MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_016944	ATC	2	6	2297470	2297475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741911
38002	NC_016944	CAG	2	6	2297559	2297564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741911
38003	NC_016944	TG	3	6	2297705	2297710	0 %	50 %	50 %	0 %	379741911
38004	NC_016944	TGG	2	6	2297714	2297719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741911
38005	NC_016944	GCTTTG	2	12	2297764	2297775	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379741911
38006	NC_016944	AGCAC	2	10	2297821	2297830	40 %	0 %	20 %	40 %	379741911
38007	NC_016944	TGG	2	6	2297876	2297881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741911
38008	NC_016944	TTG	2	6	2297898	2297903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741911
38009	NC_016944	CTG	4	12	2297939	2297950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741911
38010	NC_016944	AGC	2	6	2297958	2297963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741911
38011	NC_016944	CAC	2	6	2297969	2297974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741911
38012	NC_016944	TGAC	2	8	2297985	2297992	25 %	25 %	25 %	25 %	379741911
38013	NC_016944	CATA	2	8	2298143	2298150	50 %	25 %	0 %	25 %	379741911
38014	NC_016944	ATC	2	6	2298162	2298167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741911
38015	NC_016944	GCC	2	6	2298198	2298203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741911
38016	NC_016944	GCA	2	6	2298286	2298291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741911
38017	NC_016944	CAC	2	6	2298302	2298307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741911
38018	NC_016944	TAC	2	6	2298318	2298323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741911
38019	NC_016944	GAAC	2	8	2298334	2298341	50 %	0 %	25 %	25 %	379741911
38020	NC_016944	AGA	2	6	2298383	2298388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741912
38021	NC_016944	GAT	2	6	2298624	2298629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741912
38022	NC_016944	TACCA	2	10	2298693	2298702	40 %	20 %	0 %	40 %	379741912
38023	NC_016944	CCA	2	6	2298816	2298821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741913
38024	NC_016944	CAA	2	6	2298883	2298888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741913
38025	NC_016944	GAG	2	6	2298918	2298923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379741913
38026	NC_016944	AAC	2	6	2298936	2298941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741913
38027	NC_016944	CAA	2	6	2298961	2298966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741913
38028	NC_016944	AC	3	6	2298982	2298987	50 %	0 %	0 %	50 %	379741913
38029	NC_016944	GGA	2	6	2298991	2298996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379741913
38030	NC_016944	CTTT	3	12	2299058	2299069	0 %	75 %	0 %	25 %	379741913
38031	NC_016944	CTCA	2	8	2299080	2299087	25 %	25 %	0 %	50 %	379741913
38032	NC_016944	ATGG	2	8	2299540	2299547	25 %	25 %	50 %	0 %	379741914
38033	NC_016944	TTACT	2	10	2299596	2299605	20 %	60 %	0 %	20 %	379741914
38034	NC_016944	GT	3	6	2299735	2299740	0 %	50 %	50 %	0 %	379741914
38035	NC_016944	CTT	2	6	2299747	2299752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741914
38036	NC_016944	CCG	2	6	2299854	2299859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741914
38037	NC_016944	TG	3	6	2299883	2299888	0 %	50 %	50 %	0 %	379741914
38038	NC_016944	GTG	2	6	2299891	2299896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741914
38039	NC_016944	GCT	2	6	2299906	2299911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741914
38040	NC_016944	ATG	2	6	2300080	2300085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741914
38041	NC_016944	GAG	2	6	2300101	2300106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379741914
38042	NC_016944	CATCGA	2	12	2300180	2300191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379741914
38043	NC_016944	GCA	2	6	2300239	2300244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741914
38044	NC_016944	TGG	2	6	2300274	2300279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741914
38045	NC_016944	TGA	2	6	2300526	2300531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741914
38046	NC_016944	GAA	2	6	2300544	2300549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741914
38047	NC_016944	CAT	2	6	2300580	2300585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741914
38048	NC_016944	GTC	2	6	2300702	2300707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741914
38049	NC_016944	TATCAA	2	12	2300832	2300843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379741915
38050	NC_016944	CAC	2	6	2301042	2301047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741915
38051	NC_016944	TTC	2	6	2301145	2301150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741915
38052	NC_016944	CCA	2	6	2301212	2301217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741915
38053	NC_016944	TTG	2	6	2301254	2301259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741915
38054	NC_016944	CGTA	2	8	2301325	2301332	25 %	25 %	25 %	25 %	379741915
38055	NC_016944	GTG	2	6	2301388	2301393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741915
38056	NC_016944	AGA	2	6	2301398	2301403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741915
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38058	NC_016944	TTAA	2	8	2301521	2301528	50 %	50 %	0 %	0 %	379741915
38059	NC_016944	GTG	3	9	2301654	2301662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741916
38060	NC_016944	ACA	2	6	2301761	2301766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741916
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38063	NC_016944	T	6	6	2301919	2301924	0 %	100 %	0 %	0 %	379741916
38064	NC_016944	CCA	2	6	2301988	2301993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741916
38065	NC_016944	ACC	2	6	2302056	2302061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741916
