MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae IEC224 chromosome I

Total Repeats: 49712

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_016944	GATG	2	8	1422265	1422272	25 %	25 %	50 %	0 %	379741143
23502	NC_016944	TCA	2	6	1422312	1422317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741143
23503	NC_016944	GAA	2	6	1422473	1422478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741143
23504	NC_016944	GC	4	8	1422586	1422593	0 %	0 %	50 %	50 %	379741143
23505	NC_016944	ATG	2	6	1422620	1422625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741143
23506	NC_016944	GCC	2	6	1422632	1422637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741143
23507	NC_016944	CTG	2	6	1422651	1422656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741143
23508	NC_016944	CCG	2	6	1422657	1422662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741143
23509	NC_016944	GCG	2	6	1422696	1422701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741143
23510	NC_016944	GTCA	2	8	1422709	1422716	25 %	25 %	25 %	25 %	379741143
23511	NC_016944	CAAG	2	8	1422760	1422767	50 %	0 %	25 %	25 %	379741143
23512	NC_016944	GC	3	6	1422790	1422795	0 %	0 %	50 %	50 %	379741143
23513	NC_016944	AGC	2	6	1422925	1422930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741144
23514	NC_016944	GCA	2	6	1422956	1422961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741144
23515	NC_016944	CCG	2	6	1422978	1422983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741144
23516	NC_016944	AGC	2	6	1423135	1423140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741144
23517	NC_016944	GCTG	2	8	1423190	1423197	0 %	25 %	50 %	25 %	379741144
23518	NC_016944	TCA	2	6	1423225	1423230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741144
23519	NC_016944	GAT	2	6	1423241	1423246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741144
23520	NC_016944	GCG	2	6	1423254	1423259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741144
23521	NC_016944	GGT	2	6	1423301	1423306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741144
23522	NC_016944	GGC	2	6	1423311	1423316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741144
23523	NC_016944	GCG	2	6	1423384	1423389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741144
23524	NC_016944	CTCA	2	8	1423503	1423510	25 %	25 %	0 %	50 %	379741144
23525	NC_016944	TGGAA	2	10	1423522	1423531	40 %	20 %	40 %	0 %	379741144
23526	NC_016944	GCCAC	2	10	1423548	1423557	20 %	0 %	20 %	60 %	379741144
23527	NC_016944	TG	3	6	1423563	1423568	0 %	50 %	50 %	0 %	379741144
23528	NC_016944	CAC	2	6	1423613	1423618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741144
23529	NC_016944	GTG	2	6	1423635	1423640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741144
23530	NC_016944	GGC	2	6	1423650	1423655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741144
23531	NC_016944	ATC	2	6	1423686	1423691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741144
23532	NC_016944	ACA	2	6	1423693	1423698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741144
23533	NC_016944	GGC	2	6	1423721	1423726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741144
23534	NC_016944	TCAT	2	8	1423777	1423784	25 %	50 %	0 %	25 %	379741144
23535	NC_016944	CAC	2	6	1423790	1423795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741144
23536	NC_016944	GT	3	6	1423851	1423856	0 %	50 %	50 %	0 %	379741144
23537	NC_016944	T	6	6	1423879	1423884	0 %	100 %	0 %	0 %	379741144
23538	NC_016944	ACCG	2	8	1423889	1423896	25 %	0 %	25 %	50 %	379741144
23539	NC_016944	A	6	6	1423911	1423916	100 %	0 %	0 %	0 %	379741144
23540	NC_016944	ATT	2	6	1423933	1423938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741144
23541	NC_016944	A	6	6	1423940	1423945	100 %	0 %	0 %	0 %	379741144
23542	NC_016944	ACC	2	6	1423965	1423970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741144
23543	NC_016944	CCG	2	6	1423998	1424003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741144
23544	NC_016944	TGAT	2	8	1424041	1424048	25 %	50 %	25 %	0 %	379741144
23545	NC_016944	TGG	2	6	1424052	1424057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741144
23546	NC_016944	TGCC	2	8	1424188	1424195	0 %	25 %	25 %	50 %	379741144
23547	NC_016944	ACC	2	6	1424231	1424236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741144
23548	NC_016944	CTGC	2	8	1424240	1424247	0 %	25 %	25 %	50 %	379741144
23549	NC_016944	TTA	2	6	1424306	1424311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741144
23550	NC_016944	TGA	2	6	1424336	1424341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741144
23551	NC_016944	TCA	2	6	1424356	1424361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741144
23552	NC_016944	GAT	2	6	1424373	1424378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741144
23553	NC_016944	GC	3	6	1424434	1424439	0 %	0 %	50 %	50 %	379741144
23554	NC_016944	ACG	2	6	1424476	1424481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741144
23555	NC_016944	GTG	2	6	1424511	1424516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741144
23556	NC_016944	GCTT	2	8	1424598	1424605	0 %	50 %	25 %	25 %	379741144
23557	NC_016944	GCG	2	6	1424660	1424665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741144
23558	NC_016944	ATC	2	6	1424667	1424672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741144
23559	NC_016944	CT	3	6	1424954	1424959	0 %	50 %	0 %	50 %	379741145
