MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48004	NC_016445	GCC	2	6	2847294	2847299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037036
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48116	NC_016445	GCA	2	6	2854080	2854085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037042
48117	NC_016445	A	6	6	2854222	2854227	100 %	0 %	0 %	0 %	360037042
48118	NC_016445	ATCA	2	8	2854264	2854271	50 %	25 %	0 %	25 %	360037042
48119	NC_016445	TCAA	2	8	2854322	2854329	50 %	25 %	0 %	25 %	360037042
48120	NC_016445	CAT	2	6	2854330	2854335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037042
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48123	NC_016445	TGG	2	6	2854562	2854567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037043
48124	NC_016445	CGT	2	6	2854603	2854608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037043
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48130	NC_016445	CGG	2	6	2855044	2855049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037043
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48230	NC_016445	GTGG	2	8	2860498	2860505	0 %	25 %	75 %	0 %	360037048
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48345	NC_016445	GT	4	8	2866671	2866678	0 %	50 %	50 %	0 %	360037053
48346	NC_016445	CGT	2	6	2866704	2866709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037053
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48349	NC_016445	TGAT	2	8	2866825	2866832	25 %	50 %	25 %	0 %	360037053
48350	NC_016445	GGT	3	9	2866836	2866844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037053
48351	NC_016445	ACG	2	6	2866845	2866850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037053
48352	NC_016445	CTT	2	6	2866888	2866893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360037053
48353	NC_016445	GGT	2	6	2866905	2866910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037053
48354	NC_016445	TGA	2	6	2866919	2866924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037053
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48356	NC_016445	CCA	2	6	2867172	2867177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360037053
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48360	NC_016445	GGT	2	6	2867322	2867327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037053
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48365	NC_016445	GCTG	2	8	2867515	2867522	0 %	25 %	50 %	25 %	360037054
48366	NC_016445	CG	3	6	2867604	2867609	0 %	0 %	50 %	50 %	360037054
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48376	NC_016445	TGGG	2	8	2868111	2868118	0 %	25 %	75 %	0 %	360037054
48377	NC_016445	GTA	2	6	2868206	2868211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037054
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48383	NC_016445	ATC	3	9	2868561	2868569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037055
48384	NC_016445	GCA	2	6	2868617	2868622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360037055
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48404	NC_016445	GCGCA	2	10	2870034	2870043	20 %	0 %	40 %	40 %	360037057
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48422	NC_016445	CTG	2	6	2871168	2871173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037058
48423	NC_016445	CTGG	2	8	2871251	2871258	0 %	25 %	50 %	25 %	360037058
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48431	NC_016445	CACT	2	8	2871807	2871814	25 %	25 %	0 %	50 %	360037058
48432	NC_016445	TGA	3	9	2871827	2871835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037058
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48435	NC_016445	CAT	2	6	2872051	2872056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037058
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48438	NC_016445	TCTGG	2	10	2872229	2872238	0 %	40 %	40 %	20 %	360037058
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48440	NC_016445	GAT	2	6	2872335	2872340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037058
48441	NC_016445	TC	3	6	2872445	2872450	0 %	50 %	0 %	50 %	360037058
48442	NC_016445	GGTT	2	8	2872553	2872560	0 %	50 %	50 %	0 %	360037058
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48446	NC_016445	ATTCC	2	10	2872878	2872887	20 %	40 %	0 %	40 %	360037058
48447	NC_016445	CCG	2	6	2872956	2872961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360037058
48448	NC_016445	TCGA	2	8	2873055	2873062	25 %	25 %	25 %	25 %	360037058