38066	NC_016944	AAC	2	6	2302095	2302100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741916
38067	NC_016944	TTA	2	6	2302130	2302135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741916
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38069	NC_016944	TGA	2	6	2302168	2302173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741916
38070	NC_016944	CCGA	2	8	2302181	2302188	25 %	0 %	25 %	50 %	379741916
38071	NC_016944	AGC	2	6	2302248	2302253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741916
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38074	NC_016944	CTG	2	6	2302503	2302508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741917
38075	NC_016944	TCT	2	6	2302576	2302581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741917
38076	NC_016944	ACCA	2	8	2302604	2302611	50 %	0 %	0 %	50 %	379741917
38077	NC_016944	GCC	2	6	2302632	2302637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741917
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38082	NC_016944	CT	3	6	2302939	2302944	0 %	50 %	0 %	50 %	379741917
38083	NC_016944	AGAGT	2	10	2302968	2302977	40 %	20 %	40 %	0 %	379741917
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38085	NC_016944	CA	3	6	2303012	2303017	50 %	0 %	0 %	50 %	379741917
38086	NC_016944	ATCA	2	8	2303046	2303053	50 %	25 %	0 %	25 %	379741917
38087	NC_016944	GCCC	2	8	2303091	2303098	0 %	0 %	25 %	75 %	379741917
38088	NC_016944	TCA	2	6	2303156	2303161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741917
38089	NC_016944	TGCCAC	2	12	2303393	2303404	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379741917
38090	NC_016944	GCC	2	6	2303446	2303451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741917
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38097	NC_016944	GT	3	6	2303759	2303764	0 %	50 %	50 %	0 %	379741917
38098	NC_016944	GTT	2	6	2303769	2303774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741917
38099	NC_016944	ACT	2	6	2303823	2303828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741917
38100	NC_016944	ATG	2	6	2303934	2303939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741917
38101	NC_016944	GTAG	2	8	2304029	2304036	25 %	25 %	50 %	0 %	379741917
38102	NC_016944	AATGG	2	10	2304225	2304234	40 %	20 %	40 %	0 %	379741918
38103	NC_016944	AAT	2	6	2304246	2304251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379741918
38104	NC_016944	TTGC	2	8	2304297	2304304	0 %	50 %	25 %	25 %	379741918
38105	NC_016944	GTT	3	9	2304312	2304320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741918
38106	NC_016944	GTT	2	6	2304364	2304369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741918
38107	NC_016944	GCAA	2	8	2304379	2304386	50 %	0 %	25 %	25 %	379741918
38108	NC_016944	CGATG	2	10	2304461	2304470	20 %	20 %	40 %	20 %	379741918
38109	NC_016944	CGAT	2	8	2304496	2304503	25 %	25 %	25 %	25 %	379741918
38110	NC_016944	T	6	6	2304508	2304513	0 %	100 %	0 %	0 %	379741918
38111	NC_016944	CAG	2	6	2304537	2304542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741918
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38113	NC_016944	GCA	2	6	2304628	2304633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741918
38114	NC_016944	GAC	2	6	2304662	2304667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741918
38115	NC_016944	TCA	2	6	2304733	2304738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741918
38116	NC_016944	CTT	2	6	2304857	2304862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741919
38117	NC_016944	GTT	2	6	2304893	2304898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741919
38118	NC_016944	GCTT	2	8	2304936	2304943	0 %	50 %	25 %	25 %	379741919
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38123	NC_016944	GTG	2	6	2305166	2305171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741919
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38141	NC_016944	CTG	2	6	2306131	2306136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741921
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38230	NC_016944	AGC	2	6	2311518	2311523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741928
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38233	NC_016944	CGC	2	6	2311640	2311645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741928
38234	NC_016944	ATTA	2	8	2311646	2311653	50 %	50 %	0 %	0 %	379741928
38235	NC_016944	ATCA	2	8	2311691	2311698	50 %	25 %	0 %	25 %	379741928
38236	NC_016944	GAT	2	6	2311699	2311704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741928
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38244	NC_016944	TGC	3	9	2311932	2311940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741928
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38333	NC_016944	GCCG	2	8	2317893	2317900	0 %	0 %	50 %	50 %	379741934
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38344	NC_016944	CA	3	6	2318649	2318654	50 %	0 %	0 %	50 %	379741935
38345	NC_016944	GAC	2	6	2318663	2318668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741935
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38349	NC_016944	T	6	6	2319027	2319032	0 %	100 %	0 %	0 %	379741935
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38464	NC_016944	CTT	2	6	2325932	2325937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741944
38465	NC_016944	AGC	2	6	2325961	2325966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741944
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38467	NC_016944	CGC	2	6	2326034	2326039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741944
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38475	NC_016944	AGC	2	6	2326390	2326395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741944
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38485	NC_016944	CGG	2	6	2326869	2326874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741945
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