MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_016944	GCAGTG	2	12	2416906	2416917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379742024
40002	NC_016944	TCA	2	6	2416956	2416961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742024
40003	NC_016944	GTG	2	6	2416971	2416976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379742024
40004	NC_016944	ATTT	2	8	2417036	2417043	25 %	75 %	0 %	0 %	379742024
40005	NC_016944	ACA	2	6	2417044	2417049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742024
40006	NC_016944	GCG	2	6	2417124	2417129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742024
40007	NC_016944	CTC	2	6	2417138	2417143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379742024
40008	NC_016944	TTTC	2	8	2417188	2417195	0 %	75 %	0 %	25 %	379742024
40009	NC_016944	ATG	2	6	2417234	2417239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742025
40010	NC_016944	GTT	2	6	2417316	2417321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742025
40011	NC_016944	TGC	2	6	2417373	2417378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742025
40012	NC_016944	ACA	2	6	2417382	2417387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742025
40013	NC_016944	CAA	2	6	2417402	2417407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379742025
40014	NC_016944	AGCT	2	8	2417424	2417431	25 %	25 %	25 %	25 %	379742025
40015	NC_016944	CGG	2	6	2417452	2417457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742025
40016	NC_016944	AAGA	2	8	2417585	2417592	75 %	0 %	25 %	0 %	379742025
40017	NC_016944	ATT	2	6	2417798	2417803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379742026
40018	NC_016944	AGTGA	2	10	2417806	2417815	40 %	20 %	40 %	0 %	379742026
40019	NC_016944	GCTT	2	8	2417881	2417888	0 %	50 %	25 %	25 %	379742026
40020	NC_016944	CCAA	2	8	2417900	2417907	50 %	0 %	0 %	50 %	379742026
40021	NC_016944	GC	3	6	2418169	2418174	0 %	0 %	50 %	50 %	379742026
40022	NC_016944	CAG	2	6	2418176	2418181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742026
40023	NC_016944	TCA	2	6	2418220	2418225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742026
40024	NC_016944	GTAC	2	8	2418226	2418233	25 %	25 %	25 %	25 %	379742026
40025	NC_016944	CAGA	2	8	2418254	2418261	50 %	0 %	25 %	25 %	379742026
40026	NC_016944	AGT	2	6	2418401	2418406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742026
40027	NC_016944	GAT	2	6	2418468	2418473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742026
40028	NC_016944	GCC	2	6	2418516	2418521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742026
40029	NC_016944	CAGTA	2	10	2418523	2418532	40 %	20 %	20 %	20 %	379742026
40030	NC_016944	GT	3	6	2418551	2418556	0 %	50 %	50 %	0 %	379742026
40031	NC_016944	CAAC	2	8	2418638	2418645	50 %	0 %	0 %	50 %	379742026
40032	NC_016944	TCAC	2	8	2418688	2418695	25 %	25 %	0 %	50 %	379742026
40033	NC_016944	GCG	2	6	2418725	2418730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742026
40034	NC_016944	CTTG	2	8	2418749	2418756	0 %	50 %	25 %	25 %	379742026
40035	NC_016944	CCA	2	6	2418847	2418852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742026
40036	NC_016944	GTC	2	6	2418862	2418867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742026
40037	NC_016944	CGC	2	6	2418879	2418884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742026
40038	NC_016944	GCC	3	9	2419033	2419041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742026
40039	NC_016944	CTTG	2	8	2419178	2419185	0 %	50 %	25 %	25 %	379742026
40040	NC_016944	TCA	2	6	2419333	2419338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742026
40041	NC_016944	GCC	2	6	2419372	2419377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742026
40042	NC_016944	GCTT	2	8	2419402	2419409	0 %	50 %	25 %	25 %	379742026
40043	NC_016944	CCA	2	6	2419433	2419438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742026
40044	NC_016944	GAG	2	6	2419460	2419465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379742026
40045	NC_016944	CGA	2	6	2419469	2419474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742026
40046	NC_016944	CAG	2	6	2419521	2419526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742026
40047	NC_016944	ATA	2	6	2419648	2419653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742026
40048	NC_016944	GC	3	6	2419699	2419704	0 %	0 %	50 %	50 %	379742026
40049	NC_016944	GT	3	6	2419821	2419826	0 %	50 %	50 %	0 %	379742026
40050	NC_016944	TTG	2	6	2419888	2419893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742026
40051	NC_016944	CGGTG	2	10	2419992	2420001	0 %	20 %	60 %	20 %	379742026
40052	NC_016944	CAC	2	6	2420225	2420230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742026
40053	NC_016944	AAG	2	6	2420261	2420266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742026
40054	NC_016944	TTG	2	6	2420317	2420322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742026
40055	NC_016944	ACC	2	6	2420365	2420370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742026
40056	NC_016944	CTT	2	6	2420439	2420444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742026
40057	NC_016944	ATA	2	6	2420449	2420454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742026
40058	NC_016944	CT	3	6	2421007	2421012	0 %	50 %	0 %	50 %	379742027
