MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 51177

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_016445	TGC	2	6	1262842	1262847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035550
21502	NC_016445	GAA	2	6	1262894	1262899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035550
21503	NC_016445	TCGAA	2	10	1262923	1262932	40 %	20 %	20 %	20 %	360035550
21504	NC_016445	CAA	3	9	1262987	1262995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035550
21505	NC_016445	CG	3	6	1263121	1263126	0 %	0 %	50 %	50 %	360035550
21506	NC_016445	CTT	2	6	1263243	1263248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035550
21507	NC_016445	GCCC	2	8	1263349	1263356	0 %	0 %	25 %	75 %	360035550
21508	NC_016445	CCAT	2	8	1263396	1263403	25 %	25 %	0 %	50 %	360035551
21509	NC_016445	GTC	2	6	1263413	1263418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035551
21510	NC_016445	GCA	2	6	1263474	1263479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035551
21511	NC_016445	TGC	2	6	1263543	1263548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035551
21512	NC_016445	CTG	2	6	1263605	1263610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035551
21513	NC_016445	GAC	2	6	1263653	1263658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035551
21514	NC_016445	ACA	2	6	1263721	1263726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035551
21515	NC_016445	ACG	2	6	1263766	1263771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035551
21516	NC_016445	AGC	2	6	1263774	1263779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035551
21517	NC_016445	GTG	2	6	1263795	1263800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035551
21518	NC_016445	TGA	2	6	1263862	1263867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035551
21519	NC_016445	CCG	2	6	1263895	1263900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035551
21520	NC_016445	CAC	2	6	1263940	1263945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035551
21521	NC_016445	GCA	2	6	1264051	1264056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035551
21522	NC_016445	TGG	2	6	1264071	1264076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035551
21523	NC_016445	CCTAT	2	10	1264196	1264205	20 %	40 %	0 %	40 %	360035551
21524	NC_016445	GCC	2	6	1264232	1264237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035551
21525	NC_016445	TGA	2	6	1264391	1264396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035552
21526	NC_016445	GTG	2	6	1264465	1264470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035552
21527	NC_016445	CTC	2	6	1264482	1264487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360035552
21528	NC_016445	AGC	2	6	1264541	1264546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035552
21529	NC_016445	GTG	2	6	1264586	1264591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035552
21530	NC_016445	CGCA	2	8	1264629	1264636	25 %	0 %	25 %	50 %	360035552
21531	NC_016445	CAA	3	9	1264639	1264647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035552
21532	NC_016445	TTGA	2	8	1264666	1264673	25 %	50 %	25 %	0 %	360035552
21533	NC_016445	GC	3	6	1264697	1264702	0 %	0 %	50 %	50 %	360035552
21534	NC_016445	A	6	6	1264713	1264718	100 %	0 %	0 %	0 %	360035552
21535	NC_016445	ACTTT	2	10	1264780	1264789	20 %	60 %	0 %	20 %	360035552
21536	NC_016445	GCC	2	6	1264799	1264804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035552
21537	NC_016445	ACCATG	2	12	1264849	1264860	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	360035552
21538	NC_016445	GCA	2	6	1264876	1264881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035552
21539	NC_016445	CAC	2	6	1264923	1264928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035552
21540	NC_016445	TCCAT	2	10	1264934	1264943	20 %	40 %	0 %	40 %	360035552
21541	NC_016445	TGA	2	6	1264949	1264954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035552
21542	NC_016445	TTG	2	6	1264979	1264984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035552
21543	NC_016445	ATT	2	6	1265002	1265007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035552
21544	NC_016445	ATTTT	2	10	1265021	1265030	20 %	80 %	0 %	0 %	360035552
21545	NC_016445	CCA	2	6	1265120	1265125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035552
21546	NC_016445	TATT	2	8	1265162	1265169	25 %	75 %	0 %	0 %	360035552
21547	NC_016445	CTTC	2	8	1265173	1265180	0 %	50 %	0 %	50 %	360035552
21548	NC_016445	TCTCC	2	10	1265184	1265193	0 %	40 %	0 %	60 %	360035552
21549	NC_016445	GCA	2	6	1265227	1265232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035552
21550	NC_016445	CT	3	6	1265239	1265244	0 %	50 %	0 %	50 %	360035552
21551	NC_016445	CT	3	6	1265351	1265356	0 %	50 %	0 %	50 %	360035552
21552	NC_016445	GCTG	2	8	1265367	1265374	0 %	25 %	50 %	25 %	360035552
21553	NC_016445	A	6	6	1265386	1265391	100 %	0 %	0 %	0 %	360035552
21554	NC_016445	AG	3	6	1265607	1265612	50 %	0 %	50 %	0 %	360035553
21555	NC_016445	CAA	2	6	1265628	1265633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360035553
21556	NC_016445	ATG	2	6	1265676	1265681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035553
21557	NC_016445	GAT	2	6	1265739	1265744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035553
21558	NC_016445	AGG	2	6	1265750	1265755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360035553
21559	NC_016445	CTG	2	6	1265801	1265806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035554
21560	NC_016445	CGG	2	6	1265816	1265821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035554
21561	NC_016445	TGC	2	6	1265919	1265924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035554
21562	NC_016445	CTC	2	6	1265954	1265959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360035554
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21565	NC_016445	GCAA	2	8	1266265	1266272	50 %	0 %	25 %	25 %	360035555
21566	NC_016445	CGAACA	2	12	1266360	1266371	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	360035555
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21571	NC_016445	GACGCT	2	12	1266582	1266593	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	360035555
21572	NC_016445	GAA	2	6	1266594	1266599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360035555
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21574	NC_016445	CTG	2	6	1267007	1267012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035556
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21577	NC_016445	TTTGG	2	10	1267134	1267143	0 %	60 %	40 %	0 %	360035556
