MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_016445	CCG	2	6	207642	207647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034592
3502	NC_016445	CTGAT	2	10	207666	207675	20 %	40 %	20 %	20 %	360034592
3503	NC_016445	TGG	2	6	207719	207724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034592
3504	NC_016445	ACTC	2	8	207818	207825	25 %	25 %	0 %	50 %	360034592
3505	NC_016445	ATC	2	6	207913	207918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034592
3506	NC_016445	AAG	2	6	207960	207965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034592
3507	NC_016445	ATCG	2	8	208015	208022	25 %	25 %	25 %	25 %	360034592
3508	NC_016445	CAA	2	6	208051	208056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034592
3509	NC_016445	CGT	2	6	208157	208162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034592
3510	NC_016445	TCT	2	6	208182	208187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034592
3511	NC_016445	CAACC	2	10	208207	208216	40 %	0 %	0 %	60 %	360034592
3512	NC_016445	CAT	2	6	208222	208227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034592
3513	NC_016445	TGG	2	6	208242	208247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034592
3514	NC_016445	GTCG	2	8	208265	208272	0 %	25 %	50 %	25 %	360034592
3515	NC_016445	CAA	2	6	208286	208291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034592
3516	NC_016445	TGA	2	6	208344	208349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034592
3517	NC_016445	TCTA	2	8	208377	208384	25 %	50 %	0 %	25 %	360034592
3518	NC_016445	GTG	2	6	208419	208424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034592
3519	NC_016445	TTC	2	6	208457	208462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034592
3520	NC_016445	TGA	2	6	208513	208518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034592
3521	NC_016445	GCA	2	6	208540	208545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034592
3522	NC_016445	GTTTG	2	10	208603	208612	0 %	60 %	40 %	0 %	360034592
3523	NC_016445	CAA	2	6	208675	208680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034592
3524	NC_016445	CTG	2	6	208682	208687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034592
3525	NC_016445	GGT	2	6	208715	208720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034592
3526	NC_016445	TGA	2	6	208750	208755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034592
3527	NC_016445	TGC	2	6	208803	208808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034592
3528	NC_016445	GTG	2	6	208823	208828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034592
3529	NC_016445	TTGT	2	8	208880	208887	0 %	75 %	25 %	0 %	360034592
3530	NC_016445	CAC	2	6	208931	208936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034592
3531	NC_016445	CAC	2	6	208966	208971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034592
3532	NC_016445	CAT	2	6	209044	209049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034593
3533	NC_016445	GCTG	2	8	209088	209095	0 %	25 %	50 %	25 %	360034593
3534	NC_016445	TGGC	2	8	209096	209103	0 %	25 %	50 %	25 %	360034593
3535	NC_016445	TGC	2	6	209187	209192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034593
3536	NC_016445	CTTT	2	8	209193	209200	0 %	75 %	0 %	25 %	360034593
3537	NC_016445	CTG	2	6	209204	209209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034593
3538	NC_016445	CGT	2	6	209324	209329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034593
3539	NC_016445	GAT	2	6	209509	209514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034593
3540	NC_016445	AGTC	2	8	209552	209559	25 %	25 %	25 %	25 %	360034593
3541	NC_016445	A	6	6	209900	209905	100 %	0 %	0 %	0 %	360034594
3542	NC_016445	GCG	2	6	209918	209923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034594
3543	NC_016445	GC	3	6	209937	209942	0 %	0 %	50 %	50 %	360034594
3544	NC_016445	TGG	2	6	209986	209991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034594
3545	NC_016445	ATC	2	6	210059	210064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034594
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3547	NC_016445	CG	3	6	210255	210260	0 %	0 %	50 %	50 %	360034595
3548	NC_016445	TTG	2	6	210268	210273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034595
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3550	NC_016445	GTG	2	6	210321	210326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034595
3551	NC_016445	AGC	2	6	210355	210360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034595
3552	NC_016445	TTG	2	6	210373	210378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034595
3553	NC_016445	CGA	2	6	210398	210403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034595
3554	NC_016445	T	6	6	210415	210420	0 %	100 %	0 %	0 %	360034595
3555	NC_016445	AAG	2	6	210451	210456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034595
3556	NC_016445	GTG	2	6	210552	210557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034595
3557	NC_016445	GGC	2	6	210621	210626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034595
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3559	NC_016445	CGG	2	6	210733	210738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034595
3560	NC_016445	TGAT	2	8	210742	210749	25 %	50 %	25 %	0 %	360034595
3561	NC_016445	TGG	4	12	210862	210873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034595
