MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_016445	ATGA	2	8	144823	144830	50 %	25 %	25 %	0 %	360034529
2502	NC_016445	CAC	2	6	144839	144844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034529
2503	NC_016445	AGC	2	6	144861	144866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2504	NC_016445	CGA	2	6	144875	144880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2505	NC_016445	CAAC	2	8	144923	144930	50 %	0 %	0 %	50 %	360034529
2506	NC_016445	GGT	2	6	144939	144944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034529
2507	NC_016445	TGGC	2	8	144989	144996	0 %	25 %	50 %	25 %	360034529
2508	NC_016445	AGTG	2	8	145023	145030	25 %	25 %	50 %	0 %	360034529
2509	NC_016445	GAT	2	6	145033	145038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034529
2510	NC_016445	TCCT	2	8	145089	145096	0 %	50 %	0 %	50 %	360034529
2511	NC_016445	GTC	2	6	145107	145112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2512	NC_016445	AGT	2	6	145222	145227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034529
2513	NC_016445	CTG	2	6	145349	145354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2514	NC_016445	CAA	2	6	145363	145368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034529
2515	NC_016445	CACAG	2	10	145421	145430	40 %	0 %	20 %	40 %	360034529
2516	NC_016445	CAA	2	6	145551	145556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034529
2517	NC_016445	TTGG	2	8	145621	145628	0 %	50 %	50 %	0 %	360034529
2518	NC_016445	ATT	2	6	145657	145662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034529
2519	NC_016445	AGG	2	6	145679	145684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034529
2520	NC_016445	CCT	2	6	145781	145786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034529
2521	NC_016445	GTT	2	6	145819	145824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034529
2522	NC_016445	ATCA	2	8	145826	145833	50 %	25 %	0 %	25 %	360034529
2523	NC_016445	GCAGTG	2	12	145887	145898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360034529
2524	NC_016445	CGG	2	6	145976	145981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034529
2525	NC_016445	TAA	2	6	146148	146153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034529
2526	NC_016445	ACC	2	6	146167	146172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034529
2527	NC_016445	TCAA	2	8	146386	146393	50 %	25 %	0 %	25 %	360034529
2528	NC_016445	GCG	2	6	146431	146436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034529
2529	NC_016445	A	6	6	146527	146532	100 %	0 %	0 %	0 %	360034529
2530	NC_016445	GGC	2	6	146539	146544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034529
2531	NC_016445	GAT	2	6	146598	146603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034529
2532	NC_016445	CGT	2	6	146648	146653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2533	NC_016445	CTAT	2	8	146657	146664	25 %	50 %	0 %	25 %	360034529
2534	NC_016445	CT	3	6	146742	146747	0 %	50 %	0 %	50 %	360034529
2535	NC_016445	GCT	2	6	146770	146775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2536	NC_016445	GGAGC	2	10	146782	146791	20 %	0 %	60 %	20 %	360034529
2537	NC_016445	CAA	2	6	146823	146828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034529
2538	NC_016445	TGG	2	6	146892	146897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034529
2539	NC_016445	GGT	2	6	146926	146931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034529
2540	NC_016445	TA	3	6	147088	147093	50 %	50 %	0 %	0 %	360034529
2541	NC_016445	TGC	2	6	147151	147156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034529
2542	NC_016445	CGC	2	6	147164	147169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034529
2543	NC_016445	TGGA	2	8	147395	147402	25 %	25 %	50 %	0 %	360034529
2544	NC_016445	AGG	2	6	147470	147475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034529
2545	NC_016445	GAA	2	6	147481	147486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034529
2546	NC_016445	AAT	2	6	147496	147501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034529
2547	NC_016445	GT	3	6	147688	147693	0 %	50 %	50 %	0 %	360034530
2548	NC_016445	AAG	2	6	147739	147744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034530
2549	NC_016445	CT	3	6	147858	147863	0 %	50 %	0 %	50 %	360034530
2550	NC_016445	TATCA	2	10	147874	147883	40 %	40 %	0 %	20 %	360034530
2551	NC_016445	TACT	2	8	147899	147906	25 %	50 %	0 %	25 %	360034530
2552	NC_016445	ATG	2	6	147910	147915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034530
2553	NC_016445	CGT	2	6	147947	147952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034530
2554	NC_016445	GAG	2	6	147953	147958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034530
2555	NC_016445	AGT	2	6	147994	147999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034530
2556	NC_016445	TGC	2	6	148000	148005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034530
2557	NC_016445	TG	3	6	148047	148052	0 %	50 %	50 %	0 %	360034530
2558	NC_016445	CT	3	6	148090	148095	0 %	50 %	0 %	50 %	360034530
2559	NC_016445	TTC	2	6	148104	148109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034530
2560	NC_016445	TGA	2	6	148118	148123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034530
2561	NC_016445	TTC	2	6	148138	148143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034530
2562	NC_016445	TCA	3	9	148223	148231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034530
2563	NC_016445	ATC	2	6	148246	148251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034530
2564	NC_016445	CAG	2	6	148291	148296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034530
2565	NC_016445	GATA	2	8	148297	148304	50 %	25 %	25 %	0 %	360034530
2566	NC_016445	TTG	2	6	148359	148364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034530
2567	NC_016445	CAT	2	6	148443	148448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034530
2568	NC_016445	CAA	2	6	148476	148481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034530
2569	NC_016445	CAA	2	6	148497	148502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034530
2570	NC_016445	CGA	2	6	148542	148547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034530
2571	NC_016445	T	6	6	148549	148554	0 %	100 %	0 %	0 %	360034530