23560	NC_016944	ACA	2	6	1424980	1424985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741145
23561	NC_016944	ATG	2	6	1425012	1425017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741145
23562	NC_016944	AAGAG	2	10	1425069	1425078	60 %	0 %	40 %	0 %	379741145
23563	NC_016944	GGT	2	6	1425139	1425144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741145
23564	NC_016944	TTA	2	6	1425150	1425155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741145
23565	NC_016944	TGTT	2	8	1425315	1425322	0 %	75 %	25 %	0 %	379741145
23566	NC_016944	TTG	2	6	1425445	1425450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379741146
23567	NC_016944	CTTT	2	8	1425502	1425509	0 %	75 %	0 %	25 %	379741146
23568	NC_016944	AAG	3	9	1425527	1425535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741146
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23570	NC_016944	TGA	2	6	1425587	1425592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741146
23571	NC_016944	AAG	2	6	1425596	1425601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741146
23572	NC_016944	CGG	2	6	1425627	1425632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741146
23573	NC_016944	GGC	2	6	1425663	1425668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741146
23574	NC_016944	TGG	2	6	1425698	1425703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741146
23575	NC_016944	TCA	2	6	1425881	1425886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741146
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23578	NC_016944	ACA	2	6	1426035	1426040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741146
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23582	NC_016944	CAG	2	6	1426225	1426230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741146
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23585	NC_016944	GT	3	6	1426388	1426393	0 %	50 %	50 %	0 %	379741146
23586	NC_016944	GGTC	2	8	1426395	1426402	0 %	25 %	50 %	25 %	379741146
23587	NC_016944	CTT	2	6	1426424	1426429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741146
23588	NC_016944	ATT	2	6	1426501	1426506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379741146
23589	NC_016944	TGG	2	6	1426564	1426569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741146
23590	NC_016944	ATC	2	6	1426600	1426605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379741146
23591	NC_016944	CTGTTA	2	12	1426726	1426737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379741146
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23596	NC_016944	CCA	3	9	1427107	1427115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379741147
23597	NC_016944	TCT	2	6	1427185	1427190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741147
23598	NC_016944	TCG	2	6	1427360	1427365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741147
23599	NC_016944	TTC	2	6	1427403	1427408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741147
23600	NC_016944	GCA	2	6	1427417	1427422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741147
23601	NC_016944	CGA	2	6	1427519	1427524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741147
23602	NC_016944	T	6	6	1427525	1427530	0 %	100 %	0 %	0 %	379741147
23603	NC_016944	TGC	2	6	1427541	1427546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741147
23604	NC_016944	GCC	2	6	1427568	1427573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741147
23605	NC_016944	CTT	2	6	1427645	1427650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379741147
23606	NC_016944	GTC	2	6	1427745	1427750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741147
23607	NC_016944	CCG	2	6	1427912	1427917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379741147
23608	NC_016944	T	7	7	1427983	1427989	0 %	100 %	0 %	0 %	379741147
23609	NC_016944	CAA	2	6	1428035	1428040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741147
23610	NC_016944	GAT	3	9	1428521	1428529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741148
23611	NC_016944	TGA	2	6	1428587	1428592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379741148
23612	NC_016944	CT	3	6	1428626	1428631	0 %	50 %	0 %	50 %	379741148
23613	NC_016944	AAG	2	6	1428664	1428669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379741148
23614	NC_016944	CGG	2	6	1428874	1428879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379741148
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23966	NC_016944	GTC	2	6	1450434	1450439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741164
23967	NC_016944	CAA	2	6	1450502	1450507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379741164
23968	NC_016944	GT	5	10	1450520	1450529	0 %	50 %	50 %	0 %	379741164
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23988	NC_016944	TTGC	2	8	1452354	1452361	0 %	50 %	25 %	25 %	379741166
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23992	NC_016944	CGT	3	9	1452530	1452538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379741167
23993	NC_016944	GTG	2	6	1452544	1452549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379741167
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23999	NC_016944	AGCA	2	8	1453191	1453198	50 %	0 %	25 %	25 %	379741167
24000	NC_016944	CAG	2	6	1453201	1453206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379741167

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