MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio sp. EJY3 chromosome 1

Total Repeats: 55574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55501	NC_016613	TGG	2	6	3473055	3473060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375267100
55502	NC_016613	CATA	2	8	3473062	3473069	50 %	25 %	0 %	25 %	375267100
55503	NC_016613	CA	3	6	3473083	3473088	50 %	0 %	0 %	50 %	375267100
55504	NC_016613	TAG	2	6	3473249	3473254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375267101
55505	NC_016613	GAT	2	6	3473300	3473305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375267101
55506	NC_016613	TGC	2	6	3473348	3473353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267101
55507	NC_016613	ACC	2	6	3473369	3473374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375267101
55508	NC_016613	CGA	2	6	3473416	3473421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375267101
55509	NC_016613	CAT	2	6	3473569	3473574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375267102
55510	NC_016613	TAA	2	6	3473595	3473600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	375267102
55511	NC_016613	CCAT	2	8	3473634	3473641	25 %	25 %	0 %	50 %	375267102
55512	NC_016613	GAAT	2	8	3473673	3473680	50 %	25 %	25 %	0 %	375267102
55513	NC_016613	ATC	2	6	3473777	3473782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375267102
55514	NC_016613	ATC	2	6	3473858	3473863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375267102
55515	NC_016613	AGCCAT	2	12	3473881	3473892	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375267102
55516	NC_016613	CAG	2	6	3473907	3473912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375267102
55517	NC_016613	TAAGG	2	10	3473925	3473934	40 %	20 %	40 %	0 %	375267102
55518	NC_016613	CTG	2	6	3473952	3473957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267102
55519	NC_016613	AAG	2	6	3473966	3473971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375267102
55520	NC_016613	TCA	2	6	3473997	3474002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375267102
55521	NC_016613	CAA	2	6	3474011	3474016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375267102
55522	NC_016613	TGT	2	6	3474139	3474144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375267102
55523	NC_016613	A	6	6	3474162	3474167	100 %	0 %	0 %	0 %	375267102
55524	NC_016613	A	7	7	3474198	3474204	100 %	0 %	0 %	0 %	375267102
55525	NC_016613	TCC	2	6	3474239	3474244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	375267102
55526	NC_016613	GGT	2	6	3474282	3474287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	375267102
55527	NC_016613	T	6	6	3474345	3474350	0 %	100 %	0 %	0 %	375267103
55528	NC_016613	GTT	2	6	3474351	3474356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	375267103
55529	NC_016613	TGA	2	6	3474470	3474475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375267103
55530	NC_016613	AGG	2	6	3474503	3474508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	375267103
55531	NC_016613	CCA	2	6	3474592	3474597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	375267103
55532	NC_016613	TCA	2	6	3474964	3474969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	375267104
55533	NC_016613	GAAC	2	8	3475003	3475010	50 %	0 %	25 %	25 %	375267104
55534	NC_016613	TCT	2	6	3475072	3475077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375267104
55535	NC_016613	T	6	6	3475114	3475119	0 %	100 %	0 %	0 %	375267104
55536	NC_016613	TTTG	3	12	3475148	3475159	0 %	75 %	25 %	0 %	375267104
55537	NC_016613	TGC	2	6	3475183	3475188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267104
55538	NC_016613	T	6	6	3475233	3475238	0 %	100 %	0 %	0 %	375267104
55539	NC_016613	TCAAGC	2	12	3475261	3475272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	375267104
55540	NC_016613	AAGT	2	8	3475284	3475291	50 %	25 %	25 %	0 %	375267104
55541	NC_016613	CGT	2	6	3475299	3475304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267104
55542	NC_016613	CTG	2	6	3475332	3475337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267104
55543	NC_016613	TCAA	2	8	3475420	3475427	50 %	25 %	0 %	25 %	375267104
55544	NC_016613	TCT	2	6	3475450	3475455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375267104
55545	NC_016613	TGCT	2	8	3475491	3475498	0 %	50 %	25 %	25 %	375267104
55546	NC_016613	AGC	2	6	3475500	3475505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	375267104
55547	NC_016613	GC	3	6	3475504	3475509	0 %	0 %	50 %	50 %	375267104
55548	NC_016613	CGT	2	6	3475513	3475518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267104
55549	NC_016613	ATG	2	6	3475576	3475581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	375267104
55550	NC_016613	ATTGA	2	10	3475589	3475598	40 %	40 %	20 %	0 %	375267104
55551	NC_016613	GCC	2	6	3475600	3475605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375267104
55552	NC_016613	TTC	2	6	3475608	3475613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375267104
55553	NC_016613	CTG	2	6	3475697	3475702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267104
55554	NC_016613	GGCTT	2	10	3475707	3475716	0 %	40 %	40 %	20 %	375267104
55555	NC_016613	ACA	2	6	3475760	3475765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	375267104
55556	NC_016613	TTC	2	6	3475839	3475844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375267105
55557	NC_016613	GCG	2	6	3475845	3475850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	375267105
55558	NC_016613	CCG	2	6	3476090	3476095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	375267105
55559	NC_016613	CATTG	2	10	3476152	3476161	20 %	40 %	20 %	20 %	375267105
55560	NC_016613	AAG	2	6	3476202	3476207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	375267105
55561	NC_016613	CG	4	8	3476288	3476295	0 %	0 %	50 %	50 %	375267105
55562	NC_016613	CTG	2	6	3476318	3476323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267105
55563	NC_016613	TGC	2	6	3476340	3476345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	375267105
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55572	NC_016613	TTC	2	6	3476893	3476898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	375267106
55573	NC_016613	GT	3	6	3476906	3476911	0 %	50 %	50 %	0 %	375267106
55574	NC_016613	CAAT	2	8	3477212	3477219	50 %	25 %	0 %	25 %	375267106

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.