MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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22118	NC_016445	ACC	2	6	1301087	1301092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035588
22119	NC_016445	ACC	2	6	1301166	1301171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035588
22120	NC_016445	CCA	2	6	1301221	1301226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035588
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22122	NC_016445	GCC	2	6	1301300	1301305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035588
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22125	NC_016445	CAG	2	6	1301392	1301397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035588
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22144	NC_016445	TGA	2	6	1302517	1302522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035590
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22226	NC_016445	TGGC	2	8	1307615	1307622	0 %	25 %	50 %	25 %	360035597
22227	NC_016445	CGC	2	6	1307645	1307650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035597
22228	NC_016445	GCAAAC	2	12	1307706	1307717	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	360035597
22229	NC_016445	GCA	2	6	1307773	1307778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035597
22230	NC_016445	CAG	3	9	1308038	1308046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035597
22231	NC_016445	CTT	2	6	1308088	1308093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035597
22232	NC_016445	CAA	2	6	1308206	1308211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035597
22233	NC_016445	CTT	2	6	1308238	1308243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035597
22234	NC_016445	AGC	2	6	1308273	1308278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035597
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22236	NC_016445	TAGT	2	8	1308390	1308397	25 %	50 %	25 %	0 %	360035597
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22245	NC_016445	T	7	7	1309298	1309304	0 %	100 %	0 %	0 %	360035598
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22345	NC_016445	TTG	2	6	1316177	1316182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035602
22346	NC_016445	TGC	2	6	1316193	1316198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035602
22347	NC_016445	ATC	2	6	1316234	1316239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035602
22348	NC_016445	ATG	2	6	1316255	1316260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035602
22349	NC_016445	CAAAGG	2	12	1316281	1316292	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	360035602
22350	NC_016445	CCA	2	6	1316386	1316391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035602
22351	NC_016445	TCG	2	6	1316502	1316507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035602
22352	NC_016445	CGAG	2	8	1316519	1316526	25 %	0 %	50 %	25 %	360035602
22353	NC_016445	CCA	2	6	1316533	1316538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035602
22354	NC_016445	GTG	2	6	1316602	1316607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035602
22355	NC_016445	CCA	2	6	1316968	1316973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035603
22356	NC_016445	A	6	6	1316978	1316983	100 %	0 %	0 %	0 %	360035603
22357	NC_016445	GAA	2	6	1317032	1317037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035603
22358	NC_016445	TGTGA	2	10	1317062	1317071	20 %	40 %	40 %	0 %	360035603
22359	NC_016445	ATC	2	6	1317122	1317127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035603
22360	NC_016445	CCG	2	6	1317240	1317245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035603
22361	NC_016445	CGG	2	6	1317276	1317281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035603
22362	NC_016445	A	7	7	1317284	1317290	100 %	0 %	0 %	0 %	360035603
22363	NC_016445	ACG	2	6	1317297	1317302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035603
22364	NC_016445	GGC	2	6	1317326	1317331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035603
22365	NC_016445	TGG	2	6	1317406	1317411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035603
22366	NC_016445	AGCC	2	8	1317418	1317425	25 %	0 %	25 %	50 %	360035603
22367	NC_016445	CGT	2	6	1317428	1317433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035603
22368	NC_016445	CGC	2	6	1317467	1317472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035603
22369	NC_016445	CTG	2	6	1317479	1317484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035603
22370	NC_016445	GC	3	6	1317523	1317528	0 %	0 %	50 %	50 %	360035603
22371	NC_016445	TAA	2	6	1317571	1317576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360035603
22372	NC_016445	CAAA	2	8	1317663	1317670	75 %	0 %	0 %	25 %	360035603
22373	NC_016445	TGA	2	6	1317724	1317729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035603
22374	NC_016445	AGA	2	6	1317733	1317738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035603
22375	NC_016445	ATG	2	6	1317771	1317776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035603
22376	NC_016445	ACC	2	6	1317782	1317787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035603
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22378	NC_016445	AACC	2	8	1317868	1317875	50 %	0 %	0 %	50 %	360035603
22379	NC_016445	TAC	2	6	1317983	1317988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035603
22380	NC_016445	CAT	2	6	1318060	1318065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035603
22381	NC_016445	TGG	2	6	1318078	1318083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035603
22382	NC_016445	CAT	2	6	1318120	1318125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035603
22383	NC_016445	ATC	2	6	1318148	1318153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035603
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22385	NC_016445	GTC	2	6	1318275	1318280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035603
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22387	NC_016445	AC	3	6	1318333	1318338	50 %	0 %	0 %	50 %	360035603
