
41529	NC_016944	TGC	2	6	2511542	2511547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742114
41530	NC_016944	GAT	2	6	2511760	2511765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742114
41531	NC_016944	T	6	6	2511789	2511794	0 %	100 %	0 %	0 %	379742114
41532	NC_016944	GC	3	6	2511795	2511800	0 %	0 %	50 %	50 %	379742114
41533	NC_016944	CG	3	6	2511817	2511822	0 %	0 %	50 %	50 %	379742114
41534	NC_016944	AGA	2	6	2511855	2511860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742114
41535	NC_016944	TGA	2	6	2511951	2511956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742114
41536	NC_016944	CGG	2	6	2511960	2511965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742114
41537	NC_016944	TGATT	2	10	2511972	2511981	20 %	60 %	20 %	0 %	379742114
41538	NC_016944	CGC	2	6	2512012	2512017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742114
41539	NC_016944	CAT	2	6	2512056	2512061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742114
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41542	NC_016944	AGCA	2	8	2512195	2512202	50 %	0 %	25 %	25 %	379742114
41543	NC_016944	CAAGC	2	10	2512204	2512213	40 %	0 %	20 %	40 %	379742114
41544	NC_016944	CA	3	6	2512254	2512259	50 %	0 %	0 %	50 %	379742114
41545	NC_016944	CGC	2	6	2512339	2512344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742114
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41549	NC_016944	AACT	2	8	2512936	2512943	50 %	25 %	0 %	25 %	379742116
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41551	NC_016944	TATG	2	8	2513016	2513023	25 %	50 %	25 %	0 %	379742116
41552	NC_016944	CTCGG	2	10	2513055	2513064	0 %	20 %	40 %	40 %	379742116
41553	NC_016944	TGC	2	6	2513079	2513084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742116
41554	NC_016944	ATC	2	6	2513122	2513127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742116
41555	NC_016944	GCC	2	6	2513205	2513210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742116
41556	NC_016944	TCT	2	6	2513225	2513230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742116
41557	NC_016944	TTG	2	6	2513377	2513382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742116
41558	NC_016944	AAGC	2	8	2513413	2513420	50 %	0 %	25 %	25 %	379742116
41559	NC_016944	GCA	2	6	2513454	2513459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742116
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41562	NC_016944	T	6	6	2513604	2513609	0 %	100 %	0 %	0 %	379742116
41563	NC_016944	GCA	2	6	2513610	2513615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742116
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41565	NC_016944	CCA	3	9	2513874	2513882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742116
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41567	NC_016944	CGC	2	6	2513983	2513988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742116
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41582	NC_016944	GCTT	2	8	2514836	2514843	0 %	50 %	25 %	25 %	379742116
41583	NC_016944	GC	3	6	2514882	2514887	0 %	0 %	50 %	50 %	379742116
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41589	NC_016944	CCAT	2	8	2515060	2515067	25 %	25 %	0 %	50 %	379742117
41590	NC_016944	CGC	2	6	2515091	2515096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742117
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41599	NC_016944	TG	3	6	2515604	2515609	0 %	50 %	50 %	0 %	379742117
41600	NC_016944	CAAG	2	8	2515760	2515767	50 %	0 %	25 %	25 %	379742117
41601	NC_016944	GCG	2	6	2515842	2515847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742117
41602	NC_016944	CTCG	2	8	2515883	2515890	0 %	25 %	25 %	50 %	379742117
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41606	NC_016944	GCA	2	6	2516021	2516026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742117
41607	NC_016944	GCG	2	6	2516087	2516092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742117
41608	NC_016944	TCT	2	6	2516152	2516157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742117
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41612	NC_016944	C	6	6	2516383	2516388	0 %	0 %	0 %	100 %	379742117
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41960	NC_016944	GGT	2	6	2535530	2535535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742130
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41964	NC_016944	CA	3	6	2535674	2535679	50 %	0 %	0 %	50 %	379742130
41965	NC_016944	GAT	2	6	2535695	2535700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742130
41966	NC_016944	TCA	2	6	2535743	2535748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742130
41967	NC_016944	TGCT	2	8	2535767	2535774	0 %	50 %	25 %	25 %	379742130
41968	NC_016944	CATC	2	8	2535776	2535783	25 %	25 %	0 %	50 %	379742130
41969	NC_016944	GAT	2	6	2535800	2535805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742130
41970	NC_016944	CAA	2	6	2535831	2535836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742130
41971	NC_016944	AGT	2	6	2535856	2535861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742130
41972	NC_016944	CTG	2	6	2535893	2535898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742130
41973	NC_016944	GC	3	6	2535917	2535922	0 %	0 %	50 %	50 %	379742130
41974	NC_016944	TCA	2	6	2535928	2535933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742130
41975	NC_016944	TCA	2	6	2535970	2535975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742130
41976	NC_016944	TGTA	2	8	2536059	2536066	25 %	50 %	25 %	0 %	379742130
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41982	NC_016944	CCA	2	6	2536328	2536333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742130
41983	NC_016944	GGCA	2	8	2536377	2536384	25 %	0 %	50 %	25 %	379742130
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41987	NC_016944	C	6	6	2536740	2536745	0 %	0 %	0 %	100 %	379742130
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41992	NC_016944	TTG	2	6	2537345	2537350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742131
41993	NC_016944	TTCC	2	8	2537407	2537414	0 %	50 %	0 %	50 %	379742131
41994	NC_016944	ATC	2	6	2537453	2537458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742131
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