MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41003	NC_016944	CTCA	2	8	2481395	2481402	25 %	25 %	0 %	50 %	379742082
41004	NC_016944	CAC	2	6	2481416	2481421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742082
41005	NC_016944	CAA	2	6	2481428	2481433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742082
41006	NC_016944	GTGCT	2	10	2481441	2481450	0 %	40 %	40 %	20 %	379742082
41007	NC_016944	GCC	2	6	2481475	2481480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742082
41008	NC_016944	CTGG	2	8	2481553	2481560	0 %	25 %	50 %	25 %	379742082
41009	NC_016944	A	6	6	2481675	2481680	100 %	0 %	0 %	0 %	379742082
41010	NC_016944	TGG	2	6	2481787	2481792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742082
41011	NC_016944	ACT	2	6	2481794	2481799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742082
41012	NC_016944	GAAA	2	8	2482060	2482067	75 %	0 %	25 %	0 %	379742083
41013	NC_016944	A	6	6	2482065	2482070	100 %	0 %	0 %	0 %	379742083
41014	NC_016944	CTTG	2	8	2482158	2482165	0 %	50 %	25 %	25 %	379742083
41015	NC_016944	AAGG	2	8	2482193	2482200	50 %	0 %	50 %	0 %	379742083
41016	NC_016944	TG	4	8	2482258	2482265	0 %	50 %	50 %	0 %	379742083
41017	NC_016944	GAA	2	6	2482313	2482318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742083
41018	NC_016944	TGG	2	6	2482351	2482356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742083
41019	NC_016944	TGT	2	6	2482413	2482418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742083
41020	NC_016944	GAG	2	6	2482484	2482489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379742083
41021	NC_016944	TGAT	2	8	2482589	2482596	25 %	50 %	25 %	0 %	379742084
41022	NC_016944	GCT	2	6	2482604	2482609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742084
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41024	NC_016944	CT	3	6	2482816	2482821	0 %	50 %	0 %	50 %	379742084
41025	NC_016944	TGA	2	6	2482866	2482871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742084
41026	NC_016944	CGG	2	6	2482896	2482901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742084
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41028	NC_016944	CA	3	6	2482932	2482937	50 %	0 %	0 %	50 %	379742084
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41033	NC_016944	CAT	2	6	2483156	2483161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742084
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41042	NC_016944	TGA	2	6	2483575	2483580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742085
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41056	NC_016944	TGA	2	6	2484355	2484360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742085
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41058	NC_016944	TTTA	2	8	2484515	2484522	25 %	75 %	0 %	0 %	379742086
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41089	NC_016944	GCCA	2	8	2486377	2486384	25 %	0 %	25 %	50 %	379742087
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41351	NC_016944	CTG	3	9	2501176	2501184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742102
41352	NC_016944	CTT	2	6	2501214	2501219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742102
41353	NC_016944	CTA	2	6	2501277	2501282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742102
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41357	NC_016944	TCG	2	6	2501465	2501470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742102
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41459	NC_016944	TTTC	2	8	2507683	2507690	0 %	75 %	0 %	25 %	379742109
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41466	NC_016944	GCC	2	6	2507980	2507985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742110
41467	NC_016944	TGC	2	6	2508055	2508060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742110
41468	NC_016944	CACTT	2	10	2508075	2508084	20 %	40 %	0 %	40 %	379742110
41469	NC_016944	GCA	2	6	2508137	2508142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742110
41470	NC_016944	GAT	2	6	2508156	2508161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742110
41471	NC_016944	TCA	2	6	2508229	2508234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742110
41472	NC_016944	TCA	2	6	2508260	2508265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742110
41473	NC_016944	CGA	2	6	2508306	2508311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742111
41474	NC_016944	GC	3	6	2508313	2508318	0 %	0 %	50 %	50 %	379742111
41475	NC_016944	CAAT	2	8	2508470	2508477	50 %	25 %	0 %	25 %	379742111
41476	NC_016944	TTGG	2	8	2508497	2508504	0 %	50 %	50 %	0 %	379742111
41477	NC_016944	CCGC	2	8	2508608	2508615	0 %	0 %	25 %	75 %	379742111
41478	NC_016944	TGC	2	6	2508645	2508650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742111
41479	NC_016944	AGA	2	6	2508662	2508667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742111
41480	NC_016944	TGA	2	6	2508750	2508755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742111
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41482	NC_016944	TGA	2	6	2508789	2508794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742111
41483	NC_016944	TTTTGC	2	12	2508822	2508833	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379742111
41484	NC_016944	CATGG	2	10	2508847	2508856	20 %	20 %	40 %	20 %	379742111
41485	NC_016944	AC	4	8	2508878	2508885	50 %	0 %	0 %	50 %	379742111
41486	NC_016944	ATC	2	6	2508886	2508891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742111
41487	NC_016944	ATCA	2	8	2508895	2508902	50 %	25 %	0 %	25 %	379742111
41488	NC_016944	GC	3	6	2508925	2508930	0 %	0 %	50 %	50 %	379742111
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41490	NC_016944	CA	4	8	2508973	2508980	50 %	0 %	0 %	50 %	379742111
41491	NC_016944	ACC	2	6	2509033	2509038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742111
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41493	NC_016944	CGG	2	6	2509199	2509204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742112
41494	NC_016944	CA	3	6	2509251	2509256	50 %	0 %	0 %	50 %	379742112
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41497	NC_016944	GAAG	2	8	2509544	2509551	50 %	0 %	50 %	0 %	379742112
41498	NC_016944	TCAA	2	8	2509653	2509660	50 %	25 %	0 %	25 %	379742112
41499	NC_016944	ATG	2	6	2509767	2509772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742112
41500	NC_016944	GATC	2	8	2509777	2509784	25 %	25 %	25 %	25 %	379742112

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