MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_016944	TGA	2	6	1749669	1749674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741438
29003	NC_016944	TGG	2	6	1749711	1749716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741438
29004	NC_016944	GCGA	2	8	1750081	1750088	25 %	0 %	50 %	25 %	379741439
29005	NC_016944	CAA	2	6	1750126	1750131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741439
29006	NC_016944	CGG	2	6	1750145	1750150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741439
29007	NC_016944	GGC	3	9	1750218	1750226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741439
29008	NC_016944	TGC	2	6	1750286	1750291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741439
29009	NC_016944	CAA	2	6	1750297	1750302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741439
29010	NC_016944	TGA	2	6	1750455	1750460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741439
29011	NC_016944	AAC	2	6	1750601	1750606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741439
29012	NC_016944	AATT	2	8	1750616	1750623	50 %	50 %	0 %	0 %	379741439
29013	NC_016944	TATT	2	8	1750693	1750700	25 %	75 %	0 %	0 %	379741439
29014	NC_016944	AT	3	6	1750729	1750734	50 %	50 %	0 %	0 %	379741439
29015	NC_016944	GAT	2	6	1750996	1751001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741440
29016	NC_016944	ATT	2	6	1751035	1751040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741440
29017	NC_016944	AAGAT	2	10	1751046	1751055	60 %	20 %	20 %	0 %	379741440
29018	NC_016944	ACTG	2	8	1751083	1751090	25 %	25 %	25 %	25 %	379741440
29019	NC_016944	TTC	2	6	1751177	1751182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741440
29020	NC_016944	TG	3	6	1751204	1751209	0 %	50 %	50 %	0 %	379741440
29021	NC_016944	CAA	2	6	1751228	1751233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741440
29022	NC_016944	CCA	2	6	1751265	1751270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741440
29023	NC_016944	T	6	6	1751336	1751341	0 %	100 %	0 %	0 %	379741440
29024	NC_016944	CAC	2	6	1751400	1751405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741440
29025	NC_016944	CTTGGT	2	12	1751419	1751430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379741440
29026	NC_016944	GAT	2	6	1751513	1751518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741440
29027	NC_016944	TTC	2	6	1751556	1751561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741440
29028	NC_016944	GT	3	6	1751592	1751597	0 %	50 %	50 %	0 %	379741440
29029	NC_016944	TGACTT	2	12	1751664	1751675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379741440
29030	NC_016944	GCG	2	6	1751708	1751713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741440
29031	NC_016944	GAT	2	6	1751815	1751820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741440
29032	NC_016944	TGG	2	6	1751944	1751949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741440
29033	NC_016944	AGA	2	6	1751950	1751955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741440
29034	NC_016944	CAAA	2	8	1751982	1751989	75 %	0 %	0 %	25 %	379741440
29035	NC_016944	AAC	2	6	1752052	1752057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741440
29036	NC_016944	GCT	2	6	1752098	1752103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741440
29037	NC_016944	AAG	2	6	1752138	1752143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741440
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29039	NC_016944	A	6	6	1752237	1752242	100 %	0 %	0 %	0 %	379741441
29040	NC_016944	GAT	2	6	1752315	1752320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741441
29041	NC_016944	CCAA	2	8	1752405	1752412	50 %	0 %	0 %	50 %	379741441
29042	NC_016944	TCC	2	6	1752581	1752586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379741441
29043	NC_016944	TGA	2	6	1752701	1752706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741441
29044	NC_016944	CGG	2	6	1752771	1752776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741441
29045	NC_016944	GGT	2	6	1752787	1752792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741441
29046	NC_016944	CAG	2	6	1752882	1752887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741441
29047	NC_016944	TGC	2	6	1752920	1752925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741441
29048	NC_016944	CGA	3	9	1752938	1752946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741441
29049	NC_016944	TTGA	2	8	1752985	1752992	25 %	50 %	25 %	0 %	379741441
29050	NC_016944	ATC	2	6	1753096	1753101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741441
29051	NC_016944	TGC	2	6	1753104	1753109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741441