2572	NC_016445	ACT	2	6	148589	148594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034530
2573	NC_016445	GCTTCA	2	12	148601	148612	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	360034530
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2581	NC_016445	GTC	2	6	148903	148908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034530
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2583	NC_016445	TG	3	6	149090	149095	0 %	50 %	50 %	0 %	360034530
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2587	NC_016445	GTC	2	6	149397	149402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034531
2588	NC_016445	TGT	2	6	149450	149455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034531
2589	NC_016445	GAT	2	6	149456	149461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034531
2590	NC_016445	T	6	6	149470	149475	0 %	100 %	0 %	0 %	360034531
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2599	NC_016445	GCAG	2	8	150158	150165	25 %	0 %	50 %	25 %	360034532
2600	NC_016445	TGA	2	6	150167	150172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034532
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2606	NC_016445	CT	3	6	150325	150330	0 %	50 %	0 %	50 %	360034532
2607	NC_016445	CCA	2	6	150383	150388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034532
2608	NC_016445	GTAA	2	8	150389	150396	50 %	25 %	25 %	0 %	360034532
2609	NC_016445	GCC	2	6	150398	150403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034532
2610	NC_016445	AC	3	6	150446	150451	50 %	0 %	0 %	50 %	360034532
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2621	NC_016445	CCA	2	6	151117	151122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034532
2622	NC_016445	CTG	3	9	151209	151217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034532
2623	NC_016445	TTC	2	6	151435	151440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034532
2624	NC_016445	CAA	2	6	151644	151649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034533
2625	NC_016445	GCTT	2	8	151655	151662	0 %	50 %	25 %	25 %	360034533
2626	NC_016445	ACAG	2	8	151740	151747	50 %	0 %	25 %	25 %	360034533
2627	NC_016445	TGC	2	6	151761	151766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034533
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2652	NC_016445	TGG	2	6	153088	153093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034534
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2729	NC_016445	ATC	2	6	159014	159019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034542
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2732	NC_016445	GCT	2	6	159156	159161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034542
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2734	NC_016445	TGA	2	6	159186	159191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034542
2735	NC_016445	AATCA	2	10	159253	159262	60 %	20 %	0 %	20 %	360034542
2736	NC_016445	GAT	2	6	159301	159306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034542
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2738	NC_016445	ACC	2	6	159351	159356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034542
2739	NC_016445	TCG	2	6	159517	159522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034542
2740	NC_016445	A	7	7	159713	159719	100 %	0 %	0 %	0 %	360034543
2741	NC_016445	A	7	7	159792	159798	100 %	0 %	0 %	0 %	360034543
2742	NC_016445	AAGA	2	8	159837	159844	75 %	0 %	25 %	0 %	360034543
2743	NC_016445	AGCGC	2	10	159845	159854	20 %	0 %	40 %	40 %	360034543
2744	NC_016445	TG	3	6	159856	159861	0 %	50 %	50 %	0 %	360034543
2745	NC_016445	GTT	2	6	159971	159976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034543
2746	NC_016445	AAC	2	6	160075	160080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034543
2747	NC_016445	AC	3	6	160163	160168	50 %	0 %	0 %	50 %	360034543
2748	NC_016445	AATCA	2	10	160230	160239	60 %	20 %	0 %	20 %	360034543
2749	NC_016445	TCCT	2	8	160293	160300	0 %	50 %	0 %	50 %	360034543
2750	NC_016445	ATC	2	6	160303	160308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034543
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2752	NC_016445	GACA	2	8	160373	160380	50 %	0 %	25 %	25 %	360034543
2753	NC_016445	CAAC	2	8	160545	160552	50 %	0 %	0 %	50 %	360034543
2754	NC_016445	CCAT	2	8	160673	160680	25 %	25 %	0 %	50 %	360034544
2755	NC_016445	GTG	2	6	160718	160723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034544
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2769	NC_016445	TG	3	6	161537	161542	0 %	50 %	50 %	0 %	360034545
2770	NC_016445	AGCCTG	2	12	161552	161563	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	360034545
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2777	NC_016445	TGA	2	6	161826	161831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034545
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2833	NC_016445	A	7	7	165598	165604	100 %	0 %	0 %	0 %	360034549
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2845	NC_016445	TGA	2	6	166211	166216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034550
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2861	NC_016445	CTTT	2	8	166983	166990	0 %	75 %	0 %	25 %	360034551
2862	NC_016445	GATCA	2	10	167003	167012	40 %	20 %	20 %	20 %	360034551
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2986	NC_016445	TTC	2	6	175923	175928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034558
2987	NC_016445	GCA	2	6	175974	175979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034558
2988	NC_016445	AGCA	2	8	176026	176033	50 %	0 %	25 %	25 %	360034558
2989	NC_016445	AGC	2	6	176108	176113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034558
2990	NC_016445	ATG	2	6	176158	176163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034558
2991	NC_016445	GAT	2	6	176292	176297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034558
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2993	NC_016445	GAA	2	6	176517	176522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034558
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2999	NC_016445	AAAT	2	8	176795	176802	75 %	25 %	0 %	0 %	360034559
3000	NC_016445	GTG	2	6	176889	176894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034559

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