48449	NC_016445	ATG	2	6	2873218	2873223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037058
48450	NC_016445	TTAC	2	8	2873230	2873237	25 %	50 %	0 %	25 %	360037058
48451	NC_016445	AG	3	6	2873270	2873275	50 %	0 %	50 %	0 %	360037058
48452	NC_016445	A	6	6	2873295	2873300	100 %	0 %	0 %	0 %	360037058
48453	NC_016445	CG	3	6	2873360	2873365	0 %	0 %	50 %	50 %	360037058
48454	NC_016445	GCAA	2	8	2873378	2873385	50 %	0 %	25 %	25 %	360037058
48455	NC_016445	GATT	2	8	2873399	2873406	25 %	50 %	25 %	0 %	360037058
48456	NC_016445	GGGCA	2	10	2873451	2873460	20 %	0 %	60 %	20 %	360037058
48457	NC_016445	GTG	2	6	2873478	2873483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037058
48458	NC_016445	CAT	2	6	2873487	2873492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037058
48459	NC_016445	GAT	2	6	2873523	2873528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037058
48460	NC_016445	TGAA	2	8	2873542	2873549	50 %	25 %	25 %	0 %	360037058
48461	NC_016445	GCG	2	6	2873628	2873633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037058
48462	NC_016445	GCG	2	6	2873687	2873692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037058
48463	NC_016445	GGCT	2	8	2873703	2873710	0 %	25 %	50 %	25 %	360037058
48464	NC_016445	GCCAA	2	10	2873740	2873749	40 %	0 %	20 %	40 %	360037058
48465	NC_016445	GCCAA	2	10	2873956	2873965	40 %	0 %	20 %	40 %	360037058
48466	NC_016445	GCT	2	6	2873993	2873998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037058
48467	NC_016445	ACCA	2	8	2874027	2874034	50 %	0 %	0 %	50 %	360037058
48468	NC_016445	AAC	2	6	2874111	2874116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037058
48469	NC_016445	GCAAG	2	10	2874230	2874239	40 %	0 %	40 %	20 %	360037058
48470	NC_016445	GGC	2	6	2874284	2874289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360037058
48471	NC_016445	GTG	2	6	2874394	2874399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037058
48472	NC_016445	GA	3	6	2874454	2874459	50 %	0 %	50 %	0 %	360037058
48473	NC_016445	TC	3	6	2874610	2874615	0 %	50 %	0 %	50 %	360037058
48474	NC_016445	ACTG	2	8	2874734	2874741	25 %	25 %	25 %	25 %	360037058
48475	NC_016445	CTG	2	6	2874884	2874889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037059
48476	NC_016445	CAA	2	6	2874914	2874919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037059
48477	NC_016445	TAC	2	6	2875030	2875035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037059
48478	NC_016445	TCGATG	2	12	2875098	2875109	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	360037059
48479	NC_016445	GGT	2	6	2875165	2875170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037059
48480	NC_016445	TTA	2	6	2875325	2875330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360037059
48481	NC_016445	GA	3	6	2875401	2875406	50 %	0 %	50 %	0 %	360037059
48482	NC_016445	AAAGT	2	10	2875473	2875482	60 %	20 %	20 %	0 %	360037059
48483	NC_016445	AC	4	8	2875572	2875579	50 %	0 %	0 %	50 %	360037059
48484	NC_016445	TGA	2	6	2875580	2875585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360037059
48485	NC_016445	CTG	2	6	2875609	2875614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037060
48486	NC_016445	GATT	2	8	2875677	2875684	25 %	50 %	25 %	0 %	360037060
48487	NC_016445	ATTT	2	8	2875693	2875700	25 %	75 %	0 %	0 %	360037060
48488	NC_016445	CAT	2	6	2875740	2875745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360037060
48489	NC_016445	ATTG	2	8	2875765	2875772	25 %	50 %	25 %	0 %	360037060
48490	NC_016445	GC	3	6	2875785	2875790	0 %	0 %	50 %	50 %	360037060
48491	NC_016445	GTG	2	6	2875796	2875801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037060
48492	NC_016445	A	6	6	2875802	2875807	100 %	0 %	0 %	0 %	360037060
48493	NC_016445	CAA	2	6	2875882	2875887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037060
48494	NC_016445	GC	4	8	2875917	2875924	0 %	0 %	50 %	50 %	360037060
48495	NC_016445	GC	3	6	2875943	2875948	0 %	0 %	50 %	50 %	360037060
48496	NC_016445	A	6	6	2875979	2875984	100 %	0 %	0 %	0 %	360037060
48497	NC_016445	CTG	2	6	2875990	2875995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360037060
48498	NC_016445	AAC	2	6	2875997	2876002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360037060
48499	NC_016445	GTCA	2	8	2876046	2876053	25 %	25 %	25 %	25 %	360037060
48500	NC_016445	GTG	2	6	2876060	2876065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360037060

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