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22391	NC_016445	CGG	2	6	1318465	1318470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035603
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22413	NC_016445	CCA	2	6	1319775	1319780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035604
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22418	NC_016445	CAGCT	2	10	1320288	1320297	20 %	20 %	20 %	40 %	360035605
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22424	NC_016445	TGG	2	6	1320460	1320465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035605
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22437	NC_016445	TGC	2	6	1321171	1321176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
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22442	NC_016445	TCA	2	6	1321618	1321623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035606
22443	NC_016445	GAC	2	6	1321655	1321660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035606
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22447	NC_016445	TTC	2	6	1321759	1321764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035606
22448	NC_016445	TAGCT	2	10	1321956	1321965	20 %	40 %	20 %	20 %	360035606
22449	NC_016445	GCTGA	2	10	1322007	1322016	20 %	20 %	40 %	20 %	360035606
22450	NC_016445	TGA	2	6	1322146	1322151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035606
22451	NC_016445	TGC	2	6	1322197	1322202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22452	NC_016445	TGC	2	6	1322227	1322232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22453	NC_016445	CCG	2	6	1322270	1322275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035606
22454	NC_016445	CTCA	2	8	1322331	1322338	25 %	25 %	0 %	50 %	360035606
22455	NC_016445	GCG	2	6	1322408	1322413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035606
22456	NC_016445	GCTT	2	8	1322437	1322444	0 %	50 %	25 %	25 %	360035606
22457	NC_016445	TGC	2	6	1322470	1322475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22458	NC_016445	GCA	2	6	1322504	1322509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22459	NC_016445	CG	3	6	1322525	1322530	0 %	0 %	50 %	50 %	360035606
22460	NC_016445	CGAA	2	8	1322633	1322640	50 %	0 %	25 %	25 %	360035606
22461	NC_016445	TCA	2	6	1322665	1322670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035606
22462	NC_016445	AGC	2	6	1322683	1322688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22463	NC_016445	GCT	2	6	1322696	1322701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22464	NC_016445	CGC	2	6	1322706	1322711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035606
22465	NC_016445	TCA	2	6	1322815	1322820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035606
22466	NC_016445	AG	3	6	1322898	1322903	50 %	0 %	50 %	0 %	360035606
22467	NC_016445	CAT	2	6	1322960	1322965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035606
22468	NC_016445	GTC	2	6	1322976	1322981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22469	NC_016445	CAG	2	6	1322994	1322999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22470	NC_016445	CCG	2	6	1323004	1323009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035606
22471	NC_016445	TGC	2	6	1323151	1323156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22472	NC_016445	GACT	2	8	1323172	1323179	25 %	25 %	25 %	25 %	360035606
22473	NC_016445	CAC	2	6	1323194	1323199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035606
22474	NC_016445	CAT	2	6	1323398	1323403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035606
22475	NC_016445	ACC	2	6	1323409	1323414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035606
22476	NC_016445	CACG	2	8	1323446	1323453	25 %	0 %	25 %	50 %	360035606
22477	NC_016445	TGC	2	6	1323460	1323465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22478	NC_016445	GTT	2	6	1323488	1323493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035606
22479	NC_016445	CAC	2	6	1323519	1323524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035606
22480	NC_016445	TGC	2	6	1323556	1323561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22481	NC_016445	GCTT	2	8	1323562	1323569	0 %	50 %	25 %	25 %	360035606
22482	NC_016445	GC	3	6	1323582	1323587	0 %	0 %	50 %	50 %	360035606
22483	NC_016445	CTG	2	6	1323633	1323638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22484	NC_016445	CGC	2	6	1323639	1323644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035606
22485	NC_016445	CAA	2	6	1323678	1323683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035606
22486	NC_016445	AGTTG	2	10	1323715	1323724	20 %	40 %	40 %	0 %	360035606
22487	NC_016445	TTG	2	6	1323801	1323806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035606
22488	NC_016445	CTG	2	6	1323825	1323830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22489	NC_016445	CTT	2	6	1323935	1323940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035606
22490	NC_016445	ACC	2	6	1323943	1323948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035606
22491	NC_016445	ATC	2	6	1323949	1323954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035606
22492	NC_016445	TCT	2	6	1323988	1323993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035606
22493	NC_016445	T	6	6	1324007	1324012	0 %	100 %	0 %	0 %	360035606
22494	NC_016445	CTG	2	6	1324014	1324019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22495	NC_016445	GGT	2	6	1324046	1324051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035606
22496	NC_016445	CAG	2	6	1324098	1324103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22497	NC_016445	GAGAA	2	10	1324160	1324169	60 %	0 %	40 %	0 %	360035606
22498	NC_016445	CGC	2	6	1324373	1324378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035606
22499	NC_016445	GCA	2	6	1324388	1324393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035606
22500	NC_016445	GCC	2	6	1324431	1324436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035606

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