MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 16880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_016446	ATG	2	6	179690	179695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037445
2503	NC_016446	TC	3	6	179934	179939	0 %	50 %	0 %	50 %	360037446
2504	NC_016446	GGAT	2	8	179950	179957	25 %	25 %	50 %	0 %	360037446
2505	NC_016446	TTA	2	6	180055	180060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037446
2506	NC_016446	TCAT	2	8	180095	180102	25 %	50 %	0 %	25 %	360037446
2507	NC_016446	TGC	3	9	180237	180245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037446
2508	NC_016446	GGT	2	6	180283	180288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037446
2509	NC_016446	GT	3	6	180287	180292	0 %	50 %	50 %	0 %	360037446
2510	NC_016446	TGA	2	6	180302	180307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037446
2511	NC_016446	TGA	2	6	180648	180653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037447
2512	NC_016446	GCCAAA	2	12	180725	180736	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	360037447
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2514	NC_016446	T	6	6	180775	180780	0 %	100 %	0 %	0 %	360037447
2515	NC_016446	GGT	2	6	180792	180797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037447
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2521	NC_016446	CAG	2	6	181133	181138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037447
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2523	NC_016446	CTGCG	2	10	181211	181220	0 %	20 %	40 %	40 %	360037447
2524	NC_016446	ACG	2	6	181261	181266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037447
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2529	NC_016446	CAG	2	6	181480	181485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037447
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2534	NC_016446	CTG	2	6	181646	181651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037447
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2538	NC_016446	T	6	6	181929	181934	0 %	100 %	0 %	0 %	360037447
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2548	NC_016446	CAGC	2	8	182540	182547	25 %	0 %	25 %	50 %	360037448
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2554	NC_016446	TTG	2	6	182906	182911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037448
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2557	NC_016446	TAC	2	6	183270	183275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037448
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2559	NC_016446	GATT	2	8	183388	183395	25 %	50 %	25 %	0 %	360037448
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2562	NC_016446	TGTT	2	8	183459	183466	0 %	75 %	25 %	0 %	360037448
2563	NC_016446	TGA	2	6	183517	183522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037448
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2588	NC_016446	GC	3	6	185167	185172	0 %	0 %	50 %	50 %	360037449
2589	NC_016446	GC	3	6	185280	185285	0 %	0 %	50 %	50 %	360037449
2590	NC_016446	TCG	2	6	185330	185335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037449
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2593	NC_016446	GATGT	2	10	185445	185454	20 %	40 %	40 %	0 %	360037449
2594	NC_016446	GATTC	2	10	185463	185472	20 %	40 %	20 %	20 %	360037449
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2602	NC_016446	GATT	2	8	186160	186167	25 %	50 %	25 %	0 %	360037450
2603	NC_016446	CAC	2	6	186202	186207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037450
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2606	NC_016446	ATG	2	6	186444	186449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037451
2607	NC_016446	ACCTT	2	10	186468	186477	20 %	40 %	0 %	40 %	360037451
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2620	NC_016446	ACCAA	2	10	187401	187410	60 %	0 %	0 %	40 %	360037452
2621	NC_016446	GCC	2	6	187589	187594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037452
2622	NC_016446	T	6	6	187605	187610	0 %	100 %	0 %	0 %	360037452
2623	NC_016446	ATCT	2	8	187706	187713	25 %	50 %	0 %	25 %	360037452
2624	NC_016446	TGG	2	6	187726	187731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037452
2625	NC_016446	GTG	2	6	187775	187780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037452
2626	NC_016446	TTG	2	6	187820	187825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037452
2627	NC_016446	TG	3	6	187991	187996	0 %	50 %	50 %	0 %	360037452
2628	NC_016446	TGG	2	6	188008	188013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037452
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2630	NC_016446	CAT	3	9	188191	188199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037452
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2635	NC_016446	GCG	2	6	188819	188824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037454
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2648	NC_016446	TACGT	2	10	189299	189308	20 %	40 %	20 %	20 %	360037454
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2661	NC_016446	TTG	2	6	190095	190100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037454
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2669	NC_016446	AAATC	2	10	190578	190587	60 %	20 %	0 %	20 %	360037454
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2671	NC_016446	GAC	2	6	190877	190882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037454
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2687	NC_016446	GCA	2	6	191830	191835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037455
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2726	NC_016446	TTA	2	6	194593	194598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037458
2727	NC_016446	TTAT	2	8	194735	194742	25 %	75 %	0 %	0 %	360037458
2728	NC_016446	GAA	2	6	194788	194793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037458
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2730	NC_016446	T	6	6	194860	194865	0 %	100 %	0 %	0 %	360037458
2731	NC_016446	AACA	2	8	194882	194889	75 %	0 %	0 %	25 %	360037458
2732	NC_016446	TGA	2	6	194925	194930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037458
2733	NC_016446	GT	3	6	194997	195002	0 %	50 %	50 %	0 %	360037458
2734	NC_016446	TGG	2	6	195042	195047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037458
2735	NC_016446	AGA	2	6	195084	195089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037458
2736	NC_016446	GCA	2	6	195093	195098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037458
2737	NC_016446	A	7	7	195131	195137	100 %	0 %	0 %	0 %	360037458
2738	NC_016446	CT	3	6	195159	195164	0 %	50 %	0 %	50 %	360037458
2739	NC_016446	TCAC	2	8	195166	195173	25 %	25 %	0 %	50 %	360037458
2740	NC_016446	GCA	2	6	195691	195696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037459
2741	NC_016446	GCG	2	6	195697	195702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037459
2742	NC_016446	TGG	2	6	195738	195743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037459
2743	NC_016446	TGCG	2	8	195795	195802	0 %	25 %	50 %	25 %	360037459
2744	NC_016446	GGT	2	6	195865	195870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037459
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2986	NC_016446	ATTT	2	8	212192	212199	25 %	75 %	0 %	0 %	360037475
2987	NC_016446	GCT	2	6	212322	212327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037475
2988	NC_016446	GGT	2	6	212367	212372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037475
2989	NC_016446	GAA	2	6	212386	212391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360037475
2990	NC_016446	GAT	2	6	212418	212423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037475
2991	NC_016446	CAT	2	6	212432	212437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037475
2992	NC_016446	GCG	2	6	212499	212504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037475
2993	NC_016446	GTG	2	6	212536	212541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037475
2994	NC_016446	ATT	2	6	212553	212558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037475
2995	NC_016446	TGG	3	9	212564	212572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037475
2996	NC_016446	ATT	2	6	212597	212602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037475
2997	NC_016446	CA	3	6	212680	212685	50 %	0 %	0 %	50 %	360037475
2998	NC_016446	ATC	2	6	212716	212721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037475
2999	NC_016446	TTG	2	6	212748	212753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360037475
3000	NC_016446	CTGGT	2	10	212888	212897	0 %	40 %	40 %	20 %	360037475

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