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21585	NC_016445	AGC	2	6	1267511	1267516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035556
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21588	NC_016445	GAT	2	6	1267618	1267623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035556
21589	NC_016445	CTT	2	6	1267746	1267751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035556
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21593	NC_016445	GC	3	6	1267952	1267957	0 %	0 %	50 %	50 %	360035556
21594	NC_016445	CAC	2	6	1268126	1268131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035557
21595	NC_016445	TGGCAA	2	12	1268159	1268170	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	360035557
21596	NC_016445	TGA	2	6	1268235	1268240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360035557
21597	NC_016445	TATC	2	8	1268301	1268308	25 %	50 %	0 %	25 %	360035557
21598	NC_016445	CTT	2	6	1268349	1268354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035557
21599	NC_016445	GGT	2	6	1268370	1268375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035557
21600	NC_016445	TAT	2	6	1268390	1268395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035557
21601	NC_016445	TGGT	2	8	1268432	1268439	0 %	50 %	50 %	0 %	360035557
21602	NC_016445	GAAG	2	8	1268482	1268489	50 %	0 %	50 %	0 %	360035557
21603	NC_016445	CAG	2	6	1268525	1268530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035557
21604	NC_016445	TGG	2	6	1268591	1268596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035557
21605	NC_016445	TTTG	2	8	1268638	1268645	0 %	75 %	25 %	0 %	360035557
21606	NC_016445	CGC	2	6	1268650	1268655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035557
21607	NC_016445	ACT	2	6	1268699	1268704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035557
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21610	NC_016445	CG	3	6	1268861	1268866	0 %	0 %	50 %	50 %	360035557
21611	NC_016445	TCT	2	6	1268873	1268878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035557
21612	NC_016445	CCCAA	2	10	1269004	1269013	40 %	0 %	0 %	60 %	360035557
21613	NC_016445	TTGC	2	8	1269077	1269084	0 %	50 %	25 %	25 %	360035557
21614	NC_016445	TTG	2	6	1269110	1269115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035557
21615	NC_016445	CAT	2	6	1269169	1269174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035557
21616	NC_016445	TGC	2	6	1269189	1269194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035557
21617	NC_016445	TTG	2	6	1269206	1269211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035557
21618	NC_016445	CTG	2	6	1269233	1269238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035557
21619	NC_016445	TGG	2	6	1269260	1269265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360035557
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21621	NC_016445	T	6	6	1269284	1269289	0 %	100 %	0 %	0 %	360035557
21622	NC_016445	CTGCT	2	10	1269423	1269432	0 %	40 %	20 %	40 %	360035557
21623	NC_016445	CGG	3	9	1269493	1269501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360035557
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21730	NC_016445	CT	3	6	1276313	1276318	0 %	50 %	0 %	50 %	360035564
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21732	NC_016445	GC	3	6	1276419	1276424	0 %	0 %	50 %	50 %	360035564
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21849	NC_016445	GC	3	6	1283300	1283305	0 %	0 %	50 %	50 %	360035571
21850	NC_016445	GCTTCC	2	12	1283331	1283342	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	360035571
21851	NC_016445	CTT	2	6	1283386	1283391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035571
21852	NC_016445	CGA	2	6	1283427	1283432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360035571
21853	NC_016445	CGC	2	6	1283438	1283443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035571
21854	NC_016445	TTC	2	6	1283537	1283542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035571
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21856	NC_016445	CG	4	8	1283609	1283616	0 %	0 %	50 %	50 %	360035571
21857	NC_016445	GTT	2	6	1283629	1283634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035571
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21862	NC_016445	TCT	2	6	1283805	1283810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360035571
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21864	NC_016445	A	6	6	1283863	1283868	100 %	0 %	0 %	0 %	360035571
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21967	NC_016445	CATG	2	8	1290831	1290838	25 %	25 %	25 %	25 %	360035578
21968	NC_016445	ATT	2	6	1290857	1290862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360035578
21969	NC_016445	CCA	2	6	1290863	1290868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035578
21970	NC_016445	TTG	2	6	1290884	1290889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360035578
21971	NC_016445	CTG	2	6	1290937	1290942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035578
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21973	NC_016445	GCT	2	6	1291071	1291076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035578
21974	NC_016445	CAAAG	2	10	1291131	1291140	60 %	0 %	20 %	20 %	360035578
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21988	NC_016445	TGC	2	6	1291947	1291952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360035580
21989	NC_016445	TCA	2	6	1291969	1291974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035580
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21992	NC_016445	ACCA	2	8	1292049	1292056	50 %	0 %	0 %	50 %	360035580
21993	NC_016445	ATC	2	6	1292275	1292280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035580
21994	NC_016445	TCA	2	6	1292390	1292395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035580
21995	NC_016445	TTGA	2	8	1292439	1292446	25 %	50 %	25 %	0 %	360035580
21996	NC_016445	ATC	2	6	1292448	1292453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360035580
21997	NC_016445	CCA	2	6	1292480	1292485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360035580
21998	NC_016445	CGCC	2	8	1292498	1292505	0 %	0 %	25 %	75 %	360035580
21999	NC_016445	GCC	2	6	1292626	1292631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360035580
22000	NC_016445	ACTGTC	2	12	1292649	1292660	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	360035580

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