29052	NC_016944	CGG	2	6	1753205	1753210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741441
29053	NC_016944	CAT	2	6	1753242	1753247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741441
29054	NC_016944	TGC	2	6	1753393	1753398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741442
29055	NC_016944	CCA	2	6	1753430	1753435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741442
29056	NC_016944	CA	3	6	1753434	1753439	50 %	0 %	0 %	50 %	379741442
29057	NC_016944	ACC	2	6	1753440	1753445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741442
29058	NC_016944	GCC	3	9	1753449	1753457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741442
29059	NC_016944	TATC	2	8	1753514	1753521	25 %	50 %	0 %	25 %	379741442
29060	NC_016944	ATC	2	6	1753542	1753547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741442
29061	NC_016944	TGA	2	6	1753646	1753651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741442
29062	NC_016944	GC	3	6	1753656	1753661	0 %	0 %	50 %	50 %	379741442
29063	NC_016944	CCA	2	6	1753670	1753675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741442
29064	NC_016944	GAC	2	6	1753772	1753777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741442
29065	NC_016944	GTATT	2	10	1753780	1753789	20 %	60 %	20 %	0 %	379741442
29066	NC_016944	CCA	2	6	1753796	1753801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741442
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29068	NC_016944	CAC	2	6	1753830	1753835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741442
29069	NC_016944	CATGG	2	10	1753893	1753902	20 %	20 %	40 %	20 %	379741442
29070	NC_016944	ATC	2	6	1753924	1753929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741442
29071	NC_016944	CTGA	2	8	1754001	1754008	25 %	25 %	25 %	25 %	379741442
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29074	NC_016944	T	7	7	1754183	1754189	0 %	100 %	0 %	0 %	379741442
29075	NC_016944	TCT	2	6	1754206	1754211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741442
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29084	NC_016944	ATC	2	6	1754819	1754824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741443
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29086	NC_016944	CAT	2	6	1754833	1754838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741443
29087	NC_016944	CTCA	2	8	1754843	1754850	25 %	25 %	0 %	50 %	379741443
29088	NC_016944	GCG	2	6	1754852	1754857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741443
29089	NC_016944	CAG	2	6	1754876	1754881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741443
29090	NC_016944	GCC	2	6	1754898	1754903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741443
29091	NC_016944	CAC	2	6	1754912	1754917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741443
29092	NC_016944	CCA	2	6	1754938	1754943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741443
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29096	NC_016944	A	6	6	1755057	1755062	100 %	0 %	0 %	0 %	379741443
29097	NC_016944	AGC	2	6	1755100	1755105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741443
29098	NC_016944	CT	3	6	1755149	1755154	0 %	50 %	0 %	50 %	379741443
29099	NC_016944	GTTC	2	8	1755172	1755179	0 %	50 %	25 %	25 %	379741443
29100	NC_016944	TGT	2	6	1755232	1755237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741443
29101	NC_016944	GCT	2	6	1755315	1755320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741443
29102	NC_016944	TCA	2	6	1755331	1755336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741443
29103	NC_016944	GCA	2	6	1755339	1755344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741443
29104	NC_016944	TTGG	2	8	1755408	1755415	0 %	50 %	50 %	0 %	379741443
29105	NC_016944	CAT	2	6	1755433	1755438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741443
29106	NC_016944	AGCG	2	8	1755452	1755459	25 %	0 %	50 %	25 %	379741443
29107	NC_016944	GGTGA	2	10	1755499	1755508	20 %	20 %	60 %	0 %	379741443
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29111	NC_016944	AGC	2	6	1756103	1756108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741444
29112	NC_016944	CCGCAA	2	12	1756110	1756121	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	379741444
29113	NC_016944	AAAG	2	8	1756228	1756235	75 %	0 %	25 %	0 %	379741444
29114	NC_016944	CCGA	2	8	1756241	1756248	25 %	0 %	25 %	50 %	379741444
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29116	NC_016944	GCCTAA	2	12	1756351	1756362	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379741444
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