40059	NC_016944	ACG	2	6	2421134	2421139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742027
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40076	NC_016944	TTC	2	6	2422343	2422348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742028
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40100	NC_016944	AGA	2	6	2423929	2423934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379742030
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40104	NC_016944	A	6	6	2424092	2424097	100 %	0 %	0 %	0 %	379742030
40105	NC_016944	CGT	2	6	2424104	2424109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742030
40106	NC_016944	CAT	2	6	2424120	2424125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742030
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40117	NC_016944	CGA	2	6	2424707	2424712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742031
40118	NC_016944	ATG	2	6	2424910	2424915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742031
40119	NC_016944	GTCC	2	8	2424962	2424969	0 %	25 %	25 %	50 %	379742031
40120	NC_016944	ATA	2	6	2424972	2424977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742031
40121	NC_016944	GCT	2	6	2425037	2425042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742031
40122	NC_016944	TGA	2	6	2425100	2425105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742031
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40124	NC_016944	CAT	2	6	2425325	2425330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742031
40125	NC_016944	GATTC	2	10	2425334	2425343	20 %	40 %	20 %	20 %	379742031
40126	NC_016944	GTA	2	6	2425374	2425379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742031
40127	NC_016944	GAT	2	6	2425452	2425457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379742031
40128	NC_016944	GAG	2	6	2425522	2425527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379742031
40129	NC_016944	CGGA	2	8	2425536	2425543	25 %	0 %	50 %	25 %	379742031
40130	NC_016944	CTG	2	6	2425551	2425556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742031
40131	NC_016944	AATA	2	8	2425565	2425572	75 %	25 %	0 %	0 %	379742031
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40179	NC_016944	GACT	2	8	2429351	2429358	25 %	25 %	25 %	25 %	379742035
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40190	NC_016944	CA	3	6	2429889	2429894	50 %	0 %	0 %	50 %	379742036
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40229	NC_016944	CAC	2	6	2434701	2434706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742038
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40233	NC_016944	GCC	2	6	2434984	2434989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379742038
40234	NC_016944	CAC	2	6	2435023	2435028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379742038
40235	NC_016944	TTG	2	6	2435048	2435053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379742038
40236	NC_016944	TCA	2	6	2435061	2435066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742038
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40260	NC_016944	CATCAC	2	12	2436596	2436607	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379742041
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40333	NC_016944	ATTT	2	8	2441551	2441558	25 %	75 %	0 %	0 %	379742047
40334	NC_016944	AACCA	2	10	2441581	2441590	60 %	0 %	0 %	40 %	379742047
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40337	NC_016944	ACCC	2	8	2441736	2441743	25 %	0 %	0 %	75 %	379742047
40338	NC_016944	CGGCAA	2	12	2441865	2441876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742047
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40344	NC_016944	T	6	6	2442163	2442168	0 %	100 %	0 %	0 %	379742047
40345	NC_016944	GCA	2	6	2442191	2442196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742047
40346	NC_016944	CTT	2	6	2442200	2442205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742047
40347	NC_016944	CA	3	6	2442212	2442217	50 %	0 %	0 %	50 %	379742047
40348	NC_016944	TGC	2	6	2442352	2442357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742047
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40468	NC_016944	CGG	2	6	2449065	2449070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379742051
40469	NC_016944	CAG	2	6	2449110	2449115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379742051
40470	NC_016944	AG	3	6	2449287	2449292	50 %	0 %	50 %	0 %	379742051
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40472	NC_016944	AAT	2	6	2449498	2449503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379742052
40473	NC_016944	CTT	2	6	2449563	2449568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379742052
40474	NC_016944	GCT	2	6	2449586	2449591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379742052
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40483	NC_016944	ATC	2	6	2450276	2450281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742052
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40485	NC_016944	TTCAAC	2	12	2450387	2450398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379742053
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40500	NC_016944	C	7	7	2451829	2451835	0 %	0 %	0 %	100 %	379742054

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