MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22619	NC_016445	CG	3	6	1331521	1331526	0 %	0 %	50 %	50 %	360035613
22620	NC_016445	GCG	2	6	1331602	1331607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035613
22621	NC_016445	CGG	2	6	1331639	1331644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035613
22622	NC_016445	ACGAT	2	10	1331657	1331666	40 %	20 %	20 %	20 %	360035613
22623	NC_016445	TGA	2	6	1331678	1331683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035613
22624	NC_016445	AGA	2	6	1331715	1331720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035613
22625	NC_016445	TGTC	2	8	1331723	1331730	0 %	50 %	25 %	25 %	360035613
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22634	NC_016445	TAC	2	6	1332521	1332526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035614
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22638	NC_016445	A	6	6	1332686	1332691	100 %	0 %	0 %	0 %	360035614
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22640	NC_016445	TGA	2	6	1332853	1332858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035614
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22642	NC_016445	TCA	2	6	1333245	1333250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035615
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22645	NC_016445	TTG	2	6	1333448	1333453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035615
22646	NC_016445	CTG	2	6	1333487	1333492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035615
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22649	NC_016445	ATCA	2	8	1333595	1333602	50 %	25 %	0 %	25 %	360035615
22650	NC_016445	CT	4	8	1333634	1333641	0 %	50 %	0 %	50 %	360035615
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22654	NC_016445	GTG	2	6	1333862	1333867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035615
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22669	NC_016445	TTCT	2	8	1334529	1334536	0 %	75 %	0 %	25 %	360035617
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22733	NC_016445	CTCTTT	2	12	1338721	1338732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035622
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22735	NC_016445	CAC	2	6	1338745	1338750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035622
22736	NC_016445	CCA	2	6	1338840	1338845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035622
22737	NC_016445	GC	4	8	1338849	1338856	0 %	0 %	50 %	50 %	360035622
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22740	NC_016445	CTT	2	6	1338972	1338977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035622
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22766	NC_016445	GTTG	2	8	1340248	1340255	0 %	50 %	50 %	0 %	360035622
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22835	NC_016445	AGTGCG	2	12	1344702	1344713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	360035626
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22838	NC_016445	GCCAAA	2	12	1345583	1345594	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	360035628
22839	NC_016445	TGA	2	6	1345600	1345605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035628
22840	NC_016445	CTT	2	6	1345609	1345614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035628
22841	NC_016445	TGC	2	6	1345683	1345688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035628
22842	NC_016445	TCA	2	6	1345695	1345700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035628
22843	NC_016445	ATC	2	6	1345736	1345741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035628
22844	NC_016445	TCT	2	6	1345761	1345766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035628
22845	NC_016445	TCT	2	6	1345837	1345842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035628
22846	NC_016445	GCTT	2	8	1345886	1345893	0 %	50 %	25 %	25 %	360035628
22847	NC_016445	CAC	2	6	1345898	1345903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035628
22848	NC_016445	ACC	2	6	1345931	1345936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035628
22849	NC_016445	ACC	2	6	1346313	1346318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035628
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22957	NC_016445	TGCCT	2	10	1353002	1353011	0 %	40 %	20 %	40 %	360035634
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22959	NC_016445	A	6	6	1353058	1353063	100 %	0 %	0 %	0 %	360035634
22960	NC_016445	TCGG	2	8	1353071	1353078	0 %	25 %	50 %	25 %	360035634
22961	NC_016445	AACACA	2	12	1353169	1353180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035635
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22963	NC_016445	TGC	2	6	1353205	1353210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035635
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22966	NC_016445	TGC	2	6	1353394	1353399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035635
22967	NC_016445	ATC	2	6	1353433	1353438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035635
22968	NC_016445	GCA	2	6	1353440	1353445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035635
22969	NC_016445	AGT	2	6	1353491	1353496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035635
22970	NC_016445	AACC	2	8	1353539	1353546	50 %	0 %	0 %	50 %	360035635
22971	NC_016445	CCA	2	6	1353560	1353565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035635
22972	NC_016445	CTT	2	6	1353695	1353700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035635
22973	NC_016445	TGC	2	6	1353702	1353707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035635
22974	NC_016445	ACT	2	6	1353987	1353992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035636
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22977	NC_016445	GC	3	6	1354233	1354238	0 %	0 %	50 %	50 %	360035636
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22982	NC_016445	TGGG	2	8	1354549	1354556	0 %	25 %	75 %	0 %	360035636
22983	NC_016445	CTCA	2	8	1354620	1354627	25 %	25 %	0 %	50 %	360035636
22984	NC_016445	ACA	2	6	1354665	1354670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035636
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22989	NC_016445	AC	3	6	1355231	1355236	50 %	0 %	0 %	50 %	360035637
22990	NC_016445	TGGC	2	8	1355308	1355315	0 %	25 %	50 %	25 %	360035637
22991	NC_016445	A	8	8	1355345	1355352	100 %	0 %	0 %	0 %	360035637
22992	NC_016445	AGT	2	6	1355387	1355392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035637
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22995	NC_016445	AATC	2	8	1355585	1355592	50 %	25 %	0 %	25 %	360035637
22996	NC_016445	GAT	2	6	1355636	1355641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035637
22997	NC_016445	TGG	2	6	1355739	1355744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035637
22998	NC_016445	GCA	2	6	1355760	1355765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035637
22999	NC_016445	ATTTT	2	10	1355893	1355902	20 %	80 %	0 %	0 %	360035637
23000	NC_016445	TCA	2	6	1355941	1355946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035638

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