3562	NC_016445	ACTCG	2	10	210892	210901	20 %	20 %	20 %	40 %	360034595
3563	NC_016445	TTGA	2	8	210942	210949	25 %	50 %	25 %	0 %	360034595
3564	NC_016445	AGA	2	6	211025	211030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034595
3565	NC_016445	AGA	2	6	211082	211087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034595
3566	NC_016445	ATGG	2	8	211188	211195	25 %	25 %	50 %	0 %	360034596
3567	NC_016445	A	7	7	211231	211237	100 %	0 %	0 %	0 %	360034596
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3570	NC_016445	AC	3	6	211474	211479	50 %	0 %	0 %	50 %	360034597
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3575	NC_016445	GAACG	2	10	211730	211739	40 %	0 %	40 %	20 %	360034597
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3578	NC_016445	AC	3	6	211800	211805	50 %	0 %	0 %	50 %	360034597
3579	NC_016445	CAG	2	6	211807	211812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034597
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3581	NC_016445	CAGA	2	8	211866	211873	50 %	0 %	25 %	25 %	360034597
3582	NC_016445	GAA	2	6	211888	211893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034597
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3588	NC_016445	TGA	2	6	212049	212054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034597
3589	NC_016445	AGA	2	6	212140	212145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034597
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3591	NC_016445	AACC	2	8	212166	212173	50 %	0 %	0 %	50 %	360034597
3592	NC_016445	GAT	2	6	212218	212223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034597
3593	NC_016445	GAT	2	6	212266	212271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034597
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3597	NC_016445	ACACC	2	10	212355	212364	40 %	0 %	0 %	60 %	360034597
3598	NC_016445	AGC	2	6	212372	212377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034597
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3600	NC_016445	CAC	2	6	212454	212459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034597
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3603	NC_016445	CCGT	2	8	212654	212661	0 %	25 %	25 %	50 %	360034597
3604	NC_016445	TAAA	2	8	212726	212733	75 %	25 %	0 %	0 %	360034597
3605	NC_016445	A	6	6	213034	213039	100 %	0 %	0 %	0 %	360034598
3606	NC_016445	TGC	2	6	213062	213067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034598
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3608	NC_016445	CAAT	2	8	213363	213370	50 %	25 %	0 %	25 %	360034598
3609	NC_016445	ATG	2	6	213388	213393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034599
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3611	NC_016445	TTTG	2	8	213600	213607	0 %	75 %	25 %	0 %	360034599
3612	NC_016445	TGC	2	6	213803	213808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034599
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3617	NC_016445	TGACAG	2	12	214118	214129	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360034599
3618	NC_016445	TGGC	2	8	214141	214148	0 %	25 %	50 %	25 %	360034599
3619	NC_016445	CGCGG	2	10	214236	214245	0 %	0 %	60 %	40 %	360034599
3620	NC_016445	CTG	2	6	214309	214314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034599
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3622	NC_016445	CG	3	6	214397	214402	0 %	0 %	50 %	50 %	360034599
3623	NC_016445	TCTCT	2	10	214421	214430	0 %	60 %	0 %	40 %	360034599
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3739	NC_016445	TAC	2	6	221329	221334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034605
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3857	NC_016445	TGTT	2	8	228996	229003	0 %	75 %	25 %	0 %	360034612
3858	NC_016445	A	6	6	229023	229028	100 %	0 %	0 %	0 %	360034612
3859	NC_016445	ATC	2	6	229100	229105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034612
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3862	NC_016445	GCA	2	6	229450	229455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034612
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3986	NC_016445	CAA	2	6	236867	236872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034619
3987	NC_016445	TGGC	2	8	236879	236886	0 %	25 %	50 %	25 %	360034619
3988	NC_016445	CCG	2	6	236992	236997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034619
3989	NC_016445	ATC	2	6	237244	237249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034620
3990	NC_016445	AT	3	6	237251	237256	50 %	50 %	0 %	0 %	360034620
3991	NC_016445	TGG	2	6	237274	237279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034620
3992	NC_016445	CTG	2	6	237282	237287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034620
3993	NC_016445	TGG	2	6	237401	237406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034620
3994	NC_016445	CT	3	6	237417	237422	0 %	50 %	0 %	50 %	360034620
3995	NC_016445	TG	3	6	237448	237453	0 %	50 %	50 %	0 %	360034620
3996	NC_016445	ATCT	2	8	237498	237505	25 %	50 %	0 %	25 %	360034620
3997	NC_016445	TGC	2	6	237509	237514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034620
3998	NC_016445	A	6	6	237570	237575	100 %	0 %	0 %	0 %	360034620
3999	NC_016445	AGA	2	6	237592	237597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034620
4000	NC_016445	GTG	2	6	237601	237606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034620

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